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生物信息
Topic 16. 临床预测模型之接收者操作特征曲线 (ROC)
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你67篇原创内容-->公众号全网总结最全的ROC绘制方法
90066456ace6
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2023-12-15 05:11
【动态规划总结】动态规划算法掌握一种技巧-完美理解
动态规划(英语:Dynamicprogramming,简称DP),是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
生物信息
学中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
未来星_狒狒
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2023-12-06 04:08
二
算法领域
算法
动态规划
大数据 - MapReduce:从原理到实战的全面指南
每天都有数以百万计的数据被生成、存储和处理,覆盖了从互联网搜索、电子商务,到
生物信息
学和气候研究等各个领域。
快乐非自愿
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2023-12-04 19:03
大数据
mapreduce
利用Biopython来进行序列比对
作者:童蒙编辑:angelica前言序列比对在
生物信息
中很常见,通过比较序列的相似度来推测其相关的功能。
生信阿拉丁
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2023-12-04 13:09
生物信息
流程搭建方法
先来看一则招聘信息:image.png关于
生物信息
流程,不同的分类标准可能得到不一样的分类结果,比如:Areviewofbioinformaticpipelineframeworks这篇综述中,按照隐式公约框架
生物信息与育种
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2023-12-04 11:35
学习小组Day2笔记--四海
Linux系统学习一、了解Linux系统处理大数据使用的都是Linux系统,学习
生物信息
大数据必须学习Linux系统。
寂静之巅
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2023-12-04 00:04
Docker封装
生物信息
学宏基因组流程
宏基因组学(metagenomics)是一种以环境样品中的微生物群体所有基因组作为研究对象,利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能的新的研究微生物多样性的方法。宏基因组不依赖于微生物的分离培养,克服了传统的纯培养方法的技术限制,为研究和开发利用占微生物种类99%以上的未可培养的微生物提供了一种新的途径和良好的策略;可以得到环境中丰度较低的,甚至是痕量微生物的信
儒雅随和王小板
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2023-12-03 05:50
R语言中如何改变表格数据的填充顺序
#搬运过来的,看不懂请看原出处原作者:熊荣川六盘水师范学院
生物信息
学实验室
[email protected]
://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz通常在R语言中矩阵
一声沧海笑
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2023-12-02 12:53
r语言
开发语言
【EI会议征稿】第四届
生物信息
学与智能计算国际学术研讨会(BIC 2024)
第四届
生物信息
学与智能计算国际学术研讨会(BIC2024)20244thInternationalConferenceonBioinformaticsandIntelligentComputing2024
艾思科蓝-何老师【H8053】
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2023-12-02 06:39
Ei稳定检索会议推荐栏目
计算机方向的国际学术会议
生物
智能计算
医疗
生物信息学
人工智能及应用
数据挖掘
dbCAN碳水化合物酶基因数据库及run_dbCAN4工具安装配置及使用
dbCAN是一个非常有用的
生物信息
学工具,对于研究纤维素生物转化、生物能源、生产生物基化学品等领域的研究具有重要意义。Run_dbCAN是一个用于预
小果运维
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2023-12-01 14:46
生信分析-bioinfo
科学数据分析
数据库
CAZyDB
run_dbcan
碳水化合物酶基因库
2021-11-11 不仅仅是科学原理,还有独特的视角!—《诠释人性:如何用自然科学理解生命、爱与关系》
作者卡米拉·庞,伦敦大学学院生物化学博士,从事转化
生物信息
学研究的博士后科学家。8岁时,卡米拉被诊断患有自闭症谱系障碍(ASD),26岁时被诊断患有多动症(ADHD),而焦虑也一直伴随着她。
树毛竹
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2023-11-30 22:45
IF:4+ 鉴定与股骨头坏死软骨氧化应激相关的Hub基因和通路
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你75篇原创内容-->公众号现在肿瘤的文章已经很多很多了
90066456ace6
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2023-11-30 00:53
国自然热点锁定
一年一度的国自然科学基金又要开始申请了,不管是科研大牛还是实验小白,也都开始摩拳擦掌的准备一展风采,
生物信息
个性化挖掘也成为大家科研工作中不可或缺的一部分。
概普生信
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2023-11-29 20:39
