r语言ggplot2 第94页

R语言：分类变量绘图中的排序问题

使用r自带的数据集mpg，绘制了箱线图（boxplot）用来描述不同汽车类别（class）可以行驶的公里数（hwy）的分布。ggplot(data=mpg,mapping=aes(x=class,y=hwy))+geom_boxplot()这个箱式图高低不平的看上去很不协调，如果想重新排一下序如何处理？reorder(x,X,FUN=mean,...,order=is.ordered(x))x:需

Eagle_Data·2023-01-27 08:24

机器学习预测模型解释器 R语言实现SHAP分析，预测模型评估

机器学习预测模型解释器R语言实现SHAP分析，预测模型评估SHAP分析包含我们科研私家菜团队优化开发的SHAP包及模型分析示例代码，保证代码和图表均可以复现。提供全程。

「已注销」·2023-01-27 08:19

nature microbiology图表复现之聚类条形图

本节来复现naturemicrobiology上的一张带聚类的条形图，图均基于ggplot2,ggtree，通过jjAnno很轻松的添加了阴影，下面来进行具体介绍，数据代码已经上传VIP交流群FusariumfruitingbodymicrobiomememberPantoeaagglomeransinhibitsfungalpathogenesisbytargetinglipidrafts

R语言数据分析指南·2023-01-27 06:04

画一个有标签的火山图—标出显著变化的基因

参考：ggplot2绘制火山图实例rm(list=ls())setwd('')library(ggplot2)DEG=read.csv('marker.csv',header=T)rownames(DEG

五谷吃不完了·2023-01-27 01:13

2021生信技能树R语言终极练习题

使用循环，对iris的1到4列分别画点图（plot）方案1：我的答案参考https://www.jianshu.com/p/4b7f3b9e4cf2>library(patchwork)>library(ggplot2

超级可爱的懂事长鸭·2023-01-27 01:18

R_柱状图（加误差线，显著性差异）

先放最终效果图结果图#bar_plot2021/01/19#导入所需的包library(ggplot2)library(ggthemr)library(ggsignif)library(tidyverse

奔跑的Forrest·2023-01-26 22:51

[29]《R数据科学》ggplot2图形标签与注释

标签要想将探索性图形转换为解释性图形，最容易的办法就是加上一些标签。可以使用labs()函数来添加标签，以下示例为图形添加了一个标题：ggplot(mpg,aes(displ,hwy))+geom_point(aes(color=class))+geom_smooth(se=FALSE)+labs(title=paste('Fuelefficiencygenerallydecreaseswith'

灰常不错·2023-01-26 16:57

R语言-菌群alpha多样性之箱线图绘制

箱型图（Boxplot）或者盒图是一种能同时展示一组或多组数据的极值、四分位数、中位数和离群值，显示数据离散情况的统计图。下面介绍一下如何在R软件中利用箱形图可视化两组微生物群的Alpha多样性指数。作图数据说明使用Q2打开文件“shannonvector.qzv”，下载元数据“alpha_diversity_metadata.tsv”，最后一列为shannon指数，内容如下：alpha_dive

husy_·2023-01-26 15:45

R语言有序多分类概率模型比较并计算模型和参数的P

概述二分类logistics回归很容易被理解。但是，同时我们经常在叶听到“多元有序logistics回归？”“有序多分类回归？”这样的名次？容易让人大雾弥漫：多元？是多酚类还是多变量？有序？怎么安排有序？迷迷糊糊做了，但是，P值怎么计算？polr{MASS}RDocumentationOrderedLogisticorProbitRegressionDescription：Fitsalogisti

茅逗逗·2023-01-26 15:57

学习小组Day5笔记——山川石

<-c(1,2,3)#向量赋值x<-1:10#1-10的所有整数x<-seq(1,10,by=0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数x<-rep(1:3,times=2)#1-3重复两次引自CSDNR语言学习笔记

山川石·2023-01-26 14:45

数据框塑形——Tidyr vs Reshape

数据框的塑形是学习R语言过程中的一个重要的知识点，是从Excel思维转换成编程思维的重要过程。

墨墨如·2023-01-26 13:30

R语言基础作业

R语言作业1、打开Rstudio告诉我它的工作目录。

民先生·2023-01-26 12:53

R语言与支持向量机SVM应用实例

IRIS数据集简介IRIS数据集中的数据源于1936年费希尔法发表的一篇论文。彼时他收集了三种鸢尾花（分别标记为setosa、versicolor和virginical）的花萼和花瓣数据。包括花萼的长度和宽度，以及花瓣的长度和宽度。我们将根据这四个特征来建立支持向量机模型从而实现对三种鸢尾花的分类判别任务。有关数据可以从datasets软件包中的iris数据集里获取，下面我们演示性地列出了前5行数

Ethan_pika·2023-01-26 09:46

【冰糖R语言】Error in predict.svm(ret, xhold, decision.values = TRUE) : Model is empty!

