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生物信息
动态规划DP【持续更新】
动态规划 动态规划(英语:Dynamicprogramming,简称DP)是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
生物信息
学中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
nirvana · rebirth
·
2023-09-21 01:00
ACM
DP
动态规划
DP
ACM
算法
Java手写隐马尔可夫模型
它可以用于语音识别、自然语言处理、
生物信息
学、图像识别等领域。在本文中,我们将手写实现隐马尔可夫模型,并介绍其应用拓展案例。
全栈项目讲解
·
2023-09-20 19:31
Java手写源码合集
java
开发语言
【陈巍学基因-3】small RNA-seq
这次介绍:1.smallRNA建库测序方法2.smallRNA的
生物信息
学分析表达量差异分析聚类分析靶基因的GeneOntology分析(GO分析)靶基因的KEGGPathway分析3.血清、血浆microRNA
oddxix
·
2023-09-20 14:08
4 篇 NAR | 生物大数据时代,如何做好数据管理和再利用,发IF10+的数据库文章?...
生物信息
分析离不开数据资源和数据库,
生物信息
学数据库分类概览(第一版)系统梳理了常用功能数据库。
生信宝典
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2023-09-20 11:46
数据库
背靠背 Nature 新方向 - 蛋白质结构家族图谱的“潘多拉魔盒”
NBT-Foldseek快速准确搜索结构相似的蛋白,AlphaFold蛋白质数据库提供了一个快速的搜索工具AlphaFold的极限:高中生揭示人工智能在
生物信息
学挑战中的缺陷AlphaFold2开源了,
生信宝典
·
2023-09-20 11:44
数据库
java如何打包系统_Java工程项目打包成一个安装包从而在电脑上部署
我们都知道
生物信息
其实包含方方面面非实验工作,只是应用在生物中,解决生物学问题。一句话总结:生信是个框,不做实验都往里面装。
乔本大叔
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2023-09-20 05:12
java如何打包系统
2017校招面经(BAT、搜狗、搜狐、一点资讯、360、华为优招)
1.简单介绍面试岗位:机器学习|数据挖掘|算法工程师|基础研究比赛经历:天池比赛Top10,滴滴算法大赛Top5,京东算法大赛Top1科研经历:实验室主要方向:计算机视觉+
生物信息
。
婉妃
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2023-09-19 18:07
自动化工具 Ansible 管理集群
生物信息
团队一般都有个集群,集群的管理无论是安装移除软件、修改配置或者更新等等,不能人手动一个一个节点操作,第一浪费时间第二怕不一致。
BeeBee生信
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2023-09-19 16:06
字符串相似度算法
适用于处理文本、推荐系统、
生物信息
学等领域CosineSimilarity余弦相似度用于度量两个向量之间的夹角余弦值,适用于文本相似性、信息检
留白1992
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2023-09-19 14:13
Java
数据库
算法
java
相似度
jaccard
levenshtein
similarity
mysql
观察者笔记——阶段学习总结与未来安排(百日一更)
自学时的笔记1.2.课程笔记三、数据分析3.1.numpy3.2.pandas3.3.matplotlib四、网络爬虫五、人工智能5.1.传统机器学习5.2.深度学习六、数学建模七、数据结构与算法八、
生物信息
学九
星石传说
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2023-09-18 23:46
python篇
笔记
学习
生物信息
学---蛋白质组学中氨基酸信息编码方式
特征编码:1.基于序列的特征:资料来源:蛋白质序列特征提取方法之——CKSAAP1.1CKSAPP(k空间氨基酸对的组成):在CKSAAP(Compositonofk-spacedAminoAcidPairs)方法中,利用在蛋白质序列片断中k个间隔距离的残基对(residuepairs)在该序列中的组成比例,建立数学模型,提取出特征向量,从而达到预测泛素(Ubiquitin)的目的。残基:组成多肽
灰太狼家的小鸭子
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2023-09-18 12:01
生物信息学知识
学习
10X空间转录组与卷积神经网络(CNNs)
相信许多做
生物信息
学的童鞋来说,空间转录组是最近很火的技术,但是不知道大家发现了没有,我们做空间的分析对于空间位置信息利用的很少,大多数情况我们就是把很多单细胞的分析方法映射于空间,从生物学的角度看,当然是没有问题的
单细胞空间交响乐
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2023-09-17 10:19
动态规划学习
动态规划学习动态规划(DynamicProgramming,DP)是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
生物信息
学中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
alive`
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2023-09-16 19:32
cpp
动态规划
学习
算法
敏感肌能刮痧吗? 面部刮痧你不知道的常识太多了
刮痧呢,一般情况是用特定的刮痧板按照一定的穴位顺序进行按压刮痧,使面部经络穴位因刮试刺激而血脉通畅,达到行气活血梳通毛孔纹理,排出痧气,调整面部
生物信息
,平衡阴阳的目的。
必海时尚
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2023-09-16 13:27
如何用python把fastq里所有序列的前几个碱基提取出来
本文首发于微信公众号:
生物信息
学习最近实验室开始用python的越来越多了,看着大家都在进步,哈哈,也是一件蛮有成就感的事情。
gtt儿_生物信息学习
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2023-09-15 11:28
如何使用Python的Pyecharts做一个数据可视化的Graph 关系图?
