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R语言数据处理学习记录--用自己的数据完成mental test（使用ggcor包）

R语言数据处理学习记录–用自己的数据完成mentaltest（使用ggcor包）注：本文仅作为自己的学习记录以备复习查阅关于科学上网：https://www.zhihu.com/question/498939985

炮炮炮~~·2023-03-29 17:22

Day2: R语言入门笔记1-R语言的介绍

二、学习R的资源1.网络资源R语言官方网站R-bloggerR语言期刊R语言搜索引擎R函数在线帮助关于R的问答网站统计之都中国R语言会议美国计算机世界杂志提供的R语言初学者入门资料2.R语言书籍初学入门

七七师姐·2023-03-29 17:53

R如何正确动态创建变量名,解决target of assignment expands to non-language object

这个报错，在我刚学习R语言的时候，也遇到过。当时

xuzhougeng·2023-03-29 15:31

使用Python完成《数据分析实战》中的案例-1

数据分析实战书中所有案例分析均是使用R语言实现，由于目前正在学习Python语言，故触生尝试使用Python实现书中案例的想法。

煌煌_839a·2023-03-29 14:58

R语言基础——日期数据

晨兮er·2023-03-29 14:58

R语言基础——数据结构创建

目录1.向量的创建2.矩阵的创建3.数组的创建4.数据框的创建5.列表的创建R语言中有许多用于存储数据的对象类型，包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。

晨兮er·2023-03-29 14:28

RNA-seq数据分析二：DESeq2 筛选差异基因

首先DESeq2在R-studio上的安装非常让人自闭，具体可参考徐洲更老师的R语言安装介绍https://www.bilibili.com/video/BV19p4y1i7Zb?

云养江停·2023-03-29 13:29

应用统计学与R语言实现笔记（番外篇四）——bookdown使用与OR值计算

本期是之前做的应用统计学与R语言实现笔记的番外篇四，本期主要关注两个问题，一个是重新利用R的bookdown包创建新的电子书，另一个是计算公共卫生当中一个比较常见的指标OR值。

G小调的Qing歌·2023-03-29 08:05

求助关于GO富集分析可视化代码问题

dplyr)#数据清洗library(stringr)library(org.Hs.eg.db)#物种注释(Homosapiens)library(clusterProfiler)#富集分析library(ggplot2

weixin_55021421·2023-03-29 05:53

【R语言】——基因GO/KEGG富集分析!超级简单的保姆级教程！

和“【R语言】——基因GO/KEGG功能富集结果可视化（保姆级教程）”介绍如何使用DAVID在线分析工具对基因进行GO/KEGG功能富集分析和使用Rggplot包对获得的基因GO/KEGG功能富集结果进行可视化

在打豆豆的小潘学长·2023-03-29 05:22

用R语言对基因进行KEGG分析（附详细代码）

1、所需的数据类型（只需要一列geneid即可分析）2、分析代码：rm(list=ls())genelist<-read.csv("C:/Users/user/Desktop/结果文件/pathway/数据更新/gene.csv",header=TRUE)install.packages('R.utils')getOption("clusterProfiler.download.method")#

佛系盼毕业·2023-03-29 05:21

R语言：GO富集和KEGG富集、可视化教程，附代码

R语言：GO富集和KEGG富集、可视化教程，附代码小白一枚，博客仅用于记录自己的学习历程，参考了很多代码，感觉有些代码太复杂了，根据自己的喜欢进行了部分改动。

是二月啊·2023-03-29 05:20

R语言Rmosek包安装问题

首先，按部就班安装‘Rmosek’包，然后导入并没有报错install.package('Rmosek')library(Rmosek)然而，在调用时，result<-mosek(problem_W,opts)却出现了错误：...Pleasecallmosek_attachbuilder(what_mosek_bindir)tocompletetheinstallation...于是，百般折腾也没

HJ_Tan·2023-03-29 04:46

使用R语言包clusterProfiler做KEGG富集分析时出现的错误及解决方法

使用enrichKEGG做通路富集分析时，一直报错：显示Nogenecanbemapped....k<-enrichKEGG(gene=gene,organism="hsa",pvalueCutoff=1,qvalueCutoff=1)但是之前用同样的基因做分析是能够成功地富集到通路，即便是网上的数据会更新，也不可能变化的这么大吧，我换了一组基因，出现相同的问题。去B站视频教程的评论去找答案，发现

HJ_Tan·2023-03-29 03:59

用R语言来做日历

library(calendR)calendR(year=2021,month=11,text=c("老婆生日","表妹结婚"),text.pos=c(11,25),text.col="blue",weeknames.col="black",special.days="weekend",special.col="green",start="M",subtitle="Stayfoolish,Stay

goodwish·2023-03-29 01:56

基于R语言因果关系推断模型实践技术应用与案例分析

通过数据得到可靠的因果关系一直是科学研究的主要目标之一。对因果关系的研究已经有千年之久；但是，作为科学研究主要方法之一统计学一直都只能给出相关关系，直到上个世纪80年代左右才有了实质性的进展。作为因果推断方法的主要提出者，有数位因果推断的大师级人物因为相关的研究成果获得诺贝尔经济学奖，图灵奖等重磅奖项。对于普通学者们，运用因果推断模型的主要困难有两个，一是因果推断的理论和常用的（基于相关关系）统计

