r语言ggplot2 第85页

R语言 ——kmodes()所属R语言包

kmodes(klaR)kmodes()所属R语言包：klaRK-ModesClusteringK-Modes聚类译者：生物统计家园网机器人LoveR描述----------Description---

幸运六叶草·2023-03-20 10:27

R语言---生存分析---笔记整理

6.代码实现原文链接：R语言-Survivalanalysis（生存分析）|KeepNotesblog1.什么是生存分析？

浅沫～·2023-03-20 10:27

R语言dplyr

导入所需包install.packages("nycflights13")library(nycflights13)library(tidyverse)打开文件getwd()##查看默认存储路径，再将csv文档存入文件夹打开library(readxl)read.csv("hw1_a")View(hw1_a)#查看整个数据集str(hw1_a)#查看数据框各个变量的类型summary(hw1_a)

小新122·2023-03-20 09:27

用人工智能方法计算水果难题------遗传算法篇

作者：梁凯R语言中文社区专栏作者知乎ID：https://www.zhihu.com/people/liang-kai-77

R3eE9y2OeFcU40·2023-03-20 07:21

R语言学习笔记_06

方差分析以焦虑症治疗为例，现有两种治疗方案：认知行为疗法（CBT）和眼动脱敏再加工法（EMDR）。我们招募10位焦虑症患者作为志愿者，随机分配一半的人接受为期五周/六个月的CBT，另外一半接受为期五周/六个月的EMDR。在治疗结束时，要求每位患者都填写状态特质焦虑问卷（STAI），也就是一份焦虑度测量的自我评测报告。方差分析主要通过F检验来进行效果评测。现假设你对治疗方案差异和它随时间的改变都感兴

nnlrl·2023-03-20 03:43

[R语言] Heatmap绘图经验总结

这里利用R语言中的相关R包，来介绍我的一些Heatmap绘图经验。一

YERA·2023-03-20 01:20

CIS 3100代做、代写C++编程设计、C++代做、代写Object-Oriented调试Matlab程序|代写R语言程序

Object-OrientedProgrammingIFall2018CIS3100ProgrammingAssignment6Forthisassignment,youaretoimplementtheStringclass,thespecificationofwhichisshownbelow.UsingthisStringclassyouarethentoimplementanapplica

wuyubu·2023-03-19 20:38

EMD（经验模态分解）算法一

参考R语言提取时间序列的周期性成分应用EMD，小波滤波器，BAXTER过滤器等的方法进行应用。

cumtzzy·2023-03-19 19:42

R语言初级教程(21): 数据框（下篇）

这是介绍数据框处理的最后一篇文章。10.删掉重复的行有时，数据框会包含重复的行，其中所有变量在两行或更多行中具有完全相同的值。来看个简单的示例：>var1var2var3var4dupsdupsvar1var2var3var411211222113321144411532116615571222注意，第5行与第3行完全相同。要删除所有重复行，可以使用unique()函数：>unique(dups)

R语言和Python学堂·2023-03-19 17:26

【R语言】基因ID转换

做生物学研究的人，难免会遇到各种各样的基因ID号。有我们比较熟悉的也比较直观的基因名字，如TP53。也有其他数据库里，但是也比较常用的ID，如ensemblID，entrezgeneID等等。下图是TP53这个基因在genecard数据库里面的详细信息https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=TP53&keywords=TP53我们可以看

生信交流平台·2023-03-19 15:31

【R语言编程】---install.packages命令报错解决方案

不知道哪里出了问题，Warningininstall.packages:unabletoaccessindexforrepositoryhttps://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib:cannotopenURL'https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'Warningininstall.pa

卡布达b1·2023-03-19 11:26

DoHeatmap 调整热图颜色

[参考链接](https://github.com/satijalab/seurat/issues/1048)library(Seurat)library(ggplot2)pbmc<-readRDS

Zee_李海海·2023-03-19 09:38

R绘图基础指南 | 3. 散点图(一)

3.1绘制基本散点图library(gcookbook)library(ggplot2)#列出我们用到的列head(heightweight[,c("ageYear","heightIn")])>head

