r语言ggplot2 第96页

R语言实现基于随机森林的高光谱影像分类

在PaviaUniversity数据中选取100×100大小的影像和参考数据，选取30个样本作为训练样本，基于随机森林进行分类library("R.matlab")library("yaImpute")library("randomForest")PATH0)#固定她的返回结果set.seed(100)RandomIndex<-sample(pavia_no0,length(pavia_no0))

hcwhugis·2023-01-17 15:26

R语言--模型的定阶、估计和显著性检验

在前面，我们介绍了平稳非白噪声的检验方法。这章我们是在平稳非白噪声的前提下，对模型进行定阶、估计和检验。模型的识别与定阶①直观识别对于识别我们可以采用直观的识别方法，那就是通过自相关和偏自相关acf(X,lag.max=)#自相关图像pacf(X,lag.max=)#偏自相关图像我们根据自相关和偏自相关所展示的图判断，如下：上图分别为ACF和PACF图像，我们根据主观的判别法，可以看出ACF是呈现

好酒不见啦·2023-01-17 15:26

python 密度聚类_Python密度聚类算法-DBSCAN实践

本文主要内容：前言DBSCAN聚类算法参数选择DBSCAN算法迭代可视化展示常用评估方法：轮廓系数用Python实现DBSCAN聚类算法一、前言去年学聚类算法的R语言的时候，有层次聚类、系统聚类、K-means

weixin_39927623·2023-01-17 14:42

dbscan聚类python_DBSCAN聚类算法 Python 代码

一、前言二、DBSCAN聚类算法三、参数选择四、DBSCAN算法迭代可视化展示五、常用的评估方法：轮廓系数六、用Python实现DBSCAN聚类算法一、前言去年学聚类算法的R语言的时候，有层次聚类、系统聚类

淮漠·2023-01-17 14:41

用R语言实现密度聚类dbscan

作者：张丹，R语言中文社区专栏特邀作者，《R的极客理想》系列图书作者，民生银行大数据中心数据分析师，前况客创始人兼CTO。个

R3eE9y2OeFcU40·2023-01-17 14:08

R语言常见问题

简介：本文记录使用R语言实现结构主题模型（STM）过程中的有关R的基础知识R包下载打开RGui，输入以下代码，并选择附近地区的CRAN镜像即可install.packages('package_name

思想在拧紧·2023-01-17 14:36

r语言ggplot画两条曲线_R语言作图——Line plot with error

Step1.绘图数据的准备首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式，建议大家在excel中保存成csv格式。

weixin_39981360·2023-01-17 12:18

R语言批处理中国地面气候资料日值数据集(V3.0)

R语言批处理中国地面气候资料日值数据集(V3.0)本文的处理数据、说明文档以及脚本，在这儿Ⓜ️（我的CSDN博客下载中~）一、数据内容结构简介以月为单位，每个文件代表一个月，每个文件中包括所有站点的详细数据

NULL，·2023-01-17 12:12

数据挖掘二：数据整合

教材：数据挖掘基于R语言的实战。1数据整合根据关键字将数据集进行链接，并生成合适的变量放入整合的数据集。

你真的不能替我学吗·2023-01-17 10:21

按照《生信技能树30道练习题带你玩转统计学的R语言版》其中的代码进行-探索

data(iris)Q1:载入R中自带的数据集iris，指出其每列是定性还是定量数据str(iris)'data.frame':150obs.of5variables:$Sepal.Length:num5.14.94.74.655.44.654.44.9...$Sepal.Width:num3.533.23.13.63.93.43.42.93.1...$Petal.Length:num1.41.4

weixin_44071424·2023-01-17 10:50

R语言【独立性检验】：卡方独立性检验、Fisher精确检验、Cochran-Mantel-Haenszel检验

文章目录1.卡方检验2.费希尔精确检验（FisherExactTest）3.Cochran-Mantel-Haenszel检验独立性检验：用来判断变量之间相关性的方法，如果两个变量彼此独立，那么两者统计上就是不相关的1.卡方检验可以使用chisq.test()函数对二维表的行变量和列变量进行卡方独立性检验，具体的数学问题不在这里讨论。数据是二维的列联表以吸烟与性别是否有关系举例，卡方检验的假设检验