思考的小猴子·2023-03-28 23:16

R语言|tryCatch()使用

纸飞机_b371·2023-03-28 21:54

R语言画森林图：多元回归分析结果可视化

当我们分析几个因子对结果的影响，预测结局时候，往往需要用到森林图显示多元回归的结果，可以先用spss进行多元回归分析，得出的结果文件画森林图一.加载包，整理需要画的文件和需要显示的文件library(forestplot)#加载包，不能加载就安装一下rownames1，即在森林图中，其95%CI横线不与无效竖线相交，且该横线落在无效线右侧时，可认为试验组的发生率大于对照组的发生率当某研究RR的95

mayoneday·2023-03-28 20:28

TCGA数据下载与整理-TCGAbiolinks包

写在前面，如果不是R语言高手，建议利用网站下载个人爱好——1、官网：https://portal.gdc.cancer.gov方法见从TCGA数据库下载并整合清洗高通量肿瘤表达谱-临床性状数据。

young5100·2023-03-28 19:01

ggpubr：快速绘制用于发表的图形

更好的阅读体验-->>ggplot2(HadleyWickham开发)是目前R语言数据可视化的主流。

Boer223·2023-03-28 19:15

R中利用ggplot2做双轴图

以下代码实现利用ggplot2做双轴图的功能#构建数据Date<-seq(from=as.Date("2015-01-01"),to=as.Date("2015-12-01"),by="month")Consumers

LeoinUSA·2023-03-28 16:53

R语言作图——Circular bar plot(环形柱状图)

R语言作图系列的更新频率跟理想中的一月一次差别有点忒大了，不得不让小仙陷入深深的反思，对于时间的规划也有了一些新的感悟。

生信了·2023-03-28 13:11

R语言主成分分析(PCA)加“置信椭圆”

使用R语言为PCA散点图加置信区间的方法，我知道的有三种，分别是使用ggplot2,ggord,ggfortify三个包去绘制。后面两个R包是基于ggplot2的快捷返方法。

Z_bioinfo·2023-03-28 11:46

详解R语言apply系列函数的使用

目录applylapply,sapply,vapplyrapplytapplymapplyR语言的循环效率并不高，所以并不推荐循环以及循环嵌套。

·2023-03-28 10:06

洛克菲勒大学2021年生信课2：Introduction to R, session 2

上一篇文章是R语言的入门。涉及了一些最最基础的知识，主要包括R里的几种数据类型。建议R语言零基础的同学把第一讲理解并掌握后，再进行这一讲的学习。

生信start_site·2023-03-28 10:39

# R语言自定义函数获取当月最大天数

获取当月最大天数udf_max_mon_d<-function(date){m<-format(date,format="%m")days31<-c("01","03","05","07","08","10","12")days30<-c("04","06","09","11")days28<-c("02")if(m%in%days31)return(31)if(m%in%days30)retur

lucier19981·2023-03-28 08:31

组间比较不只有箱线图，还有这些

使用的数据时R语言内置数据iris，以下代码都可以直接运行。

小洁忘了怎么分身·2023-03-28 07:08

语言指导（proto3）

本指导描述了如何使用protocolbuffer语言来构建protocolbuffer数据，包括.proto文件语法和如何基于该.proto文件生成数据访问类。本文是涵盖protocolbuffer

红牛慕课_韩忠康·2023-03-27 18:12

R绘图|ggplot2火山图的绘制

上一期R绘图|ggplot2散点图的绘制简单介绍了散点图在高通量数据展示上的作用，以及如何绘制？散点图在数据展示上存在局限，只能体现基因的差异幅度，并不能体现统计学意义。

Clariom·2023-03-27 15:24

R语言|for循环————R语言入门到入土系列(八)

R语言入门到入土系列 R语言作为数据科学的第一利器；本人介绍了一些R语言的基础入门知识，希望能帮到大家，往期系列文章点击下面文字直达数据类型——R语言入门到入土系列(一).数据结构(一)向量———R语言入门到入土系列

铭记yu心·2023-03-27 08:10

R语言：手把手教你画pheatmap热图

R语言：手把手教你画pheatmap热图微生态导读：pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类，但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类

高锰酸钾配甲醛_ab83·2023-03-27 06:54

R语言学习笔记：网页爬虫

爬虫一定要确认是合法的！合法的！合法的！（重要的事情说三遍）目前大部分顶级期刊不接受爬虫爬取的数据的论文投稿用IMDB网站的乐高大电影网页作为例子：https://www.imdb.com/title/tt1490017/安装并调用rvest程序包lego_movie=html('https://www.imdb.com/title/tt1490017/')#输入网址lego_movie%>%ht

DANoob·2023-03-27 03:11

ggplot2优雅的绘制华夫图

R包安装与加载package.list=c("tidyverse","wesanderson","lubridate","ggstream",ggwaffle"waffle","extrafont")for(packageinpackage.list){if(!require(package,character.only=T,quietly=T)){install.packages(package

R语言数据分析指南·2023-03-27 00:42

Fig2-d 泡泡图的绘制2020-12-14

）首先需要的数据与格式：image.png读取数据bubble<-read.csv(file.choose())#选择对应的CSV文件bubble#展示读取的数据开始绘制：#导入画图包library(ggplot2

RashidinAbdu·2023-03-27 00:24

学习小组第三期Day5--王灵

R语言基本知识向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串表格在R语言中改名叫作数据框函数或者命令不会用时，可以使用查看帮助，调出对应文档，翻到example部分进行研究?

