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r语言ggplot2
R语言
整理gdc-client工具下载的TCGA数据
提取临床信息##提取临床信息rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)#######LoadthepackagesrequiredtoreadXMLfiles.library("XML")library("methods")getwd()dir='E:/Rsudio_workstation/TCGA/GDC/clinical/'##设置临床信息所在的路径all
Eric's blog
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2023-02-03 20:58
数据库学习
r语言
TCGA
医学统计方法的
R语言
实现v2022
使用
R语言
进行医学统计分析是我学习
R语言
的初衷,所以医学统计方法的
R语言
实现一直本号的重要内容之一,通过整理这些推文,也确实让我进步颇多!本篇是对过去1年中,所有介绍过的医学统计方法的推文汇总。
医学和生信笔记
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2023-02-03 20:28
医学统计学
r语言
开发语言
TCGA官网下载和TCGAbiolinks下载的文件数量竟然不一样?
本文首发于公众号:医学和生信笔记“医学和生信笔记,专注
R语言
在临床医学中的使用,
R语言
数据分析和可视化。主要分享
R语言
做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。
医学和生信笔记
·
2023-02-03 20:28
R语言和生物信息学
程序人生
R语言
限制性立方样条回归
帮大家梳理了从线性拟合到非线性拟合的常用方法,包括多项式回归、分段回归、样条回归、限制性立方样条回归,以及它们之间的区别和联系,详情请看:多项式回归和样条回归1多项式回归和样条回归2并且上一篇推文已经介绍了
R语言
实现多项式回归的内容
医学和生信笔记
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2023-02-03 20:28
医学统计学
r语言
开发语言
1行代码提取6种TCGA表达矩阵和临床信息
本文首发于公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记,专注
R语言
在临床医学中的使用,
R语言
数据分析和可视化。主要分享
R语言
做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。
医学和生信笔记
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2023-02-03 20:27
R语言和生物信息学
矩阵
r语言
R语言
调色板
相信各位在肝图表写论文时,一定都会思考:这张图表用啥颜色?论文整体配色搭配怎么把控才好看?毕竟高分期刊大牛文章的共通点,除了论文精彩,整体配色也十分具有吸引力。许多在线配色/提取颜色的工具效果不错,通过下载大牛文章使用PS、AI等直接“偷色”也不是难事。如今即便自己缺少美学灵感,但仍可以做到轻松获取出彩的配色方案。有兴趣可参考往期推文:《作图颜色调得好,高分文章跑不了!》、《如何“偷走”大牛文章漂
ChrisJO
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2023-02-03 19:25
公众号运营01:教你如何生成漂亮的关键词云图
所以一直想知道怎么做,然后尝试了用
R语言
做,发现这么复杂啊,就没有一个简单的办法吗?然后搜了搜,发现还真有,而且比用程序生成还简单,还好看。所以今天就分享一下:生成关键词云图的网站与使用方法!
Riemann_Jin
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2023-02-03 18:32
跟着代哥哥来一份2019年上学期不倒的flag
学习
R语言
。3.英语暂时不准备相关考试,每周学3.5h英语,保持英语沟通能力。专业词汇纳入专业学习范畴,需要达到能英文汇报病历与跟国际门诊程度。4.减肥与运动晚饭不吃主食,每周
YY是个文化人
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2023-02-03 17:39
R语言
安装xlsx包以及可能遇到的问题
文章目录步骤1:java下载和安装步骤2:安装和导入xlsx加载的时候可能出现的问题参考文献步骤1:java下载和安装下载和安装过程见Java的下载安装教程,过程很详细,其中cmd部分见cmd常用命令:更换文件夹、切换路径、查看目录和返回根目录和子目录步骤2:安装和导入xlsx导入xlsx包install.packages("xlsx")library(xlsx)读取excel文件读入excel文
酸奶奶昔
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2023-02-03 15:05
r语言
r语言
开发语言
R语言
学习--unique的用法
分享:刘绵宇官方解释:uniquereturnsavector,dataframeorarraylikexbutwithduplicateelements/rowsremoved.unique主要是返回一个把重复元素或行给删除的向量、数据框或数组————————————————原文链接:https://blog.csdn.net/happywlg123/java/article/details/8
虾里巴人
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2023-02-03 15:56
java大数据与python大数据如何选择?