【EI会议征稿】第四届
生物信息
学与智能计算国际学术研讨会(BIC 2024)
第四届
生物信息
学与智能计算国际学术研讨会(BIC2024)20244thInternationalConferenceonBioinformaticsandIntelligentComputing2024
搞科研的小刘选手
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2023-11-29 20:17
学术会议
大数据
自动化
区块链
人工智能
信号处理
数据分析
r语言 相关性作图_R绘图:相关性分析与作图
公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程:
生物信息
学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析
知乎剧综
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
加权基因共表达网络分析 (WGCNA)| 共表达网络模块构建 |
生物信息
学数据分析必备技能
一、前言1.1概念加权基因共表达网络分析(WGCNA,Weightedcorrelationnetworkanalysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度协同变化的基因集,并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶点。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基
小杜的生信筆記
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2023-11-28 17:42
DNA 11. 识别肿瘤蛋白质三维结构上突变热点(HotSpot3D)
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你125篇原创内容-->公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程
90066456ace6
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2023-11-28 14:46
基于Qiime2处理Silva数据库
生物信息
学习提示:仅供学习交流使用。
Biostudy-1005
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2023-11-26 18:27
生物信息学分析
生物信息学
数据分析
数据可视化
统计学
QIIME2进阶二_元数据及数据导入QIIME2
本节主要讲解如何将元数据与数据导入
生物信息
分析软件QIIME2,实现数据导入与检查。
环微分析
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2023-11-26 18:54
环境微生物生物信息分析分享板
生物信息学
QIIME2进阶三_用QIIME2实现对数据的质量控制
本文主要介绍了使用
生物信息
软件QIIME2中的DADA2与Deblur插件对扩增子基因序列进行质量控制。
环微分析
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2023-11-26 18:54
环境微生物生物信息分析分享板
生物信息学
QIIME2进阶五_QIIME2扩增子基因序列多样性分析
本节主要介绍了如何使用
生物信息
分析分析软件QIIME2对扩增子基因序列进行Alpha和Beta多样性分析,以及Alpha稀疏和深度选择。
环微分析
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2023-11-26 18:54
环境微生物生物信息分析分享板
生物信息学
QIIME2进阶一_用QIIME2解析序列,诠释生命
本文旨在介绍
生物信息
学软件QIIME2及其核心组成。2010年,美国科罗拉多大学的RobKnight教授(现单位美国加州大学圣地亚哥分校)团队发布QIIME(发音同chime)分析流程。
环微分析
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2023-11-26 18:53
环境微生物生物信息分析分享板
生物信息学
QIIME 2介绍
QIIME2(QuantitativeInsightsIntoMicrobialEcology2)是一个用于分析和解释微生物组数据的开源
生物信息
学工具。
qq_27390023
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2023-11-26 18:51
生物信息学
纯
生物信息
学SCI文章好发吗?不好意思,很难了
如我题目所说,这次探讨的问题是纯
生物信息
学文章好不好发表。纯
生物信息
学最大的好处就是跳过了基础实验这个最大门槛,省去大量时间和精力,以至于同学们对生信发文的坚信程度达到了无比执着的境地。
医学程序研究
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2023-11-26 10:34
计算最长公共子序列算法
概述最长公共子序列问题是计算机科学与技术领域中一个重要的问题,广泛应用于字符串匹配、版本控制、
生物信息
学等领域。解决最长公共子序列问题的动态规划算法具有高效、可靠的特点,因此被广泛采用。
大宝贱
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2023-11-25 15:34
#
搜索算法
算法
【金猿案例展】某国家级研究所——组学大数据分析平台建设
生物信息
学经过近30年的发展,从最初的基因组数据的收集和存储,到利用数学建模和人工智能思想,挖掘数据背后的生物学意义、对样本数据进行合理分类、建立合理的二级和三级数据库,
数据猿
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2023-11-24 20:46
分布式
人工智能
大数据
编程语言
数据分析
生物信息
学之玩转Linux---学习笔记(一)---生信技能树
Linux系统是进行
生物信息
学分析的基石,许多
生物信息
学软件都是基于Linux系统开发的。所以学习Linux对于
生物信息
学分析尤为重要。
