ggplot2

ggplot2 图形的反转

最近要绘制一个条形图，但是坐标轴的名称比较长，图形出来之后很多名字都重叠了，类似这样：image.png所以，想着把图形翻转以下，将特征的名称放到y轴。实现的方法很简单，在绘图的后面加上coord_flip()就可以了。ggplot(data=MD,aes(x=genre))+geom_bar()+ggthemes::theme_clean()+theme(axis.text.x=element_
Liam_ml·2020-02-08 16:39

使用ggplot2和ggrepel包做火山图

HadleyWickham男神的ggplot2包以及tidyverse超级大包真是让人膜拜！
你猜我菜不菜·2020-02-06 23:36

ggplot2高级:使用ggproto构建自己的图层(一)

这部分内容是Extendingggplot2的学习笔记，大部分内容都是原文的简单翻译。
徐洲更hoptop·2020-02-06 17:47

GEO数据库 mRNA芯片分析全流程

分析流程主要包括基于limma包的差异分析、pheatmap包的热图和ggplot2的火山图（包括对基因的批量标记）。
多啦A梦詹·2020-02-06 12:48

PCA主成分分析实战和可视化 | 附R代码和测试数据

一、PCA应用#加载需要用到的R包library(psych)library(reshape2)library(ggplot2)library(factoextra)1.数据初始化#基因表达数据exprData
生信宝典·2020-02-06 08:34

生信学习基础_R语言07_visualization data with R_R语言ggplot2实现数据可视化

原文地址：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/07_ggplot2.html大神的中文整理版：https://www.jianshu.com
酷睿_1991·2020-02-06 08:30

ggplot2绘图：多张图合并为一张

以下内容来自教程ggplot2-EasyWaytoMixMultipleGraphsontheSamePageR语言中多张图画到同一个页面上常用的函数为par()和layout()par()函数详解https
牧羊的男孩儿·2020-02-05 05:30

R -> ggplot2包（1）

ggplot2包说明文档学习笔记（1）ggplot2的绘图数据来源是一个dataframeggplot2通过一次次地添加图层来达到绘图的目的，每个图层之间通过+连接ggplot2并不会在乎画出来的图是否有实际意义
煮豆燃逗比·2020-02-02 23:01

玩转ggplot2

（注：本文基于RStudio环境）ggplot2是什么ggplot2是R语言中的一个包，用于绘图功能，相比于自带的plot函数，绘制的图形更加优美，如图用plot函数绘制的图形用ggplot函数绘制的图形玩转
Leahlijuan·2020-02-02 08:48

帮BBC做个宣传

很典型的ggplot2风格的图。
xuwenpku·2020-02-02 06:37

ggplot2 绘制带星号和 Pvalue 值的相关系数热图

ggplot2绘制相关系数热图加显著性*和Pvaue值参考：哪里不会搜哪里，哈哈哈其实归根到底就是全文要敲用判断和paste()或者paste0()tidyverse::case_when()factor
二货潜·2020-02-02 03:35

R画上下调柱状图

library(ggplot2)#用于可视化library(dplyr)#用于数据处理set.seed(1111
尧小飞·2020-02-02 02:15

GO和KEGG富集分析及去冗余工具及原理

另外，该包还可以对富集结果进行比较并可视化（基于ggplot2包：http://ggplot2.org/book/）。具体参数设置
Y大宽·2020-02-02 00:41

在R中用ggplot2绘制带bar的线图

这里主要是想介绍一下我应用ggplot2绘制的方法。  另外，大家会有疑问这个数据不是重复测量数据呀？是的，这个数据的类型可能并不合适这个图，大家暂且将dose变量理解
xuwenpku·2020-02-01 19:18

【r<-介绍|分享】使用R进行生存分析

library(survival)library(ranger)library(ggplot2)library(dpl
王诗翔·2020-02-01 03:47

用ggplot将多个数据集绘在一个图上以及双标轴问题

以下看代码library(ggplot2)x<-c("a
xuwenpku·2020-02-01 02:06

使用R绘制一幅疫情分布图

流行病学中发病情况的地区分布图是很常见的一类做图，R中的ggplot2是一个非常优雅的绘图工具，通过原始的地理测绘数据配合ggplot2绘制地图是比较硬核的一种方法，国家测绘中心早年免费提供地理测绘数据
波波在敲代码·2020-01-27 13:04

【r<-ggplot2】修改x和y轴刻度

这个Rtutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y轴刻度。同样，该文包含如何执行轴转换（对数化，开方等）和日期转换。
王诗翔·2020-01-23 19:45

