ggplot2

R可视化——ggplot2包绘制哑铃图和棒棒糖图

哑铃图（DumbbellChart），顾名思义，形似哑铃，每个数据由最低和最高值及一条连线组成，是展示数据差异的可视化图表之一。棒棒糖图（LollipopChart），也称为火柴杆图，与条形图作用类似，是柱状图与散点图的结合图形，常用于比较多个类别的值之间的差异。1、设置工作环境、加载R包rm(list=ls())setwd("D:\\棒棒糖图&哑铃图")#设置工作环境#加载R包library(g
科研那点事儿·2024-01-26 21:32

跟着Nature Metabolism学作图:R语言ggplot2一次性展示很多个饼图

论文Single-cellprofilingofvascularendothelialcellsrevealsprogressiveorgan-specificvulnerabilitiesduringobesityhttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00674-x#Sec58s42255-022-00674-x.pdfhttps://github
小明的数据分析笔记本·2024-01-26 14:02

跟着Microbiome学作图：R语言ggplot2画堆积柱形图展示微生物门水平的相对丰度

论文Reduceddiversityandalteredcompositionofthegutmicrobiomeinindividualswithmyalgicencephalomyelitis/chronicfatiguesyndrome本地文件Giloteaux2016_Article_ReducedDiversityAndAlteredComp.pdfimage.png今天的推文我们来重复
小明的数据分析笔记本·2024-01-26 04:46

R 中调用python

例如，这里我们使用pandas进行一些数据操作，然后使用ggplot2绘制结果：image.pngython对象都存在于一个持久会话中，因此可以像R对象一样跨块使用。
Liam_ml·2024-01-24 21:42

跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图及多图共享图例

论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.p
小明的数据分析笔记本·2024-01-24 20:34

空间绘图 | Python-pykrige包-克里金(Kriging)插值计算及可视化绘制

前面两篇推文我们分别介绍了使用Python和R进行IDW(反距离加权法)插值的计算及结果的可视化过程，详细内容可见如下：Python-IDW插值计算及可视化绘制R-gstat-ggplot2IDW计算及空间插值可视化绘制
数据魅力(DataCharm)·2024-01-24 14:43

绘图提高篇 | Python - IDW插值计算及可视化绘制

前面几篇推文我们分辨介绍了使用Python和R绘制了二维核密度空间插值方法，并使用了Python可视化库plotnine、Basemap以及R的ggplot2完成了相关可视化教程的绘制推文，详细内容如下
数据魅力(DataCharm)·2024-01-24 14:12

绘图提高篇 | ggplot2+sf 核密度空间插值可视化绘制

本期推文我们就介绍下使用R进行核密度估计、空间插值计算以及ggplot2+sf的可视化绘制操作。涉及的主要知识点如下：R
数据魅力(DataCharm)·2024-01-24 14:12

绘图提高篇 | R-gstat-ggplot2 IDW计算及空间插值可视化

上一篇文章，我们使用了Python自定义IDW插值函数进行了IDW空间插值及可视化的plotnine、Basemap的绘制方法，本期推文我们将使用R-gstat进行IDW插值计算和使用ggplot2进行可视化绘制
数据魅力(DataCharm)·2024-01-24 14:39

跟着Nature学作图：R语言ggplot2散点图和添加辅助线完整示例

论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分组图数据，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataF
小明的数据分析笔记本·2024-01-23 18:03

ggplot2点的形状设置

当需要映射到数据当中时，需转化为因子mat.cities$population=factor(mat.cities$population)shape=mat.cities$population成功
赵会成·2024-01-23 08:43

R语言 | ggplot2-boxplot的上下边缘的横线去哪了

废话ggplot2是R语言绘图神奇，在各种扩展包的加持下无往而不胜。然而使用ggplot2绘制boxplot的时候，生成的图片看着总有一丝丝的别扭。
阿狸的窝·2024-01-23 00:47

跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图突出强调其中某些点

论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.p
小明的数据分析笔记本·2024-01-22 15:10

