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r语言ggplot2
R语言
和Rstudio的介绍和安装
R语言
和Rstudio的介绍和安装
R语言
的来源:R是S语言的一种实现。S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释型语言。
躺平yyds
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2022-11-27 19:53
R语言入门与数据分析
软件安装及遇到的问题
r语言
数据分析
开发语言
基于
R语言
的Lasso回归在水稻全基因组预测中的应用
基于
R语言
的Lasso回归在水稻全基因组预测中的应用0引言全基因组选择是21世纪动植物育种的一种重要的选择策略,其核心就是全基因组预测,即基于分布在整个基因组上的多样性分子标记来对育种值进行预测,为个体的选择提供依据
Dream of Grass
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2022-11-27 19:50
R语言
r语言
回归
生物信息学
R语言
for循环中sprintf函数无法输出的问题
job<-c('admin.','blue-collar','entrepreneur','housemaid','management','retired','self-employed','services','student','technician','unemployed')jobP<-function(a,b){val<-t.test(df$duration[df$job==a],df
星幻夜极
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2022-11-27 18:12
r语言
R语言
co2数据集 可视化
R中自带的co2序列描述了1959.1~1997.12年每个月的CO2含量1959.1~1997.12年每个月的CO2含量趋势plot(co2)1959.1~1997.12年每个月的CO2含量趋势存在一定的规律,一直在有规律的增加co2序列是否平稳?library(forecast)Acf(co2)Pacf(co2)基于Acf和Pacf图分析:Acf存在比较明显的自相关,co2序列不平稳基于ari
Mrrunsen
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2022-11-27 18:40
R语言大学作业
r语言
开发语言
r语言
归一化_数据变换-归一化与标准化
一般在机器学习的模型训练之前,有一个比较重要的步骤是数据变换。因为,一般情况下,原始数据的各个特征的值并不在一个统一的范围内,这样数据之间就没有可比性。数据变换的目的是将不同渠道,不同量级的数据转化到统一的范围之内,方便后续的分析处理。数据变换的方法有很多,比如数据平滑,数据聚集,数据概化,数据规范化和属性构造等。本篇文章主要介绍数据规范化,这是一种比较常用,也比较简单的方法。数据规范化是使属性数
Hu??
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2022-11-27 17:33
r语言归一化
covariance matrix
r语言
_时间序列分析|ARIMAX模型分步骤详解和R中实践
这是关于时间序列的第N篇文章,本文将介绍ARIMAX模型,简单来说就是在ARIMA的基础上增加一个外生变量。ARIMAX和ARIMA相比在理论上没有太多新的内容,所以本文直接介绍在R里怎么一步一步跑ARIMAX。在阅读这篇文章前,需要对ARIMA有一定了解,传送门在这里:0100:时间序列分析|AR(p),MA(q),ARIMA入门及R中实践zhuanlan.zhihu.com0100:时间序列分
weixin_39674414
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2022-11-27 16:20
covariance
matrix
r语言
R语言
——数据分析
R语言
——什么是数据分析数据数据:是指对客观事件进行记录并可以鉴别的符号,是对客观事物的性质、状态以及相互关系等进行记载的物理符号或这些物理符合的组合为什么要做数据分析我们可以通过数据分析的结果来指导决策数据分析的过程数据采集
齐天大荒
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2022-11-27 13:20
R语言学习日记
数据分析
r语言
基于
R语言
的数据分析报告
基于
R语言
的数据分析报告(很多同学私信反馈通过kaggle没办法下载数据集,我把数据集上传到百度云供大家取用,链接:https://pan.baidu.com/s/1S48WWmtK-BcgF3jkwMfivw
夜里惊羽
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2022-11-27 13:19
深度学习
数据分析
r语言
数据挖掘
R语言
聚类分析
文章目录系统聚类(层次聚类,Hierarchicalclustering)快速聚类(划分聚类,partitioningclustering)K-means聚类围绕中心点的划分PAM主要介绍使用
