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r语言ggplot2
R语言
-假设检验
目录假设检验假设检验的原理1.提出假设2.做出决策3.表述结果4.效应量1.总体均值的检验1.1一个总体均值的检验1.1.1大样本的检验1.1.2小样本的检验1.2两个总体均值只差的检验1.2.1独立大样本的检验1.2.2独立小样本的检验1.2.3配对样本的检验1.3总体比例的检验1.3.1一个总体比例的检验1.3.2两个总体比例只差的检验1.4总体方差的检验1.4.1一个总体方差的检验1.4.2
M冰
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2023-02-05 14:59
R语言
统计相关
r语言
数据挖掘
数据分析
《
R语言
与统计分析》-多元统计分析
####多元统计分析########主成分分析####princomp(formula,data=NULL,subset,na.action,...)princomp(x,cor=FALSE,scores=TRUE,covmat=NULL,subset=rep_len(TRUE,nrow(as.matrix(x))),fix_sign=TRUE,...)#cor=FALSE,表示用样本的协方差阵S
parcaf
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2023-02-05 14:27
python
开发语言
《
R语言
与统计分析》-非参数的假设检验
####非参数的假设检验########单总体位置参数的检验########中位数的符号检验-sign.test#####M满足P(XM)=1/2#R无内置函数,自己写#sign.test=m0)s<-sum(sign)result<-binom.test(s,n,p=0.5,alternative=alter,conf.level=alpha)p$p.value=result$p.valuep}
parcaf
·
2023-02-05 14:57
r语言
开发语言
《
R语言
与统计分析》-方差分析
####单因子方差分析####aov(formula,data=NULL,projections=FALSE,qr=TRUE,contrasts=NULL,...)#在单因子方差分析中,formula为x~A#aov(formula)等价于anova(lm(formula))####均值的多重比较########多重t检验-p.adjust####p.adjust(p,method=p.adjus
parcaf
·
2023-02-05 14:57
r语言
开发语言
《
R语言
与统计分析》-回归分析与相关分析
####回归分析与相关分析########相关性及其度量########Pearson相关性检验、Spearman秩检验、Kendall检验-cor.test####cor.test(x,y,alternative=c("two.sided","less","greater"),method=c("pearson","kendall","spearman"),exact=NULL,conf.lev
parcaf
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2023-02-05 14:57
python
机器学习
回归
R语言
假设检验完整入门教程
R语言
提供t.test()函数执行不同类型T检验,语法如下:#y为null为单样本T检验t.test(x,y=NULL,alternative=c
梦想画家
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2023-02-05 14:56
R语言
假设检验
T检验
配对检验
双变量检验
单变量检验
基于
R语言
的假设检验(二)
上一期文章《基于
R语言
的假设检验(一)》中通过参数方法对假设检验做了一下梳理,包括单样本和两样本的均值、方差假设检验。
Sim1480
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2023-02-05 14:26
基于
R语言
非参数统计Brown-Mood中位数检验和Wilcoxon-Mann-Whitney秩和检验
实验案例:分析方法:Brown-Mood中位数检验和Wilcoxon-Mann-Whitney秩和检验首先加载函数进行分位数检验:(1)Brown-Mood中位数检验及任意q分位数的检验;假设:H0:Mx=My;H1:Mx>My可以看到,精确的p值为0.07585>0.05,可以拒绝原假设,认为两组数据25%分位数不同。同理,对75%分位数进行检验:可见p值为0.102>0.05,拒绝原假设,认为
wg110001
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2023-02-05 14:26
R语言
r语言
模糊匹配(学习一)
背景:在预处理的过程中,要将基础疾病按照ICD-10的标准,对应转换成代码,数据量大概1000~1500,尝试利用
R语言
进行匹配。遇到的问题:基础疾病选用的是医生的诊断,不规范的写法导致匹配困难。
parcaf
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2023-02-05 14:26
R语言学习
r语言
R语言
-变量筛选流程
背景:有了一个稀疏的多变量的变量矩阵,一个对应的响应变量向量,对变量矩阵利用不同惩罚进行变量筛选。用到的包:library(readr)library(glmnet)4.19更新B<-read_csv("B.csv",col_names=T,locale=locale(encoding="GBK"))B<-as.matrix(B)fit=glmnet(B[,c(2:304)],B[,1],fami
