ggplot2 第41页

[R] ggplot2 legend,axis

坐标轴参考http://blog.csdn.net/bone_ace/article/details/47427453#标签修改命令scale_x_continue(breaks=c(1:20),labels=c(1:20),limits=c(1,20)##limits设置区间大小，breaks设置刻度位置，labels设置刻度图例参考https://github.com/tidyverse/gg

_CelesteHuang_·2020-02-29 03:22

R语言，ROC曲线，deLong test

绘制ROC曲线利用R语言绘制ROC曲线是非常容易的事情，提前导入好pROC包和ggplot2包，只需要三行代码：1、读取数据data<-read.csv('test.csv',header=FALSE)

历冰雪_10·2020-02-28 17:36

ggplot2（6）标度、坐标轴和图例

6.1简介标度控制着数据到图形属性的映射。标度将我们的数据转化为视觉上可以感知的东西：例如大小、颜色、位置和形状。标度也为我们提供了读图时所使用的工具：坐标轴和图例。执行标度的过程分为三步：变换、训练和映射。标度可以粗略地分为四类：位置标度、颜色标度、手动离散型标度以及同一型标度。6.2标度的工作原理标度的定义域即数据空间，值域即图形属性空间。当输入变量是离散型时，标度的定义域是某些值组成的集合，

叮叮当当sunny·2020-02-27 12:00

R语言中的坐标轴处理(ggplot2)丨数析学院

问题在R中，如何更改图表坐标轴的次序或方向？指南注意：在下文的例子中，任何有关于图表y轴的处理方法都可以类似的运用到图表的x轴上。首先构建一个用于演示处理的经典箱线图，图中的数据源自内置的数据集PlantGrowth。交换X轴与Y轴接下来，我们要演示如何实现x轴与y轴的互换（将x轴作为纵轴，y轴作为横轴）：未完待续：课程内容较多，请复制链接通过电脑学习，获得最佳学习效果。http://dataca

Datartisan数据工匠·2020-02-27 01:41

R数据分析实战--泰坦尼克号

library(ggplot2)library(VIM)library(plyr)library(dplyr)library(stringr)载入数据TrainData<-read.csv('..

晨语凡心·2020-02-26 19:39

可视化学习笔记(一)：ggplot2：条形图

require(ggplot))(install.packages("ggplot2"))#if(!

100gle·2020-02-26 18:54

ux2017·2020-02-26 04:46

ggplot2（5）工具箱

5.1简介ggplot2的图层化架构鼓励我们以一种结构化的方式来设计和构建图形。本章旨在概述可用的几何对象和统计变换，在文中逐个详述。每一节都解决一个特定的作图问题。

叮叮当当sunny·2020-02-25 10:00

（八）高级绘图——初窥ggplot2

ggplot2包的目的是提供一个全面的、基于语法的、连贯一致的图形生成系统，允许用户创建新颖的、有创新性的数据可视化图形。1、简介ggplot2语法下面将从一个例子来看看ggplot2的基本语法。

井底蛙蛙呱呱呱·2020-02-25 09:48

ggplot2-ggpie

data=read.table("6_fo_go.txt.Level2.count.txt",header=F,sep="\t",fileEncoding="UTF-16")#读取文件读取不出来考虑下文件编码问题library("magrittr")library("ggpubr")#data[,2]=data[,2]*100/sum(data[,2])#求百分比数字df<-data.frame(

汪汪2017·2020-02-25 03:22

ggplot绘图的艺术-3：映射：将数据变量对应到图形属性

1.映射在上一节练习ggplot绘图的艺术-2：ggplot2的绘图思想中，我们已经涉及到了映射的概念。所谓映射，就是数据集中的数据关联到相应的图形属性过程中一种对应关系。

曹务强·2020-02-24 22:33

GLM - Chapter 5

它是基于ggplot2包开发的，它同时还提供了一系列geom方法和一些已经打包好的绘图函数。接下来我们将举几个例来说明这个包。

Datartisan数据工匠·2020-02-23 07:18

可视化学习笔记(三)：ggplot2：散点图

1、简单散点图使用geom_point()函数即可绘制，并且在映射中可以使用以下映射参数：shape：指定形状colour：填充（需要注意的是，fill对point可能不起作用）size：修改大小2、样式修改2.1颜色修改颜色的手动修改使用以下函数：scale_colour_manual()scale_colour_brewer()2.2形状修改使用scale_shape_manual()函数可以

