r语言ggplot2 第92页

R语言高维数据的主成分pca、 t-SNE算法降维与可视化分析案例报告|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=6592我们被要求在本周提供一个报告，该报告将结合pca，t-SNE算法等数值方法降低维度有两个主要用例：数据探索和机器学习。它对于数据探索很有用，因为维数减少到几个维度（例如2或3维）允许可视化样本然后可以使用这种可视化来从数据获得见解（例如，检测聚类并识别异常值）。对于机器学习，降维是有用的，因为在拟合过程中使用较少的特征时，模型通常会更好地概

·2023-02-01 23:27

R语言高维数据的主成分pca、 t-SNE算法降维与可视化分析案例报告|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=6592我们被要求在本周提供一个报告，该报告将结合pca，t-SNE算法等数值方法降低维度有两个主要用例：数据探索和机器学习。它对于数据探索很有用，因为维数减少到几个维度（例如2或3维）允许可视化样本然后可以使用这种可视化来从数据获得见解（例如，检测聚类并识别异常值）。对于机器学习，降维是有用的，因为在拟合过程中使用较少的特征时，模型通常会更好地概

·2023-02-01 23:56

R语言使用虚拟变量(Dummy Variables) 回归分析工资影响因素|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=23170我们被要求在本周提供一个报告，该报告将结合虚拟变量，回归等数值方法在本文中，本文与以下两个问题有关。你应该如何添加虚拟变量？你应该如何解释结果简介如果使用一个例子，我们可能会更容易理解这些问题。数据假设我们想研究工资是如何由教育、经验和某人是否担任管理职务决定的。假设每个人都从年薪4万开始。实践出真知。每增加一年的经验，工资就增加5千。你

·2023-02-01 23:55

R语言用贝叶斯线性回归、贝叶斯模型平均 (BMA)来预测工人工资|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=24141我们被要求在本周提供一个报告，该报告将结合贝叶斯线性回归，贝叶斯模型平均等数值方法。在本文中，贝叶斯模型提供了变量选择技术，确保变量选择的可靠性。对社会经济因素如何影响收入和工资的研究为应用这些技术提供了充分的机会，同时也为从性别歧视到高等教育的好处等主题提供了洞察力背景下面，贝叶斯信息准则（BIC）和贝叶斯模型平均法被应用于构建一个简明

·2023-02-01 23:55

R语言使用虚拟变量(Dummy Variables) 回归分析工资影响因素|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=23170我们被要求在本周提供一个报告，该报告将结合回归，虚拟变量等数值方法在本文中，本文与以下两个问题有关。你应该如何添加虚拟变量？你应该如何解释结果简介如果使用一个例子，我们可能会更容易理解这些问题。数据假设我们想研究工资是如何由教育、经验和某人是否担任管理职务决定的。假设每个人都从年薪4万开始。实践出真知。每增加一年的经验，工资就增加5千。你

·2023-02-01 23:24

第六学习小组Day1笔记--gl

如何学习主要学习了知识星球的操作技巧学习中遇到困难的解决办法谷歌百度搜狗微信搜索公众号（第一次接触）生信公众号1.生信技能树2.生信菜鸟团3.biobabble（Y叔，R语言大神）4.生信媛（徐洲更）5

Aloptna·2023-02-01 23:39

Day1-Fish仔

DAY1学习笔记第一天开始学习linux和R语言啦记得本科的时候学习简单的编程都徘徊在及格线上，希望通过这次的学习班能学习到新的东西并且能够坚持下来吧1.学会学习遇到问题学会自己搜索自己解决1.1.google

kinder_85a2·2023-02-01 20:22

R语言：highcharter包绘制可交互的高级图表（一）

本期介绍在R语言如何使用highcharter包绘制可交互的高级图表，highcharter包是R语言中绘制Highcharts图表的包。

数据老黄·2023-02-01 19:05

ggplot学习笔记（一）

ggplot2的作图一般步骤为：准备数据，一般为数据框，且一般为长表，即每个观测时间占一行，每个观测变量占一列。

财富经略·2023-02-01 18:22

Coding and Paper Letter（七十六）

awesomepipeline3.R语言包salmix，用极大似然方法拟合时间序列数据的概率分布。salmix4.实现地球动图的代码与说明。

G小调的Qing歌·2023-02-01 17:35

散点图(包括添加边际图和地毯线)