R语言
进行层次聚类
医学和生信笔记
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2022-11-27 13:19
医学统计学
r语言
医学统计学
R语言
数据分析报告 鲍鱼年龄预测
鲍鱼年龄预测一、背景与目标鲍鱼的生长在贝类家族中属于比较慢的种类.从受精卵开始,长到商品规格6-8厘米,通常需要1-4年甚至更长时间.以我国的皱纹鲍为例,大约需要近3年的生长才能达到7厘米左右.鲍鱼的生长速度随年龄的增长呈下降趋势.鲍鱼壳在生长过程中会留下类似树木年轮的生长纹.生长纹的明显与否,与其所处环境季节和摄食饵料的种类有关.在生长快速的季节,生长纹明显,距离较宽;在生长缓慢的季节则相反,生
Mrrunsen
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2022-11-27 13:48
R语言大学作业
r语言
数据分析
数据挖掘
R语言
:
ggplot2
包详解及各类精美图形绘制
文章目录1.1
Ggplot2
介绍1.2
Ggplot2
特点默认值迭代高级元素1.3
Ggplot2
映射组件layerScalecoordtheme1.4
Ggplot2
自带数据集1.5
Ggplot2
组成部分1.6
这也是计划的一部分
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2022-11-27 12:20
数据分析
r语言
开发语言
数据挖掘
LASSO-Logistic模型--基于
R语言
glmnet包
R语言
中glmnet包是比较重要且流行的包之一,曾被誉为“三驾马车”之一。
yitianguxingjian
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2022-11-27 12:20
R语言
机器学习
数据挖掘理论
r语言
岭回归
lasso
Logistic
predict函数 R_
r语言
中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现
原文:http://tecdat.cn/?p=3795tecdat.cn介绍Glmnet是一个通过惩罚最大似然来拟合广义线性模型的包。正则化路径是针对正则化参数λ的值网格处的套索或弹性网络罚值计算的。该算法速度极快,可以利用输入矩阵中的稀疏性x。它符合线性,逻辑和多项式,泊松和Cox回归模型。可以从拟合模型中做出各种预测。它也可以适合多响应线性回归。glmnet算法采用循环坐标下降法,它连续优化每
weixin_39943383
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2022-11-27 12:49
predict函数
R
r
ridge回归
R
加权最小二乘
代码
R中怎么做加权最小二乘
回归模型中截距项的意义
R语言
安装glmnet包
R语言
安装glmnet包安装glmnet包安装glmnet包正常这样安装时报错install.packages("glmnet")改为如下代码可正常安装。
Houly
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2022-11-27 12:49
r语言
算法
矩阵
R语言
如何和何时使用glmnet岭回归
这里向您展示如何在R中使用glmnet包进行岭回归(使用L2正则化的线性回归),并使用模拟来演示其相对于普通最小二乘回归的优势。最近我们被客户要求撰写关于岭回归的研究报告,包括一些图形和统计输出。岭回归当回归模型的参数被学习时,岭回归使用L2正则化来加权/惩罚残差。在线性回归的背景下,它可以与普通最小二乘法(OLS)进行比较。OLS定义了计算参数估计值(截距和斜率)的函数。它涉及最小化平方残差的总
拓端研究室TRL
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2022-11-27 12:19
拓端
拓端tecdat
拓端数据
回归
r语言
R语言
中实现广义线性模型lasso的包——glmnet
对于高维的广义线性模型,传统的是没有l1l_1l1惩罚项,有些时候我们需要加入惩罚项就得自己写优化函数。后来发现glmnet可以解决这样的问题。glmnet包在处理具有l1l_1l1和l2l_2l2惩罚项的似然函数问题是非常高效的,可以很好得利用X矩阵的稀疏性。Lasso回归复杂度由参数lambda来控制,lambda越大模型复杂度的惩罚力度越大,从而获得一个较少变量的模型。除了参数lambda,
zoujiahui_2018
·
2022-11-27 12:47
R
R语言
glmnet包拟合广义线性模型
R包glmnet是通过惩罚最大似然法拟合广义线性和类似模型的软件包。1.加载包和数据#install.packages("glmnet",repos="https://cran.us.r-project.org")library(glmnet)ls("package:glmnet")#x=matrix(rnorm(100*20),100,20)*10#y=rnorm(100)###1.加载包和数据
qq_27390023
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2022-11-27 12:47