大数据是目前互联网流行的技术语言,处理大数据的编程语言比较有优势的也很多,比如java、python、go、
R语言
、Hadoop等等,按道理来说每种编程语言都可以处理大数据,只是处理的规模不一样而且,但是现在比较受欢迎的数据处理编程语言是
少年派画漫
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2023-02-03 14:39
R语言
初级教程(22): 条件和循环语句
1.if…else语句决策是编程的重要组成部分。可以在R中使用条件if...else语句来实现决策。if语句其语法为:if(test_expression){statement}如果test_expression的计算结果为TRUE,则大括号中的语句会被执行;但是如果是FALSE,则大括号中的语句不会被执行。其流程图为:来看个例子:x0){print("Positivenumber")}输出为:[
R语言和Python学堂
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2023-02-03 12:11
2020-10-14 入门小组DAY6-三三
学生信,
R语言
必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。包的使用是一通百通的,我们以dplyr为例,讲一下R包。
草莓桃桃茶
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2023-02-03 12:15
r语言
tunerf_
R语言
机器学习:caret包使用及其黑箱模型解释(连续变量预测)
原标题:
R语言
机器学习:caret包使用及其黑箱模型解释(连续变量预测)作者:黄天元,复旦大学博士在读,目前研究涉及文本挖掘、社交网络分析和机器学习等。
weixin_39667452
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2023-02-03 12:36
r语言
tunerf
R语言
机器学习Caret包(Caret包是分类和回归训练的简称)、数据划分、数据预处理、模型构建、模型调优、模型评估、多模型对比、模型预测推理
R语言
机器学习Caret包(Caret包是分类和回归训练的简称)、数据划分、数据预处理、模型构建、模型调优、模型评估、多模型对比、模型预测推理目录
Data+Science+Insight
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2023-02-03 12:35
R语言从入门到机器学习
机器学习
人工智能
数据挖掘
r语言
数据分析
R语言
-包安装与一些基本操作
文章目录包检查可用
R语言
的包1.获取包含R包的库位置2.获取已安装的所有软件包列表3.获取当前在R环境中加载的所有包4.安装一个新的软件包有两种方法安装:5.加载包到当前R环境6.卸载包包
R语言
的包是R
[小G]
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2023-02-03 10:41
R
r
矩阵行列式≠0,但是不满秩?是的,真有这样的!
最近用
R语言
处理数据的时候,总是出现“Errorinsolve.default(A):systemiscomputationallysingular:reciprocalconditionnumber=
明明就_faf8
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2023-02-03 09:16
[
R语言
学习] 使用
ggplot2
进行数据可视化
数据:
ggplot2
包中的mpg数据框image.png创建ggplot图形library(
ggplot2
)ggplot(data=mpg)+geom_point(mapping=aes(x=displ
17号小行星
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2023-02-03 07:06
R包crayon格式化输出信息_2021-07-22
R语言
现在已经不是小众语言了,学校教育和各行各业的工作中都可以使用
R语言
中便捷的统计学函数和强悍的图形可视化
知无牙
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2023-02-03 06:16
R语言
中工具变量:例题一
这篇文章主要是:
R语言
中工具变量的使用、涉及到的数据处理以及模型含义。两个例题:例题一涉及6个问题,使用的数据集为
R语言
自带的fertil2。
多美丽
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2023-02-03 04:03
2
数据来源:联合国人口数据库过程:使用
R语言
、调用
ggplot2
、animation、dplyr、tidyr、xlsx、ggthemes难点:1.数据来源,联合国数据每年的数据没有按照性别分布的,只有每五年数据有分男女性别
让我猜猜有人偷了你的甜甜圈
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2023-02-03 04:22
哥俩好-
ggplot2
优雅的绘制配对条形图
欢迎关注
R语言
数据分析指南本节来介绍如何使用
ggplot2
包绘制配对条形图,下面通过一个小案例进行展示安装并加载R包package.list=c("tidyverse","ggtext","ggnewscale
R语言数据分析指南
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2023-02-03 01:11
从实战经验来看 究竟如何才能做出赚钱的量化投资策略?