1.散点图library(ggplot2)library(tidyverse)library(cowplot)#准备数据set.seed(1000)small_diamondscor.test(small_diamonds

余绕·2023-02-01 13:24

回归统计绘图_R语言统计与绘图：COX回归模型怎么建？

临床研究论文COX比例风险回归模型FitProportionalHazardsRegressionModel如果如下内容有错误，请留言，谢谢，感激不尽！1写在前面本文需要的R包："survival"、"tableone"、"broom"、"forestplot"和"survminer".本代码使用survival自带的lung数据集，lung数据集中出现的变量解释：2安装拓展包install.pa

张颖月·2023-02-01 12:49

R语言实战-第十七章 R in action-chapter17

本章目的：基于一组预测变量预测一个分类结果（如:根据关键词、图像、来源等判断一份邮件是否是病毒邮件）本章用到的package:#rpartrpart.plotparty实现决策树模型及其可视化#randomForest包拟合随机森林#e1071包构造支持向量机#基本函数glm实现逻辑回归library(rpart)library(rpart.plot)library(party)library(r

Anny Yeung·2023-02-01 12:49

r语言nonzerocoef函数_R语言如何做COX回归分析和nomogram？

准备用几次推送与大家一起系统的学习下Nomogrm的绘制原理及其在R软件和SAS软件中的实现。首先声明，文章只是自己文献上的整理及自己的一点点理解，错误之处还请大家指出！在wikipedia里对Nomogram的介绍是，Nomogram—词来源于希腊语，Nomos指“法律”而Gramma意思是“书写”。Nomogram的理论是由法国工程师PhilbertMauriced’Ocagne(1862-1

太空X基地·2023-02-01 12:19

R语言与临床模型预测——LASSO回归，单因素多因素cox，差异表达分析，Venn图，森林图，列线图，矫正曲线，ROC全套代码及解析——第八部分绘制森林图本专栏可免费答疑

1.下载数据2.匹配基因3.基因去重复4.匹配临床数据5.批量cox回归分析6.差异表达基因筛选7.取交集，选出预后相关的差异表达基因8.森林图绘制9.lasso回归进一步排除具有共线性的基因10.验证集验证，数据合并验证11.多因素cox回归建模12.列线图13.矫正曲线14.ROC曲线分析上次我们筛选出了差异表达预后基因，并放在了文件夹中：下面我开始绘制森林图，绘制森林图，我们还需要一个数据，

楷然教你学生信·2023-02-01 12:18

关于风险回归的Cox 模型构建，森林图(1)

主要参考的连接是Forestplot（森林图）|Cox生存分析可视化https://zhuanlan.zhihu.com/p/85675323R语言：多因素Cox回归森林图(基于forestplot包)

forever luckness·2023-02-01 12:48

Jmeter工具笔记-性能测试工具Jmeter5.5下载使用

Jmeter语言设置：2）打开Template按钮，并选中BuildingaWebTe

乱石之渐·2023-02-01 12:07

R语言之数据结构

RStudio清空控制台快捷键：cltr+lR语言的数据结构主要包括：向量c()，矩阵matrix()，数组array()，数据框data.frame()、因子factor()、列表list()一、向量

柴柴爱学习·2023-02-01 12:31

使用 R 语言 DESeq2 对 RNA-seq 数据的下游分析

参考文章：使用R语言DESeq2对RNA-seq数据的下游分析—小小羊最后作heatmap图时报错：解决方法：这是不报错时的df报错时，红框中为1，2，3......数字，所以应改为