parcaf
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2023-02-05 14:26
r语言
R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划
本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/CGz51qOjFSJ4Wx_qOMzjiw更多关于
R语言
,
ggplot2
绘图,生信分析的内容,敬请关注小号。
生信补给站
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2023-02-05 14:57
R语言
实现统计分析——非参数假设检验
作者简介糖甜甜甜公众号:经管人学数据分析往期回顾:词云一分钟了解周董的歌词非参数检验是指总体不服从正态分布,且分布情况不明时,用来检验数据是否来自同一个总体假设等一类检验方法。非参数检验通常是将数据转换成秩(顺序的意思)来进行分析的,秩就是该数据按照升幂排列之后,每个观测值的位置。1单样本泊松分布总体的均值检验泊松分布适合于描述单位时间内随机事件发生的次数。假设一次市场推广活动中前一个小时有50人
R语言中文社区
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2023-02-05 14:56
《
R语言
与统计分析》-参数的假设检验
####方差已知时,求单正态总体均值置信区间-z.test########单正态总体均值假设检验-z.test#####R无内置函数,自己写#z.test0.5){n030)-prop.test####prop.test(x,n,p=NULL,alternative=c("two.sided","less","greater"),conf.level=0.95,correct=TRUE)####两
parcaf
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2023-02-05 14:25
r语言
开发语言
R语言
使用e1071包的svm函数拟合支持向量机二分类模型、使用predict函数和训练好的二分类模型进行预测推理、confusionMatrix函数输出二分类混淆矩阵
R语言
使用e1071包的svm函数拟合支持向量机二分类模型、使用predict函数和训练好的二分类模型进行预测推理、confusionMatrix函数输出二分类混淆矩阵(包含许多衍生指标、PPV、NPV
statistics.insight
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2023-02-05 13:12
R语言入门课
人工智能
r语言
数据挖掘
数据分析
R语言
常用画图函数小结
最近一段时间在用
R语言
画图,小结一下常用的画图函数。我只列个大纲,目的是要用的时候可以记起来用哪个函数画,然后去搜索相应的代码。
Steven潘
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2023-02-05 12:29
临床基线表与COX回归
本文以
R语言
中自带临床数据集lung为例,展示基本的COX回归与临床基线表的制作。
米开朗巨魔
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2023-02-05 08:32
数据分析之学习计划
《
R语言
数据分析》这本书我看了一点,大概知道了
R语言
DiegoJohnson
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2023-02-05 05:12
【R】批量完成Oneway ANOVA,并以Mean±SD格式(带差异标记)导出到EXCEL
批量完成OnewayANOVA之前其实就写过,但是老的代码对刚入门
R语言
的人可能还是不太友好,因此又修改了一版。这一版的代码可以说即使不懂
R语言
也一样可以使用,当然前提是你的电脑里安装了R。
Cdudu
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2023-02-05 04:36
重复单细胞it-ChIP文章小图
Tips:最近看单细胞ChIP-seq文章一个图,本来作者用baseplot画的,因此尝试用
ggplot2
画出baseplot风格。
caokai001
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2023-02-05 00:00
2020-09-02-
R语言
绘制PCA图
CSV文件,header=TRUE保证表头不被当成表格数据,sep=","用逗号把数据分开mydata<-read.table("abc.csv",header=TRUE,sep=",")library(
ggplot2
麦冬花儿
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2023-02-04 23:12
基于
R语言
对股市价格预测的ARIMA建模
基于
R语言
对股市价格预测的ARIMA建模获取数据tushareID=399224利用ARIMA对股市价格进行拟合后预测,本次实验的数据源于tushare首先导入本次实验所需要的所有包require(zoo
superhake
