ggplot2

教你画一个掰弯的热图（Heatmap），展示更多的基因表达量

图形的掰弯，这个是我很久以前已经实现的功能，当然这个功能的灵感（而不是实现逻辑）来至《TheGrammerofGraphics》（这本书也是R包ggplot2的实现基础）。
生信札记·2019-05-22 20:35

GO KEGG画图

rm(list=ls())library(ggplot2)library(Cairo)library(grid)GO_BP<-read.table("Term.txt"
KK_f2d5·2019-05-22 16:44

GO KEGG画图

rm(list=ls())library(ggplot2)library(Cairo)library(grid)GO_BP<-read.table("Term.txt"
KK_f2d5·2019-05-22 16:44

（数据科学学习手札57）用ggplotly()美化ggplot2图像

进行数据可视化的朋友一定用过或听说过plotly这样的神器，我在（数据科学学习手札43）Plotly基础内容介绍中也曾做过非常详细的介绍，其渲染出的图像以浏览器为载体，非常精美，且绘制图像的自由程度堪比ggplot2
费弗里·2019-05-15 20:00

ggtree绘制进化树

library(ggplot2)library(treeio)library("ggtree")tree<-read.tree('tree.tre')tax<-read.table('group.info
271828182845904·2019-05-15 11:51

ggplot2双轴图问题

title:"ggplot2双轴图"author:"wintryheart"date:"2019年5月11日"output:html_document:toc:TRUEtoc_float:TRUEknitr
冬之心·2019-05-13 15:02

5 reshape2

ggplot2需要长类型的数据，plyr也需要长类型的数据，大多数的模型(比如lm(),glm()以及gam())也需要长数据。reshape2包主要掌握melt和ca
陈宇乔·2019-05-10 07:28

ggplot2绘制蛋白表达差异分布火山图-190116

火山图解析原始数据格式：原始数据>getwd()>setwd("/Users/liruiting")#install.packages("ggplot2")>library(ggplot2)>datapdf
酷睿_1991·2019-05-09 00:06

还在用Matplotlib? 又一可视化神器Altair登场

擅长不同编程语言的程序员会选择各自技术范畴内成熟、好用的工具包，比如R语言的开发者最常使用的是ggplot2，但它不支持Python；以前Python语言的开发者使用最多的是matplotlib，一个很强大的可视化库
Python大本营·2019-05-09 00:00

数据可视化 -----ggplot2绘制箱线图叠加散点图和连线

数据可视化---------ggplot2绘制箱线图叠加散点图和连线准备输入文件这里提供示例输入文件样式：samplepercentgroupCancer0.109914791Cancer0.1967765372Cancer0.1635510933Cancer0.0893057674Cancer0.6294999675Health0.3064271091Health0.1391109062Heal
sinat_24993757·2019-05-05 11:49

哈佛R语言课程--7.R语言进行数据可视化

https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/07_ggplot2.html学习目标使用扩展包“ggplot2”绘制图表。
小洁忘了怎么分身·2019-05-01 22:19

无参转录组差异表达分析（重点火山图）

library(limma)library(ggplot2)library(DESeq2)library(pheatmap)options(stringsAsFactors=F)raw_count1,]
多啦A梦的时光机_648d·2019-04-26 11:48

ggplot2之qplot(笔记一)

以ggplot2自带数据集diamonds为例。
javaLi·2019-04-23 19:27

R-data-sciecne-3

统计变换geom_bar函数可绘制基本的条形图，diamons数据集是ggplot2内置数据集，包含54000多颗钻石的信息，每颗钻石有price,color等变量变量与观测的思维Sys.setlocale
医科研·2019-04-13 09:26

Biological theme comparison—画出多样本比较的KEGG图

Statisticalanalysisandvisualizationoffunctionalprofilesforgenesandgeneclusters#clusterProfiler这个包里面给出了样例数据rm(list=ls())library(clusterProfiler)library(ggplot2
五谷吃不完了·2019-04-05 15:13

R中绘图包ggplot2的用法

一.ggplot2简介ggplot2是基于R语言下图形语法的一个绘图包。
专抢小孩糖糖·2019-04-04 23:26

R基本函数学习 190330

library(sqldf)library(tcltk)library(ggplot2)library()和install.packages()install用于联网、在线安装、本地安装install.packages
SilenYoung·2019-03-31 02:52

推荐：这才是你寻寻觅觅想要的 Python 可视化神器

受Seaborn和ggplot2的启发，它专门设计为具有简洁，一致且易于学习的API：只需一次导入，您就可以在一个函数调用中创建丰富的交互式绘图，包括分面绘图（facetin
leenard·2019-03-25 13:50