Graph关系图通常用于社交网络分析、网络安全分析和
生物信息
学科研等等领域,以及其他任何需要探索复杂关系的应用场景。温馨提示:以下是本篇文章的
db_wjj_2079
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2023-09-15 02:20
python
信息可视化
开发语言
echart 动画 饼图_巧用EChart画动态饼图
生物信息
学领域算法对于解决复杂生物学问题非常重要,随着NGS的发展对于算法需求也越来越多,同时也伴随着对数据可视化的需求的增加。
天下事一点通
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2023-09-14 23:46
echart
动画
饼图
单个基因的
生物信息
学分析(2)-蛋白质结构域预测
本期的主题仍然属于《单个基因的
生物信息
学分析》,主要讲解介绍一下单个蛋白质结构域分析。
blue_unique
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2023-09-14 13:05
基于Protege的知识建模实战
一.Protege简介、用途和特点1.Protege简介Protege是斯坦福大学医学院
生物信息
研究中心基于Java开发的本体编辑和本体开发工具,也是基于知识的编辑器,属于开放源代码软件。
NLP工程化
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2023-09-14 06:46
自然语言处理
Protege
语义网
知识图谱
我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿从2016年,我开始自学
生物信息
,那个时候,为了加深自己学习,所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。我有一个自己的博客,xuzhougeng.top。
xuzhougeng
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2023-09-13 19:20
在windows环境下安装运行NCBI-blast程序
NCBIBLAST程序作为广泛使用的序列比对工具深受大家喜爱,对于一般的
生物信息
处理过程来讲,网页版的工具已经足够使用,但是若想自己构建自定义的搜索数据库以及对大量序列进行检索,则需要在本地运行。
指尖笑1226
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2023-09-13 14:04
python笔记——python
生物信息
学数据管理第一部分
#import语句及模块>>>importos#导入模块>>>dir(os)#模块中呈现的变量和函数的完整列表>>>help(os.chdir)#模块下某个函数的简短解释>>>help(matplotlib.pylab)#运算a**b#a的b次幂a%b#a/b的余数a//b#向下舍入除法#整数运算结果是整数,浮点数运算结果是浮点数>>>4/31>>>4.0/31.3333333333333333#
懒猫古德
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2023-09-13 07:59
Linux上安装Tarball软件------以MUMmer为例
下文以一个
生物信息
学小软件MUMmer为例,说明一下tarball软件的安装流程。
夏夏LJ
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2023-09-13 01:32
项目实训-智能生物序列分析平台-序列分析日志
在经过与老师的探讨后,我们决定将之前创新实训的课题,继续深挖,开发一套基于人工智能模型的生物序列分析平台,内置了传统nlp模型与
生物信息
中的各类模型的整合,打算做到60个算法的集合,最终我们实现了两个平台上一共
土豆与浆果
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2023-09-13 00:53
软件工程应用与实践
自然语言处理
深度学习
人工智能
大数据
项目实训-智能生物序列分析平台-项目工作总结7
概要在经过与老师的探讨后,我们决定将之前创新实训的课题,继续深挖,开发一套基于人工智能模型的生物序列分析平台,内置了传统nlp模型与
生物信息
中的各类模型的整合,打算做到60个算法的集合,最终我们实现了两个平台上一共
lllhhhyyy999
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2023-09-13 00:23
前端
后端
python
22-从DNA损伤修复以及分析亚型角度分析膀胱癌中的免疫调节
Hello,大家好,今天小编给大家带来的是有关DNA损伤修复基因以及膀胱癌亚型免疫调节的文章,文章主要挖掘了膀胱癌不同亚型中免疫调节基因并进行了
生物信息
学分析,内容丰富却也不难理解,于2019年发表在JournalforImmunotherapyofCancer
AAA肿瘤信息学王协
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2023-09-12 19:43
linux怎么查看一个bam文件,Linux常规操作笔记
