scanpy保存图片的常用方法汇总

在使用 Scanpy(一个用于单细胞RNA测序数据分析的Python库)时,保存图片(如可视化结果)是常见的操作。Scanpy 的绘图功能主要基于 Matplotlib 和 Seaborn,保存图片的方法也与这些库的保存机制一致。以下是 Scanpy 保存图片的详细方法及注意事项:


1. 基本保存图片的方法

Scanpy 的绘图函数(如 sc.pl.umapsc.pl.tsnesc.pl.pca 等)通常会返回 Matplotlib 的 Axes 对象或直接显示图形。要保存图片,可以通过 Matplotlib 的 plt.savefig() 函数实现。

基本代码示例
import scanpy as sc
import matplotlib.pyplot as plt

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