使用ggtree给进化树添加注释信息

,quietly=TRUE))#install.packages("BiocManager")#BiocManager::install("ggtree",version="3.8")library(ggplot2
Davey_63dc·2019-03-24 19:39

ggplot2的主题设置与一页多图

ggplot2的绘图策略是首先确定数据如何展示，然后利用主题系统对细节进行渲染。
彼得暹罗猫·2019-03-24 10:41

强烈推荐 | Python可视化神器

受Seaborn和ggplot2的启发，它专门设计为具有简洁，一致且易于学习的API：只需一次导入，您就可以在一个函数调用中创建丰富的交互
Python大本营·2019-03-24 00:00

ggplot2 可视化 Part 2- swirl course

在part1里我们了解了ggplot2的基本绘图功能qplot,这次我们来看看另一个重要功能qplot七个图形对象DATAFRAME数据帧AESTHETICMAPPINGS外观图法GEOMS几何对象FACETS
farland·2019-03-20 17:03

R入门（七） --- 函数、安装包

写函数的格式,以一个简单的为例newscorebeginr::bib(pkg='ggplot2')@Book{R-ggplot2,author={HadleyWickham},t
紫苏Sun·2019-03-17 18:57

Rggplot2

ggplot2图形之基本语法：ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离ggplot2是按图层作图ggplot2保有命令式作图的调整函数，使其更具灵活性ggplot2
zhenglit·2019-03-11 17:51

商务数据分析报告--R语言--学习笔记（1）-- ggplot2画图

#导入类库library("showtext")#写入非标准字library("ggplot2")#画图library("magrittr")#
lv3·2019-02-25 23:00

（数据科学学习手札55）利用ggthemr来美化ggplot2图像

一、简介R中的ggplot2是一个非常强大灵活的数据可视化包，熟悉其绘图规则后便可以自由地生成各种可视化图像，但其默认的色彩和样式在很多时候难免有些过于朴素，本文将要介绍的ggthemr包专门针对原生ggplot2
费弗里·2019-02-18 00:00

ggplot2图集汇总（一）

作者：路遥马亡R语言中文社区专栏作者知乎ID：https://zhuanlan.zhihu.com/c_135409797前言上次推文小白R语言数据可视化进阶练习一汇总了一部分的图集，这次推文接上一篇再次汇总，此图集汇总将不断更新！08相关图相关图，通常分析多个因素之间的相关性时都会计算相关性系数，通过作图的方式，让相关性可视化，更利于数据分析。1library(GGally)23#Created
R语言中文社区·2019-02-16 11:00

ggplot里面加判断

library(ggplot2)df<-data.frame(x=1:10,y=11:20)Switch=Tggplot(df,aes(x,y))+{if(Switch)geom_hline(yintercept
安哥生个信·2019-02-13 11:54

reshape2包

1.长/宽数据R语言中，90%的情况下都是使用长型数据，比如构建回归模型，或者利用ggplot2构图，因此当遇到宽型数据时，第一时间就是要把它们转变成长型数据。
apricoter·2019-01-23 21:39

【ggplot2】阴影，图层叠加

pheno_simu_obs.png首先阴影图的绘制，geom_ribbon(data=dyArea,aes(years,ymin=dmin,ymax=dmax,fill=factor(params)),alpha=.3)其次图层叠加ggplot()+geom_ribbon(data=dyArea,aes(years,ymin=dmin,ymax=dmax,fill=factor(params))
_CelesteHuang_·2019-01-19 06:17

【ggplot2】阴影，图层叠加

pheno_simu_obs.png首先阴影图的绘制，geom_ribbon(data=dyArea,aes(years,ymin=dmin,ymax=dmax,fill=factor(params)),alpha=.3)其次图层叠加ggplot()+geom_ribbon(data=dyArea,aes(years,ymin=dmin,ymax=dmax,fill=factor(params))
_CelesteHuang_·2019-01-19 06:17

PCA主成分分析实战和可视化 | 附R代码和测试数据

一、PCA应用#加载需要用到的R包library(psych)library(reshape2)library(ggplot2)library(factoextra)1.数据初始化#基因表达数据exprData0
生信宝典·2019-01-18 21:15

数据可视化——R语言使用ggplot2工具包绘制组别间指标差异对比图(箱形图及误差条图)

数据可视化——R语言ggplot2包绘制组别间指标差异对比图(箱形图及误差条图)使用工具：R语言中的ggplot2工具包，RcolorBrewer颜色工具包有时，我们需要对多个模型之间的性能评估的重复测量指标进行比较
微露·2019-01-06 21:37