我把夜熬成了白_·2023-01-17 10:19

先学r还是python高级_医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言？

为什么而学？做一件事，学一门语言，到底为什么而学，搞清楚目的再谈学习什么语言，因为要去医院实习的缘故，认识很多医学生想要学习生信。我常常会先和他们聊一聊什么是生信，为什么学，我希望在开始学习之前大家也能问自己两个问题。我学习编程语言是不是跟风，有没有明确的目的如果你有明确的目的，那学习编程语言是为了转行还是为了更好的服务于自己的科研其实我并不在意你因为什么而学习编程，只是为了发文章可以，能够画出更

weixin_39689819·2023-01-17 10:48

R plot图片背景设置为透明_学习健明老师发布的R语言练习题的学习笔记（一）...

学习者：骆栢维题目来源：生信基石之R语言初级10个题目：http://www.bio-info-trainee.com/3793.html备注:本文为笔者学习健明老师GitHub答案代码的学习收获！

weixin_39746869·2023-01-17 10:48

r语言向量转置_学习健明老师发布的R语言练习题的学习笔记（二）

学习者：骆栢维题目来源：生信基石之R语言中级10个题目：http://www.bio-info-trainee.com/3750.html备注:本文为笔者学习健明老师GitHub答案代码的学习收获！

weixin_39619174·2023-01-17 10:18

生信人的20个R语言习题的答案

这是生信技能树关于生信人的20个R语言习题的答案：1安装R包数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包

生信小白白·2023-01-17 09:14

生信人（R、LINUX、RNA-seq习题）

R、LINUX、RNA-seq习题R语言的练习题初级10个题目，尽量根据参考代码理解及完成：http://www.bio-info-trainee.com/3793.html中级要求是：http://www.bio-info-trainee.com

awk_bioinfo·2023-01-17 09:42

送书《R语言数据分析和可视化》 | 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香！！！...

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析(step-by-step)）、批次效应处理等内容。点击阅

生信宝典·2023-01-17 09:41

生信学习——R语言学习总结

写在前面——经过了四十天断断续续的学习，算是对R语言有了初步的了解。其实使用R语言，无非就是对数据进行处理分析，然后把结果可视化。

Dzfly..·2023-01-17 09:10

BGI-College生信入门——8、R语言基础（一）

什么是R？R是用于统计和作图的免费软件可在各种UNIX平台、Windows和MacOS上编译和运行R的组成一种语言、带有图形的运行环境、调试器、访问某些系统功能以及运行脚本文件中程序的能力R的安装RinstallationonUnix-likeRinstallationonWindowsRinstallationonMac什么是RStudioRStudio是R的集成开发环境(IntegratedD

华大基因学院·2023-01-17 09:07

生信人的20个R语言习题

假期摸鱼自学了一下数据挖掘—基于R语言的实践，一直没找找到书本配套实操文件，只能过一遍理论知识，现在跟做Jimmy大神的生信人的20个R语言习题。

你真的不能替我学吗·2023-01-17 09:36

RNA 22. SCI 文章中基于表达估计恶性肿瘤组织的基质细胞和免疫细胞（ESTIMATE）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你90篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用

桓峰基因·2023-01-17 09:48

encoder decoder模型_BERT模型精讲

本文概览：1.Autoregressive语言模型与Autoencoder语言模型1.1语言模型概念介绍Autoregressive语言模型：指的是依据前面(或后面)出现的单词来预测当前时刻的单词，代表有

weixin_39853863·2023-01-17 07:34

R语言机器学习篇——逻辑回归1（二分类）

一逻辑回归概念在监督学习中存在大量关于“是与否”的二分类问题，以过滤垃圾邮件为例，假设响应变量只有两种可能取值（既0和1），此时该变量称为虚拟变量或是哑变量。线性概率模型一般并不适合作预测。这是因为虽然明知y的取值非0即1，但根据线性概率模型所作的预测值却可能出现y＞1或y＜0的不现实情形，对于二分类问题,机器学习一般不用线性概率模型。为使y的预测值总是介于[0,1]之间，在给定x时，考虑y的两点

zarzzzz1·2023-01-16 13:58

R语言机器学习篇——逻辑回归2(多分类)