木舟笔记·2023-03-19 07:49

[ggplot2]小提琴图经验总结

一、前期准备1.所用软件与版本：R4.0.52.所需R包：ggplot2,cowplot,ggpub,magrittr3.示例数据：iris数据集二、绘

YERA·2023-03-19 07:50

使用R中ggplot2和Hmisc绘制带误差线的柱状图

>BiocManager::install("Biobase",version="3.8")>library("Hiiragi2013")>data("x")>dim(Biobase::exprs(x))>selectedProbes=c(Fgf4="1420085_at",Gata4="1418863_at",+Gata6="1425463_at",Sox2="1416967_at")>libr

热衷组培的二货潜·2023-03-19 05:45

转录组不求人系列(十二): Cell文章最喜欢用的差异基因GO、KEGG富集分析工具

首先最常见的就是对上下调基因的富集分析了，富集分析我们之前出过一期R语言版本的：clusterProfiler：基因功能富集分析的惊喜之作这里就不再赘述了，我们介绍一款NCS文章比较喜欢的、出现率较高的功能富集工具

KS科研分享与服务·2023-03-19 01:07

R语言ggplot2作图小技巧：如何给坐标轴添加minor breaks

需要用到ggh4x这个R包library(ggplot2)library(ggh4x)dat<-data.frame(x=1:10,y=1:10)ggplot(data=dat,aes(x=x,y=y)

小明的数据分析笔记本·2023-03-18 16:00

R语言match函数的应用举例

match函数是生信技能树生信爆款入门课程R语言部分的讲到的一个重要知识点。为加深理解，现在找一个数据集做下练习巩固。

Seurat_·2023-03-18 16:32

R语言学习

R语言操作基础image.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.png

球球_180b·2023-03-18 14:18

swirl包学习R语言--Dates and Times

1/日期的class是Date,时间的是POSIXct,POSIXlt查看系统日期：Sys.Date(),unclass()转化为数字，从1970-01-01计算查看系统时间：Sys.time()as.POSIXlt(),时间按年月日。。。的结构存储weekdays()months()quarters()季度，Q1-Q4strptime()按结构设置一个时间，类似于as.POSIXlt时间可以加减

Lemon_93d5·2023-03-18 06:46

Patterns留学生作业代做、代做Collapse Hierarchy作业、代写c/c++，Python，Java编程语言作业代做R语言编程|代写Datab

Assignment4:RefactoringandPatternsYouworkforaneducationalsoftwarecompanythatisdevelopingasuiteofsimplePhysicssimulations.Thecodeinpendulum.zipisthebeginningofasuiteintendedtopermitthecreationofaseries

ftyju43·2023-03-17 23:09

ggplot2 配色

ggplot2的提供了海量的默认配色方案和DIY配色选项，根据色彩显示类型一般分为连续型（渐变色）和离散型（差异色）两种。

吴十三和小可爱的札记·2023-03-17 20:36

2019-01-19 R学习第五天青萍之末 14李健豪

一：R语言基础知识1：关于R语言语法（1）：就像世间万物皆有各种各样的元素组成一样，组成数据的最基本的元素分为两种数字或者字符串（用chr表示），可用class函数定义。

青萍之末2333·2023-03-17 19:04

Atlassia wiki环境配置

7u75-linux-x64.tar.gz3.Atlassian-crowd软件atlassian-crowd-2.8.3.tar.gz主程序crowd-language_zh_CN-2.7.0.jar语言包

曹操python·2023-03-17 18:38

R语言基础

R语言基础第一个问题：在mac电脑上把课程学习完，准备写作业，发现自己的mac电脑的截图软件或者微信里的截图功能一开启，其它需要被截图的窗口全部隐藏了，无法截图。

萱_1014·2023-03-17 15:42

R语言学习 - 第2部分数据类型

R基本对象数值型(Numeric)>vxclass(vx)[1]"numeric"逻辑型(Logical)>vxclass(vx)[1]"logical"字符型(Character)>vxclass(vx)[1]"character"整数型(Integer)>vxclass(vx)[1]"integer"复合型(Complex)>vxclass(vx)[1]"complex"缺省值(missing