R for data Science（二）

ggplot2数据可视化这次我们接着上面的继续讲解数据可视化，数据集是mpg数据集imageimage那我们怎么做出上面的这些图呢？
一路向前_莫问前程_前程似锦·2024-01-22 10:32

带标签注释的柱状图加散点图

https://drsimonj.svbtle.com/plotting-individual-observations-and-group-means-with-ggplot2图片发自App
热衷组培的二货潜·2024-01-21 21:23

04高通量测序-R实现主成分分析

R实现主成分分析如何使用prcomp()函数来做PCA如何使用基础图形和ggplot2绘制PCA图如何确定每个主成分占多少变动如何检查载荷得分（LoadingScores），以确定哪些变量对图表有最大的影响
不到7不改名·2024-01-21 12:35

R语言的ggplot2绘制多个分组簇状柱状图

今天要分享的是ggplot2去绘制多个分组簇状柱状图，话不多说，现在开始吧：老规矩，还是先看数据和最终的效果图，进行解释后，再说明如何绘制数据情况最终图情况可以明显看到，图代表的意思是不同年龄组、性别的高血压和糖尿病的患病率年龄是
kaiming0000·2024-01-21 09:56

R 语言学习 case3：柱状图（ggchart）

index.htmlstep1:安装工具包install.packages("ggcharts")install.packages("tidytext")step2:导入工具包library(dplyr)library(ggplot2
早起CaiCai·2024-01-21 09:55

R语言的ggplot2绘制分组折线图？

R绘制分组折线图.R首先看数据情况：group有3组。Time有3组，数据意思是在3组3个时间点测量了某指标，现在要绘制组1、组2、组3某指标y按时间的变化趋势数据情况：看看最终的效果图如下：下面是本次使用的代码.libPaths()setwd("C:/Users/12974/Desktop/百度经验/03图形绘制/03R绘制分组折线图")#设置工作空间getwd()#加载工作空间##导入数据da
kaiming0000·2024-01-21 09:54

10.ggplot2——坐标轴和刻度位置（一）

10坐标轴和刻度位置每个图都有两个对应于坐标轴的x和y刻度图形属性。通常，用户明确指定映射到x和y的变量，但有时图形属性被映射到计算变量，就像geom_histogram()那样，而且不需要明确指定。例如，和以下绘图规则相同：ggplot(mpg,aes(x=displ))+geom_histogram()ggplot(mpg,aes(x=displ,y=after_stat(count)))+g
denghb001·2024-01-21 08:09

跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2普通箱线图/分组箱线图/分面箱线图

论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.p
小明的数据分析笔记本·2024-01-20 21:48

可视化：中国地图 python/ geopandas/ echarts

之前我们介绍了如何用R语言中的ggplot2画中国地图。本篇我们在python中搞定地图，主要结合我在BMW丰富的画地图经历总结一下，到lync很久没用python工作了，手生。
YueTann·2024-01-19 05:37

ggplot2绘制折线图

加载需要的R包：library(reshape2)library(tidyverse)library(ggplot2)导入数据：data<-read.
钿璎纍纍佩珊珊·2024-01-19 04:09

R 数据可视化 —— 图形排列之 patchwork

前言上一节讲的是如何使用cowplot包来对图形进行排列对齐，今天要讲的是，如何使用patchwork包来排列图形patchwork包主要针对的是ggplot2图形，也可以是其他图像系统绘制的图形。
名本无名·2024-01-18 11:29

重现已有的图标Fig3-d 带显著性差异标志的箱线图box plot ，热图矩阵和正负值柱状图的绘制 2020-12-07

数据准备与格式：读取数据d<-read.csv(file.choose())d导入需要的包：library(ggplot2)library(ggthemr)library(ggpubr)ggthemr(
RashidinAbdu·2024-01-18 07:37

跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言ggplot2作图展示方差分解的结果

之前的推文分享过一篇内容是重复了一篇NatureEcology&Evolution期刊论文的方差分解过程，虽然对运行过程还是不太理解，但是能得到结果。今天的推文我们利用得到的结果复现一下论文中的Figure4a的右半部分，左侧的堆积柱形图以及如何把两个图组合到一起争取再单独出一期推文介绍（其实是最近有点创作乏力，一篇推文的内容水成两篇哈哈哈哈）image.png首先是运行之前推文的代码得到画图数据
小明的数据分析笔记本·2024-01-17 23:25

tidyverse包简介

>library(tidyverse)──Attachingpackages───────────────────────────────────────tidyverse1.2.1──✔ggplot22.2.1
LeoinUSA·2024-01-17 19:33

R语言画三维散点图展示主成分分析（PCA）的结果

但是之前自己也没有画过，正好今天有人问到了这个，就查了查ggplot2的扩展包有没有做这个事情的，找了一个ggrgl，接下来试一下能不能行首先是安装帮助文档https://github.com/coolbutuseless
小明的数据分析笔记本·2024-01-17 04:37

跟着Nature Communications学画图：R语言ggplot2画带有底纹的柱形图

论文是Bioactivitydescriptorsforuncharacterizedchemicalcompoundsimage.png本地存储文件名s41467-021-24150-4.pdf公众号后台有读者留言问到了这个论文里的一些图的实现办法，但是我没有找到作图用到的原始数据。复现起来还是比较麻烦的。浏览全文的时候发现了其中一个带有底纹的柱形图。这个还是比较有用的。因为有的期刊可能会要求配
小明的数据分析笔记本·2024-01-17 01:30

ggplot2绘制GO富集分析柱状图

1.使用clusterProfiler包进行GO富集分析使用clusterProfiler的enrichGO函数来获取GO分析gene_idn_word||(nchar(x)>40)){if(nchar(x)>40)x<-substr(x,1,40)x<-paste(paste(strsplit(x,"")[[1]][1:min(length(strsplit(x,"")[[1]]),n_word
Seurat_Satija·2024-01-16 18:25

ggplot2添加特殊字符一文就够

之前写过一篇文档来介绍如何给标签添加特殊字符，近来有朋友需要画图正好又遇到更加复杂的需求，索性来一篇文档对此进行归纳总结之前的方法通过bquote函数进行特殊字符格式的添加，如下所示iris%>%as_tibble()%>%ggplot(aes(Sepal.Length,Sepal.Width,fill=Species))+geom_point(size=4,pch=21,color="white
R语言数据分析指南·2024-01-16 01:56

R语言ggplot2漂亮的热图和配色 简单小例子

偶然间在github上发现的这个链接，示例数据和代码都有，很好的R语言学习素材链接是https://github.com/blmoore/blogR，主要内容有image.png光看这个可能有些枯燥，我们来看结果图image.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.png这些看起来是不是还挺酷炫的，接下来的推文争取把这些图片对应的代码全部重复一遍，
小明的数据分析笔记本·2024-01-16 01:44

R语言ggplot2作图配色相关R包

R语言ggplot2作图的时候配色如果不知道如何选择，可以参考如下链接https://r-charts.com/color-palettes/image.pngimage.pngimage.png这里分别提供了连续型数据和离散型数据的配色
小明的数据分析笔记本·2024-01-15 21:24

R绘图中的分面记录

library(ggplot2)a4=read.csv("C:/Users/jszx/Desktop/plot_data_20210524/noncoding_case.csv",header=T,na.strings
Atourist·2024-01-14 03:40

R 绘制交互式地图 Mapview

1.leaflet1.1加载China地图library(ggplot2)library(dplyr)library(
jamesjin63·2024-01-13 21:05

添加统计检验 P value

使用Rggplot2自带的鸢尾花iris数据集，比较setosa、versicolor、virginica三类鸢尾花的Sepal.Width是否具有显著差异。
qq_21478261·2024-01-13 05:18

ggplot2绘制-堆叠柱形图参数细讲

ggplot2绘制-堆叠柱形图参数细讲昨天我们主要说了如何使用群落微生物的物种属水平丰度表来绘制堆叠柱形图。
fafu生信小蘑菇·2024-01-13 03:22