所使用的Linux系统是曾健明的服务器,服务器信息如下:/usr/local/bin/miniconda3/bin路径下面安装了
生物信息
学软件,可以使用全路径调用它们,或者添加该目录到环境变量。
谢兴豪
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2023-09-12 16:50
肝细胞癌中关键生物标志物的筛选和鉴定:来自
生物信息
分析的证据
摘要肝细胞癌是世界上最常见的癌症之一。人们对其病因进行了大量的研究,但对其分子机制尚不清楚。从基因表达综合数据库(GeneExpressionOmnibus,GEO)下载芯片数据集GSE19665、GSE33006和GSE41804,以确定肝癌发生和进展中的候选基因。鉴定差异表达基因(DEGs),并进行功能富集分析。构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),并使用STRING和Cytoscape进行模
亦是旅人呐
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2023-09-11 11:30
天才在左疯子在右——果冻世界
甚至犬齿也比普通人发达,而且最有意思的是,尿液里居然会有大量的
生物信息
素,那是犬科动物的特有标志;狼孩鼻粘膜细胞也很发达——就是灵敏的嗅觉。
项工页
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2023-09-10 22:56
SCS【34】单细胞/T细胞/抗体免疫库数据分析(immunarch)
简介immunarch是专为分析T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)而设计的R包,主要为医学科学家和
生物信息
学家量身定制。
桓峰基因
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2023-09-10 20:13
数据分析
数据挖掘
Y叔要求职
余光创香港大学
生物信息
学博士,目前在港大从事博士后工作求职意向:副教授以上地点:主要意向是广州和深圳简历:https://guangchuangyu.github.io/resume/YGC.pdfgooglescholar
Y叔_HKU
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2023-09-10 14:45
[DEBUG] springboot+freemarker+shiro控制按钮的出现与隐藏
更多技术文章请访问我的博客园账户:点击这里那边会更新有关
生物信息
学,javaWeb,统计学理论和一些杂七杂八的记录:)leetcode刷题记录争取日更(github):点击这里部分敏感信息已打码。
陆书生
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2023-09-09 08:04
代号47 #02:出发
“
生物信息
已确认,黑豹启动。”黑豹,我的速度级战车,车内配置
未来的圣托里尼
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2023-09-09 02:18
单细胞数据库整理
celltypeMarker2.SingleCellPortal-BroadInstitute界面不是那么好用,数据应该含有挺多物种的,也包括人和小鼠的3.SingleCellExpressionAtlas-EMBL-EBI欧洲
生物信息
学中心
Seurat_Satija
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2023-09-08 17:32
Duplicate产生原因
Dup背景高通量测序检验流程可分为“实验室操作”(又称为“湿实验”)和“
生物信息
学分析”(又称“干实验”)两部分。
笺牒九州的怪咖
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2023-09-08 10:10
论文笔记_21范数:Efficient and Robust Feature Selection via Joint 2,1-Norms Minimization
Abstract特征选择在机器学习中非常重要,尤其是在
生物信息
学任务中。本文提出一种新的鲁棒特征选择方法,这一方法核心在于在损失函数核正则化项中联合使用21范数。
Lr_AI
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2023-09-08 01:27
生信自学历程
各位看官早上好、中午好、晚上好、凌晨好,本人是统计学学士,研究生转到了生理学,主要研究方向为表观遗传学,当然
生物信息
只是一门工具罢了。
生信大猫
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2023-09-06 15:26
kaks calculator批量计算多个基因的选择压力kaks值
欢迎来到"bio
生物信息
"的世界今天给大家带来“批量计算kaks值”的技能。关于kaks的背景知识我就不介绍了,感兴趣的自行搜索,这里直接开始讲怎么批量计算kaks值。
橙子牛奶糖
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2023-09-06 06:04
分子生物学2