在多分类的问题中，同样可用逻辑回归进行预测，这里的一些概念便不做过多介绍，重点说明参数的意义。多分类回归参数意义如果响应变量y分为k类，则多项逻辑模型有k-1个参数向量，假设将第一类作为参照类别，这里对参数的解释可采取如下思路对于响应变量y归属于第k类的条件概率与属于第一类的条件概率之比为：这就是事件属于第k类与属于第1类发生几率之比，也称为相对风险。进一步讨论，如果某特征变量为离散变量（如性别、

zarzzzz1·2023-01-16 13:28

对比Python与R语言于气泡图的制作——数据可视化

（引用或转载本文请注明出处）近期因实际需要，笔者在此记录下利用Python以及R语言对测序结果做气泡图可视化的心得。代码中的数据为随机（其实是我乱按的）出来的数据并非实验室结果。文末将注明引用文献。

芜湖熊天霸·2023-01-16 09:02

r语言进行自然语言处理_开始进行自然语言处理

r语言进行自然语言处理当今，大多数应用程序仍在处理来自结构化和半结构化源的数据的世界中工作。它们连接到SQL数据库以查询信息或显示来自JSON或XML数据源的信息。

cxu0262·2023-01-16 06:08

R语言常用基本函数

工作目录#获取当前工作目录getwd()#设置工作目录setwd()包管理#安装包install.packages("packageName")类#查看类信息getClass("ClassName")#查看对象的类型class(aObject)输出信息#基础print(anyObject)#输出前5行head(collection,5)#第二个参数不指定的话，默认是6脚本调用#获取传入执行脚本的参

118路司机·2023-01-16 04:50

RNA 19. SCI 文章中无监督聚类法（ConsensusClusterPlus）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你83篇原创内容公众号基于RNA数据做临床预测时，我们往往并不知道该对样本怎么分类

桓峰基因·2023-01-15 19:23

【聚类】ConsensusClusterPlus包

ConsensusClusterPlus包是R语言中实现consensusclustering的一种方法。

DerekRusso·2023-01-15 19:22

ConsensusClusterPlus，一步到位的一致性聚类！

在之前的文章中分享了一致性聚类的原理，本文介绍下如何用R语言进行分析。

生信修炼手册·2023-01-15 19:52

R语言 ConsensusClusterPlus 确定最佳K值

用PCA的方法确定最佳聚类数M为计算出共识矩阵Fn=ecdf(M[lower.tri(M)])提取出共识矩阵下三角的数据，然后将用ecdf方法生成拟合曲线计算0.1到0.9之间的面积面积最小值对应K为最佳KKvec=2:maxKx1=0.1;x2=0.9#thresholddefiningtheintermediatesub-intervalPAC=rep(NA,length(Kvec))name

箫声依旧小鱼儿·2023-01-15 19:52

R语言使用gbm包的gbm函数拟合梯度提升机回归模型：使用predict函数和训练好的模型进行预测推理、使用plot函数可视化线图对比预测值和实际值曲线

R语言使用gbm包的gbm函数拟合梯度提升机回归模型：使用predict函数和训练好的模型进行预测推理、使用plot函数可视化线图对比预测值和实际值曲线目录

statistics.insight·2023-01-15 13:37

pettitt检验r语言_[原创]Matlab气候突变检测程序合集（更新了）

weixin_39692254·2023-01-15 12:28

nuistsy·2023-01-15 09:19

Koo叔说Shader-CG语言介绍

为什么Cg/HLSL是最佳选择GLSL:Unity支持GLSL,这是OpenGL的Shader语言，在GLSLPROGRAM…ENDGLSL

小城码仔·2023-01-15 09:49

用R语言画切线和法线

文章目录7法线梯度、切线和法线切线和法线的绘制7法线梯度、切线和法线为了书写方便，记xi=x1,x2,...,xnx_i=x_1,x_2,...,x_nxi=x1,x2,...,xn，∂f∂xi=∂f∂x1,∂f∂x2,⋯∂f∂xn\frac{\partialf}{\partialx_i}=\frac{\partialf}{\partialx_1},\frac{\partialf}{\partia