r语言
开发语言
R语言
glmnet包lasso回归中分类变量的处理
我们在既往文章《手把手教你使用
R语言
做LASSO回归》中介绍了glmnet包进行lasso回归,后台不少粉丝发信息向我问到分类变量处理的问题,我后面查了一下资料之前文章分类变量没有处理,非常抱歉。
天桥下的卖艺者
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2022-11-27 12:17
R语言
r语言
R语言
:glmnet包重点详解及多类回归实现(lasso/岭回归/弹性网)
文章目录1.1Glmnet介绍1.2Glmnet数学表示1.3Glmnet多回归方式对比1.4Glmnet代码原理1.5Glmnet安装与载入1.6Glmnet回归使用1.7Glmnet回归结果分析1.8Glmnet回归结果可视化1.9Glmnet模型评价方法1.10Glmnet选择最佳模型1.11Glmnet预测1.1Glmnet介绍Glmnet是一个通过惩罚极大似然来适应广义线性和相似模型的软
这也是计划的一部分
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2022-11-27 12:46
数据分析
r语言
回归
机器学习
R语言
BIOMOD2模型的物种分布模拟
随着生物多样性全球大会的举办,不论是管理机构及科研单位、高校都在积极准备,根据国家林草局最新工作指示,我国将积极整合、优化自然保护地,加快推进国家公园体制试点,构建以国家公园为主体的自然保护地体系。针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题,科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特
Mr.靳靳
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2022-11-27 10:42
生态
r语言
【R-terra包|第二节】:栅格重分类、投影变换、分区统计
terra|第二节:栅格重分类、投影变换、区域统计、属性融合与提取本节将介绍基于
R语言
terra包的栅格重分类、矢量绘图、字段融合、投影变换、区域统计、属性表的提取、栅格矢量的输出等内容。
地理空间科学
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2022-11-27 10:39
R-terra包
空间数据处理
r语言
图像处理
Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型
视频:线性回归中的贝叶斯推断与
R语言
预测工人工资数据案例贝叶斯推断线性回归与
R语言
预测工人工资数据,时长09:58用PyMC3进行贝叶斯线性回归在本节中,我们将对统计
拓端研究室TRL
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2022-11-27 07:16
拓端
拓端tecdat
拓端数据
python
线性回归
开发语言
R语言
机器学习系列-决策树回归代码
在模型构建部分,二分类模型与回归模型大致相似,主要在rpart函数中多了parms参数可以设置,其值是一个list,其中可以指定分裂规则,将其设定为gini则构建CART决策树,将其设定为information则构建ID3决策树;还可以指定损失函数的权重,这个在遇到训练集样本不平衡的情况时比较有用,具体可以看下帮助文档。初始决策树构建好之后,后剪枝、输出变量重要性、树形图的操作均与回归部分类似。得
Mrrunsen
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2022-11-27 06:10
R语言大学作业
机器学习
决策树
r语言
用python调用r包
安装rpy2pipinstallrpy2加载%load_extrpy2.ipython使用r包之前%%R例如%%Rrm(list=ls())library(
ggplot2
)
Maria254
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2022-11-27 03:09
r语言
开发语言
机器人学习&工具超全指南
机械臂路径规划学习路径规划课程推荐实际学习课程-b站书籍推荐机器学习计算机视觉-3D视觉,目标检测ROS学习奥特课程ROSWIKi计算机基础学习学习指南工具篇git&GitHubCMakeshell脚本Docke
r语言
篇
路拾遗37
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2022-11-27 02:41
研究生项目学习
37のSLAM学习
37の归纳总结
机器人
学习
人工智能
SLAM
机器人工程师
R语言
ARMA,ARIMA(Box-Jenkins),SARIMA和ARIMAX模型用于预测时间序列数据
相关视频:在Python和
R语言
中建立EWMA,ARIMA模型预测时间序列在本文中,我将介绍ARMA,ARIMA(Box-Jenkins),SARIMA和ARIMAX模型如何用于预测时间序列数据。
拓端研究室TRL
·
2022-11-27 01:46
拓端
拓端tecdat
拓端数据
r语言
开发语言
matlab中一页多图,如何实现一页多图与子母图?