生物信息
的传递——从mRNA到蛋白质蛋白质是基因表达的最终产物,它的生物合成包括:1,翻译的起始2,肽链的延伸3,肽链的终止及释放密码子的简并性按照1个密码子由3个核苷酸组成的原则,4种核苷酸可组成64
操控者
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2023-09-05 15:00
2021-04-01
度过了一个学期的大学生活,相比较于高中来说是要轻松很多,我们学的专业是
生物信息
专业,是一个前沿专业,目前的社会需求很大,但需要的是这门学科的顶尖人才。
傍晚收摊
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2023-09-04 04:20
生物数据库之专项数据库
它是关于基因、蛋白质、生化反应以及通路的综合
生物信息
数据库。由多个子库构成(图1.KEGG子库列表)。
yhh_hygge
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2023-09-03 11:30
生物基础知识---CDS,基因,Matlab
生物信息
工具箱
1.CDS(Sequencecodingforaminoacidsinprotein)蛋白质编码区2.每个基因中都有编码区与非编码区,其中真核生物编码区又含有外显子与内含子,但真核生物的基因中也有无内含子的例外.如组蛋白基因和干扰素基因就没有内含子.编码区为编码蛋白质的有效基因片段.非编码区不编码蛋白质。3.编码区是细胞DNA的一部分,基因分为:编码区,非编码区。编码区是指能够转录信使RNA的部分
素材积累
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2023-09-03 09:39
论文写作
csvtk | 命令行下表格统计分析、数据筛选、替换、整理神器
如同
生物信息
领域中的FASTA/Q格式一样,CSV/TSV作为计算机、数据科学和
生物信息
的基本格式,应用非常广泛。
生信师姐
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2023-09-03 03:18
捷报 | 求臻医学两地医学检验实验室满分通过此项室间质评
捷报近日,国家卫生健康委临床检验中心(NCCL)公布了2023年全国肿瘤体细胞突变高通量测序检测
生物信息
学分析室间质评结果,求臻医学北京、杭州两地医学检验实验室再度喜获佳绩,以满分的优异成绩通过本次考核
求小臻
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2023-09-03 00:35
求臻医学
室间质评
科技
关于样本方差为什么除以 n-1
今天上午集训摸鱼看到同学给我发的这个问题感觉挺有意思的感性理解这一部分的内容仅代表本蒟蒻没看严谨证明之前的个人见解,如果您想看严谨的证明,请翻到下一部分还是先把图放上来罢省的有人不知道讲的什么东西呃我知道这是生物竞赛的东西(不过
生物信息
学都开始教图论了我讲这玩意有什么问题
竹 子
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2023-09-02 22:38
随笔
概率论
学习
轰动学界的Nature重磅进展:生信研究迎来史诗级大爆发
2017年度人物均授予了CRISPR相关技术的突破,2020年CRISPR技术获得诺贝奖,短短不到十年时间CRISPR技术荣获最高学术荣誉随着高通量生物技术的发展,已经开发了多种组学技术来表征不同但互补的
生物信息
生信宝典
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2023-09-02 19:30
lintcode77 · 最长公共子序列【中等 动态规划】
该问题是典型的计算机科学问题,是文件差异比较程序的基础,在
生物信息
学中也有所应用。https://en.wikipedia.org
赵长辉
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2023-09-02 11:19
动态规划
算法
jupyter-lab介绍
作为一枚
生物信息
攻城狮,数据分析时经常需要写写代码和文档,相信同行对jupyter都有所了解,或者非常熟悉。
生信阿拉丁
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2023-09-02 03:03
《TCGA数据下载的终极篇》
NCI,美国国家癌症研究所)和NationalHumanGenomeResearchInstitute(NHGRI,国家人类基因组研究所)合作,在2006年建立的癌症研究项目,旨在运用高通量测序技术和
生物信息
学分析方法探究癌症
生信学霸
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2023-09-01 17:56
XP-CLR分析学习笔记
XP-CLR分析笔记
生物信息
学和遗传学是相互交织的两个学科,共同致力于解读生物体内复杂的基因信息。这些信息有助于理解物种的演化,疾病的起因,以及个体差异等方面。
生信分析笔记
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2023-09-01 10:05
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