LiuYueRR
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2023-11-24 20:58
图神经网络的数学原理总结
许多现实生活问题使GDL成为万能工具:在社交媒体、药物发现、芯片植入、预测、
生物信息
学等方面都显示出了很大的前景。
金戈鐡馬
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2023-11-24 18:41
深度学习
神经网络
人工智能
深度学习
图
GNN
【分子指纹】化学分子指纹的概念和应用
DrugDiscovToday|化学分子指纹的概念和应用2022年9月13日,哈尔滨医科大学药物基因组信息学教研室陈秀杰教授、哈尔滨医科大学
生物信息
科学与技术学院解洪波副教授团队在期刊DrugDiscoveryToday
DJ.马
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2023-11-24 12:45
人工智能药物设计
人工智能
分子指纹
成长礼4|耐药机制研究总结
总结了微生物的一些耐药机制,研究方法以及相关的
生物信息
软件,相信会让你对微生物耐药机制有个好的了解。抗生素是20世纪最重要
f70420f979c3
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2023-11-24 08:41
STRING||蛋白互作数据库在线分析基因互作网络(PPI)
它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还有利用
生物信息
学的方法预测的结果。研究蛋白之间的相互作用网络,有助于挖掘核心的调控基因。
生信编程日常
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2023-11-24 07:29
基于 Dash Bio 的
生物信息
学数据可视化
DashBio是面向
生物信息
学,且与Dash兼容的组件,它可以将
生物信息
学领域中常见的数据整合到Dash应用程序,以实现响应式的
生物信息
学数据可视化。
Python中文社区
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2023-11-24 01:51
使用python处理
生物信息
数据(十)
Python学习的第十天,好些天没有学习python了。4月6号下午回武汉了,从汉口火车站下车,车站弥漫着消毒水的味道,有些疫情防控人员全副武装,有些工作人员引导我们扫码入地铁站,安静而肃杀的氛围,从没见过如此安静的武汉,回想过去的两个月武汉真是英雄的城市,进了地铁发现人不多,公交车转乘到住的小区,扫码登记进去了。今天主要学习如何使用类class管理复杂程序。写一个程序去计算孟德尔的豌豆实验中的表
你猜我菜不菜
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2023-11-23 14:52
基因组组装----k-mer
k-mer:在
生物信息
学中,k-mers是包含在生物序列中的长度为k的子序列。比如序列:GTAGAGCTGT,根据k值不同,可得到以下k-mer。
bcl_hx
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2023-11-23 12:16
C++干货分享
最全的C++资源大全,涵盖人工智能、音频、
生物信息
、压缩、密码学、机器学习、静态编译等多方面资源,分享给程序猿兄弟们,收藏起来吧~人工智能btsk:游戏行为树启动器工具https://github.com
??c++
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2023-11-23 08:03
编程
C++
C语言
10+生信文章鉴赏:如何将靶点与癌症的关系研究透彻
该研究利用
生物信息
学的方法,在零实验的情况下,通过对shelterin在各种癌症中的表达、突变以及与免疫通路的关系,系统性的研究了shelterin作为靶点以及作为癌症标志物的可能性。
概普生信
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2023-11-22 15:46
用python做
生物信息
数据分析(2-pysam)
写perl的思维,可能确实不能拿来学python。毕竟,python的裤子有很多。面向对象的语言,如果不好好穿裤子,怎么找对象?。手上要做的事情,需要解析sam,更或者bam文件。当然,如果有可能的话,还需要对SAM或者BAM进行排序!这个事情我在java写过,but,最后效率不如htsjdk,故最后还是打包了htsjdk。吸取这个教训,使用python的时候。第一步,先用pysam。pysam的
生信石头
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2023-11-22 05:27
GEO数据挖掘-数据下载
断断续续学习
生物信息
也有一段时间了,因为做实验的缘故没办法系统学习,只能看大家的帖子一点点补充。俗话说的好,好记性不如烂笔头,为方便记忆,我就将每天用到的生信知识记录下来,加油!
活捉一只Sophie
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2023-11-22 03:49
生物信息
学之抗癌药物反应论文阅读六:DNN整合基因组谱
论文地址:Predictingdrugresponseoftumorsfromintegratedgenomicprofilesbydeepneuralnetworks利用深度神经网络预测整合基因组谱的肿瘤药物反应作者信息:Yu-ChiaoChiu1,Hung-IHarryChen1,2,TingheZhang2,SongyaoZhang2,3,AparnaGorthi1,Li-JuWang1,Y
Programming_miao
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2023-11-22 03:58
生物信息学论文阅读小记
生物信息学
药物反应预测
深度神经网络
GDSC
TCGA
1130转录组分析(三)--王通老师讲解
1130RNAseq
生物信息
分析(王通老师)01课程介绍[if!supportLists]1.[endif]RNAseq测序定义[if!supportLists]2.