在R中实现一页多图,如果用R基础函数绘图,相对比较容易,如果用
ggplot2
绘图,实现起来相对比较麻烦,我给大家介绍下两种情况下的实现方法:1.R基础绘图一页多图之par函数R基础函数绘图,可以通过par
李业云
·
2022-11-26 17:59
matlab中一页多图
R语言
的分位数回归
回归是科研中最常见的统计学研究方法之一,在研究变量间关系方面有着极其广泛的应用。由于其基本假设的限制,包括线性回归及广义线性回归在内的各种常见的回归方法都有三个重大缺陷:(1)对于异常值非常敏感,极少量的异常值可能导致结果产生巨大的误差;(2)对数据的分布有着较为苛刻的要求,如果数据不符合指定的分布,结果同样是不可信的;(3)只能估计因变量的条件均值,不能估计自变量对因变量分位点的不同影响。分位数
zmjia111
·
2022-11-26 17:25
机器学习
深度学习
R语言
r语言
回归
数据挖掘
深度学习
R语言
数据统计分析与
ggplot2
高级绘图
一、
R语言
简介与数据管理1.1
R语言
介绍1.2R包安装1.3R数据读取与重构1.4dplyr包与数据编辑二、试验设计与数据分析2.1试验设计简介2.2RCB设计2.3BIB设计2.4.正交设计2.5析因设计三
zmjia111
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2022-11-26 17:54
机器学习
可视化
R语言
r语言
开发语言
回归
开源软件
深度学习
R语言
的现代线性回归
一、线性回归1.线性回归模型与模型假定2.最小二乘法方法与性质3.方差估计与模型效用4.决定系数与拟合优度5.假设检验二、多元回归1.系数估计与模型拟合2.交互作用模型3.二次模型4.预测与外推的陷阱三、模型构建1.定量与定性自变量2.定性自变量回归3.模型选择4.逐步回归四、稳健估计1.共线性与方差膨胀2.奇异值与强影响数据:失效点分析3.稳健估计量4.稳健回归的自助标准误五、通向广义线性回归1
zmjia111
·
2022-11-26 17:22
R语言
机器学习
深度学习
r语言
回归
深度学习
pytorch
[跟着NC学作图]--生存分析(Survival analysis)
主要包括转录组的组装(有参和有参)、lncRNA的鉴定及功能预测、可移动mRNA和lncRNA的鉴定、以及[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]。-
小杜的生信筆記
·
2022-11-26 15:48
R语言
绘制热图(pheatmap包)
本期介绍用
R语言
pheatmap包绘制热图。使用R自带的数据集mtcars,用热图可视化其变量间的相关关系。
大嘎嘎子
·
2022-11-26 13:54
数据可视化
r语言
开发语言
数据挖掘
数据分析
matlab聚类热图,不用 R 语言,学会这两招,科研小白也能轻松搞定聚类热图的绘制...
