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ggplot2
ggplot2
绘制棒棒糖图——Lollipop chart
棒棒糖图,就是长得像棒棒糖一样的图(一句废话),和柱形图,散点图想要表达的意思是一致的,不过展示会更加好看一点,是点图geom_point()和堆叠图geom_segment()的组合,今天这篇文章主要介绍几种常见的棒棒图表现形式,以及一些美化。0.准备工作#读取数据>datahead(data)IDNUM1A_1642A_2593A_3534A_4585A_558#调用R包>library(ti
Wei_Sun
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2023-12-20 13:27
ggplot2
绘制堆积柱形图
前面给大家简单介绍了如何用☞R绘制堆积柱形图,今天我们来看看如何用
ggplot2
这个包来绘制堆积柱形图。
生信交流平台
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2023-12-20 03:33
R语言绘制频率直方图
频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式,同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型;R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便,但是当遇到多组数据的时候就不如
ggplot2
绘制来的方便
种地的pele
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2023-12-19 22:31
宏基因组经典论文复现(1)
ggplot2
绘制散点图
之前写了不少微生物多样性的数据可视化案例,但是始终没有与宏基因组接触,如今大势所趋不得不走上这条道路,论文复现也得早日提上日程,今天就让我们开始来复现下述论文中的图Expandedcatalogofmicrobialgenesandmetagenome-assembledgenomesfromthepiggutmicrobiome今天先从图a开始,本打算将全部图片代码一起展示,但是的确很耗时遂作罢
R语言数据分析指南
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2023-12-19 12:46
R语言文本分析《三国演义》
getwd()setwd("E:\\三国")library(jiebaR)library(
ggplot2
)library(jpeg)library(reshape2)library(wordcloud)
乔巴爱雪雪
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2023-12-18 01:31
R语言
R
文本分析
词频统计
python--seaborn散点图
seaborn是专门用于统计数据可视化的包,可媲美R语言中的
ggplot2
包。本文介绍用seaborn绘制散点图。
FTDdata
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2023-12-17 12:27
跟着Nature Communications学作图:R语言
ggplot2
画图展示捐赠者的临床概况
www.nature.com/articles/s41467-022-33663-5#Sec18今天的推文我们重复一下论文中的Figure1a,看起来非常像一个表格,很有意思image.png我们使用
ggplot2
小明的数据分析笔记本
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2023-12-17 09:19
R语言做箱形图
R语言做箱形图library(
ggplot2
)#loadingdatasetandstoringitindsvariableds<-read.csv("csv文件路径",header=TRUE)crop3
sherlockjjobs
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2023-12-14 21:02
R
r语言
开发语言
利用ggplot绘制密度散点图(同时附带spearman的R和P值)
正式操作首先,加载一些必须的包library(
ggplot2
)library(dplyr)library(viridis)#使用viridis提供的翠
Kevin_Hhui
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2023-12-14 15:49
ggplot2
回顾(4): 瓦片图、多边形图
瓦片图根据所提供点的位置和数量将画板规则地均分为若干块,再将点周围的一小块方形区域涂色small%ggplot(aes(x,y))+geom_tile(fill="lightblue")多边形图沿着第一个点到最后一个点,形成封闭的图形small%ggplot(aes(x,y))+geom_polygon()+geom_point(size=4)circle%ggplot(aes(x,y))+geo
TOP生物信息
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2023-12-06 16:25
R plot图片背景设置为透明_万能转换:R图转成Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等...
