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一、引言本文以2015-2020年上海地区为研究区,基于GEE实现LUCC变化识别、驱动因子提取及重要性评估的完整流程,为LUCC驱动机制研究提供可复用的技术框架。二、技术原理与数据基础2.1核心技术框架LUCC驱动因子分析的核心逻辑是通过对比“变化区域”与“未变化区域”的环境与人文特征差异,识别对土地利用转换具有显著影响的因子。本研究采用“变化识别-因子提取-模型评估”三步框架:LUCC变化识别
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在生物信息学研究中,高效利用数据库是提升研究效率的关键。本文整理了4类常用的生信数据库,涵盖公共数据、转录调控、植物研究及医学研究领域,包含各数据库的核心功能、网址及实用操作技巧,适合新手快速上手。一、常用公共生信数据库1.GSA数据库GSA数据库被誉为我国自己的“NCBI”,主要用于存储组学原始数据,功能类似NCBI的SRA数据库。主要优势:基于国内服务器,数据上传和下载的网速更快,沟通便捷,必
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在转录组Bulk测序数据分析中,热图是展示基因表达模式、样本聚类关系的核心可视化工具。一张高质量的热图不仅能清晰呈现数据特征,更能提升研究成果的展示效果。本文基于R语言的pheatmap包,整理了六种适用于不同场景的热图绘制方法,涵盖基础聚类、分组对比、通路注释等需求,私信即可获取全部代码,方便科研人员快速实现数据可视化。一、绘图前的数据准备热图绘制的核心是基因表达矩阵,数据格式的规范性直接影响后
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单细胞数量越来越多,上云分析成了必不可少的道路,单细胞大数据分析是未来的趋势,大规模平行的单细胞和单核RNA测序为健康和疾病中的系统组织图谱开辟了道路,但是随着数据生成规模的不断增长,对用于规模化分析的计算途径是迫切需要的。在此,研究人员开发了Cumulus——一款用于进行大规模单细胞和单核RNA测序数据集分析的云框架。Cumulus通过将云计算的功能与算法和执行方面的改进相结合,实现了高扩展性,
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生信小课堂影响因子:7.3研究概述:透明细胞肾细胞癌((Clearcellrenalcellcarcinoma,ccRCC)是一种常见的肾癌亚型,复发和预后不良的倾向性高,其肿瘤微环境复杂,显著影响肿瘤进展和免疫治疗反应。近年来研究发现肿瘤浸润性B淋巴细胞(TIL-Bs)可能在ccRCC中具有促肿瘤作用,这与已知的B细胞在多种恶性肿瘤中抗肿瘤反应有所不同,值得深究,可为ccRCC的TME提供新的见
- 2022-12-28
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今日启发:Elton:《病毒星球》(Ⅴ)【美】卡尔·齐默以藻类为代表的海洋微生物是地球上最伟大的地质工程师,它们和病毒之间的斗争,甚至会影响整个地球的大气层。海洋中的藻类和能产生光合作用的细菌提供了地球上大约一半的氧气,其他代谢产物还参与了云的形成。除此之外,这些微小的单细胞生物还会影响大气中二氧化碳的含量,继而影响地球的温度和海底矿物的形成。海洋病毒和单细胞生物之间的平衡导致了今天地球的气候环境
- 基于深度学习的语音识别:从音频信号到文本转录
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前言语音识别(AutomaticSpeechRecognition,ASR)是人工智能领域中一个极具挑战性和应用前景的研究方向。它通过将语音信号转换为文本,为人们提供了更加自然和便捷的人机交互方式。近年来,深度学习技术在语音识别领域取得了显著进展,极大地提高了语音识别的准确率和鲁棒性。本文将详细介绍如何使用深度学习技术构建一个语音识别系统,从音频信号的预处理到模型的训练与部署。一、语音识别的基本概
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反转录是生命系统中一种独特的遗传信息逆向流动机制,指以RNA分子为模板,在逆转录酶(亦称RNA依赖型DNA聚合酶,RDDP)的催化作用下,遵循碱基互补配对原则合成双链DNA的非经典途径。该过程突破了传统中心法则对遗传物质传递方向的限定,成为基因工程技术体系中获取目的基因的核心策略:通过分离特定mRNA并逆转录生成互补DNA(cDNA),实现了从转录本到遗传蓝图的精准追溯,为功能基因组学研究和遗传操
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- 卡罗林斯卡学院与华大等团队联合发表人类、猪、小鼠大脑中的蛋白编码基因图谱
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美国时间2020年3月5日,由卡罗林斯卡学院、瑞典皇家理工学院和华大等团队共同完成的一项题目为“人类、猪、小鼠大脑中的蛋白编码基因图谱”的研究发表于Science(影响因子41)。该研究基于多种转录组学方法和抗体图谱技术,对大脑不同区域进行了全面、深入的分子解析,并且提供了高质量的蛋白编码基因的分子图谱,为进一步研究提供了有力的武器。该研究成功地构建了哺乳动物大脑的基因图谱,是对现有的若干个大脑图
- 空间转录组样本准备指南
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样本类型:•目前10x官方测试的样本类型包含人、小鼠和大鼠各器官(皮肤、胰腺以及成骨组织暂时还不适用)。•对于人、鼠较为特殊的组织样本,比如胚胎、眼或较为柔软纤薄的组织,会有一定的难度,难点在于冷冻包埋时要保持其原本的形态结构,以及调整到合适的位置以利于切片。建议先拿组织进行一些冷冻包埋和切片的预实验,多练习和尝试。•其他物种样本,尤其是哺乳类样本,可进行尝试,但会有一些风险。建议先收集样本,进行
- 最新1区9+非肿瘤纯生信,逻辑清晰易懂,机器学习筛选关键基因的纯生信也可以发高水平期刊,抓紧上车!
