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ggplot2
R语言操作(UDA)-- Part3: 探索两个变量
探索两个变量3.1ScatterPlot散点图library(
ggplot2
)pf<-read.csv('pseudo_facebook.tsv',sep='\t')qplot(x=age,y=friend_count
快乐自由拉菲犬
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2020-03-30 17:14
染色体上画基因结构图分布图之gggenes
2018-11-7基因结构图绘制之gggenes最重要的包参考链接补上https://github.com/wilkox/gggenes安装包library(
ggplot2
)#install.packages
Js潜
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2020-03-30 09:15
无标题文章
[TOC]
ggplot2
学习笔记1.安装install.packages('
ggplot2
')2.qplotset.seed(1410)##让样本可重复dsmallhead(diamonds,4)caratcutcolorclaritydepthtablepricexyz10.23IdealESI261.5553263.953.982.4320.21PremiumESI159.8613263.89
六耳弥猴
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2020-03-30 07:33
Coding and Paper Letter(七十一)
1Coding:1.R语言包ggcorrplot2,
ggplot2
的拓展包,类似于corrplot包的功能,用于绘制相关系数图。在这个系列的第十七篇里有另一个相关的包,有兴趣的同学可以做下比较。
G小调的Qing歌
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2020-03-30 05:19
用 Python 来做数据可视化:Seaborn
在R语言的数据可视化工具中,
ggplot2
的地位不可撼动,而在Python中也有与之对位的Matplotlib(最初由JohnD.Hunter撰写,神经生物学家,不幸因癌症于2012年去世,Matplotlib
Icystone
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2020-03-30 00:08
《
ggplot2
:数据分析与图形艺术》笔记3:用图层构建图像
在前面的练习中,我们使用qplot练习作图,作为
ggplot2
的快速入门。然而,qplot的局限性在于它只能使用一个数据集和一组图形属性映射,当我们要进行复杂数据的统计分析时,qplot就不够用了。
曹务强
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2020-03-29 21:59
R 语言中添加辅助线(
ggplot2
)丨数析学院
问题:在R中,该如何在图中加入各种辅助线?指南:本节我们将以各种不同的数据图表为例,具体说明这类问题。横轴为分类变量、纵轴为连续变量的数据图表绘制横跨整个坐标系的直线:因为y轴是连续的,所以在这里我们使用geom_hline,当然在x轴是连续的情况下也可以使用geom_vline(加入xintercept参数)。为不同分类变量绘制独立的辅助线为了给每个条形图绘制不同的辅助线,我们需要用到geom_
Datartisan数据工匠
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2020-03-29 17:52
盘一盘 生信技能树R语言小作业(高级)
生信人的20个R语言习题1.安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:reshape2绘图包:
ggplot2
Forest_Lee
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2020-03-29 02:03
R地图系列(2):maptools+
ggplot2
包添加地图元素
接上一篇,R地图系列(1):maptools包绘制中国地图,如果没有读过第一篇的读者建议回去浏览一遍。由上一篇文章得知,我们的数据已经保存在map中了。那么,如何将将包含经纬度的数据投影到地图上去呢?数据准备画图之前需要准备的数据包括(随便举个例子):城市名,经度,纬度,人口数(自行车数等等),随便编一些数据,大家可以看看数据格式。namelatitudelongitudenum杭州30.2741
周书恒
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2020-03-28 23:58
R之ggvis学习笔记
官网:http://ggvis.rstudio.com/ggvis是R的一个数据可视化包,它可以:声明性地使用与
ggplot2
类似的语法描述数据图形;创建丰富的交互式图形,在本地Rstudio或浏览器中使用这些图形
叮叮当当sunny
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2020-03-28 18:00
R语言作业-20题
生信人的20个R语言习题1安装R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:reshape2绘图包:
ggplot2
options
小梦游仙境
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2020-03-27 23:57
R统计绘图 - 热图简化
blog.genesino.com/2017/06/heatmap-simple/Jumpto...热图绘制-pheatmap不改脚本的热图绘制生信宝典,一起换个角度学生信热图绘制-pheatmap绘制热图除了使用