今天推荐一位量化私募基金经理在第九届
R语言
会议上所作报告,主要围绕量化投资实践经验以及一些经典的理论知识,梳理量化投资的方法论体系,希望为大家在量化投资领域产生新的认识提供一些帮助。
小壁虎的春天
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2023-02-03 00:29
量化交易
R语言
学习笔记:Logistic模型与选择(二)
在获得预测模型之后,我们可以根据模型计算出每个人患心脏病的概率,同时为这个概率划定一条分界线,如概率大于0.5时认为此人有心脏病,概率小于0.5时则认为此人没有心脏病P(A)=[e^(kx+b)]/[1+e^(kx+b)]=1/2刚刚的模型k=0.0159,b=3.66,解得x(SBP)=230.2在图上加入分界线abline(v=230.2,lwd=5,col='blue')可以看出该分界线存在
DANoob
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2023-02-02 23:33
R语言
LME4混合效应模型研究教师的受欢迎程度|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=11724最近我们被客户要求撰写关于混合效应模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。文中本教程对多层_回归_模型进行了基本介绍介绍本教程期望:多层_回归_模型的基础知识。R中编码的基础知识。安装R软件包lme4,和lmerTest。步骤1:设定如果尚未安装所有下面提到的软件包,则可以通过命令安装它们install.packages("NAMEOFP
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2023-02-02 23:15
R语言
LME4混合效应模型研究教师的受欢迎程度|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=11724最近我们被客户要求撰写关于混合效应模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。文中本教程对多层_回归_模型进行了基本介绍介绍本教程期望:多层_回归_模型的基础知识。R中编码的基础知识。安装R软件包lme4,和lmerTest。步骤1:设定如果尚未安装所有下面提到的软件包,则可以通过命令安装它们install.packages("NAMEOFP
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2023-02-02 22:43
R语言
随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据和可视化分析|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=22596最近我们被客户要求撰写关于预测心脏病的研究报告,包括一些图形和统计输出。本报告是对心脏研究的机器学习/数据科学调查分析。更具体地说,我们的目标是在心脏研究的数据集上建立一些预测模型,并建立探索性和建模方法。但什么是心脏研究?研究大纲介绍数据集和研究的目标探索数据集可视化使用Chi-Square独立检验、Cramer'sV检验和Goodma
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2023-02-02 22:12
数据挖掘深度学习机器学习算法
[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--散点图+箱线图组合图
本期内容为[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--散点图+箱线图组合代码部分:导入相关包和数据library(ggExtra)library(
ggplot2
)####导入数据cdatacdata[1:5,1
小杜的生信筆記
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2023-02-02 21:03
《
R语言
实战笔记》第一章:
R语言
介绍
第一章:
R语言
介绍1.3.2获取帮助1.3.3工作空间注意:函数setwd()不会自动创建一个不存在的目录。
N刻后告诉你
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2023-02-02 15:59
R语言
r语言
R语言
求一行(列表、list)数据的平均数
R语言
求一个列表的平均数可以使用mean():mean英文意思有平均数的含义x=c(1,3,5,7,9)mean(x)#这样即可求得平均数为:5假如读取过一个csv文件之后,要求其中一行数据中指定某个区间内的平均数可以使用
绅士小浩
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2023-02-02 15:58
R语言
R语言
平均数
mean
rowMeans
在
R语言
中怎样按照某一列分组求均值
主要介绍tapply函数:每次只能求一列aggregate函数:每次按组可以求多列tapply(shuju[shuju[,3],shuju$year,mean)#以年份为组,求shuju表第三列的均值aggregate(shuju[,3:4],list(shuju[,2]),mean)#以年份为均值,求数据表第三列,第四列的均值
everything_will_beOK
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2023-02-02 15:58