MissL_78e0·2023-02-01 11:09

r语言计算模型的rmse_R语言pec包深度验证Cox模型

01研究背景在cox回归中，如何利用已经构建好的预测模型预测单个患者的生存概率呢？R中的pec包中predictSurvProb()函数可以利用cph()拟合的模型计算验证集中患者在不同时间节点的生存概率。其次该包还能在验证集中计算不同时间点C-index指数，绘制成图，比较验证集在不同模型中的C-index，通过交叉验证评估不同模型的区分度，除此以外该包还能将2个模型的校准度曲线绘制在同一个坐标

weixin_39627405·2023-02-01 10:11

R语言与临床模型预测——LASSO回归，单因素多因素cox，差异表达分析，Venn图，森林图，列线图，矫正曲线，ROC全套代码及解析——第六部分差异表达基因筛选本专栏可免费答疑

楷然教你学生信·2023-02-01 10:37

生信log22|CGviewer升级啦-交互式操作画基因组Circos圈图（使用和评价）

很多做基因组分析的文章必有一个点就是展示基因组的圈图，目前的去比较好实现这种可视化的一般依靠perl语言（最原始的版本），R语言和0、为什么要做圈图唬人，华丽（不是）；更好的展现基因组结构及想要突出的信息

周芷希Hazel·2023-02-01 08:35

学习小组Day4笔记——山川石

R语言基础R和RStudioR和RStudio介绍R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。

山川石·2023-02-01 06:37

ggplot2 legend

ggplot_buildggplot_build()takestheplotobject,andperformsallstepsnecessarytoproduceanobjectthatcanberendered.plotdatapanelobjectp<-ggplot()+geom_density(data=mtcars,aes(x=mpg,fill="color1"))+geom_densi

吴十三和小可爱的札记·2023-02-01 01:59

R语言使用ARIMAX预测失业率经济时间序列数据|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=22521最近我们被客户要求撰写关于ARIMAX的研究报告，包括一些图形和统计输出。在大数据的趋势下，我们经常需要做预测性分析来帮助我们做决定。其中一个重要的事情是根据我们过去和现在的数据来预测未来。这种方法我们通常被称为预测许多情况下都需要预测：决定是否在未来五年内再建一座发电站需要对未来的需求进行预测；安排下周呼叫中心的工作人员需要对呼叫量进行

·2023-01-31 23:21

R语言使用ARIMAX预测失业率经济时间序列数据|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=22521最近我们被客户要求撰写关于ARIMAX的研究报告，包括一些图形和统计输出。在大数据的趋势下，我们经常需要做预测性分析来帮助我们做决定。其中一个重要的事情是根据我们过去和现在的数据来预测未来。这种方法我们通常被称为预测许多情况下都需要预测：决定是否在未来五年内再建一座发电站需要对未来的需求进行预测；安排下周呼叫中心的工作人员需要对呼叫量进行

·2023-01-31 23:19

R语言PCA主成分、lasso、岭回归降维分析全球气候变化对各国土地面积影响

全文链接：http://tecdat.cn/?p=31445原文出处：拓端数据部落公众号机器学习在环境监测领域的应用，着眼于探索全球范围内的环境演化规律，人类与自然生态之间的关系以及环境变化对人类生存的影响。课题着眼于环境科学中的近年来土地面积变化影响的课题，应用机器学习的方法，进行数据处理与分析预测。数据的处理方法以及机器学习本身算法理论的学习和代码实现在各领域具有相同性，之后同学可以在其他感兴

·2023-01-31 23:18

fftshift将零频率移到中心，R语言imagefx包，时序图像特征识别

fftshift将零频率移到中心，R语言imagefx包，时序图像特征识别#TueOct1214:20:322021edit#字符编码：UTF-8#R版本：R4.1.1x64forwindow11#cgh163email

youmigo·2023-01-31 21:30

【Spark】适用场景&优缺点

通过内存计算能力可以极大的提高大数据处理速度适用于需要多次操作特定数据集的应用场合数据量不大，但要求实时统计分析需求基于大数据的SQL查询、流式计算，图计算，机器学习的场景支持Java，Scala，Python，R语言