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2023-02-04 16:23
时间序列
R语言
r语言
开发语言
tushare
机器学习
笔记《概率图模型基于
R语言
》PDF代码+《Pytorch 深度学习》PDF代码总结
深度学习为世界上的智能系统(比如GoogleVoice、Siri和Alexa)提供了动力。随着硬件(如GPU)和软件框架(如PyTorch、Keras、TensorFlow和CNTK)的进步以及大数据的可用性,人们在文本、视觉和分析等领域更容易实施相应问题的解决方案。使用文本数据分词、向量化,通过构建情感分类器训练词向量,下载IMDB数据并对文本分词,构建词表生成向量的批数据,使用词向量创建网络模
xiaoxusa
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2023-02-04 12:02
R语言
使用xgboost包拟合xgboost多分类模型:caret包的confusionMatrix函数输出多分类混淆矩阵(包含许多衍生指标、PPV、NPV、特异度、敏感度、p值等)
R语言
使用xgboost包拟合xgboost多分类模型:caret包的confusionMatrix函数输出多分类混淆矩阵(包含许多衍生指标、PPV、NPV、特异度、敏感度、p值等)目录
statistics.insight
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2023-02-04 12:11
R语言入门课
人工智能
数据分析
r语言
数据挖掘
R各种在线资源学习整理,B站生信技能书
学习资源大全https://mp.weixin.qq.com/s/RVG_Jyw09RSrwjvUsOgGOg
R语言
基础https://www.jianshu.com/nb/22007361统计学基础https
伱茠陌生人
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2023-02-04 12:44
1-管道函数
今天想要研究一下
R语言
中含有百分号(%)符号的含义,之前没系统归纳过,就借此机会好好做个笔记吧。
Morning_22
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2023-02-04 11:43
R语言
epiDisplay包的clogistic.display函数获取条件logistic回归模型的汇总统计信息(自变量初始和调整后的优势比及置信区间,回归系数的Wald检验的p值)、输出汇总统计
R语言
使用epiDisplay包的clogistic.display函数获取条件logistic回归模型的汇总统计信息(自变量初始和调整后的优势比及置信区间,回归系数的Wald检验的p值、自变量的似然比检验的
statistics.insight
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2023-02-04 10:05
R语言入门课
数据分析
人工智能
数据挖掘
r语言
机器学习
学习小组Day5笔记--小明
表格在
R语言
中改名叫数据框_不要只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,
knightxm
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2023-02-04 10:51
手写数字彩色图像识别-Keras实现(基于
R语言
)
本文摘自《Keras深度学习:入门、实战及进阶》一书。本小节我们将利用MNIST数据集的训练数据训练模型,MNIST数据集的测试数据评估模型,再利用训练好的模型对本地的50个手写数字图像进行预测,查看预测效果。在num文件夹中已经保存了50张0~9的彩色数字图像使用EBImage包的readImage()函数将num文件夹中的所有数字图像读取到R中。>library(keras)>library(
jiabiao1602
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2023-02-04 07:44
深度学习
keras
深度学习
keras
图像处理
R语言
文本挖掘相关包介绍
R语言
提供了丰富的扩展包来完成文本分词和建模。常用的有tm、tmcn、RwordSe
jiabiao1602
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2023-02-04 07:44
深度学习
R语言
深度学习
对彩色花图像进行分类-基于
R语言
的Keras实现
该案例摘自《Keras深度学习入门、实战及进阶》第四章综合案例内容。该案例的数据来源于Kaggle上的FlowerColorImages(https://www.kaggle.com/olgabelitskaya/flower-color-images)。数据内容非常简单:包含10种开花植物的210张图像(128×128×3)和带有标签的文件flower-labels.csv,照片文件采用.png
jiabiao1602
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2023-02-04 07:14
R语言
keras
深度学习
深度学习
keras
r语言
图像处理
随机生存森林算法在生存数据中的应用
还有随机生存森林等机器学习算法随机生存森林的模型构建library(ggRandomForests)#加载随机生存的package,该package包含了"randomForestSRC"#该包主要作用为随机生存森林模型结果的可视化library(