不如好好学生信吧
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2023-11-22 01:36
关于精准医疗的再思考
各国定义有一些差别,但核心意思相差不大,我们看一下中国精准医疗专家组詹启敏院士的定义:应用现代遗传技术、分子影像技术、
生物信息
分析技术,结合患者生活环境和临床数据,实现精准的疾病分类和诊断,制定具有个性化的预防治疗方案
基因百晓生
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2023-11-21 11:32
深入解析序列模型:全面阐释 RNN、LSTM 与 Seq2Seq 的秘密
简介序列建模是许多领域的一个重要问题,包括自然语言处理(NLP)、语音识别和语音合成、时间序列预测、音乐生成和「
生物信息
学」。所有这些任务的共同点是它们需要坚持。接下来的事情的预测是基于历史的。
冷冻工厂
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2023-11-21 05:42
自然语言处理
Neo4j数据库介绍及简单使用
这种表示方式非常适合处理具有复杂关系的数据,如社交网络、推荐系统、网络拓扑、
生物信息
学等领域的数据。
西瓜太郎呀!
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2023-11-20 01:59
Neo4j数据库
数据库
neo4j
oracle
生物信息
百Jia软件(十):seqtk
基因学苑QQ群:32798724seqtk同样来自于
生物信息
大神李恒之手,被称为序列处理的瑞士军刀,可以方便处理日常序列分析中的小问题,例如将fq转换为fa,格式化序列,截取序列等这些问题并不难,但是可能需要编程完成
基因学苑
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2023-11-19 20:22
生物信息软件
最佳
生物信息
工作环境(2023年11月更新版)
日常工作环境的好坏直接影响我们的心情和效率,这篇文章介绍一下我这些年用得顺手的一些工具。1.本地电脑平台:Mac电脑,强烈建议搞生信用苹果:iMac/Macair/MacPro。终端:iTerm2,比系统自带的好用太多。编辑器:写代码:VisualStudioCode或SublimeText写Markdown文档:Typora(已收费,放弃了)R画图:当然是Rstudio了(现在优先UseGala
简说基因-专业生信合作伙伴
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2023-11-19 20:21
生物信息
基础:实用Git命令,掌握这些就够了
我发现有搞了几年生信的朋友还不会用Github管理代码,这不免令人意外。我一直强调基础知识的重要性,而这些知识又是可以在短时间内掌握的。Github管理平时写的代码,要用到Git命令。虽然官方Git命令非常多,但我们只要掌握常用的几个能干活就好了。作为半个IT人,写代码是工作日常,如何进行代码版本控制及托管,本文介绍一下我的最佳实践,其实很容易。工作或学习过程中写的代码,存在本地的话容易丢失,也不
简说基因-专业生信合作伙伴
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2023-11-19 20:08
git
【
生物信息
学学习】Linux基础
Linux与
生物信息
Linux与
生物信息
Linux的安装将你的Linux虚拟机作为远程服务器获取虚拟机的IP地址远程登陆服务器传输文件Linux基础命令目录相关的命令常用命令cd切换目录特殊路径(”“之中的符号
Ginno
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2023-11-19 15:21
学习
linux
运维
bioinfo100-第10题-FastQC报告之adapter与kmer
我们在[
生物信息
学100个基础问题——第5题测序建库的adapter](https://zhuanlan.zhihu.com/p/34691037"\t"_blank)的时候讨论过adapter的问
RachaelRiggs
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2023-11-19 09:20
动态规划c++
1.什么是动态规划动态规划(英语:Dynamicprogramming,简称DP),是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
生物信息
学中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法
呼噜吧唧
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2023-11-18 22:12
动态规划
代理模式
算法
生物信息
学和计算生物学中的扩散模型
生物信息
学和计算生物学中的扩散模型摘译李升伟1张俊鹏2(1.特趣生物科技有限公司,广东深圳;2.大理大学工学院,云南大理)去噪扩散模型包含一种生成人工智能,可应用于计算机视觉、自然语言处理和
生物信息
学。
lisw05
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2023-11-18 21:34
人工智能
计算科学
人工智能
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