在使用e1071中的svm模型进行分类时报错“Errorinpredict.svm(ret,xhold,decision.values=TRUE):Modelisempty!”即在predict.svm中显示“Modelisempty”错误判断条件为object$tot.nSV<1即当svm模型中总支持向量数小于1时，会报出此错误要避免此问题，主要需要检查自己的输入数据格式是否正确，是否包含不合适

冰糖不在家·2023-01-26 09:14

R语言入门知识

R语言入门知识1.R、RStudio安装2.包的管理3.获取帮助4.工作路径管理5.保存与加载工作空间6.加载内置的数据集7.工作环境中的对象操作1.R、RStudio安装https://mirrors.ustc.edu.cn

Elpayaso-j·2023-01-26 08:31

生信零基础 Day4 by Sure栗子

R语言操作初级入门安装跟着网上教程就行，一找一大把，这里把官网贴上来，再推荐一本书就基本没问题了。Rstudio也要安装啊，它是操作台。

Sure栗子·2023-01-26 07:22

R语言学习

1基本命令getwd(),setwd()#查看及改变工作目录dev.off(),dev.new()#图形设备关闭，新建rm(list=ls())#删除所有的对象a=1:10,dim(a)=c(2,5),View(a)#设置变量a为2行5列is.matrix(a)#判断数据类型as.data.frame(a)#转换数据类型str(a)#查看数据结构d=options(),length(d),e=d$

bettermaan·2023-01-26 07:10

基因表达相关性也可以用弦图可视化（R语言）

纪伟讲测序·2023-01-26 02:40

大数据名词

大数据当我们使用普通R语言和python数据库来处理数据时，一般都是小的数据（小于100G），当大于100G时，用普通数据库时无法很好的处理，就必须要Spark、handook来处理。

崔吉龙·2023-01-26 01:50

CSDN付费专栏写作感悟及成长之路、兼论学习会员模式的创作者协同效应

#总结、感恩#博客地址及对应专栏地址：博主博客地址：博主R语言专栏地址（R语言从入门到机器学习、持续输出已经超过1000篇文章）博主数据科学专栏地址（数据科学从0到1）、持续输出已经超过1000

Data+Science+Insight·2023-01-26 01:05

jmeter如何使用Python脚本

1.首先在官网下载支持Python语言的jmeter语言扩展包下载地址：JythonStandalone步骤一：选择最新版本即可步骤二：选择右上角download，选择jar包2.把下载的

winterD_97d9·2023-01-26 01:27

R语言实现拟合神经网络预测和结果可视化

神经网络一直是迷人的机器学习模型之一，不仅因为花哨的反向传播算法，而且还因为它们的复杂性（考虑到许多隐藏层的深度学习）和受大脑启发的结构。神经网络并不总是流行，部分原因是它们在某些情况下仍然计算成本高昂，部分原因是与支持向量机（SVM）等简单方法相比，它们似乎没有产生更好的结果。然而，最近神经网络变得流行起来。在这篇文章中，我们将拟合神经网络，并将线性模型作为比较。数据集数据集是郊区房屋价格数据的

拓端研究室TRL·2023-01-25 23:35

ggplot2绘图细节总结

修改x轴绘图顺序通过设置x轴factor顺序实现：用forcats包：fct_inorder按照第一次出现的次序排列；fct_infreq按照出现的频率排列。data$Factor<-fct_inorder(data$Factor)ggplot(data,aes(x=Factor,y=PSM,fill=Charge))+scale_fill_manual("Charge",values=mycol

MJades·2023-01-25 22:40

求问R语言分层抽样合并两个数据框为什么出现了空集

求问R语言分层抽样合并两个数据框为什么出现了空集rbind计算不了#分层抽样mydata<-read.csv(“dat.csv”)#simsample简单随机抽样函数simsample=function

weixin_47228617·2023-01-25 12:08

R语言数据可视化包ggplot2画图之散点图

ggplot2的功能很强大，并因为其出色的画图能力而闻名，下面来介绍一下它的基本画图功能，本期介绍散点图的基本画法。

星途*·2023-01-25 10:46

R语言自学笔记：作图基础（plot、ggplot）

一.plot1.使用plot以散点图为例系统自带的函数，用于作图，例如对mtcars中某两列的数据绘制散点图。>with(mtcars,plot(mpg,wt,type="p",main="Example",+sub="relationbetweenwtandmpg",+xlab="mpg",ylab="wt",col="blue",+xlim=range(mpg),ylim=range(wt),