ggplot2
统计小萌新
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2023-02-04 07:01
机器学习
r语言
第6章 基本图形
《
R语言
实战》笔记系列本章学习大纲1.条形图、箱线图和点图2.饼图和扇形图3.直方图和核密度图第一部分条形图、箱线图和点图条形图条形图通过垂直的或水平的条形展示了类别型变量的分布(频数),使用函数barplot
一日如十年
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2023-02-04 07:42
如何用R画出精美漂亮的meta分析森林图
屏幕前的读者朋友你好啊,因为后台有很多读者留言想让我出一期关于
R语言
做出来较为精美的森林图的教程,而我在之前的推文(公众号:全哥的学习生涯)里并未对森林图的设置有过多的讲解,所以我整理了本文。
吃一口小肉丸
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2023-02-04 05:30
R语言
学习笔记——plot()常用参数介绍
plot(x,xlab,ylab,main,sub,asp,type,col,pch,lty,lwd,……)xlab,ylab指定x,y轴名称main,sub指定图的名称,分别在图的上方和下方asp指定y轴和x轴的比值type指定图形类型,“p”点图;“l”线图;“b”点线图,线不穿过点;“c”虚线图;“o”点线图,线穿过点;“h”直方图(histogram);“s”阶梯图;“S”步骤图(s与S差
王宇涵_e5f1
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2023-02-04 03:45
clusterProfiler进行富集分析并使用
ggplot2
进行可视化
library(clusterProfiler)library(org.Mm.eg.db)###富集分析sig.entrezid.id<-bitr(sig.genes,fromType="SYMBOL",toType="ENTREZID",OrgDb="org.Mm.eg.db")[,2]GO.res<-enrichGO(gene=sig.entrezid.id,OrgDb="org.Mm.eg.
yingyonghui
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2023-02-04 01:03
R语言
主成分PCA、因子分析、聚类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据
全文下载链接:http://tecdat.cn/?p=27515最近我们被客户要求撰写关于重庆市经济指标的研究报告,包括一些图形和统计输出。建立重庆市经济指标发展体系,以重庆市一小时经济圈作为样本,运用因子分析方法进行实证分析,在借鉴了相关评价理论和评价方法的基础上,本文提取出经济规模、人均发展水平、经济发展潜力、3个主因子,从重庆市统计年鉴选取8个指标构成的指标体系数据对重庆市38个区县经济发展
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2023-02-04 01:05
数据挖掘深度学习人工智能算法
R语言
主成分PCA、因子分析、聚类对地区经济研究分析重庆市经济指标|附代码数据
全文下载链接:http://tecdat.cn/?p=27515最近我们被客户要求撰写关于重庆市经济指标的研究报告,包括一些图形和统计输出。建立重庆市经济指标发展体系,以重庆市一小时经济圈作为样本,运用因子分析方法进行实证分析,在借鉴了相关评价理论和评价方法的基础上,本文提取出经济规模、人均发展水平、经济发展潜力、3个主因子,从重庆市统计年鉴选取8个指标构成的指标体系数据对重庆市38个区县经济发展
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2023-02-04 00:35
数据挖掘深度学习人工智能算法
数据分享|
R语言
分析上海空气质量指数数据:kmean聚类、层次聚类、时间序列分析:arima模型、指数平滑法|附代码数据
本文向大家介绍
R语言
对上海PM2.5等空气质量数据间的相关分析和预测分析,主要内容包括其使用实例,具有一定的参考价值,需要的朋友可以参考一下相关分析(correlationanalysis)是研究现象之间是否
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2023-02-04 00:04
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
线性混合效应模型(固定效应&随机效应)和交互可视化3案例|附代码数据
在本文中,我们将用
R语言
对数据进行线性混合效应模型的拟合,然后可视化你的结果线性混合效应模型是在有随机效应时使用的,随机效应发生在对随机抽样的单位进行多次测量时。
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2023-02-04 00:04
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
谱聚类社会化推荐挖掘协同过滤电影社交网站Flixster数据集应用研究
全文链接:http://tecdat.cn/?p=31502原文出处:拓端数据部落公众号摘要本课题着眼于谱聚类在社会化推荐挖掘中的应用研究。谱聚类算法是基于图论的数据聚类算法,与其他聚类方法相比具有明显的优势:建立在谱图理论的基础之上;操作简单,易于实现;具有识别非高斯分布的能力,非常适用于许多实际应用问题。所以,谱聚类算法成为近几年来机器学习领域的一个新的研究热点,处理方法以及机器学习本身算法理