数据可视化——R语言使用ggplot2工具包绘制分面的曲线图

数据可视化——R语言使用ggplot2工具包绘制分面的曲线图概述：R语言使用ggplot2工具包绘制分面的曲线图，即依据数据的不同属性进行分面显示，并详细设置了不同绘图参数，使得绘制的图形更美观。
微露·2019-01-05 16:10

数据可视化——R语言使用ggplot2工具包绘制精美的条形图

数据可视化——R语言使用ggplot2工具包绘制精美的条形图概述：使用R语言的ggplot2工具包绘制精美的条形图使用工具：R语言中的ggplot2工具包，RcolorBrewer颜色工具包ggplot2
微露·2019-01-04 21:40

R数据可视化手册 R数据科学 学习资料

《R数据可视化手册》中绝大多数的绘图案例都是以强大、灵活制图而著称的R包ggplot2实现的，充分展现了ggplot2生动、翔实的一面。
QQ1850845616·2018-12-31 23:26

「ggplot2练习」画基因结构图

基因结构图从本质上就可以看成方块，直线，箭头的组合解析GFF文件bioconductor上有一个GenomicFeatures包，里面有一个makeTxDbFromGFF()函数可以解析GFF文件并构建TxDb对象，如何操作该对象见【Bioconductor系列】如何用Bioconductor对基因组注释.以拟南芥TAIR10上的GFF为例(文件可以从TAIR10上下载),library(Geno
xuzhougeng·2018-12-28 22:54

R数据可视化_ggplot2绘图

R语言可视化ggplot2之ggplot函数绘图入门层（Layer）第一层是数据层第二层是美学层第三层是几何层，是最基本的层第四层是面，绘图面板划分成多少行列，对应一个分类变量第五层是统计层第六层是坐标系
桃源何处寻·2018-12-27 16:37

Jupyter notebook安装R内核和简单实例

rpy2：condainstallrpy2orpipinstallrpy2创建python内核的notebook:In[1]:%load_extrpy2.ipythonIn[2]:%Rrequire(ggplot2
KEE_HA·2018-12-26 15:13

R绘图 第十一篇：统计转换、位置调整、标度和向导（ggplot2）

统计转换和位置调整是ggplot2包中的重要概念，统计转换通常使用stat参数来引用，位置调整通常使用position参数来引用。
悦光阴·2018-12-26 10:00

R绘图 第十一篇：统计转换、位置调整、标度和向导（ggplot2）

统计转换和位置调整是ggplot2包中的重要概念，统计转换通常使用stat参数来引用，位置调整通常使用position参数来引用。
悦光阴·2018-12-26 10:00

学习小组Day4笔记-姜洪利

《R数据可视化手册》——算是对ggplot2的说明吧。常见命令和函数x>-c("hello,R","ggplot2")y%filter(
姜洪利_d076·2018-12-20 21:46

MarkDown编辑器的使用摘记

1、代码与前段文字隔1空行，并在每行文字前添加4个空格（即1个制表符Tab）library(gggplot2)importpandasaspd上一个方法在引用大量代码时需在每行前插入4个空格，在前后加上
小T数据站·2018-12-17 09:35

R语言presentation——超市销售数据分析

我们需要用到的包有：arules、arulesViz、chron、dplyr、ggplot2、gplots、reshape2、wordcloud2、plyr。
EverestRs·2018-12-15 13:38

R语言presentation——超市销售数据分析

我们需要用到的包有：arules、arulesViz、chron、dplyr、ggplot2、gplots、reshape2、wordcloud2、plyr。
EverestRs·2018-12-15 13:38

R数据科学（一）ggplot2

tidyverse_update()##################安装三个数据包install.packages(c("nycflights13","gapminder","Lahman"))tidyverse包括ggplot2
Richard_Zhou·2018-11-17 10:20

3 Data visualisation (I)

3.1前准备R中数据的可视化基本都是基于ggplot2的，运行前准备，安装必要的包install.packages("tidyverse")library(tidyverse)3.2第一步3.2.1数据的准备
德先森的书·2018-11-01 19:49

比较ggplot loess拟合和loess拟合函数

library(ggplot2)p<-ggplot(data=diamonds,aes(x=carat,y=price,color=cut))+geom_point()+facet_grid(.
琼脂糖·2018-10-19 10:31

使用diskbenchmark测试硬盘性能

gitclonehttps://github.com/ongardie/diskbenchmark.git第2步：安装必要的软件包sudoaptinstall-ygccr-base-corer-cran-ggplot2r-cran-plyrr-cran-scales
chanjarster·2018-10-19 00:00

ggplot2包基本绘图(2)-柱状图与条形图

ggplot2包是目前R语言数据可视化的主力包，本文尝试将常见的数据可视化图（excel）中的图以ggplot2包的函数加以呈现。
nikang3148·2018-10-10 22:07
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