机器学习与R语言
用
R语言
学习数据挖掘——1.用R计算数据基本统计量(均值)
目录均值(mean)用R计算均值mean(x,trim=0,na.rm=FALSE)例1例2apply(x,1或2,计算函数)例3参数trim例4参数na.rm例5学习机器学习和数据挖掘中的各种算法和模型,需要掌握统计学的基本概念。统计学是通过搜索、整理、分析数据等手段,以达到推断所测对象的本质,并预测对象未来走势的一门综合性科学。简单说,统计学是根据样本估计总体的科学。它的一些思想和大数据思想有
咕噜oo
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2023-02-02 15:27
#
R语言
数据挖掘
算法
数据分析
机器学习
R
R语言
一步到位求数据的均值,频数,标准差,标准误差
用
R语言
快速求数据各组别的均值,频数,标准差,标准误差。使用
R语言
中的'plyr'包的ddply()函数,和常见的summarise()函数。导入'plyr'包和你的数据。
吹哨子的喇叭花
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2023-02-02 15:56
r语言
开发语言
R语言
按某一列分类求均值+绘图总结
D<-aggregate(.~K,data=data1,mean)#求数据集data1按照K分类后所有列的均值rm(list=ls())#删除所有对象attach()#锁定某个对象with(mtcars,{print(summary(mpg)),plot(mpg,disp)}#with作用等同attachgrades<-read.table('student.csv',header=TRUE,ro
蓝凉丿
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2023-02-02 15:26
R语言
数据可视化
R语言
获取指定列的均值(rowmeans & apply函数)
我们通常需要计算某几列变量的均值,可以通过rowMeans函数和apply函数进行计算。如果我们要计算var1,var2这2个变量的均值,rowMeans的做法是:apply函数的做法是(第二个参数,1=行,2=列)注意:rowmeans和apply都是对dataframe求均值,所以需要用select函数先把需要求的几列变量抽取出一个新的dataframe.可以用class()函数查看数据类型是
yqc_kayla_bbd
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2023-02-02 15:56
R学习笔记
r语言
均值算法
机器学习
代写linear model作业、F-ratio留学生作业代做、代写R程序语言作业、R实验作业代做代写Python编程|代做
R语言
编程
Q2.HowmanyobservationshavebothpHgreaterthan5.99pHunitsandKgreaterthan1.81mg/litre?Q3.Youareaskedtousealinearmodel(e.g.usingRslm()function)toanalysewhetherConductivity(units=microS/cm),inauthority25,va
qugaofeng
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2023-02-02 15:43
R语言
︱机器学习模型评估方案(以随机森林算法为例)
R语言
︱机器学习模型评估方案(以随机森林算法为例)笔者寄语:本文中大多内容来自《数据挖掘之道》,本文为读书笔记。
普通网友
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2023-02-02 12:00
数据结构与算法
r语言
人工智能
图数据库(八):Neo4j中Cyphe
r语言
with关键字
WITH用于向后面的语句传递指定结果,并可以改变结果集中实体的形式和数量。注意,WITH会影响查询结果集里的变量,WITH语句外的变量不会传递到后续查询中。对结果进行筛选#聚合函数进行筛选,这句话表达的是David连接过去的节点,它向外连接关系大于1的那个节点match(David{name:'David'})--(otherPerson)-->()withotherPerson,count(*)
hanscal
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2023-02-02 11:19
数据库
neo4j
Cypher
知识图谱之Cyphe
r语言
的使用
一、什么是CypherCypher是一种声明式图查询语言,它允许对图进行表达性和高效的查询、更新和管理。它旨在适用于开发人员和运营专业人员。Cypher设计简单但功能强大;可以轻松表达高度复杂的数据库查询,使您能够专注于您的领域,而不是迷失在数据库访问中。Cypher借鉴了SQL的结构——查询是使用各种子句构建的。和SQL一样不区分大小写。二、Cypher的使用1、CREATE子句用于创建节点和关
欧菲斯集团
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2023-02-02 11:48
知识图谱
知识图谱
人工智能
图数据库(七):Neo4j中Cyphe
r语言
where关键字
WHERE用于为MATCH,OPTIONALMATCH和WITH语句添加过滤条件,来源SQL语言。限定条件WHERE#查询人名为”Peter“或者年纪大于30人名不为”Timothy“的人,或者人名既不为”Timothy“也不为”Peter"的人(进行过滤)#查询人名不为”Peter“或者年纪小于30人名为”Timothy“的人,或者人名既不为”Timothy“也不为”Peter"的人(进行过滤)