【r<-ggplot2】条形图与线图

问题你想要创建基本的条形图与线图方案想要使用ggplot2绘制图形，数据必须是一个数据框，而且必须是长格式。
王诗翔·2020-01-23 18:33

【r<-修整数据】使用reshape2包

接上一篇笔记【r<-分析】分析之前，准备数据很多R用户都搞不太清楚用于修整数据的内置函数（比如stack、unstack与reshape），庆幸的是我们还有其他选择，HadleyWickham（ggplot2
王诗翔·2020-01-23 18:57

R | 一探ggplot2

在R语言的可视化工具中，ggplot2无疑是一款简洁、强大、优雅的工具。长话短说，我们直接进入ggplot2的代码中去理解这款十分实用的可视化函数。
尘世中一个迷途小书僮·2020-01-15 16:36

ggplot2自定义绘图主题

随着ggplot2的粘滞性越来越强，用它来完成一张草图已经不能满足人们日益增长的爱美之心了。其实ggplot2就是为美图而生的，为此甚至不惜从新定义了一套绘图语法。
周运来就是我·2020-01-10 00:57

R: Bubble matrix

这次又来当了次代码搬运工了Bubblematrix我们先创建一个数据data<-read.csv('E:/Rfile/data.csv',header=T)数据表格#加载包library(reshape2)library(ggplot2
小潤澤·2020-01-08 22:28

如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

619b87e54936目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续R语言之可视化⑦easyGgplot2
柳叶刀与小鼠标·2020-01-05 22:55

R：cowplot

cowplot往往和ggplot一起连用，只不过cowplot没有灰色背景，比较好看，cowplot被CRAN所收录install.packages("cowplot")#安装包library(ggplot2
小潤澤·2020-01-05 15:13

R语言实战 绘图统计之ggplot2

折线图以本校的去年食堂数据为样例介绍以本校食堂2016/09/19数据为例,对每位学生的卡余额和账户余额进行非线性回归统计目的:拟合卡余额和账户余额之间的非线性回归关系library(gcookbook)library(ggplot2
语落心生·2020-01-05 08:04

SVM支持向量机

线性支持向量机#library(ggplot2)library(lattice)library(kernlab)library(caret)#将数据使用留出采样法进行划分成训练集、测试集train<-createDataPartition
Socrates1024·2020-01-05 07:33

【r<-高级|实战|绘图】ggplot2高级绘图

以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集，它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。第二个是mtcars数据集，它包含32辆汽车的详细信息。
王诗翔·2020-01-04 23:48

R与DAVID注释的区别2020-01-04

library(ggplot2)library(clusterProfiler)if(!
weiwuzeng·2020-01-04 12:13

Python 中的可视化工具介绍

讨论的重点是R语言自带的绘图工具baseR和HadleyWickham开发的绘图工具ggplot2之间的优劣情况。
Datartisan数据工匠·2020-01-03 23:18

第一章 使用ggplot2进行数据可视化（上）

第一章使用ggplot2进行数据可视化（上）一、安装和加载tidyverse软件包#安装install.packages("tidyverse")#加载library(tidyverse)1、mpg数据框
天涯清水·2020-01-02 22:27

如何快速回顾tidyverse工具箱中各个R包函数的用法

https://www.tidyverse.org/tidyverse工具包ggplot2数据可视化ggplot2ggplot(data=)+(mapping=aes(),stat=,position=
沈梦圆1993·2020-01-02 00:08

ggplot2学习笔记（一）

ggplot2学习笔记（一）该部分笔记整理于这里1、平滑时的分组问题###对比如下量代码与绘图结果ggplot(diamonds)+geom_point(aes(x=carat,y=price,color
harvel·2019-12-30 08:43

连续型和离散型数据对应的颜色不同

知识点ggplot2的默认配色分两类，一类是连续型变量对应的渐变色，一类是离散型变量对应的独立的几种颜色。
小洁忘了怎么分身·2019-12-29 23:58

ggplot2作分组箱线图并添加均值点连线及显著性程度标注

下面这个箱线图由两部分组成，左边是1,2两组A,B,C,D,E属性的箱线图，右边是1,2两组整体水平的箱线图，下面通过R语言的ggplot2包从头绘制类似这种箱线图及其各个组的均值点连线和显著性程度标注
生信杂谈·2019-12-29 12:54

matrix biplot using ggplot2&GGally

library(ggplot2)library(GGally)mydatatips:GGally包更新后，ggpairs()直出图都是黑白的，关键在于mapping()里加上aes()mydata是个dataframe
Holase·2019-12-28 20:14

