ggplot2

R IN ACTION SELF-TUTORIAL-19 ggplot2绘制带误差棒的柱状图 2020-06-13

数据表的格式为：image.pnglibrary(ggplot2)#ex<-read.csv(file.choose(),header=T)#会跳出选择框---选择存有数据的csv文件head(ex)#
RashidinAbdu·2020-06-16 23:52

shinyGEO分析GEO数据

参考这篇install.packages(c("shiny","survival","shinyBS","GGally","ggplot2","shinyAce","knitr","rmarkdown"
没有猫但是有猫饼·2020-06-03 10:55

ggplot2相关Q&A（持续更新）

Q1：geom_text_repel()函数给点图上的点添加标签，但是图例中的色块中出现字母"a"？图例中出现字母aA1：在geom_text_repel()函数中加一句show.legend=FALSE，也就是写成下方p+geom_text_repel(data=drawdata,aes(x=GFOLD,y=log2fdc,label=label),show.legend=FALSE)
没有猫但是有猫饼·2020-05-31 10:24

利用R包ggmsa进行多序列比对_2020-05-31

/ggmsa")##2.安装和导入R包#install.packages("ggmsa")library(ggmsa)library(ggplot2)##3.R包简要信息help(package="ggmsa
知无牙·2020-05-31 09:20

ggplot2学习day1

使用书籍：R数据可视化手册快速索引1.散点图qplot(mydata$Confirmed,mydata$Deaths)ggplot(mydata,aes(x=Confirmed,y=Deaths))+geom_point()推荐使用后者5.15.1.png2.折线图ggplot(mydata,aes(x=Confirmed,y=Deaths))+geom_line()ggplot(mydata,a
Silmarillion123·2020-05-28 16:42

《ggplot2数据分析与图形艺术》学习笔记 -- 第五章

第五章工具箱5.1简介本章列举了ggplot2中大量几乎对象和统计变换的一部分，并把它们按照用途进行细分。
生信摆渡·2020-05-19 16:47

多种动态图的绘制（R语言篇）

一、动态条形图1.1加载包library(gapminder)library(ggdark)library(ggplot2)library(gganimate)1.2加载数据集原始数据：使用gapmin
枫璃·2020-05-08 13:15

ggplot2||图层添加特定斜率的直线并显示对应图例

需求描述上次内容讲述了在做好的图层中添加特定的阴影区，来显示着重突出的部分。本次内容学习一下在图层中添加特定斜率的直线并在图例中显示，我们知道添加特定斜率的直线一般分为水平线geom_hline，垂直线geom_vline和特定斜率的直线geom_abline，添加对应的图例诸如scale_shape_manual，scale_linetype_manual,scale_color_manual,
CopLee·2020-05-06 10:54

[R语言]数据可视化的最佳解决方案：ggplot2

本篇从R的角度介绍如何使用ggplot2包，首先给几个我觉得最值得推荐的理由：采用“图层”叠加的设计方式，一方面可以增加不同的图之间的联系，另一方面也有利于学习和理解该package，photoshop
TOMOCAT·2020-05-03 19:30

R包biomaRt: 转换ID、注释基因、GO通路

从我写的RNA-seq摸索：4.edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释中提取出来这部分，方便以后修改补充参考这篇1我们利用useMart(
没有猫但是有猫饼·2020-04-21 10:14

ggplot2 绘制带星号和 Pvalue 值的相关系数热图

ggplot2绘制相关系数热图加显著性*和Pvaue值参考：哪里不会搜哪里，哈哈哈其实归根到底就是全文要敲用判断和paste()或者paste0()tidyverse::case_when()factor
热衷组培的二货潜·2020-04-19 17:55

phyloseq: Explore microbiome profiles using R(8)

本节主要是在PhyloseqTutorials学习Powerfultreegraphicswithggplot2的功能这个页面演示了通过plot_tree函数在phyloseq包中创建的系统发生树的示例
超人快飞·2020-04-18 18:09

TCGA_09

GEO0.背景火山图就是ggplot2点图KEGG富集分析BgRatio（background）：该通路总基因/收录KEGG的总基因GeneRatio：输入的差异基因数中属于该通路的/输入的所有差异基因人与动物
沈住氣·2020-04-18 10:47

R语言笔记——使用ggplot2绘制风玫瑰图（南丁格尔玫瑰图）

新冠肺炎全球疫情形势而后面又看到1篇微信公共号推文，才知道这种图形叫“风玫瑰图”，并介绍了如何使用ggplot2绘制新冠疫情的风玫瑰图。
Snown123·2020-04-16 22:48

R-ggpmisc|回归曲线添加回归方程，R2，方差表，香不香？

一载入数据和R包使用内置数据集library(ggplot2)#加载ggplot2包library(dplyr)#加载dplyr包library(ggpm
生信补给站·2020-04-16 21:00