目前绘制热图的工具很多,像MATLAB、MeV(MultipleExperimentViewer)、GraphPadPrism、
R语言
的Heatmap等等。今天介绍两种简单的工具——Excel和He
weixin_39833469
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2022-11-26 13:23
matlab聚类热图
R语言
:pheatmap R包做聚类分析热图
1.原始数据表1:表1原始数据geneABCDEgene10.0340.3510.0640.3670.063gene20.0370.110.0560.1270.05gene30.0110.1130.0130.1060.025gene40.0210.0730.0160.0780.012gene50.0090.0860.0190.0560.016gene60.3440.0530.3270.3510.3
达尔不是贝吉塔
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2022-11-26 13:52
r语言
开发语言
R语言
pheatmap包绘制热图
热图就是使用颜色来表示数据相关性的图。能绘制热图的R包很多,今天我们来介绍pheatmap包,这个包的特点是简单易学,图片精美。废话不多说,我们先导入数据和R包library(pheatmap)bc<-read.csv("E:/r/test/heatmap.csv",sep=',',header=TRUE)这是一个西红柿的RNA测序数据(公众号回复:热图数据,可以获得数据),共有20行和20列,这
天桥下的卖艺者
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2022-11-26 13:49
R语言
r语言
聚类
机器学习
R语言
鸢尾花iris数据集的层次聚类分析
【视频】KMEANS均值聚类和层次聚类:
R语言
分析生活幸福质量系数可视化实例KMEANS均值聚类和层次聚类:
R语言
分析生活幸福质量系数可视化实例,时长06:05背景鸢尾花数据
拓端研究室TRL
·
2022-11-26 10:25
拓端
拓端tecdat
拓端数据
r语言
开发语言
R语言
之K-mean聚类分析
K-mean聚类是很基础的算法,在本科阶段大家都会学,如何通过
R语言
自己写K-mean算法,话不多说,上代码,算法流程和函数解释代码后K_means=max.iter){changed<-FALSEbreak
努 力 的 小 白
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2022-11-26 07:55
r语言
聚类
k-means
kmeans
r语言
kmeans聚类_
R语言
做K均值聚类的一个简单小例子
参考链接https://www.guru99.com/r-k-means-clustering.htmlhttps://datascienceplus.com/k-means-clustering-in-r/https://www.datanovia.com/en/lessons/k-means-clustering-in-r-algorith-and-practical-examples/k均值
weixin_39785814
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2022-11-26 07:23
r语言kmeans聚类
k均值聚类算法案例
r语言
iris_大数据小白入门——KMeans聚类算法
导读K-Means聚类算法也称k均值聚类算法,是集简单和经典于一身的基于距离的聚类算法。它采用距离作为相似性的评价指标,即认为两个对象的距离越近,其相似度就越大。该算法认为类簇是由距离靠近的对象组成的,因此把得到紧凑且独立的簇作为最终目标。K-Means聚类算法作为基于划分聚类算法的一个典型算法,在数据挖掘中被广泛应用,经常被用来作为预处理步骤。本章实验还是以鸢尾花数据为例,进行K-Means聚类
黄兢成
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2022-11-26 07:52
k均值聚类算法案例
r语言iris
R语言
实现聚类kmeans
作者:张丹,
R语言
中文社区专栏特邀作者,《R的极客理想》系列图书作者,民生银行大数据中心数据分析师,前况客创始人兼CTO。个人博客http://fens.me,Alexa全球排名70k。
R语言中文社区
·
2022-11-26 07:51
R语言
聚类可视化 fviz_cluster
提供基于
ggplot2
的分区方法的优雅可视化,包括kmeans[stats包];pam、clara和fanny[集群包];dbscan[fpc包];Mclust[mclust包];HCPC[FactoMineR
Mrrunsen
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2022-11-26 07:19
R语言大学作业
聚类
r语言
数据挖掘