100gle·2020-02-22 20:08

可视化学习笔记(二)：ggplot2：折线图

1、简单折线图折线图的x既可以对应离散性变量，也可以对应连续型变量当x对应因子变量时，必须使用group=1映射确保数据点属于一个分组；否则可能会报错BOD1<-BODBOD1$Time<-factor(BOD1$Time)ggplot(BOD1,aes(x=Time,y=demand,group=1))+geom_line()2、多重折线图（分组折线图）在指定x和y映射参数的同时，将另一个离散型

100gle·2020-02-22 06:27

R语言绘制概率密度图

一般而言，在R语言中，可以使用ggplot2绘制常见的统计图形，本文的方式稍微有所不同，先介绍lattice如何绘制概率密度图，然后再介绍通过ggplot2如何绘制概率密度图。

leengsmile·2020-02-21 22:17

ggplot2（4）用图层构建图像

4.1简介qplot()的局限性在于它只能使用一个数据集和一组图形属性映射，解决这个问题的办法就是使用图层。每个图层可以有自己的数据集和图形属性映射，附加的数据元素可通过图层添加到图形中。一个图层由五个部分组成：数据：必须是一个数据框；一组图形属性映射，用来设定数据集中的变量如何映射到该图层的图形属性；几何对象，用来指定在图层中用哪种几何对象来绘图；统计变换，返回一个包含新变量的数据框；位置调整，

叮叮当当sunny·2020-02-21 21:00

ggplot2（3）语法突破

3.1简介图形图层语法基于Wilkinson的图形语法，并在其基础上添加了许多新功能，使得图形更有表现力，并能完美地嵌入到R的环境中。图形图层语法使得图形的重复更新变得简单——每次只更新一个特征。该语法的价值还在于它从更高的视角审视了图形的构成，它认为图形的每个组件都是可以修改的。因此，这就给了我们一个作图的基本结构框架，使得图形的绘制更为容易。对于特殊的问题，我们还可以利用它很方便地定义新图形。

叮叮当当sunny·2020-02-21 18:00

ggplot2（2）从qplot开始入门

2.1简介qplot的意思是快速作图（quickplot）。qplot是一种快捷方式，如果您已习惯于使用基础plot()，则可以使用它。它可以使用一致的调用模式快速创建许多不同类型的图。qplot(x,y,...,data,facets=NULL,margins=FALSE,geom="auto",xlim=c(NA,NA),ylim=c(NA,NA),log="",main=NULL,xlab=

叮叮当当sunny·2020-02-21 12:00

【r<-数据分析】使用dplyr（1）：介绍与filter操作

准备这部分我们聚焦于如何使用dplyr包，除ggplot2的另一个tidyverse核心成员。我们将使用nyclights13数据包解释关键的概念并使用ggplot2帮助理解数据。#导入包l

王诗翔·2020-02-21 12:22

【r<-包】图形沟通：ggplot2

准备工作library(tidyverse)#>─Attachingpackages──────────────────────────────────────────tidyverse1.2.1─#>✔ggplot23.0.0

王诗翔·2020-02-21 07:11

ggplot2（1）简介

1.1简介ggplot2是一个用来绘制统计图形（数据图形）的R软件包，与其他大多数的图形软件包不同，ggplot2是由其背后的一套图形语法所支持的。

叮叮当当sunny·2020-02-20 13:00

无聊的人用ggplot2画篮球场

NBA数据分析中用来描述球员的投篮分布经常会用篮球场加散点图的形式，这样似的那么用R的ggplot2能不能做一个简易版的投篮分布图呢？答案当然是肯定的。首先就要解决如何画篮球场。