数据可视化——一文入门ggplot2

数据的构造3、映射和代码风格4、添加几何对象4.1添加单个几何对象4.2分类设置颜色、形状、大小4.3设置整体的颜色形状大小4.4添加多个几何对象5、分层6、总结0引言之前在R语言分组画条形图一文中使用过ggplot2
统计学小王子·2020-04-16 13:36

R语言之可视化⑤R图形系统

==================================R中有不同的图形包可用于可视化您的数据：1)Rbasegraphs,2)LatticeGraphs(Sarkar2016)and3)ggplot2
柳叶刀与小鼠标·2020-04-14 01:41

R语言之可视化（20）ggradar雷达图

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图
柳叶刀与小鼠标·2020-04-14 00:45

TCGA_06

ggplot2作图绘图分面时如果需要制定行数：facet_wrap(~列名,nrow=行数)查询某包的所有函数：ls("package:ggplot2")#返回的是一个字符串为什么有时ggplot2代码在控制台会有两个加号
沈住氣·2020-04-14 00:25

在线绘制桑基图

http://112.125.26.206:3001/alluvial-diagram/现在许多文章都利用桑基图来展示ceRNA网络、功能富集等图，也有很多R包专门可以用来画桑基图，不过小编在这里发现ggplot2
呆呆聊生信·2020-04-13 21:59

R语言之可视化①⑧子图组合patchwork包

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图
柳叶刀与小鼠标·2020-04-13 13:59

【r<-包|绘图】使用lattice进行高级绘图

lattice与ggplot2正是基于grid构建，它们都有自己独特的图形语法。我当前使用的主要是ggplot2，base画图基本不用，这里学习下lattice包并想后续深入学习绘图的底层原理与实现。
王诗翔·2020-04-12 17:24

R语言之可视化（26）ggplot2绘制饼图

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图
柳叶刀与小鼠标·2020-04-12 17:58

R语言之可视化①⑦调色板

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图
柳叶刀与小鼠标·2020-04-12 13:17

《R数据科学》|| 1-3章ggplot2与dplyr探索

第一章：使用ggplot2进行数据可视化ggplot()，在此函数种添加的映射会作为全局变量应用到图中的每个几何对象种。图层geom_point点图层映射数据
Dawn_WangTP·2020-04-11 23:17

R语言生态学数据分析

在生态学研究中，越来越多的研究采用Ｒ语言做为数据分析的工具，在这里整理常用生态学数据分析代码，供参考．物种组成柱形图#载入相应的包#如果未安装，请按下行代码安装#install.package(c("ggplot2
lazy虎·2020-04-11 23:47

数据可视化-常用工具篇

1、R之ggplot2(*图片来自百度)ggplot可谓是生信用到最多的绘图工具，具体请参考：官方站点：http://ggplot2.tidyverse.org绘图教程参考：https:
爱上生物大数据·2020-04-11 18:45

R语言之可视化①误差棒

语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续===============================================本教程介绍如何使用R软件和ggplot2
柳叶刀与小鼠标·2020-04-11 06:46

R语言之可视化①①热图绘制heatmap

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图
柳叶刀与小鼠标·2020-04-10 21:59

如何画出漂亮的插图

https://www.zhihu.com/question/21664179把知乎上这个回答保存下来足足200多页，决定花一下午时间好好看看笔记1统计学中绘图可以用python的seaborn和R的ggplot2
电信carry·2020-04-09 20:36

R绘图的生物学家（6）：Plot anything

代码解释1.数据导入和清洗整理#之前已经完成了这部分的解释#library(ggplot2)theme_set(theme_gray(base_size=18))#Loadingthedatafilename5000
lxmic·2020-04-09 13:19

条形图和折线图的绘制（ggplot2）丨数析学院

指南：使用ggplot2来绘制统计图，数据应该是dataframe(并且比较推荐行数比列数多的情况下使用)。如果你的数据需要重新整理，这里可以参考以便获得更多信息。
Datartisan数据工匠·2020-04-08 13:29

【R】ggplot2绘图radical stacked bar chart

今天花一天时间画了一张图：先上成品ScreenShot2017-02-24at8.09.25PM.png代码参考：http://stackoverflow.com/questions/24872193/circular-stacked-bar-plot-in-r主要思路不变，分7个步骤，Step0:peraparedatafamilyitemscoretimevalueX1Morris10x1.b
_CelesteHuang_·2020-04-08 10:07

分区散点图脚本（R）

散点图归类作图脚本：图例：RB.RNA_PEP_Quadrant.png代码：library(ggplot2)b$name.R"||die$!
正踪大米饭儿·2020-04-07 23:30