使用element_text在ggplot2中自定义文本

ggplot2的主题系统可以让我们更好的控制图形非数据元素的细节，通过更加精细的修改来提升图像的美感，ggplot2的主题系统自带多个element_功能element_text()element_line
R语言数据分析指南·2024-01-12 06:48

R语言-配对T检验-配对连线图（Paried_line plots），也称为前后配对图（Before-after plots）

list=ls())library(ggstatsplot)#remove.packages(c("vctrs","dplyr"))#install.packages("dplyr")library(ggplot2
MRI_lab·2024-01-10 21:34

跟着Nature学作图：R语言ggplot2分组折线图完整实例

论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分组图数据，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的Figure1cimage
小明的数据分析笔记本·2024-01-10 15:44

ggplot2绘制圆形热图

常见的热图看腻了，这节来介绍如何通过ggplot2绘制圆形热图，为了方便各位观众老爷观看，我制作了一个交互式文档https://mp.weixin.qq.com/s/lbTqk8ZlLp6A-VX-MYLgFA
R语言数据分析指南·2024-01-10 13:53

R语言ggplot2可视化多项式曲线、多项式方程以及多项式模型评估指标R方：使用ploynom包拟合三阶多项式模型

R语言ggplot2可视化多项式曲线、多项式方程以及多项式模型评估指标R方：使用ploynom包拟合三阶多项式模型目录
statistics.insight·2024-01-10 13:56

可视化学习笔记(八)：ggplot2：分面

1、分面设定1.1两种分面设定第一种分面是使用facet_grid()函数，它允许指定变量作为横向（或纵向）分割图像的依据facet_grid(row_var~col_var)当只想单独指定行分面或列分面时，没有指定分面变量的参数需要用'.'代替第二种是使用facet_wrap()函数，使用后则将图形按纸上的文字一样依次排布，但用法与第一种方法有所区别facet_wrap(row_var~)fac
100gle·2024-01-10 02:09

R语言ggplot2堆积柱形图添加误差线的简单小例子

最近有人在公众号后台留言问到这个问题，今天的推文介绍一下ggplot2做堆积柱形图并添加误差线的办法完整代码'''堆积柱形图添加误差线'''getwd()library(ggplot2)library(
小明的数据分析笔记本·2024-01-09 18:16

r语言拟合曲线

r语言拟合曲线#圆滑曲线library(ggalt)library(ggplot2)df<-read.csv("lqs-1.csv",header=T)p2<-ggplot(data=df,
不懂python不懂R·2024-01-09 13:06

【R>>ggplot2】坐标轴刻度位置调整

需求描述：画箱式图或柱状图，进行坐标轴翻转后，默认情况下x轴跑到最下边，吧最下面的刻度调整到最上面。下面以ToothGrowth为例：rm(list=ls())library(tidyverse)library(ggsci)data(ToothGrowth)head(ToothGrowth)ToothGrowth$dose<-factor(ToothGrowth$dose)ggplot(Tooth
高大石头·2024-01-08 18:48

R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

首先是示例数据image.png使用R语言的ggplot2做一个热图#install.packages("see")df<-read.csv("20210809_example.csv")library
小明的数据分析笔记本·2024-01-08 11:40

ggplot2优雅的自定义分面轴刻度

本节来解释如何使用ggh4x自带的facetted_pos_scales()来自定义分面图形的轴刻度加载R包library(tidyverse)library(ggh4x)数据清洗air_df%pivot_longer(cols=1:4,names_to="Env_vars",values_to="Values")绘制分面折线图P<-ggplot(air_df,aes(x=Day,y=Values
R语言数据分析指南·2024-01-08 06:29

R 数据可视化 —— ggplot 散点图

ggplot2提供了geom_point函数，以及它的变体：geom_jitter()、geom_count()和geom_bin2d()来绘制点图。
名本无名·2024-01-07 13:36

2019-06-03绘制带有误差线的折线图

本段代码是探究不同处理条件，伤口面积随着时间的变化，通过Rmisc包summarySE函数，得出图片如下：Rplot.pngsetwd("~/Desktop/190603")getwd()library("ggplot2
森尼啊·2024-01-07 09:07
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