牧羊的男孩儿·2020-02-18 22:54

ggplot2回顾(8): 标度

其实在看这一章之前，我还不怎么能理解“标度”这个词到底指什么。现在有些想法了，比如将一个离散型变量向颜色这个图形属性做映射，变量有几种值就会选用几种颜色，问题是“用什么颜色？”这就是标度，它被用来完成图形属性映射之后的一些事情。再比如，将一个连续型变量映射给x轴，x轴上面哪些地方有无刻度，x轴的显示范围都需要“标度”来控制。这张图很有用，你能很清楚的知道图形属性和变量类型一定时，默认的标度是什么，

presentlife·2020-02-18 12:08

ggplot2|详解八大基本绘图要素

本文首发于微信公众号“生信补给站”，期待您的关注！！！"一张统计图形就是从数据到几何对象(geometricobject,缩写为geom,包括点、线、条形等)的图形属性(aestheticattributes,缩写为aes,包括颜色、形状、大小等)的一个映射。此外,图形中还可能包含数据的统计变换(statisticaltransformation,缩写为stats),最后绘制在某个特定的坐标系(c

生信补给站·2020-02-18 07:04

Data Science with R in 4 Weeks - Week 1 - Day2

boxplot首先需要安装ggplot2这个packageinstall.packages("ggplot2")library("ggplot2"

慢思考快思考·2020-02-17 20:34

ggplot2 style plotting in Python

R是一门数据科学非常好的工具，但是由于一些原因还是需要学习一下其他工具，比如python，python很好，pecificallypandasandthewonderfulscikit-learn。散点图Rggplot(mtcars,aes(x=hp,y=mpg))+geom_point()pythonggplot(mtcars,aes(x='hp',y='mpg'))+\geom_point()

Liam_ml·2020-02-17 14:17

#方法杂谈#生存曲线分析及绘制(二)

昨天做的生存曲线是黑白的，今天使用ggplot2做彩图：#载入ggfortity包后，使用ggplot2::autoplot可以做生存彩图：library(ggfortify)library(survival

生信杂谈·2020-02-17 01:41

ggplot2学习笔记系列之主题（theme）设置

凡是与数据无关的图形设置可以归为主题类，ggplot2中主题设置十分多，根本不可能讲解完，只能稍微讲点皮毛，灵活运用才是关键，本文只是总体上略作介绍。

taoyan·2020-02-16 13:10

【r<-方案】TCGA表达矩阵长宽格式变换

这里介绍实际处理TCGA表达矩阵数据（同样适用于其他相同格式的数据）时的一个问题，如何把类似矩阵的数据快速变换为支持ggplot2绘图的长格式。

王诗翔·2020-02-16 03:30

2018-08-22把gglot2默认图变漂亮

来自网络博客https://www.jumpingrivers.com/blog/styling-ggplot2-r-graphics/Stylingggplot2graphicsI

iColors·2020-02-15 22:05

Day14-生信人的20个R语言习题第11-20题-2019-06-23

density，然后画所有样本的这些图参考：http://bio-info-trainee.com/tmp/basic_visualization_for_expression_matrix.html理解ggplot2

天涯清水·2020-02-15 13:00

R语言常用的数据处理的包(1)

dplyr包dplyr包是HadleyWickham(ggplot2包的作者，被称为‘一个改变R的人’)的杰作，dplyr可用于处理R内部或者外部的结构化数据，相较于plyr包，dplyr专注接受dataframe

z赵云飞·2020-02-15 05:30

三种可视化方法，手把手教你用R绘制地图网络图！

下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或ggraph包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。在对地理位置以及位置的连接关系进行可视化时，还可以在图中展示一些属性。

大数据文摘·2020-02-15 03:38

Day9-生信人的20个R语言习题-2019-06-18-未完

语言习题请先看：生信人的linux考试安装一些R包：数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包：ggplot2

天涯清水·2020-02-14 20:35

生信技能树R语言作业-高级

为达到更好的浏览效果及查看全部图片，可转至RPubs1安装一些R包数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包：ggplot2rm

Y大宽·2020-02-14 19:54

ggplot2绘制Pathway富集分析气泡图

>library(ggplot2)#载入ggplot2>pathway=read.table("KEGG.enrichment.txt",,header=T,sep="\t")#读取数据>pathway

Biodata_佰德生物·2020-02-14 07:36

[原]深入对比数据科学工具箱：Python3 和 R 之争[2020版]

R从诞生开始就继承了S语言的统计特性，经历了野蛮生长，2009年ggplot2和data.table的横空出世大幅提升数据可视分析的效率，极大冲击了数据科学早期市场，要知道当时数据科学还主要被商业软件Excel