你和PPT高手之间,就只差一个iSlideExcel改变了你的基因名,30%相关Nature文章受影响,NCBI也受波及特点可以用命令将交互式R图或
ggplot2
、Lattice或baseR图保存到MicrosoftWor
weixin_39851008
·
2023-12-06 07:12
R
plot图片背景设置为透明
ggplot2
回顾(7): geom_bar()和 geom_histogram()比较
适用范围不同bar图x一般为离散变量,直方图x一般为连续变量默认的统计变换不同前者是stat="count",统计一个数量就完事了,即生成新变量..count..diamonds%>%ggplot(aes(x=cut))+geom_bar()后者是stat="bin",生成新变量..count..和..density..diamonds%>%ggplot(aes(x=carat))+geom_hi
TOP生物信息
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2023-12-05 20:59
ggplot2
回顾(14): 绘图函数--以平行坐标图为例
library(
ggplot2
)library(reshape2)library(plyr)归一化range01testtestRNAX2005X2006X2007X2008X20091piRNA132212mRNA112133miRNA445314lncRNA351245circRNA12111&
TOP生物信息
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2023-12-04 20:26
跟着Nature Communications学作图:R语言
ggplot2
气泡图组合水平柱形图完整示例
论文Pan-Africangenomedemonstrateshowpopulation-specificgenomegraphsimprovehigh-throughputsequencingdataanalysishttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31724-3本地pdfs41467-022-31724-3.pdf论文中公布了大部分图的数据,
小明的数据分析笔记本
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2023-12-03 14:44
R语言中如何水平放置Y轴坐标的数字?
方法一:使用
ggplot2
包
ggplot2
是R语言中一个非常流行的绘图包,它提供了灵活且美观的图形绘制功能。
嵌入式之禅
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2023-12-03 02:20
r语言
python
开发语言
R语言
03.查看不同粒度下的分群走向
list=ls())library(Seurat)#devtools::install_github('satijalab/seurat-data')library(SeuratData)library(
ggplot2
科研小徐
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2023-12-02 20:56
2023-11-28-直播单细胞图表美化-seurat数据结构 featureplot dotplot vlnplot
之前跟SCI学umap图|
ggplot2
绘制umap图,坐标位置,颜色,大小还不是你说了算介绍过DimPlot的一些调整方法。
生信小博士
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2023-12-02 17:19
单细胞
直播
跟着Nature Communications学作图:R语言
ggplot2
画世界地图并用md语法添加文字标签
论文MiDAS4:Aglobalcatalogueoffull-length16SrRNAgenesequencesandtaxonomyforstudiesofbacterialcommunitiesinwastewatertreatmentplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29438-7数据链接https://figshare.c
小明的数据分析笔记本
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2023-12-02 15:50
不好好做图的NSC系列(八):
ggplot2
重现Nature文章多组柱状图+散点,这是一场硬仗
最近,看到一篇nature文章,整篇文章的图的风格类似于如下图1,因为第一次见这种图,感觉展示效果不错,所以尝试做一下!图片Fluhr,L.,Mor,U.,Kolodziejczyk,A.A.etal.Gutmicrobiotamodulatesweightgaininmiceafterdiscontinuedsmokeexposure,Nature,2021.本来看着Figure1h很简单,就先
KS科研分享与服务
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2023-12-02 12:53
使用R自带的数据集 Titanic,绘制以下图形 R语言
请确保已安装并加载了
ggplot2
和tidyverse这两个R包,它们将帮助我们进行数
TechInk
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2023-12-02 08:51
r语言
开发语言
R语言
答读者问:
ggplot2
画气泡图展示相关性分析的结果
有读者在公众号后台留言问下图应该如何实现image.png实现这个图的办法很多,今天的推文介绍使用R语言
ggplot2
包实现这个图的方法。
小明的数据分析笔记本
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2023-12-01 09:16
【转载】R语言 如何用ggplot绘制多条折线(附例子)
本文转载自STATOLOGYHowtoPlotMultipleLinesin
ggplot2
(WithExample)-Statology你可以用如下的基本代码在ggplot中绘制多条折线。
thisis_redbrick
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2023-12-01 08:19
r语言
python
开发语言
R
ggplot2
中reorder()如何降序
image.png先画个简单的barplot:library(
ggplot2
)data=read.table("test.txt",header=F)ggplot(data,aes(x=V1,y=V2)
11的雾
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2023-12-01 05:29
ggplot2
绘制PCA图(1)
12个组,每组3个重复,一共36个样品的主成分分析图1、导入包和数据处理library(tidyr)library(dplyr)library(
ggplot2
)data_odata_oS1S2S3S4S5S6S7M17.395760e
Zhigang_Han
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2023-11-30 16:35
学习小组Day4笔记--行
正式开始学习R语言了,今天笔记内容为R语言基础和
ggplot2
的入门学习R语言基础1、认识R与RStudioR是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。
奔跑的羽蒙
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2023-11-30 13:28
R语言
ggplot2
绘制Y轴截断柱形图
有时候做柱形图如果其中某一两个数值非常大,作图的时候其他柱子就非常低,看起来就不是很美观,其中一种办法是对Y轴进行截断,如果单纯使用
ggplot2
的代码实现起来还是相对比较麻烦的,Y叔(ggtree/clusterProfiler
小明的数据分析笔记本
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2023-11-30 03:37
RNA-seq可视化之差异分析得到的FC值,我们能做什么?