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影响因子:9.186关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型1单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因2单个疾病结合免疫浸润,热点基因集,机器学习算法等。3两种相关疾病联合分析,包括非肿瘤结合非肿瘤,非肿瘤结合肿瘤或者非肿瘤结合泛癌分析4基于分型的非肿瘤生信分析5单细胞结合普通转录组生信分析目前非肿瘤生信发文的门槛较低,欢迎大家!研究概述:本研究首先使用R语言在三个基因表达数据集中找到
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什么是AnythingLLM?AnythingLLM是最易于使用的一体化AI应用程序,可以执行RAG、AI代理等操作,且无需任何代码或基础设施难题。您需要为您的企业或组织提供一款完全可定制、私有且一体化的AI应用程序,该应用程序基本上是一个具有许可的完整ChatGPT,但具有任何LLM、嵌入模型或矢量数据库。如何安装《无需任何代码构建自己的大模型知识库:AnythingLLM最易于使用的一体化AI
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目录安装PythonPDF库Python读取PDF表单数据1、一次性读取多种PDF表单的数据2、读取特定PDF表单的数据PDF表单是常见的数据收集工具,用于收集用户或客户提供的信息。通过编程的方式读取PDF表单的数据可以准确获取用户信息,避免手动输入或转录,从而节省时间和劳动力,同时降低数据输入错误的风险。这篇文章将探讨如何使用Python快速读取PDF表单数据。安装PythonPDF库Pytho
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作者,EvilGenius关于我们外显子的分析课程,我们来一次预报名吧,课表如下第一节:外显子分析基础知识与框架(包括基础文件的格式等)第二节:fastq数据处理到callSNV+基础认知(简单判断谱系突变和体系突变、以及GT:AD:AF:DP等基础信息)第三节(可能需要拆分成2节课):各大数据库如何注释突变信息(clinvar、cosmic、gnomad、HGMD、hotspot、oncoKB、
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一、微软ASR核心能力1.支持场景场景功能实时语音转文本低延迟流式识别(会议字幕/直播转录)音频文件转文本支持多种格式(WAV/MP3等),批量处理长音频定制化模型针对特定行业术语(医疗/金融)训练专属模型多语言混合识别中英文混合、方言识别(如中文普通话+粤语)说话人分离区分不同发言人(声纹识别)2.关键性能指标识别准确率:中文普通话>95%(安静环境)英文>96%(MicrosoftResear
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###技术背景介绍随着人工智能技术的不断发展,语音识别已成为我们生活中不可或缺的一部分。GoogleCloudSpeech-to-TextAPI是其中的佼佼者,能够从音频文件中提取文本信息,减少人工转录的麻烦。这篇文章将指导你如何使用`GoogleSpeechToTextLoader`来加载和转录音频文件。###核心原理解析`GoogleSpeechToTextLoader`是一个工具,它通过调用
- 转录组数据分析流程重磅升级(202407)
简说基因-专业生信合作伙伴
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本流程用于转录组二代测序数据的标准分析,可生成表达量矩阵和测序数据质控结果。本次升级的亮点有:1.支持单端测序数据2.支持多Lane数据自动合并分析流程步骤本工具执行一套非常流行的转录组定量分析流程,即Hisat2+Stringtie经典组合,其步骤为:1.Fastp,进行质量控制,去除测序数据中不合格的序列,保留高质量序列用于后续分析;2.Hisat2,将经过质控得到的Cleandata,比对到
- scanpy读取10x单细胞数据
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做单细胞或空间组课题时经常会需要导入文献中的单细胞数据作为参考,市面上最常见的格式又以10xgenomics为主要代表,通常包括barcodes.tsv.gz、features.tsv.gz(或者genes.tsv.gz)、matrix.mtx.gz三种格式文件。在面对数据读取问题时,R语言Seurat包有Read10X函数,Python中scanpy包则对应scanpy.read_10x_mtx
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转录组多组学生物信息学linuxgithub论文阅读数据挖掘算法
01背景介绍以一篇中文为例,看转录组组装在一篇中文核心或者SCI期刊的地位。内容如下:参考转录组的组装、构建和注释使用fastp软件(v0.23.1)(Chenetal.,2018)对RNA-seq测序产生的原始数据进行质控。该软件能够自动识别并去除测序数据中的接头序列,删除包含“N”的读数以及质量较低的读数,最终得到经过处理的高质量、无污染的测序读数用于下一步分析。使用hisat2软件(v2.2