不同类型图形的应用场景

只要有数据，ggplot2几乎能够实现所有类型的图形，图形种类多种多样，有很多甚至难以叫出名字，那么我们怎么记住这些图形，怎么将这些图形进行分类归纳记忆，从而用于以后不同的工作场景呢？
周书恒·2019-12-27 13:24

R语言绘制频率直方图

频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式，同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型；R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便，但是当遇到多组数据的时候就不如ggplot2绘制来的方便
种地的Pele·2019-12-26 23:16

barplot3d|圣诞节送你一个mutation signature搭建的“乐高”

本文首发于“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/VNLIFzc9OysepGrE3lJrkw更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号。
生信补给站·2019-12-26 15:00

在热图中画的相关基因趋势线

这里教你一招：step1：假设我们使用DESeq标准化后的数据，对标准化后的矩阵进行聚类（我取了log2（data+1））library(ggplot2)library(pheatmap)library
小潤澤·2019-12-26 11:20

[ggplot2主题] ggplot2之自定义主题篇

啦啦啦，我只是一个小搬运工。链接：https://github.com/meensrinivasan/tidytuesdaysubmissions/tree/master/Anime能画出什么？library(tidyverse)#devtools::install_github("EmilHvitfeldt/paletteer")library(paletteer)library(lubrida
二货潜·2019-12-26 03:17

Internet routines cannot be loaded installing R packages

AnacondaNavigator开启RStudio，以下错误出现Errorintools::startDynamicHelp():internetroutinescannotbeloaded然后install.packages('ggplot2
穿越那片海·2019-12-26 01:20

2019-07-20

原文地址：https://mp.weixin.qq.com/s/xg7cggq45tBI0EQUSxPKFw8.1Introduction第八章讲的是ggplot2的主题设置，通过它你可以对数据之外的图形外观进行控制
戴豪杨_still·2019-12-25 16:50

R-ggplot2笔记2018-11-21

image.png在R中用ggplot2画了如下#先将数据导入library(ggplot2)x=c(15872,31744,63488,95232,126976)y1=c(5148,6241,6929,7196,7270
巴拉巴拉11·2019-12-25 15:08

ggplot2学习

ggplot2是个神奇的包，今天刚好帮师兄画一个boxplot图，要求各个boxplot图需要不同的颜色，我们一起学习一下吧：在Hadley的ggplot2官方文档中,Hadely这样对Wilkinson
我最有才·2019-12-24 21:42

ggplot2作图详解

简介ggplot2包是基于Wilkinson在《GrammarofGraphics》一书中所提出的图形语法的具体实现,这套图形语法把绘图过程归纳为data,transformation,scale,coordinates
awk_bioinfo·2019-12-24 16:31

R-ggplot2-绘图时x轴一种是numeric，一种是date?分面时老报错？怎么搞？？

目录0.问题导入1.示例数据2.导入数据3.解决R起初报错（图1）4.设置日期及x轴breaks的位置与标注5.将右侧两列子图x轴时间转化为年份（图2）6.自定义各子图轴名（图3）7.总结8.本文所用软件包（没有需要通过install.packages('')进行安装）9.致谢0.问题导入日常绘图中，我们可能想着把相关性分析图与两种指标的时间演进图通过facet_wrap绘制到一块。然后，R就开始
TroyShen·2019-12-23 18:08

ggplot2不止分面还可绘制多层X轴

我们在处理数据的过程中，仅用一个轴标签往往无法准确表达一个数据集的实际含义，这种情况在较长的时间序列数据中十分常见。因此，我们需要添加多层分类标签，来显示数据的趋势或季节性变化。这里介绍一种简单的利用Excel显示多层分类轴标签的方法:百度经验那么，如何在ggplot中实现呢？library(tidyverse)library(lubridate)library(scales)set.seed(1
周运来就是我·2019-12-23 16:29

ggplot2绘图学习-箱线图和小提琴图

最近考种数据回来了，今年测得单株，本想用箱线图表示，后来一并把小提琴图也做了，顺便做个笔记吧。利用SUMIF对相同rowname数据合并首先遇到了一个问题，由于之前在收花时分了好几批收的，结果在最后考种统计时存在一个编号对应了好几个数据，所以第一步要把这些数据求和。一定要相信推动科技进步的永远是那些“懒汉”们，如果你比较勤快，可能会一个一个加起来在总结，但是懒汉们不会，于是就有了SUMIF函数。首
ShawnMagic·2019-12-23 06:22

【r<-方案|绘图】ggplot2误差棒快速指南

library(ggplot2)df<-ToothGrowthdf$dose<-as.factor(df$dose
王诗翔·2019-12-23 05:10
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