hanscal
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2023-02-02 11:48
数据库
neo4j
Cypher
Cypher 语句实战
neo4j_exe_environment_setup.htmlNeo4j-解压版环境设置https://www.w3cschool.cn/neo4j/neo4j_zip_environment_setup.htmlCyphe
r语言
的关键字不区分大小写
动力暖暖
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2023-02-02 11:18
图数据库
neo4j
Cypher
图数据库(六):Neo4j中Cyphe
r语言
merge关键字
MERGE用于保证元素一定存在,作为查询节点和边,若查不到就创建该节点和边。简单的用法这个关键字基本上是把create和match合并到一起merge(robert:Person{name:'Robert'})returnrobert,labels(robert)本身是不存在这个节点的,所以会直接创建;如果存在这个节点,发现此时上述命令的作用只是相当于match命令。创建和获取值当然也可以比如:#
hanscal
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2023-02-02 10:16
数据库
Cypher
neo4j
代做NYU Classes、代写HTML/CSS、代写Web Design、代做HTML/CSS/web代做SPSS|代做
R语言
编程
NYUClasses:IntroductiontoWebDesign,Section007-Fall18:Assignments2018/12/9下午7)37https://newclasses.nyu.edu/portal/site/ce47ea35-8315-4911-a0…65c549c/tool/cb04850f-d779-4fa6-98d8-998b1772c097?panel=Main
qiexinglun
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2023-02-02 09:24
数据分析:大数据分析师必备技能【统计分析、可视化辅助工具、大数据处理框架、数据库、数据仓库、数据挖掘工具、机器学习、挖掘算法、编程语言】
回归、预测;可视化辅助工具:excel、BI工具、python大数据处理框架:Hadoop、storm、spark数据库:SQL、MySql、DB数据仓库:SSIS、SSAS数据挖掘工具:Matlab、
R语言
u013250861
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2023-02-02 09:14
大数据
数据分析
数据挖掘
数据仓库
大数据
算法
R语言
生成艺术,类似太阳的图案
R语言
生成艺术,类似太阳的图案1.png2.png3.png4.png全图.png#ThuJan2110:25:172021-#https://mp.weixin.qq.com/s/lB4E624lGAXj85
youmigo
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2023-02-02 08:50
学习小组Day5笔记-鹅
(6)表格在
R语言
中改名叫数据框(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看
DoubleT_2aac
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2023-02-02 06:23
2020-10-14学习小组Day5笔记-yikedou
(6)表格在
R语言
中改名叫数据框_(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命
a8aed5395bc8
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2023-02-02 05:37
ggplot2
+ ggsignif画散点图叠加箱线图带t-test
library(
ggplot2
)library(ggsignif)p<-ggplot(cell,aes(x=Type,y=Ratio,colour=Type))+geom_boxplot(pch=16,
瓶瓶瓶平平
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2023-02-02 05:29
折腾一个柱状图
写在前面还是想要放弃ggpubr做图了,主要问题是这东西和
ggplot2
体系的不兼容。因为ggpubr中好多变量其实是写死的,当你想要调整某个细节的时候就变得非常蛋疼了。
邵扬_Barnett
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2023-02-02 04:17
Python数据分析实战:为什么销售额会减少
不过该书使用的是
R语言
,作为还在学习阶段的Python新手,斗胆使用Python代码复现一下分析过程,如有错误,敬请指点。
了不起的原顾
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2023-02-02 00:42
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