- whisper相关的开源项目 (asr)
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AI多媒体whisperasr
基于Whisper(OpenAI的开源语音识别模型)的开源项目有很多,涵盖了不同应用场景和优化方向。以下是一些值得关注的项目:1.核心工具&增强版WhisperOpenAIWhisper由OpenAI开源的通用语音识别模型,支持多语言转录和翻译,基于PyTorch实现。faster-whisper使用CTranslate2加速推理,支持CPU/GPU,速度比原版快4倍,内存占用更低。适合需要高效部
- Spring4.1新特性——Spring MVC增强
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Spring4.1新特性——Spring缓存框架增强
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Spring4.1新特性——页面自动化测试框架Spring MVC T
- mysql 性能查询优化
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javasql优化mysql应用服务器
1 时间到底花在哪了?
mysql在执行查询的时候需要执行一系列的子任务,这些子任务包含了整个查询周期最重要的阶段,这其中包含了大量为了
检索数据列到存储引擎的调用以及调用后的数据处理,包括排序、分组等。在完成这些任务的时候,查询需要在不同的地方
花费时间,包括网络、cpu计算、生成统计信息和执行计划、锁等待等。尤其是向底层存储引擎检索数据的调用操作。这些调用需要在内存操
- windows系统配置
cherishLC
windows
删除Hiberfil.sys :使用命令powercfg -h off 关闭休眠功能即可:
http://jingyan.baidu.com/article/f3ad7d0fc0992e09c2345b51.html
类似的还有pagefile.sys
msconfig 配置启动项
shutdown 定时关机
ipconfig 查看网络配置
ipconfig /flushdns
- 人体的排毒时间
Array_06
工作
========================
|| 人体的排毒时间是什么时候?||
========================
转载于:
http://zhidao.baidu.com/link?url=ibaGlicVslAQhVdWWVevU4TMjhiKaNBWCpZ1NS6igCQ78EkNJZFsEjCjl3T5EdXU9SaPg04bh8MbY1bR
- ZooKeeper
cugfy
zookeeper
Zookeeper是一个高性能,分布式的,开源分布式应用协调服务。它提供了简单原始的功能,分布式应用可以基于它实现更高级的服务,比如同步, 配置管理,集群管理,名空间。它被设计为易于编程,使用文件系统目录树作为数据模型。服务端跑在java上,提供java和C的客户端API。 Zookeeper是Google的Chubby一个开源的实现,是高有效和可靠的协同工作系统,Zookeeper能够用来lea
- 网络爬虫的乱码处理
随意而生
爬虫网络
下边简单总结下关于网络爬虫的乱码处理。注意,这里不仅是中文乱码,还包括一些如日文、韩文 、俄文、藏文之类的乱码处理,因为他们的解决方式 是一致的,故在此统一说明。 网络爬虫,有两种选择,一是选择nutch、hetriex,二是自写爬虫,两者在处理乱码时,原理是一致的,但前者处理乱码时,要看懂源码后进行修改才可以,所以要废劲一些;而后者更自由方便,可以在编码处理
- Xcode常用快捷键
张亚雄
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一、总结的常用命令:
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退出xcode command+q
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关闭所有窗口 command+option+w
关闭当前
- mongoDB索引操作
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mongodb索引
一、索引基础: MongoDB的索引几乎与传统的关系型数据库一模一样,这其中也包括一些基本的优化技巧。下面是创建索引的命令: > db.test.ensureIndex({"username":1}) 可以通过下面的名称查看索引是否已经成功建立: &nbs
- 成都软件园实习那些话
aijuans
成都 软件园 实习
无聊之中,翻了一下日志,发现上一篇经历是很久以前的事了,悔过~~
断断续续离开了学校快一年了,习惯了那里一天天的幼稚、成长的环境,到这里有点与世隔绝的感觉。不过还好,那是刚到这里时的想法,现在感觉在这挺好,不管怎么样,最要感谢的还是老师能给这么好的一次催化成长的机会,在这里确实看到了好多好多能想到或想不到的东西。
都说在外面和学校相比最明显的差距就是与人相处比较困难,因为在外面每个人都
- Linux下FTP服务器安装及配置
ayaoxinchao
linuxFTP服务器vsftp
检测是否安装了FTP
[root@localhost ~]# rpm -q vsftpd