九筒-·2023-01-31 18:55

不会R语言，也可以画出高端大气的科研图。

每当看见别人文章中高端大气上档次的热图、富集图、韦恩图、小提琴图、蜜蜂图、火山图和主成分分析图等等，作为不会R语言的科研小白，你是否也和我一样对这种提升文章质量的Figure望洋兴叹

科研猫_2020·2023-01-31 18:59

我们统计了1337个楼盘的名字和价格，发现了这件事…

写在前面：第一次用所学的R语言软件写和数据分析沾点边的文章，虽然初衷是为了完成工作任务，然这篇文章从构思到修改完工花了自己很多时间和心思，原文已在平台发布，还是想放在自己的个人空间里，以作纪念。

得得喵·2023-01-31 15:09

EMD（经验模态分解）算法三

上次搞定了R语言对一列的值做emd然后输出所有imf的组合图，下面尝试处理多列数值。

cumtzzy·2023-01-31 13:15

第五部分第19章使用ggplot2进行高级绘图

19.1R中四种图形系统图形系统的载入系统基础安装中是否包含是否需要显示加载baseYNgridYYlatticeYYggplot2NY19.2ggplot2包介绍ggplot的图采用加号+函数串联起来创建

Hannahhao·2023-01-31 10:43

python 多元线性回归_多元统计分析之多元线性回归的R语言实现

多元统计分析之多元线性回归的R语言实现多元统计分析--multivariatestatisticalanalysis研究客观事物中多个变量之间相互依赖的统计规律性。

weixin_39667652·2023-01-31 10:51

R语言 part1 概述，命令，数据、结构类型、读入数据

R语言优势作图美观、完全免费、算法覆盖广、软件易扩展、强大的社区支持、非过程模式、交互性、统计学特性、开源软件数据思维数学思维、统计思维（从思维科学角度可分为描述、概括、分析）、逻辑思维（上取/下钻思维

Cistanche Herba·2023-01-31 10:50

R语言k折交叉验证

“机器学习中需要把数据分为训练集和测试集，因此如何划分训练集和测试集就成为影响模型效果的重要因素。最近我们被要求撰写关于k折交叉验证的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文介绍一种常用的划分最优训练集和测试集的方法——k折交叉验证。”k折交叉验证K折交叉验证(k-foldcross-validation)首先将所有数据分割成K个子样本，不重复的选取其中一个子样本作为测试集，其他K-1个样本用来训练

拓端研究室TRL·2023-01-31 09:15

R语言ggstatsplot画回归拟合图

suppressMessages(library(ggstatsplot))#不显示加载包附带的信息library(ggplot2)#将mtcars数据集的行名转换成mtcars数据集的一个列，将数据集存储为

Whuer_deng·2023-01-31 09:55

R语言处理离群值（outlier）

今天在处理土壤酶活数据时发现8个技术重复中存在离群值，于是想通过R将这些离群值删除。原始数据如下：sample_idr1r2r3r4r5r6r7r8BT116.3884.0885.1384.8735.6864.1154.6264.461BT27.5253.8083.9174.1024.1664.1043.3735.581BT311.8973.9284.5054.4654.9014.0893.979

纸飞机_b371·2023-01-31 07:22

python--seaborn直方图

seaborn是专门用于统计数据可视化的包，可媲美R语言中的ggplot2包。本文介绍用seaborn绘制直方图。

FTDdata·2023-01-31 05:49

ggplot2一页多图Rmisc-multiplot功能新手排雷

背景：在用DESeq2做转录组差异基因，有几个关注的marker基因想要画图展示；这种情况可以用DESeq2包自带的plotcounts功能，这里我利用这个功能输出数据，后面接ggplot2作图；想要把关注的

NICE_AGIS·2023-01-31 04:57

一份新手友好的R语言爬虫教程

Chrome开发工具2019-06-0311.31.42.gif对网页进行刷新image.pngAccept可以接收信息的格式User-agentUserAgent中文名为用户代理，是Http协议中的一部分，属于头域的组成部分，UserAgent也简称UA。它是一个特殊字符串头，是一种向访问网站提供你所使用的浏览器类型及版本、操作系统及版本、浏览器内核、等信息的标识。通过这个标识，用户所访问的网站