ggplot2
生信宝典
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2020-03-27 22:20
[R] 多图片组合 2019-03
目标:要做一个下面这种图,用
ggplot2
做了上半部分和下半部分,需要将两个部分组合起来tumor.count3.png1.图片组合方法一:grid.arrangelibrary(grid)library
happyxhz
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2020-03-26 04:30
《R数据科学》||5-9章 readr+tidyr+dplyr+
ggplot2
综合分析
r4ds终于安排上了时间再把《R数据科学》这本书学习了一遍。以下是学习的过程中的一些参考资料,分享一下。英文原版在线https://r4ds.had.co.nz/index.html中文翻译版已有售,建议纸质版书籍随时翻翻。电子版网盘分享https://pan.baidu.com/s/1fkpqYahQHPkwx66XD2gGGg提取码:akct最近才公布的课后习题参考答案https://jrno
Dawn_WangTP
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2020-03-25 13:39
生信人的20个R语言习题-2019-06-20
语言习题生信技能树原文链接请先看:生信人的linux考试安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:reshape2绘图包:
ggplot2
天涯清水
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2020-03-24 22:55
R小tip(六)
ggplot2
拼图
这次我们简单介绍先
ggplot2
的拼图方法,推荐patchwork这个包,语法简单,好用,接下来我们通过个例子来向大家讲述:library(
ggplot2
)library(patchwork)p1<-ggplot
小潤澤
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2020-03-24 20:19
R小tip(七)ggplot加图注
这次是学习Y叔叔的博客,因为之前介绍了基础作图加图例的推送这次介绍
ggplot2
的加图例的方法我们看下annotate()这个函数p<-ggplot()+annotate("point",x=1,y=1
小潤澤
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2020-03-24 20:15
ggplot2
advanced
ggplot2
advanced@(R)[graph]AxescontrolxaxisasDatescale_x_date(limits=as.Date(c("2012-10-01","2013-09-24
战歌
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2020-03-22 23:32
R
ggplot2
分类排序
data<-data.frame(group=c("a","c","b","b","c","a"),x=c("A","B","C","D","E","F"),y=c(3,2,10,11,4,5))data$x=with(data,factor(x,levels=x[order(ave(y,group,FUN=min),y)]))ggplot(data,aes(x,y,fill=group))+ge
e4d8a46dd77a
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2020-03-21 16:59
用circlize包绘制circos plot
根据我的学习发现这个包与
ggplot2
很相似,也是先创建一个图层,然后不断的添加图形元素(poi
taoyan
·
2020-03-20 21:46
ggplot绘图的艺术-2:
ggplot2
的绘图思想
在本次练习中,我们通过一个简单的例子,快速了解
ggplot2
作图的思想。
曹务强
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2020-03-20 04:02
seaborn的countplot
python的一个可视化模块,构建于matplotlib之上,对于pandas的DataFrame这种数据结构有着很好的支持,能够大大减少构建绘图数据是所需的工作量(我也不知道自己为什么要装逼不去用R的
ggplot2
dasdadf
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2020-03-19 22:59
生物统计-数据可视化
可视化工具:R包,ggplot,
ggplot2
,两种可视化变量:类别型、定量型。饼图、柱状图。
新欣enjoy
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2020-03-17 23:47
ggplot2
(11) 总结回顾&案例练习
从2020年2月20到2月27日,3月13日到2020年3月16日,学习了
ggplot2
:数据分析与图形艺术(哈德利·威克姆著统计之都译),历时12天。
叮叮当当sunny
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2020-03-16 13:00
均值与误差条形图的绘制(
ggplot2
)丨数析学院
指南用
ggplot2
作图时,我们的数据必须存储为数据框形式,并且为“长”型(相对于宽型),如果你需要对数据进行重塑,详情请见这里。示例数据我们将ToothGrowth数据集作为本节中的示例数据。
Datartisan数据工匠