如果未安装:package vsftpd is not installed 安装了则显示:vsftpd-2.0.5-28.el5累死的版本信息
安装FTP
运行yum install vsftpd命令,如[root@localhost ~]# yum install vsf
- 使用mongo-java-driver获取文档id和查找文档
BigBird2012
driver
注:本文所有代码都使用的mongo-java-driver实现。
在MongoDB中,一个集合(collection)在概念上就类似我们SQL数据库中的表(Table),这个集合包含了一系列文档(document)。一个DBObject对象表示我们想添加到集合(collection)中的一个文档(document),MongoDB会自动为我们创建的每个文档添加一个id,这个id在
- JSONObject以及json串
bijian1013
jsonJSONObject
一.JAR包简介
要使程序可以运行必须引入JSON-lib包,JSON-lib包同时依赖于以下的JAR包:
1.commons-lang-2.0.jar
2.commons-beanutils-1.7.0.jar
3.commons-collections-3.1.jar
&n
- [Zookeeper学习笔记之三]Zookeeper实例创建和会话建立的异步特性
bit1129
zookeeper
为了说明问题,看个简单的代码,
import org.apache.zookeeper.*;
import java.io.IOException;
import java.util.concurrent.CountDownLatch;
import java.util.concurrent.ThreadLocal
- 【Scala十二】Scala核心六:Trait
bit1129
scala
Traits are a fundamental unit of code reuse in Scala. A trait encapsulates method and field definitions, which can then be reused by mixing them into classes. Unlike class inheritance, in which each c
- weblogic version 10.3破解
ronin47
weblogic
版本:WebLogic Server 10.3
说明:%DOMAIN_HOME%:指WebLogic Server 域(Domain)目录
例如我的做测试的域的根目录 DOMAIN_HOME=D:/Weblogic/Middleware/user_projects/domains/base_domain
1.为了保证操作安全,备份%DOMAIN_HOME%/security/Defa
- 求第n个斐波那契数
BrokenDreams
今天看到群友发的一个问题:写一个小程序打印第n个斐波那契数。
自己试了下,搞了好久。。。基础要加强了。
&nbs
- 读《研磨设计模式》-代码笔记-访问者模式-Visitor
bylijinnan
java设计模式
声明: 本文只为方便我个人查阅和理解,详细的分析以及源代码请移步 原作者的博客http://chjavach.iteye.com/
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
interface IVisitor {
//第二次分派,Visitor调用Element
void visitConcret
- MatConvNet的excise 3改为网络配置文件形式
cherishLC
matlab
MatConvNet为vlFeat作者写的matlab下的卷积神经网络工具包,可以使用GPU。
主页:
http://www.vlfeat.org/matconvnet/
教程:
http://www.robots.ox.ac.uk/~vgg/practicals/cnn/index.html
注意:需要下载新版的MatConvNet替换掉教程中工具包中的matconvnet:
http
- ZK Timeout再讨论
chenchao051
zookeepertimeouthbase
http://crazyjvm.iteye.com/blog/1693757 文中提到相关超时问题,但是又出现了一个问题,我把min和max都设置成了180000,但是仍然出现了以下的异常信息:
Client session timed out, have not heard from server in 154339ms for sessionid 0x13a3f7732340003
- CASE WHEN 用法介绍
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CASE WHEN 用法介绍
1. CASE WHEN 表达式有两种形式
--简单Case函数
CASE sex
WHEN '1' THEN '男'
WHEN '2' THEN '女'
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--Case搜索函数
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- PHP技巧汇总:提高PHP性能的53个技巧