复眼猫咪·2023-03-17 15:17

Stats 101C作业代做、代做R语言作业、代写R编程设计作业、代写Kaggle Competition作业代做留学生Prolog|代做留学生Process

Stats101CKaggleCompetitionFinalProjectTherearetwocompetitions:-Aclassificationcompetition-AndaregressioncompetitionEachcompetitionaccountsfor16%ofyourfinalcoursegrade.Eachcompetitionisscoredseparately

krq0138·2023-03-17 13:56

R语言笔记二：向量、向量索引及其运算

1.内置数据集R中的内置数据集存储在datasets这个包中，这些数据一般搜集于真实的调查数据。help(package=“datasets”)：查看数据集包。data()：列出所有数据集。直接输入数据集名字，就可以使用该数据集。这些内置数据集的名字都是默认的，我们在创建变量的时候最好不要与内置数据集的名字重叠。2.数据结构R中的数据类型R对象：object，它是指可以赋值给变量的任何事物，包括常

取个name太难·2023-03-17 09:01

R语言实战—3

基本数据管理4-2创建新变量#方法1mydataleadershipmanagerdatecountrygenderageq1q2q3q4q51110/24/08USM32545552210/28/08USF40352553310/01/08UKF25355524410/12/08UKM39334NANA5505/01/09UKFNA22121>newdatanewdatamanagerdatec

七白七白七七白·2023-03-17 07:02

R安装使用文档

下载RSDK访问链接下载R语言安装包https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/R-3.5.2-win.exe下载后双击安装包进行安装

不就是个名字么不要在意·2023-03-17 06:48

R语言作业—初级

教程对应B站：【生信技能树】生信人应该这样学R语言配套资料：B站的11套生物信息学公益视频配套讲义、练习题及思维导图先仔细观看视频，理解代码含义初级题目题目链接：http://www.bio-info-trainee.com

琪音·2023-03-17 04:35

R 数据可视化 —— ggforce（形状）

前言ggforce是ggplot2的一个扩展包，提供了许多自定义的工具函数，可以更方便地为图形添加不同的形状、线条等注释，更灵活的分面图形绘制使用安装使用#从CRAN安装install.packages

名本无名·2023-03-17 03:46

R语言箱线图（boxplot）四分位算法

箱线图（Boxplot）也称箱须图（Box-whiskerPlot），是利用数据中的五个统计量：最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法。它也可以粗略地看出数据是否具有有对称性，分布的离散程度等信息；特别适用于对几个样本的比较。注：四分位数（Quartile），即统计学中，把所有数值由小到大排列并分成四等份，处于三个分割点位置的数值就是四分位数。第一四分位数(Q1)，

不一样的菜鸟·2023-03-17 03:03

ggplot---展示带下标的log2FC和-log10(pvalue)

*"FC"))+ylab(expression("-log"["10"]*"PValue"))+注意expression里面要用*把文本隔开，另外，上标用^，下标用[]简单画一个火山图library(ggplot2

一只烟酒僧·2023-03-17 00:26

如何使用R语言进行基因组覆盖度可视化

用于基因组覆盖度和深度可视化所用到的packages：pheatmapinstall.packages("pheatmap")library("pheatmap")所用的文件格式（csv文件）深度二进化文件（cvg_data.csv）：这里表征的是每个位点深度，也可采取滑动窗口的形式表征每个区域。同时采用深度二值化，阈值为100；若不需要二值化，则直接将统计的位点深度信息导入即可。sample1位

Irish_Lee·2023-03-16 20:24

·2023-03-16 18:05

ggplot2绘制环状条形图(进阶)

本节继续介绍通过ggplot2来绘制环状条形图，重点使用annotate函数对数据进行注释library(tidyverse)自定义颜色colors%head(6)%>%mutate_if(is.numeric

