r语言ggplot2 第80页

R语言，干旱，正负折线图，动图，交互折线图

#SunAug3011:10:152020-#字符编码：UTF-8#R版本：Rx644.0.2forwindow10#[email protected]#个人笔记不负责任#——拎了个梨#dt.zhuye0#建立干湿分组备用dt.zhuye[dt.zhuye==TRUE]%ec_add_series(data=dt.zhuye,type="bar",mapping=ecaes(x=Monthly

youmigo·2023-04-05 17:49

【干货分享】一文讲透量化投资方法论体系

原文是上海棋剑资产管理有限公司首席执行官王晓光先生参加第九届R语言会议作的报告，全文有点长，但深入浅出、高屋建瓴，相信耐心阅读完将受益匪浅。01关于量化投资的几个问题01如何定义与看待期望收益与风险?

CuteHand·2023-04-05 15:44

GEO数据分析之必备基础知识

学习之后GEO分析就春暖花开了：生信技能树GEO数据挖掘相关的课程解读GEO数据存放规律及下载，一文就够解读SRA数据库规律一文就够从GEO数据库下载得到表达矩阵一文就够GSEA分析一文就够（单机版+R语言版

天涯清水·2023-04-05 14:19

R语言read.table()报错: EOF within quoted string

（1）今天在读取数据的时候，出现一个报错：f_anno<-read.table("anno_new.txt",sep="\t",header=T,check.names=F,fill=T,na.strings="")Warningmessage:Inscan(file=file,what=what,sep=sep,quote=quote,dec=dec,:EOFwithinquotedstring

Zhigang_Han·2023-04-05 10:47

R语言快餐教程(1) - 我们开始做统计吧

R语言快餐教程(1)-我们开始做统计吧R语言简介R语言是基于S语言的一种开源实现。

Jtag特工·2023-04-05 08:02

R语言系列1 | R和Rstdio的安装

如果说生物信息学只能学习一门编程语言的话，那么我会给你推荐R语言。

onlybugs·2023-04-05 08:13

R语言处理表格数据（一）

目录写在前面1.Excel有上百列数据，把每列数据首尾相接合并成一个向量（一列）2.合并多个数据表（.csv）3.实现2个Excel表相同数据的关联，并提取相同数据到新表4.获取Excel表里面列名为TEM的所有数据并保存5.将文件夹中的.dbf文件转换为.xlsx文件6.excel表格中生成重复数据7.表格数据按列合并！！！写在前面这是我新开的一个专题，专门用来记录我在处理数据的过程中遇到的

Amyniez·2023-04-05 08:45

R语言处理表格数据（二）

目录1.修改excel表格列名，并合并所有excel2.分组计算（group）3.文件格式转换（txttoxlsx）4.数据合并，添加新列1.修改excel表格列名，并合并所有excel##----------------------------------------------------------------------------------------#@author:JacksonZ

Amyniez·2023-04-05 08:45

R学习笔记(13)：使用ggplot2进行图形化沟通（上）

《R数据科学》的第21章主要是讲解如何用ggplot2绘制“良好图形”，这篇笔记包括“标签”和“注释”两部分。

TOP生物信息·2023-04-05 07:20

《R数据科学》学习笔记|Note6:使用tibble实现简单数据框

相较于其他R语言教程来说，本书一个很大的优势就是直接从实用的R包出发，来熟悉R及数据科学。更新过程中，读者朋友如发现错误，欢迎指正。如果有疑问，也可以在评论区留言或后台私信。

木舟笔记·2023-04-05 05:31

【无标题】PCA分析基于文献

#来自小明的数据分析笔记source("D:/R/work/pca_and_ggplot2.R")getwd()library(ggplot2)library(ggpubr)library(cowplot

植保小萌新·2023-04-05 04:16

压砂地年终重新作图(涉及方差分析、图片合并、标准差与标准误的转化)

#宁夏中卫压砂地蝗虫对不同景观格局的响应.libPaths()rm(list=ls())install.packages(agricolae)library(agricolae)library(ggplot2