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PHP技巧汇总:提高PHP性能的53个技巧 用单引号代替双引号来包含字符串,这样做会更快一些。因为PHP会在双引号包围的字符串中搜寻变量, 单引号则不会,注意:只有echo能这么做,它是一种可以把多个字符串当作参数的函数译注: PHP手册中说echo是语言结构,不是真正的函数,故把函数加上了双引号)。 1、如果能将类的方法定义成static,就尽量定义成static,它的速度会提升将近4倍
- Yii框架中CGridView的使用方法以及详细示例
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CGridView显示一个数据项的列表中的一个表。
表中的每一行代表一个数据项的数据,和一个列通常代表一个属性的物品(一些列可能对应于复杂的表达式的属性或静态文本)。 CGridView既支持排序和分页的数据项。排序和分页可以在AJAX模式或正常的页面请求。使用CGridView的一个好处是,当用户浏览器禁用JavaScript,排序和分页自动退化普通页面请求和仍然正常运行。
实例代码如下:
- Maven项目打包成可执行Jar文件
dyy_gusi
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Maven项目打包成可执行Jar文件
在使用Maven完成项目以后,如果是需要打包成可执行的Jar文件,我们通过eclipse的导出很麻烦,还得指定入口文件的位置,还得说明依赖的jar包,既然都使用Maven了,很重要的一个目的就是让这些繁琐的操作简单。我们可以通过插件完成这项工作,使用assembly插件。具体使用方式如下:
1、在项目中加入插件的依赖:
<plugin>
- php常见错误
geeksun
PHP
1. kevent() reported that connect() failed (61: Connection refused) while connecting to upstream, client: 127.0.0.1, server: localhost, request: "GET / HTTP/1.1", upstream: "fastc
- 修改linux的用户名
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Change Linux Username
更改Linux用户名,需要修改4个系统的文件:
/etc/passwd
/etc/shadow
/etc/group
/etc/gshadow
古老/传统的方法是使用vi去直接修改,但是这有安全隐患(具体可自己搜一下),所以后来改成使用这些命令去代替:
vipw
vipw -s
vigr
vigr -s
具体的操作顺
- 第五章 常用Lua开发库1-redis、mysql、http客户端
jinnianshilongnian
nginxlua
对于开发来说需要有好的生态开发库来辅助我们快速开发,而Lua中也有大多数我们需要的第三方开发库如Redis、Memcached、Mysql、Http客户端、JSON、模板引擎等。
一些常见的Lua库可以在github上搜索,https://github.com/search?utf8=%E2%9C%93&q=lua+resty。
Redis客户端
lua-resty-r
- zkClient 监控机制实现
liyonghui160com
zkClient 监控机制实现
直接使用zk的api实现业务功能比较繁琐。因为要处理session loss,session expire等异常,在发生这些异常后进行重连。又因为ZK的watcher是一次性的,如果要基于wather实现发布/订阅模式,还要自己包装一下,将一次性订阅包装成持久订阅。另外如果要使用抽象级别更高的功能,比如分布式锁,leader选举
- 在Mysql 众多表中查找一个表名或者字段名的 SQL 语句
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在Mysql 众多表中查找一个表名或者字段名的 SQL 语句:
方法一:SELECT table_name, column_name from information_schema.columns WHERE column_name LIKE 'Name';
方法二:SELECT column_name from information_schema.colum
- 程序员对英语的依赖
Smile.zeng
英语程序猿
1、程序员最基本的技能,至少要能写得出代码,当我们还在为建立类的时候思考用什么单词发牢骚的时候,英语与别人的差距就直接表现出来咯。
2、程序员最起码能认识开发工具里的英语单词,不然怎么知道使用这些开发工具。
3、进阶一点,就是能读懂别人的代码,有利于我们学习人家的思路和技术。
4、写的程序至少能有一定的可读性,至少要人别人能懂吧...
以上一些问题,充分说明了英语对程序猿的重要性。骚年
- Oracle学习笔记(8) 使用PLSQL编写触发器
vipbooks
oraclesql编程活动Access
时间过得真快啊,转眼就到了Oracle学习笔记的最后个章节了,通过前面七章的学习大家应该对Oracle编程有了一定了了解了吧,这东东如果一段时间不用很快就会忘记了,所以我会把自己学习过的东西做好详细的笔记,用到的时候可以随时查找,马上上手!希望这些笔记能对大家有些帮助!
这是第八章的学习笔记,学习完第七章的子程序和包之后