大道无形x我有型·2023-01-31 03:14

R语言常用字符串处理

不管你成不承认，R的文字处理不如Python好，尽管也能用。R可以创建字符向量，>character(length=)对于字符串，我们常需要合并、取出部分、统计长度，R中都需要函数。#合并paste(x,y,sep='')#统计长度nchar(x)#取子串substr(x,start=,stop=)正则表达式的使用套路：m<-regexpr('/art/[0-9]*/[0-9]*/[0-9]*/a

Abyssal_Fish·2023-01-31 02:15

R脚本-生成密度分布表格

在组学分析中，我们常常会看到曼哈顿图，密度分布图，bin图等，之前我以为ggplot2画densityplot的数据处理格式和SNP密度一样，后来发现不是那么麻烦。

ShawnMagic·2023-01-31 00:29

R语言Cibersort文件获取+代码

在R语言中运行Cibersort共需要三个文件，分别是（1）官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表达矩阵；（3）Cibersort代码。

海绵宝宝他们夸我不是常人啦·2023-01-30 23:00

R语言中的时间序列分析模型：ARIMA-ARCH / GARCH模型分析股票价格|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=18860最近我们被客户要求撰写关于ARIMA-ARCH/GARCH模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。时间序列分析是统计学中的一个主要分支，主要侧重于分析数据集以研究数据的特征并提取有意义的统计信息来预测序列的未来值简介时序分析有两种方法，即频域和时域。前者主要基于傅立叶变换，而后者则研究序列的自相关，并且使用Box-Jenkins和ARCH

·2023-01-30 20:13

R语言中的时间序列分析模型：ARIMA-ARCH / GARCH模型分析股票价格|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=18860最近我们被客户要求撰写关于ARIMA-ARCH/GARCH模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。时间序列分析是统计学中的一个主要分支，主要侧重于分析数据集以研究数据的特征并提取有意义的统计信息来预测序列的未来值简介时序分析有两种方法，即频域和时域。前者主要基于傅立叶变换，而后者则研究序列的自相关，并且使用Box-Jenkins和ARCH

·2023-01-30 20:41

【视频】文本挖掘：主题模型（LDA）及R语言实现分析游记数据|附代码数据

全文下载链接：http://tecdat.cn/?p=14997最近我们被客户要求撰写关于主题模型（LDA）的研究报告，包括一些图形和统计输出。在文本挖掘中，我们经常有文档集合，例如博客文章或新闻文章，我们希望将它们分成自然组，以便我们理解它们主题建模是一种对此类文档进行分类的方法。在本视频中，我们介绍了潜在狄利克雷分配LDA模型，并通过R软件应用于数据集来理解它。什么是主题建模？主题建模是一种对

·2023-01-30 20:10

R语言生态学：进化树推断物种分化历史：分类单元数与时间关系、支系图可视化

全文链接：http://tecdat.cn/?p=31434原文出处：拓端数据部落公众号我们围绕进化树技术进行一些咨询，分析生物类群在时间上的多样性是如何变化的。我们将用到分类单元数-时间图（Lineages-through-timeplot）,该图可以用来描述物种多样化的总体趋势。数据3500trees.nexus是nexus格式的文件，里面有3500棵树。besttree.nexus也是nex

·2023-01-30 20:40

学习小组Day5 笔记-R语言语法（徐擎昱）

学R的时候没有做思维导图，只是列出目前已学的R语言语法，方便自己复制==，语法包括如下：建立Rstudy为工作路径setwd("F:/Rstudy")显示工作路径getwd()显示文件列表，如下两个命令均可

徐擎昱·2023-01-30 16:56

KM生存分析如何取最佳的cutoff

###survivalpackagelibrary(survival)library(survminer)##Loadingrequiredpackage:ggplot2##Loadingrequiredpackage

医科研·2023-01-30 14:14

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