土豆龙123·2023-03-26 19:53

2019-11-2R语言-day3-数据输出

有许多方法可以将R对象导出为其他格式。对于SPSS、SAS和Stata，用foreignpackages,对于Excel，用xlsReadWrite包。write.table(x,file="",append=FALSE,quote=TRUE,sep="",eol="\n",na="NA",dec=".",row.names=TRUE,col.names=TRUE,qmethod=c("escap

Courage_c2bc·2023-03-26 15:18

R语言单因素方差分析简单小例子

单因素方差分析是用来检验3组或者3组以上的数据间是否有差异的的一种统计分析方法。比如下面用到的示例数据：探究三种不同的肥料是否对某种作物的产量有影响。做实验的时候就是将一块地随机划分成若干小块，分别施用3种不同的肥料，最终统计产量。最后用单因素方差分析检验不同组之间的均值是否相等。单因素方差分析的零假设是不同处理间的均值没有差异，如果计算得到的P值小于0.05，则拒绝原假设，即不同处理间是有差异的

小明的数据分析笔记本·2023-03-26 14:55

R-ggplot2-瀑布图包安装使用太复杂，本文给出ggplot2版解决方案

目录0.问题导入1.ggplot2精仿版瀑布图预览2.示例数据生成3.绘制主图14.绘制主图25.主图1-2图例提取6.绘制瀑布图7.本文总结8.本篇所用软件包（没有的，还需要install.packages

TroyShen·2023-03-26 10:22

R & Rstudio安装

products/rstudio/download/R是一门编程语言，同时也有官方自带的可视化编程软件编程语言是一种解释语言，将代码进行翻译并执行Rstudio仅仅是的皮包软件（不专业的说法，IDE，R语言的集成环境

村长吃火锅·2023-03-26 09:05

R语言里面的因子

R语言中的因子确实不好理解，很多人都这么觉得。在R语言中，因子（factor）表示的是一个符号、一个编号或者一个等级，即，一个点。

大数据技术派·2023-03-26 02:04

2022-09-19一张图画多个KEGG富集结果

输入文件示例；Species用于指定不同的分组脚本library(ggplot2)pathway=read.csv("kegg1.csv",header=TRUE,check.names=FALSE)head

AsuraPrince·2023-03-26 02:25

R: stair ggplot

library(plotly)library(ggplot2)d=data.frame(x=c(1,2,4,5,7,8,9),y=c(1,2,3,5,6,7,9))ggplot(data=d,mapping

小白菜学生信·2023-03-25 21:40

R-ggplot2

mianfunction：ggplot():初始化图形并指定数据来源aes():指定每个变量的角色geom_XXX():使用几何函数向图中添加几何对象（视觉输出）使用串联符号(+)创建函数图形保存：ggsave(plot=p1,file="mygraph.pdf",width=3,height=4)以pdf格式保存了图片p1，命名为mygraph，3英寸宽4英寸高e.g.ggplot(data=m

JY_Liu·2023-03-25 19:28

Day6-Weno

我感觉自从到了R语言，我就开始乱了。。昨天的还有些太不懂，今天的后面一头雾水。。在幕布上写了提纲，明天就没什么事情了，去图书馆借R语言的书，听视频拿下！

Weno·2023-03-25 19:52

CSS颜色代码大全

R语言画图，自定义颜色，代码http://www.mamicode.com/info-detail-1448036.html

东风008·2023-03-25 17:27

R语言绘图

https://sites.harding.edu/fmccown/r/bg#背景色fg#前景色col#颜色col.axis#坐标轴颜色col.lab#标签颜色col.main#题目颜色col.sub#副题目颜色和字体相关的参数有下面几个：字体形态family#全局字体，特指字体的类型，如宋体还是楷体font#字体，特指字体的形态，如斜体还是粗体font.axis#坐标轴字体font.lab#标签

存存baby·2023-03-25 14:50

R语言超详细逆概率加权(IPTW)后生存曲线做法

library(survminer)#加载包,没有的包就按安装library(survival)library(tableone)library(survey)library(MatchIt)library(reportReg)library(foreign)testdata<-read.csv2("seerdev.csv",header=T,sep=",")#读取外部csv格式数据并将数据赋值给

灵活胖子的进步之路·2023-03-25 07:01

R语言空间分析、模拟预测与可视化

R语言在数据分析、挖掘和可视化中发挥着重要的作用，其中在空间分析方面扮演着重要角色，与空间相关的包的数量也达到130多个。

xiao5kou4chang6kai4·2023-03-25 07:32

基于R语言因果关系推断模型