R语言之可视化⑥R图形系统续

语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续======================================ggplot2
柳叶刀与小鼠标·2020-04-07 06:33

Data Science with R in 4 Weeks - Week 2 - Day1

ggplot2重点介绍一下ggplot2，作图中非常常用的一个命令。ggplot2提供非常强大的图形功能。
慢思考快思考·2020-04-06 23:39

【r<-包】ggplot2拼图包patchwork推荐与使用

patchwork是基于ggplot2的拼图包，因为ggplot2本身没有强大的拼图语法，而一般使用的gridExtra与cowplot的拼ggplot2图形都存在不少问题。
王诗翔·2020-04-06 18:27

【r<-绘图|ggplot2】绘制均值的误差棒

方案想要用ggplot2绘制图形，数据必须是数据框形式，而且是长格式（相对于宽格式）。如果你的数据需要重构，请参考thispage获取更多信息。示例数据下面的示例将使用ToothGrowth数据集。
王诗翔·2020-04-06 10:02

全栈 - 13 ggplot2 在R中进行可视化

这是全栈数据工程师养成攻略系列教程的第十三期：13ggplot2在R中进行可视化。我们已经具备了一定的代码基础，现在不妨来了解下数据可视化，从生动的图形中更好地感受数据之美。
宏伦工作室·2020-04-05 07:56

编程语言 | R代码风格

这里，我们学习的是多个知名R包(dplyr,ggplot2)
徐洲更hoptop·2020-04-05 01:08

基于R语言绘制坐标轴截断图

搜索截断图绘制的方法，有根据Excel绘制的，但是感觉操作繁琐；这里根据网上资料总结基于R的3种方法：分割+组合法，如基于ggplot2,利用coord_cartesian()将整个图形分割成多个图片,
六六_ryx·2020-04-04 17:34

北理珠大学生体质测试及健康状况的分析

首先对数据进行清洗与整理，运用R软件中的ggplot2包等，对我校大学生体质测试的各个指标进行描述性分析。然后对体质测试各个指标进行相关性分析和聚类分析，可分为3类。
极客阿宝·2020-04-03 17:22

ggplot2学习笔记系列之利用ggplot2绘制条形图

TaoYan简介条形图可以说是我们最常用的数据可视化方法了，通常用于展示不同分类条件下（在x轴上）某个数值型变量的取值（y轴上）。绘制条形图时需要特别注意的一个细节是条形图的条形高度有时表示的是数据集中变量的频数，有时表示的则是变量本身。本文将会介绍这两类条形图的绘图技巧。绘制条形图使用ggplot()函数与geom_bar(stat="identity")，绘制条形图，我们将利用gcookboo
taoyan·2020-04-03 10:21

R语言可视化手册学习笔记

library(tidyverse)##─Attachingpackages───────────────tidyverse1.2.1─##✔ggplot23.1.0✔purrr0.3.2##✔tibble2.1.1
xhog·2020-04-03 01:18

DESeq2和TopGO的R代码

library(DESeq2)library(ggplot2)#library(ggrepel)raw.data11,]#dim(raw.data1)#raw.data1<-replace(raw.data1
xie186·2020-04-02 09:32

ggplot2学习笔记之图形排列

R语言基本绘图函数中可以利用par()以及layout()来进行图形排列，但是这两个函数对于ggplot图则不太适用，本文主要讲解如何对多ggplot图形多页面进行排列。主要讲解如何利用包gridExtra、cowplot以及ggpubr中的函数进行图形排列。绘制图形#loadpackageslibrary(gridExtra)library(cowplot)library(ggpubr)#dat
taoyan·2020-04-02 01:53

解决R语言绘图中的中文乱码问题

还一种是用第三方绘图包，例如ggplot2和lattice这样的绘图包，要在这两种情况下都能正常显示中文，操作方式是不一样的。
混沌边缘的伊卡洛斯·2020-03-31 10:36

R语言之可视化（20）之geom_label（）和geom_text（）

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图
柳叶刀与小鼠标·2020-03-31 04:05

在R中调整图像颜色 (ggplot2)丨数析学院

问题：在R中，如何使用ggplot2来调整数据图像中的颜色？指南：ggplot2中默认的颜色配置都具有相等的亮度，这有时会使得色块间难以区分，对于色盲朋友们来说，这是十分不友好的。
Datartisan数据工匠·2020-03-30 23:49

[译文]——R语言中使用ggplot2进行网格图形绘制

原文链接:http://www.statmethods.net/advgraphs/ggplot2.htmlggplot2是由HadleyWickham创建的提供了强大的图形语言来用于创建复杂而优雅的绘图
Mr_dvbkhm·2020-03-30 19:39
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