HarryZhu·2020-02-14 00:22

从一个图的实战来升华 R 语言 ggplot2 可视化技能

首先我是这是我日常逛twitter看到的，然后我又是一个搬运工，放最前面的链接来源：twitter链接：https://twitter.com/FournierJohanie/status/1161454327296339968代码链接：‘bulletgraph’ougraphiqueàpuce涉及的函数readr::read_csvdplyr::glimpse：适合用来查看函数的类信息，没接触过

二货潜·2020-02-13 20:29

ggplot2高级:使用ggproto构建自己的图层(二)

Stat参数一个更加复杂的"stat"会做一些计算。我们可以通过实现一个简单版本的geom_smooth来了解。我们将会创建一个新的图层StatLm（继承自Stat）和一个的图层函数stat_lm():#基于ggproto创建StatLmStatLm<-ggproto("StatLm",Stat,required_aes=c("x","y"),compute_group=function(data

徐洲更hoptop·2020-02-13 08:07

2019-10-20 -- 生信人的20个R语言习题详解11-20题

density，然后画所有样本的这些图参考：http://bio-info-trainee.com/tmp/basic_visualization_for_expression_matrix.html理解ggplot2

程良平·2020-02-12 13:40

R语言与医学统计图形-【12】ggplot2几何对象之条图

ggplot2绘图系统——几何对象之条图（包括误差条图）1.条图格式：geom_bar(mapping=,data=,stat='count',#统计变换默认计数position='stack',#默认堆栈

生物信息与育种·2020-02-11 19:20

R语言与医学统计图形-【20】ggplot2图例

ggplot2绘图系统——图例：guide函数、标度函数、overrides.aes参数图例调整函数guide_legend也属于标度函数，但不能单独作为对象使用，即不能如p+guide_legend(

米源MY·2020-02-11 19:19

R语言与医学统计图形-【23】ggplot2坐标系转换函数

ggplot2绘图系统——坐标系转换函数包括饼图、环状条图、玫瑰图、戒指图、坐标翻转。笛卡尔坐标系（最常见）。ArcGIS地理坐标系（地图）。Cartesian坐标系。polar极坐标系。

生物信息与育种·2020-02-11 19:00

主成分分析(PCA)基本原理及分析实例

之前我们介绍了使用ggplot2作PCA图的方法，本期讲下如何进行PCA分析。主成分分析（PCA）是一种数据降维技巧，它能将大量相关变量转化为一组很少的不相关变量，这些无关变量称为主成分。

生信杂谈·2020-02-11 00:36

《ggplot2：数据分析与图形艺术》笔记2：从qplot开始入门

1.什么是qplotqplot的意思是quickplot（快速作图），利用qplot我们可以非常方便地绘制各种图形。有时在其他作图系统中需要好几行代码才能搞定的事情，在qplot()中只需要一行代码就可以搞定。通过?qplot()命令查看qplot()的帮助文档：使用方法：qplot(x,y=NULL,...,data,facets=NULL,margins=FALSE,geom="auto",x

曹务强·2020-02-10 13:36

ggplot -折线图

ggplot真的让人上头..............上数据吧折线图数据library(xlsx)library(rJava)library(ggplot2)#4月1日h4_1=read.xlsx("C:

多美丽很美丽·2020-02-09 22:49

R package——dplyr（一）

首先我们先了解一下它的作者，著名的HadleyWickham，其作品包含强大的EDA工具包ggplot2，重命名工具包reshape2等……OS：一个“等”字，多少辛苦，多少汗水……通过数据从根本上了解世界真的是一件非常

iShareOne·2020-02-09 07:50

使用ggupset画韦恩图

今天看见Y叔推荐了ggplot2风格的upsetplot——

你猜我菜不菜·2020-02-09 00:54

日常记录：R语言的一些计算和应用

1.把数据框按某列排序2.对向量排序3.对向量排序并取出累加和在前90%的元素4.处理数据并绘制散点图（ggplot2，数据过滤）5.合并两个向量，去重，计数6.merge函数，按指定列合并数据框7.统计向量中元素的频次

bio_橡树·2020-02-08 23:05

钻石与价格预测

本课的目标是创建钻石价格的预测模型ScatterplotReviewlibrary(ggplot2)ggplot(aes(x=carat,y=price),data=diamonds)+xlim(0,quantile

esskeetit·2020-02-08 22:14

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