R语言数据分析指南·2023-03-16 14:54

2019-11-19R语言-day2数据类型

R有很广泛的数据类型，包括scalars，vectors，matrices，dataframes,andlists。(以下根据quick-R进行整理，例子为自己举例）1.vectors最简单的是向量类型，即使用c()的形式表明。1.1数字向量a<-c(5,3,6,8,1)a[c(2,4)]#[1]38a已经是一个向量了，后面再加表明取这个向量的第2个和第4个值1.2字符向量b<-c("hello"

Courage_c2bc·2023-03-16 13:36

blob.extract从图像（矩阵）中提取斑点区域，R语言imagefx包，时序图像特征识别

blob.extract从图像（矩阵）中提取斑点区域，R语言imagefx包，时序图像特征识别3.png0.png1.png#SatSep1100:35:572021edit#字符编码：UTF-8#R版本

youmigo·2023-03-16 12:33

R语言机器学习与临床预测模型52--生存分析预测模型中的单因素分析和多因素分析

本内容为【科研私家菜】R语言机器学习与临床预测模型系列课程你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01生存分析生存分析是指对某给定事件发生的时间进行分析和推断，研究生存时间和结局与预后因子间的关系及其程度大小的方法

科研私家菜·2023-03-16 08:08

Python数据分析与挖掘实战学习04

一、Python数据分析工具1.StatsModelsPandas着眼于数据的读取、处理和探索，而StatsModels则更加注重数据的统计建模分析，它使得Python有了R语言的味道。

李丰田丶·2023-03-16 07:57

R语言参考卡片（二）

image.png图形装置（GraphicsDevices）x11(),windows()打开一个绘图窗口plot.new()为绘制新图形结束当前图形窗口dev.set()指定图形窗口dev.list()图形窗口列表dev.off()关闭指定图形装置layout()根据用户给定的matrix和参数width=,height=将图形装置分割image.png基础绘图plot(x)在x轴上顺次的绘制x

Davey1220·2023-03-16 03:37

安装FREddypro包

直接在Rstudio安装失败了然后通过下载*.tar.gz包文件CRAN-PackageFREddyPro(microsoft.com)参考R语言安装.tar.gz包方法-(jianshu.com)大功告成

Aerosols·2023-03-16 00:16

如何轻松绘制基因表达聚类趋势图

image.png#清除当前环境中的变量rm(list=ls())#设置工作路径setwd("C:/Users/Dell/Desktop/")#加载所需的R包library(ggplot2)library

Davey1220·2023-03-16 00:02

ggplot2 画个基因结构示意图

library(Homo.sapiens)library(ggplot2)xxC","T>A","C>G"))p1<-ggplot()+geom_point(data=xxx,aes(x=x,y=ymax

上校的猫·2023-03-16 00:56

[22] 《R数据科学》工作流：脚本

vebeenusingtheconsoletoruncode.That’sagreatplacetostart,butyou’llfinditgetscrampedprettyquicklyasyoucreatemorecomplexggplot2graphicsanddplyrpipes.Togiveyoursel

灰常不错·2023-03-15 21:33

24-使用ggplot2进行数据可视化

参考资料：根据《R数据科学(中文完整版）》第一章内容总结。1、散点图library(pacman)p_load(tidyverse)df%tbl_df();str(df)##Classes'tbl_df','tbl'and'data.frame':19obs.of5variables:##$name:Factorw/19levels"Alfred","Alice",..:2351011121516

wonphen·2023-03-15 19:01

生信人應該這樣學習R語言

#生信技能树:#看完我的B站教学视频：https://www.bilibili.com/video/av25643438#有能力这持续注释R语言实战书籍附件代码:https://github.com/biotrainee

简boo·2023-03-15 17:45

Coding and Paper Letter（七十五）

geospatial3.ggplot2的相关资源整理。awesomeggplot24.Earthaxiv的一篇论文相关代码。

G小调的Qing歌·2023-03-15 14:21

R 语言的安装（详细教程）

文章目录前言一、R语言是什么？

多加点辣也没关系·2023-03-15 14:36

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