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2020-03-16 03:19
《
ggplot2
:数据分析与图形艺术》笔记1:图形语法
经过近两个月的学习,已经熟悉了Linux的常规操作,学了一点R语言基础和
ggplot2
的基本使用方法。由于自己时间有限,就一直跟着《基因课》的网络课程学习。可是时间长了,慢慢发现了问题。
曹务强
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2020-03-15 16:34
【r<-高级|分享】用R画热图的几个参考
介绍了pheatmap包、heatmap函数、
ggplot2
包、gplot包、lattice包。可惜排版不怎么行,不知道是页面解析问题还是啥的,文章显示不全,很多设置的参数看不到。
王诗翔
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2020-03-15 02:05
在R中调整图像颜色 (
ggplot2
)丨数析学院
问题:在R中,如何使用
ggplot2
来调整数据图像中的颜色?指南:
ggplot2
中默认的颜色配置都具有相等的亮度,这有时会使得色块间难以区分,对于色盲朋友们来说,这是十分不友好的。
Datartisan数据工匠
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2020-03-15 01:23
R语言可视化学习笔记之相关矩阵可视化包ggcorrplot
image基于
ggplot2
包以及corrplot包的相关矩阵可视化包ggcorrplot,ggcorrplot包提供对相关矩阵重排序以及在相关图中展示显著性水平的方法,同时也能计算相关性p-value
cppcwang
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2020-03-14 11:40
ggplot2
(10) 减少重复性工作
10.1简介灵活性和鲁棒性的敌人是:重复!10.2迭代last_plot()用于获取最后一次绘制或修改的图形。10.3绘图模板gradient_rb<-scale_colour_gradient(low="red",high="blue")qplot(cty,hwy,data=mpg,colour=displ)+gradient_rbqplot(bodywt,brainwt,data=msleep
叮叮当当sunny
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2020-03-13 22:00
ggplot2
(9) 数据操作
9.1plyr包简介ddply{plyr}:Splitdataframe,applyfunction,andreturnresultsinadataframe.ddply(.data,.variables,.fun=NULL,...,.progress="none",.inform=FALSE,.drop=TRUE,.parallel=FALSE,.paropts=NULL).data:用来作图的
叮叮当当sunny
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2020-03-13 21:00
ggplot2
(8) 精雕细琢
library(
ggplot2
movies)##主题改变的效果。#(左)默认的灰色主题:灰色背景,白色网格线。#(右)黑白主题:白色背景,灰色网格线。q
叮叮当当sunny
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2020-03-13 20:00
ggplot2
(7) 定位
7.1简介位置调整:调整每个图层中出现重叠的对象的位置,对条形图和其他有组距的图形非常有用;位置标度:控制数据到图形中位置的映射,常用的是对数变换;分面:先将数据集划分为多个子集,然后将每个子集依次绘制到页面的不同面板中;坐标系:通过控制两个独立的位置标度来生成一个2维的坐标系。7.2分面facet_grid(网络型):面板的行与列通过变量来定义(使用x~y定义);facet_wrap(封装型):
叮叮当当sunny
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2020-03-13 12:00
R语言可视化学习笔记之ggrepel包
首先我们来看看通过geom_text()添加标签时的情形:library(
ggplot2
)#使用数据集mtcars演示ggplot(mtcars)+geom_point(aes(wt,mpg),color
taoyan
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2020-03-13 12:22
ggplot2
练习
图源于电力电子课本65页——电容滤波的单相不可控整流电路。f<-function(w,d){l<-w/sqrt(w^2+1)*exp(-atan(w)/w)*exp(-d/w)r<-sin(d)return(l-r)}w<-seq(0.01,60,0.01)d<-rep(0,length(w))s<-rep(0,length(w))for(iin1:length(w)){root<-uniroot
叮叮当当sunny
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2020-03-12 13:00
R语言20练习题
www.bio-info-trainee.com/3409.html1安装R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:reshape2绘图包:
ggplot2
source
刘小泽
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2020-03-12 01:41
R绘图:
ggplot2
绘制火山图
绘制火山图的方法有许多,Excel和第三方软件等,本文主要运用
ggplot2
和ggrepel两个R包演示[1][2]。