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2023-02-04 00:03
FigDraw 27. SCI文章中绘制误差线 (Errorbar)
R语言
数据可视化绘图教程已经不断的更新快30个教程,基本满足绘制CNS级别图形,只要深入研究肯定都会解决的,今天我们就说一下SCI文章中常见的误差图,总结归纳一下,包括线图,条形图都可以加入errorbar
桓峰基因
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2023-02-04 00:02
信息可视化
r语言
开发语言
《金融数据分析导论:基于
R语言
》习题答案(第一章)
《金融数据分析导论:基于
R语言
》是芝加哥大学的教授RueyS.Tsay所著,李洪成、尚秀芬、郝瑞丽翻译,机械工业出版社出版,是一本学习
R语言
和金融数据分析的很好的参考书籍。
cecellialiu
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2023-02-04 00:55
python
python
数据挖掘
R语言
---分布检验
R语言
对随机变量的分布进行检验,采用的是非参数统计的方法。
ww111111e
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2023-02-04 00:20
《生信学习小组Day6笔记-数据类型-周》
今天先po一张课程小结吧
R语言
数据类型和数据读取.png看出来了吧,今天主要学习Rstudio的数据类型和数据读取重要的包括向量和数据框1.向量请看看我们知识星球的小知识哦Snipaste_2018-08
小灰_6edc
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2023-02-03 22:25
多元线性回归:
R语言
的有关基础操作
数据来源:波士顿地区房价预测完整数据集(CSV格式)_weixin_51454889的博客-CSDN博客参考书目:《
R语言
实战》(其实我不太清楚实际回归时各种检查和操作的一个整体,因而本篇内容很混乱,主要以介绍对应方法的
YO乐事嘟
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2023-02-03 22:17
统计学
r语言
线性回归
R语言
2022 TCGA数据库转录组提取 新版TCGA 表格提取
TCGA转录组Table合成时间2022.5.5下载数据与json文件然后打开TCGA新转录组.R不同文件夹文件提取将次级目录的文件夹里面的文件提取到同一个文件夹下#一些基础操作list.files(pattern="\\.tsv")#当前目录显示以tsv结尾的文件dir()dir(all.files=TRUE)#显示隐藏的文件getwd()#验证二级文件夹里面是否有文件,无返回NA值,为TRUE
qsub
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2023-02-03 20:01
个人笔记
R语言
R语言
循环读取数据文件 循环读取csv tsv xlsx数据
读取数据,XLSX或者TSV或者CSV【1】先读取一个试下,确认能正确读取进去下面三种格式提供参考data<-read_excel("C:/XXX/1.xlsx",sheet="Sheet1",col_names=TRUE)data<-read.table(file='manifest.tsv',sep='\t',header=TRUE)data<-read.csv('胃癌和癌前数据.csv')【
qsub
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2023-02-03 20:30
个人笔记
r语言
R语言
2022 TCGA数据库提取 新版TCGA 表格提取
点击看新版本下面为历史旧版本list.files(pattern="\\.tsv")dir()dir(all.files=TRUE)dir()getwd()filename=1for(iin1:20){a=as.character(list.files(list.files()[i])[1])ifelse(a%in%NA==TRUE,NA,'b')b=paste(getwd(),"/",list.
qsub
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2023-02-03 20:30
r语言
癌症基因图谱( TCGA)数据库(二)数据前处理
网上大部分关于这个数据库的处理都是用的
R语言
,自己想尝试一下用Python处理一下。将所有样例
WuYle
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2023-02-03 20:00
数据挖掘
Python
笔记
数据挖掘
python
多指标联合诊断的ROC曲线
多时间点和多指标的ROC曲线临床预测模型之二分类资料ROC曲线的绘制临床预测模型之生存资料ROC曲线的绘制ROC曲线(AUC)的显著性检验生存资料ROC曲线的最佳截点和平滑曲线ROC曲线纯手工绘制
R语言
计算
医学和生信笔记
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2023-02-03 20:58
医学统计学
r语言
开发语言
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