首先整理数据datadata2colnames(data2)[2]data2data2[data2$value0&data2$value0.58,][,1]<-"C"image.png
ggplot2
绘制柱状图
热衷组培的二货潜
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2023-11-30 02:28
南丁格尔玫瑰图
1.加载包library(dplyr)library(
ggplot2
)2.生成数据set.seed(1234)temp0=data.frame(city=LETTERS[1:26],patients=round
R语言与SPSS学习笔记
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2023-11-29 15:00
r语言 相关性作图_用R语言进行相关性分析:画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值...
对于读取excel,此处有一个小技巧读取excel方法1.把excel文件另存为CSV文件1png2.png3.png4.png2.按照读取csv文件方法读取dat此名为excel1文件被R语言读取二.利用
ggplot2
JunyuanLI
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
ggplot2
多图层颜色/legend重叠冲突的情况
最近在用
ggplot2
画图的时候遇到了一个挺有意思的bug,因为
ggplot2
以图层的使用著称,但最近在将两张图叠在一起的时候遇到的颜色指定上面的bug,因为都是连续性的数据,同时又都是用的边缘色(color
纷纷不可诉
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2023-11-28 22:14
【R实战 中级方法】十一、中级绘图
通过这些绘图方法的示例,我们将能更好地理解数据,并为后续学习新的
ggplot2
包打下基础。那么开始吧!
佳奥
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2023-11-28 19:02
ggplot2
绘制密度图和直方图
本文讲述如何利用
ggplot2
绘制密度图和直方图准备数据:set.seed(1126)#设置随机种子,让结果可重复data<-rnorm(100)#生成100个符合正态分布的数字min<-floor(min
钿璎纍纍佩珊珊
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2023-11-28 13:01
第二天多套GEO数据集联合分析流程
/s/UYI61Rl0Jf5LPe3MxjXyAA(网速太渣明天继续o(╥﹏╥)o)install.packages(c("shiny","survival","shinyBS","GGally","
ggplot2
沙丘上的小fox
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2023-11-26 16:45
用R语言实现神经网络预测和结果可视化
在R中,可以使用以下代码安装和加载这些包:#安装并加载所需的R包install.packages("neuralnet")install.packages("
ggplot2
")library(neuralnet
DevNinja
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2023-11-26 15:33
r语言
神经网络
开发语言
R语言
数据分析——R语言中
ggplot2
用法(1)
备忘录地址(用来查询一些参数)https://www.maths.usyd.edu.au/u/UG/SM/STAT3022/r/current/Misc/data-visualization-2.1.pdfR语言软件参数R3.6.0安装包、导入包install.package('ggplot')library(ggplot)首先加载数据集这里用的是示例数据,R自带的一个包提供的数据集。dslabs
心灵澄净
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2023-11-26 12:27
数据分析
r语言
数据分析
开发语言
R语言
ggplot2
-颜色设置调参详解
本章是
ggplot2
科研绘图调参的第十一个章节,前十章内容请跳转:ggplot保姆级教程-科研绘图调参细节library(tidyverse)library(
ggplot2
)theme_set(theme_bw
RookieTrevor
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2023-11-26 12:21
R语言vs科研
可视化
r语言
数据分析
【matlab版本的
ggplot2
】
gramm(completedatavisualizationtoolbox,
ggplot2
/R-like)来源:Morel,Pierre.