谢俊飞
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2020-03-11 15:42
ggmap:使用
ggplot2
进行空间可视化绘图(下篇)
作者:戴维·卡尔&哈德利·威克姆翻译:李博原文地址:ggmap:SpatialVisualizationwith
ggplot2
PS:由于原文较长,故翻译分为三次进行。
白马少年说
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2020-03-11 08:02
可视化学习笔记(六):
ggplot2
:主题设置
1、设置图形标题设置标题可以通过以下方式:使用ggtitle()函数或lab(title='')函数及参数,二者是等价的但是ggtitle会使图形上方出现空白区域使用文本注解,设定x的位置为x值域的中间,y的位置为Inf,使标题置于绘图区域顶部p+annotate("text",x=mean(range(heightweight$ageYear)),y=Inf,label="AgeandHeigh
100gle
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2020-03-11 03:56
40-R语言机器学习的起点:线性回归
《精通机器学习:基于R第二版》学习笔记setwd("C:/Users/Admin/Documents/R")library(pacman)p_load(dplyr,
ggplot2
)1、单变量线性回归#怀俄明州蛇河流域的水量数据
wonphen
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2020-03-06 10:11
热图绘制
本篇使用R的
ggplot2
包实现从原始数据读入到热图输出的过程,并在教程结束后提供一份封装好
檸檬糖
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2020-03-06 01:18
R绘图的生物学家(7): Multifaceted figures
代码1.数据导入及整理这一部分依旧是之前的内容,不做过多的解释library(
ggplot2
)#resetthemetheme_set(theme_gray())#Loadingthedatafilename
lxmic
·
2020-03-04 09:49
图书馆QQ咨询群聊天数据分析
全篇分为三个步骤:数据准备和整理基础分析和高级分析结论#首先,是数据准备和整理library(stringr)library(plyr)library(lubridate)library(
ggplot2
文质彬彬彬
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2020-03-04 02:50
ggmap:使用
ggplot2
进行空间可视化绘图(中篇)
作者:戴维·卡尔&哈德利·威克姆翻译:李博原文地址:ggmap:SpatialVisualizationwith
ggplot2
PS:由于原文较长,故翻译分为三次进行。
白马少年说
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2020-03-03 14:30
R|绘图-学习笔记(二)
ggplot2
绘图系统语法绘图把数据映射到集合客体
萧子柔
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2020-03-03 02:24
R语言20练习题【完整版】
再次基础上进行加工、重构,加入了自己的理解1安装R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:reshape2绘图包:
ggplot2
刘小泽
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2020-03-01 17:56
R语言
ggplot2
画图生成pdf文件中英文字体完美解决方案(一)
强大的统计函数包,分析统计后期的数据处理和可视化都非常完美,大数据时代更是派上了用场,一些政府机构和公司在出年终报告的时候也都开始逐渐用上了数据可视化的利器
ggplot2
.笔者在今年环保部水环境管理司司长的一场关于南四湖治理和全国水环境管理的报告上感觉到将
JaysonChao
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2020-03-01 07:06
Barplot 作图代码
image.png
ggplot2
barplot分面图代码如下:library(
ggplot2
)Data<-read.table("data.txt",header=TRUE)Data<-as.data.frame
正踪大米饭儿
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2020-03-01 00:00
ggplot2
GCA SCA Recidual variances
setwd("D:/Sync/Dlm_wk/8801growth_para/data")library(
ggplot2
)df.comp<-read.csv("var_h2_compare.csv")str
董八七
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2020-02-29 17:13
ggplot2
绘制带有标准差图
ggplot2
-为折线图和条形图添加误差线以ToothGrowth数据为例,进行处理tg<-ToothGrowthhead(tg)library(
ggplot2
),library(Rmisc)数据预处理
cppcwang
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2020-02-29 07:29
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