阳露载天·2023-01-25 10:44

R语言中ggplot的一些命令行总结

#前面的变成语言不是很规范，略看#用ggplot作散点图>qplot(carat,price,data=diamonds)#演示数据集diamonds，作散点图，carat为横坐标，prince为纵坐标>qplot(log(carat),log(price),data=diamonds)#由散点图发现二者有关系，于是对数化>qplot(carat,x*y*z,data=diamonds)#横纵坐标

the_marvellous_yolk·2023-01-25 10:44

使用ggplot2画图

Whyuseggplot2ggplot2是我见过最humanfriendly的画图软件，这得益于LelandWilkinson在他的著作《TheGrammarofGraphics》中提出了一套图形语法，

macyang·2023-01-25 10:13

ggplot2学习之1——ggplot函数

这里写自定义目录标题说明函数名及参数1、双参数使用2、单参数使用3、缺省使用说明R语言的版本为4.0.2，IDE为Rstudio，版本为1.3.959。

行僧行僧·2023-01-25 10:13

R语言学习—— ggplot2函数

最近在自学R语言，但是从纯粹的理论开始学习太慢了而且没有实操不太行，所以目前是在实际应用中查漏补缺，遇到什么临时学什么，然后把笔记都一一记录下啦。

今天学会Python了吗·2023-01-25 10:12

ggplot绘图

如何生成可参考右边的帮助文档文章目录ggolot绘图一、横坐标为日期二、分类多图例ggolot绘图这里介绍下ggplot绘图过程中遇到的一些问题：横坐标为日期分类多图例一、横坐标为日期#1、引用R包：library(ggplot2

gummy_bear·2023-01-25 10:42

如何在 ggplot2 中删除网格线（附示例）

在ggplot2中删除网格线的最简单方法是使用theme_classic()：ggplot(df,aes(x=x,y=y))+geom_point()+theme_classic()

Mrrunsen·2023-01-25 10:12

ggplot2学习笔记3：ggplot()基本用法

GettingStartedwithggplot2首先明确一下ggplot()画出的图所具备的要素数据：必须以数据框的形式作为参数映射：呈现数据与视觉变量之间的关系（aestheticmappings）

灯bupa冷·2023-01-25 10:11

Windows下的Conda安装并创建python环境

Anaconda是一个免费开源的Python和R语言的发行版本，用于计算科学，Anaconda致力于简化包管理和部署。Anaconda的包使用软件包管理系统Conda进行管理。

花开花落的个人博客·2023-01-23 19:57

R语言使用GGally包的ggpairs函数可视化分组多变量的两两关系图、对角线上连续变量密度图、离散变量条形图、两两关系图中包含散点图、直方图、箱图以及总体相关性和分组相关性分析

R语言使用GGally包的ggpairs函数可视化分组多变量的两两关系图、对角线上连续变量密度图、离散变量条形图、两两关系图中包含散点图、直方图、箱图以及总体相关性和分组相关性分析目录

Data+Science+Insight·2023-01-22 20:49

R语言数据分析与可视化笔记

R语言数据分析与可视化笔记一、假设检验1.正态性检验2.方差齐性检验（1）Bartlett检验（2）Levene检验（3）Fligner-Killeen检验3.t检验（1）单样本t检验（2）两样本t检验非成对两样本

M-1015·2023-01-22 18:57

电商如何做数据分析？方法步骤+实战项目打包送，资深分析师整理

首先，纠正大家的一个想法：数据分析并不是要对工具有太多的要求，会基本的Excel数据透视表，图表可视化等基本操作即可，至于高端点的spss，Python，r语言等统计和BI工具来说是进阶的水平，这个下面再说

Leo.yuan·2023-01-22 10:34

R语言使用lm函数拟合多元线性回归模型、假定预测变量之间有交互作用（Multiple linear regression with interactions）

R语言使用lm函数拟合多元线性回归模型、假定预测变量之间有交互作用（Multiplelinearregressionwithinteractions）目录

Data+Science+Insight·2023-01-21 19:03

【R语言】交互作用测试数据

#载入数据data<-read.csv("分娩镇痛与7周产后预后评分.csv")str(data)data$Score<-as.numeric(data$Score)data$LaborAnalgesia<-as.factor(data$LaborAnalgesia)data$Delivery<-as.factor(data$Delivery)data$ID<-as.factor(data$ID)

qsub·2023-01-21 19:02

回归代码_二元Logist回归及交互作用在R语言实现代码

[email protected]联系我们：137704924或372699348群1-5：科研讨论、文献汇报群网站：http://www.sleep-brain.com/以下是二元Logist回归以及相乘交互作用R语言代码