用Python实现机器学习:随机森林
之前,我一直使用
R语言
实现随机森林等机器学习模型,在遇到报错情况时想和身边朋友交流,发现一个很尴尬的事情,擅长使用R的朋友不懂机器学习,而擅长机器学习的只用Python。
suomi2022
·
2022-11-26 02:09
python
机器学习
随机森林
BIOMOD2模型、MaxEnt模型物种分布模拟,生物多样性生境模拟,论文写作
目录①基于
R语言
BIOMOD2模型的物种分布模拟实践技术应用②基于
R语言
、MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作③基于MAXENT模型的生物多样性生境模拟与保护优先区甄选
WangYan2022
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2022-11-26 01:57
生态
BIOMOD2模型
MaxEnt模型
物种分布模拟
R语言
使用教程(二)——Rstudio改文件默认路径
Windows系统
R语言
使用教程(二)——Rstudio改文件默认路径打开rstudio-->Tools-->GlobalOptions-->General-->Browser-
Linglingge2000
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2022-11-25 22:36
r语言
开发语言
R语言
使用教程(一)——R和Rstudio安装
文章目录Windows系统
R语言
使用教程(一)——R和Rstudio安装1.r的下载及安装2.rstudio的下载及安装Windows系统
R语言
使用教程(一)——R和Rstudio安装1.r的下载及安装镜像下载网址改存储路径
Linglingge2000
·
2022-11-25 22:06
r语言
手把手神经网络讲解和无调包实现系列(2)Softmax回归【
R语言
】【小白学习笔记】
Softmax回归目录一·模型讲解1假设函数【HypothesisFunction】2激活函数【ActivationFunction】3损失函数【LossFunction】4随机梯度下降法推导【StochasticGradientDecent】5算法总结二·数据三·模型实现在第一期我们讲解并实现了最基本的线性回归,这一期我们会紧接着从回归问题讲到分类问题,而这时我们需要在线性回归模型的基础上增添一
美国小土豆
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2022-11-25 20:31
r语言
机器学习
人工智能
神经网络
深度学习
R语言
回归及混合效应模型及贝叶斯实现
回归分析是科学研究中十分重要的数据分析工具。随着现代统计技术发展,回归分析方法得到了极大改进。混合效应模型(Mixedeffectmodel),即多水平模型(Multilevelmodel)/分层模型(HierarchicalModel)/嵌套模型(NestedModel),无疑是现代回归分析中应用最为广泛的统计模型,代表了现代回归分析主流发展方向。混合效应模型形式灵活可以应对现代科学研究中各种数
xiao5kou4chang6kai4
·
2022-11-25 20:00
环境
生态
统计
r语言
回归
开发语言
基于
R语言
的现代贝叶斯统计学方法实践技术
贝叶斯统计学是一门基本思想与传统基于频率思想的统计学完全不同的统计学方法;它以其灵活性和先进性在现代的统计学中占据着重要的地位。贝叶斯统计学是开展科学研究不可缺少的重要手段,但是,因为其思想、技术和方法都与传统统计学有着较大区别;且其计算中涉及马尔科夫、蒙特卡罗和吉布斯采样等现代计算方法,对使用者经验和能力构成了很大的挑战。内容详情:专题一贝叶斯统计学的思想与概念1、信念函数与概率2、事件划分与贝
weixin_贾楠
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2022-11-25 19:30
现代贝叶斯
混合效应模型
R语言meta分析
结构方程
r语言
经验分享
支持向量机
随机森林
逻辑回归
快速了解
R语言
1R的历史
R语言
来自S语言,是S语言的一个变种。S语言由RickBecker,JohnChambers等人在贝尔实验室开发,著名的C语言、Unix系统也是贝尔实验室开发的。
Guanghui Yu
·
2022-11-25 19:29
R
r语言
统计学
统计模型
r语言
面板数据回归_工具&方法 | “名牌包”:面板、时间序列模型常用
R语言
包...
R语言
包,已经实现了现代计量经济学的很多统计分析功能,下面从面板数据模型和时间序列模型简要介绍
R语言
相关程序包:1.面板数据模型,Paneldatamodels,23个包2.时间序列模型,Timeseriesdataandmodels
留德小罗
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2022-11-25 19:58
r语言
面板数据回归
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