微小冷·2023-01-15 09:17

论文作图之R语言画斑图/热图

论文作图之R语言画斑图/热图助研科技技术员001编写论文中的斑图/热图若有疑问请咨询QQ3381528417或留言斑图（复杂网络）/热图斑图的生成需要的是一个完整的矩阵，并且在数据集中，我们不需要设置任何表头和变量名

qq_43157351·2023-01-15 09:46

python实现目标识别眼镜_用Python快速实现YOLO目标检测

文章也同步更新到微信公众号：R语言和Python学堂想获取本文完整代码和数据的下载链接，可关注微信公众号"R语言和Python学堂"，并回复发文日期"20181223"。1.什么是目标检测？

蓝天守护者ATCer·2023-01-15 05:41

从 GPT2 到 Stable Diffusion：Elixir 社区迎来了 Hugging Face

上周，Elixir社区向大家宣布，Elixir语言社区新增从GPT2到StableDiffusion的一系列神经网络模型。这些模型得以实现归功于刚刚发布的Bumblebee库。

·2023-01-14 21:57

r语言聚类分析_利用R语言进行层次聚类分析以及绘制树状图

树形图(dendrogram)是表示树的图。这种图解表示经常多种场合中被使用：在层次聚类中，它说明了由相应分析产生的聚类的排列；在计算生物学中，它显示了基因或样本的聚类，有时在热图的边缘在系统发育学中，它显示了各种生物类群之间的进化关系。在这种情况下，树状图也称为系统发育树。其实最简单的理解就是树形图是通过计算距离(计算距离的方式)来表示两个对象之间关系远近的图解。进行计算#以内置的数据集为例da

weixin_39915204·2023-01-14 21:54

R语言画好看的聚类树

本次例子用到的R包主要有TreeAndLeaf、RedeR、igraph、RColorBrewer,示例数据来自于Rflexclust包的nutrient数据。加载数据和R包library(TreeAndLeaf)library(RedeR)library(igraph)library(RColorBrewer)data(nutrient,package="flexclust")#加载数据对数据进

Mrrunsen·2023-01-14 21:23

python相关性分析函数_左手用R右手Python系列11——相关性分析

由于最近毕业论文缠身，一直都没有太多时间和精力撰写长篇的干货，但是呢学习的的脚步不能停止，今天跟大家盘点一下R语言与Python中到的相关性分析部分的常用函数。

EchiTie·2023-01-14 17:18

lefse分析本地实现方法带全部安装文件和所有细节，保证成功。

（https://download.csdn.net/download/weixin_43585681/11530532）R语言3.6.1（htt

深度礁石·2023-01-14 11:13

R语言实战-第十三章 R in action-chapter13

#第13章广义线性模型#用来分析非正态的响应变量包括分类数据和离散的计数型数据library(robust)library(qcc)#logistic回归适用于二值响应变量(0和1)#泊松分布适用于在给定时间内响应变量为事件发生数目的情形#logistic回归#以AER()包中的数据框Affairs为例library(AER)data("Affairs",package="AER")summary

Anny Yeung·2023-01-14 10:46

R语言实战-第十五章 R in action-chapter15

#第15章时间序列#15.1在R中生成时序对象#myseries<-ts(data,start=,end=,frequency=)#frequency=1表示年12表示月4表示季度数据#例生成时序对象sales<-c(18,33,41,7,34,35,25,26,25,21,25,20,22,34,40,29,25,21,22,54,31,25,26,35)tsales<-ts(sales,sta