滨封·2023-01-21 19:01

R语言对正交实验结果（含交互作用）进行极差分析与方差分析实例

题目某工厂为了提高某产品的收率，根据经验和分析，认为反应温度A、反应时间B、碱用量C和催化剂种类D可能对产品的收率造成较大的影响,并考虑交互作用AB，AC。用正交表L8(27)安排试验，试验方案及结果如下表所示，试用直观分析和方差分析来分析结果。解答1数据预处理读取数据，对各因子列数据进行因子化处理，并将最后一列y对应值赋值给responsemydata=read.csv("data2.csv",

潜水玩家·2023-01-21 19:29

R语言中利用visreg包实现模型可视化

博客来源：https://mp.weixin.qq.com/s/boJra1Fzc8ICGOh8cWFoeg

zoujiahui_2018·2023-01-21 19:28

R语言logistic回归交互项（交互作用）的可视化分析3

既往我们对logistic回归交互项（交互作用）进行了可视化分析，很多人对交互作用影响还不是很明白，都在后台发私信询问。其实交互作用就是一个变量通过对另一个变量的影响，导致结局变量改变,最常见的就是我们药物之间的交互作用，比如β受体阻滞剂对血糖有影响，同时和降糖药使用可能会加强或者减弱降糖药的降糖效果，这就是交互作用。通常分类和连续变量之间的交互作用可以解释为分类变量斜率的变化，继续使用我们的不孕

天桥下的卖艺者·2023-01-21 19:27

stata行logistic回归交互项（交互作用）的可视化分析(1)

在既往文章中，我们已经介绍了怎么使用R语言可视化visreg包对交互作用进行可视化分析（见下图），在既往文章中，我们已经使用R语言和SPSS分别绘制了logistic回归交互效应的可视化分析，

天桥下的卖艺者·2023-01-21 19:27

R语言logistic回归交互项（交互作用）的可视化分析2

在既往文章中，我们已经介绍了怎么使用R语言可视化visreg包对交互作用进行可视化分析（见下图），但是使用visreg包后我们对图形的细节掌控力不够，今天我们使用重新绘制手动图形，这在SCI论

天桥下的卖艺者·2023-01-21 19:26

R语言logistic回归交互项（交互作用）的可视化分析

交互作用我们在前面已经说过，就不具体说了。在SCI论文中可以起到画龙点睛，并能进一步挖掘数据之间的亚组关系，进行数据挖掘也非常实用，交互项的可视化能把交互数据之间的关系明白的展示出来，在实际论文中绝对是加分项，废话不多说，我们实操一下。我们这次使用的是人流后导致不孕的数据集，我们先导入看一下library(rms)bc<-read.csv("E:/r/test/buyunzheng.csv",se

天桥下的卖艺者·2023-01-21 19:56

R语言基于visreg 包COX回归和连续变量交互效应（交互作用）的可视化分析

在既往文章中，我们已经介绍了怎么使用R语言和SPSS对logistic回归亚组交互效应（交互作用）进行可视化分析（见下图）后台有粉丝问能不能进行COX

天桥下的卖艺者·2023-01-21 19:25

r语言热图对列不进行聚类_R语言制作热图的一个小实例

生信草堂浙大生信博士团队倾力打造的一个科研人员学习交流的公众微信平台。我们致力于科研社区服务，分享最前沿的科技进展，提供生信分析方法，解读经典分析案例，公众数据库的挖掘和临床数据统计分析。在此我们欢迎各位的加入！戳这里的生信草堂公众号原文，请多关注哦~热图(heatmap)用不同的颜色和颜色的深浅来展示数据之间的差异，直观、美丽、大方，深受科研工作者的喜爱，尤其是转录组类的文章里，几乎必有一幅热图

weixin_39761647·2023-01-21 17:18

r语言逻辑回归_R语言机器学习 | 3 逻辑回归

1基础知识逻辑回归(logisticregression)是线性回归的推广，属于广义线性模型(generalizedlinearmodel)的一种。所谓广义线性回归，本质上仍然是线性回归，只是把线性回归中的y变成了关于y的函数。举个例子，最简单的单个自变量的线性回归方程为：y=ax+b，现在把y在对数尺度上进行变换，即变为lny=ax+b，也就是y=exp(ax+b)。该回归方程显然是非线性的，但

weixin_39608300·2023-01-21 12:11

r语言逻辑回归_R语言——逻辑回归

#逻辑回归，利用逻辑回归解决二分类问题#irisirislevels(iris$Species)#数据预处理nrow(iris)iris1<-iris[iris$Species!="setosa",]iris1levels(iris1$Species)iris1$Species<-factor(iris1$Species)levels(iris1$Species)#将数据分成训练集和测试集#利用c

weixin_39697143·2023-01-21 12:11

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