海洋与大气科学
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2023-11-26 04:46
matlab
开发语言
基因结构图
wilkox/gggenes:➡️️➡️️⬅️️➡️️Drawgenearrowmapsin
ggplot2
(github.com)gggenes包绘制基因结构图–王进的个人网站(jingege.wang
BI_wan
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2023-11-26 03:16
R学习-hist与ggplot练习题-2018-12-04
并将文件数据读取到R软件中;2,将excel表中的数据复制到txt中,并将文件数据读取到R软件中;3,将2中复制的数据直接读取到R软件中;4,使用函数hist()画出班级身高的次数分布图和频率直方图;5,安装
ggplot2
11的雾
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2023-11-25 22:08
ggplot2
优雅的修改图例形状
本节来介绍如何更改图例中键的形状,每个geom都有一个默认的key_glyph,但可以通过在geom调用中声明key_glyph="code_here"来修改它library(tidyverse)ggplot(mtcars,aes(mpg,hp,color=factor(cyl)))+geom_point(key_glyph="abline")ggplot(mtcars,aes(mpg,hp,co
R语言数据分析指南
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2023-11-25 21:53
安装历史版本的R包
articles/219949047-Installing-older-versions-of-packages方法一:用devtoolsrequire(devtools)install_version("
ggplot2
小洁忘了怎么分身
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2023-11-25 18:48
R语言——绘制直方图
R语言——绘制直方图R语言安装Rstidio安装开始绘制直方图安装
ggplot2
包准备数据读取绘图数据调用包开始绘图完毕最近做项目,需要对实验数据绘制直方图,excel绘制之后发现有点丑,尝试用R语言绘制一下
情字何解,怎落笔都不对
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2023-11-25 18:37
r语言
直方图
群体结构分析 | Pophelper 的“平替版”
写在前面终于到了这一天,我又捡起了七八年做群体分析的技能....只是那会我画图就用
ggplot2
,而现在我只用「TBtools」。
生信石头
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2023-11-25 07:46
R语言周期性] 使用R语言进行周期性数据分析和可视化
首先,我们需要加载一些常用的R包,如
ggplot2
和lubridate。
ggplot2
是一个强大的数据可视化包,lubridate用于处理日期和时间数据。library(
ggplot2
)li
风吹麦很
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2023-11-25 06:20
r语言
数据分析
开发语言
R语言
可视化比较数据集中残差和特定样本邻居的残差的分布
#导入必要的库library(
ggplot2
)library(dpl
风吹麦很
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2023-11-25 06:50
R语言
Part 5:R语言作图
1.常用可视化R包作图base
ggplot2
ggpubr拼图par里mfrowgrid.arragecowplotcustomLayoutpatchwork导出pdf()等三段论ggsaveeofficetopptx2
不到7不改名
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2023-11-25 03:53
R语言
ggplot2
做簇状柱形图并添加误差线的一个完整示例
excel文件里,这个excel文件里有三个子表格,每一个子表格的数据如下:image.png总的数据格式image.png现在的需要是做如下的图image.png接下来就介绍如何利用原始数据到最终的图的
ggplot2
小明的数据分析笔记本
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2023-11-24 18:57
NBIS系列单细胞转录组数据分析实战(二):数据降维可视化
#加载所需的R包suppressPackageStartupMessages({library(Seurat)library(cowplot)library(
ggplot2
)library(scran)
Davey1220
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2023-11-24 01:30
t检验(连续变量)和卡方检验(分类变量)
rm(list=ls())library(
ggplot2
)library(ggpubr)library(cowplot)data%group_by(Species,SepalLength)%>%summarize
hx2024
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2023-11-23 10:40
肿瘤生信分析
分类
数据挖掘
人工智能
R语言:安装和使用
ggplot2
数据可视化库
R语言:安装和使用
ggplot2
数据可视化库
ggplot2
是R语言中一款强大的数据可视化库,它提供了丰富的绘图功能和灵活的图形定制选项。本文将详细介绍如何安装和使用
ggplot2
库。
领域征途探险
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2023-11-23 07:51
信息可视化
r语言
开发语言
R语言
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