植保小萌新·2023-04-05 04:45

生信-使用R语言将gdc数据转化为基因表达矩阵

从gdc-client下载数据后，接下来，我们可以尝试把gdc数据转化为基因表达矩阵，这里需要对原始数据文件进行加工处理1.准备工作创建一个工作目录，将样本文件夹放在all文件夹下在本地选择一个文件夹：f:/gdc/，打开R-Studio#设置目录setwd("f:/gdc/")#获取当前目录getwd()#新建文件夹all，zip，unzip，#想要的效果：all放所有样本文件，zip放目标的压

lietobrain·2023-04-05 04:43

【R语言】三种批量做T检验的方法

☞统计学知识大梳理☞100个统计学&R语言学习资源网站R语言里面也有专门做t检验的函数，t.test。

生信交流平台·2023-04-05 03:53

R · R 包开发 | 保姆级教程

比如说，安装ggplot2包提供了可视化数据的方法。R中很多强大的功能都来自开发者贡献的包。什么是包技术上，包只不过是一套函数、文档和数据的合集，以一种标准的格式保存。

一只小蛮要·2023-04-05 01:56

【R语言】RMarkdown使用

RMarkdown使用引言编写Rmarkdown生成HTML文件生成PDF参考引言Markdown是一种简单的轻量级标记语言，基本语法很少，免费的Markdown的编辑器也非常多，上手非常快。CSDN自带Markdown和在线编辑的StackEdit是我最常用的，最近刚发现R也可以用RMarkdown，效果类似JupterNotebook。RStudio结合Markdown可形成高质量的数据分析文

HelennnHuang·2023-04-05 01:21

[R语言]RMarkdown: 入门与操作

RMarkdown是通过R语言制作动态文档的文件格式。RMarkdown文档编辑

Gremmie2003·2023-04-05 01:47

Rmarkdown第一弹——Rmarkdown 简介

Rmarkdown简介Rmarkdown是R语言环境中提供的markdown编辑工具，运用rmarkdown撰写文章，既可以像一般的markdown编辑器一样编辑文本，也可以在rmarkdown中插入代码块

庄闪闪·2023-04-05 01:41

R语言 —— 包（package）的下载和使用

一、R包的安装（3种方式）1在R中直接输入代码在CRAN上查找安装install.packages("packagename")多个包可以用c()来列出多个包的名字install.packages(c("package1","package2",···))2从CRAN、Bioconductors或其他网站上下载R包的压缩文件后使用命令install.packages("E:/vegan.rar")

人工智·2023-04-04 21:32

R语言与作物模型（以DSSAT模型为例）融合应用

随着基于过程的作物生长模型（Process-basedCropGrowthSimulationModel）的发展，R语言在作物生长模型和数据分析、挖掘和可视化中发挥着越来越重要的作用。

思考的小猴子·2023-04-04 21:30

R语言多元数据统计分析在生态环境中的应用

生态环境领域研究中常常面对众多的不同类型的数据或变量，当要同时分析多个因变量（y）时需要用到多元统计分析（multivariatestatisticalanalysis）。多元统计分析内容丰富，应用广泛，是非常重要和实用的多元数据分析方法和统计工具，其中分类(classification)/分组（grouping）和梯度（gradient）/排序（ordination）分析是多元统计分析的核心内容

思考的小猴子·2023-04-04 21:00

R语言：广义估计方程(GEE)

转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记：R语言：广义估计方程(GEE)01解决何种问题在临床研究中，经常会比较两种治疗方式对患者结局的影响，并且多次测量结局。

小易学统计·2023-04-04 15:42

r语言抓取网页数据_使用R进行网页抓取的简介

r语言抓取网页数据byHirenPatel希伦·帕特尔(HirenPatel)使用R进行网页抓取的简介(AnintroductiontowebscrapingusingR)Withthee-commerceboom

cumifi2519·2023-04-04 15:42

ggplot2---Guide:axes and legends---Legend guide

Legendguide图例说明Legendtypeguideshowskey(i.e.,geoms)mappedontovalues.Legendguidesforvariousscalesareintegratedifpossible.图例上显示关键字(即:(geoms)映射到值上。如果可能的话，图例可以整合到各种各样的标尺上。guide_legend(title=waiver(),title.

汪汪2017·2023-04-04 14:16

学习小组Day4笔记--潘潘

R语言基础因为自己电脑上已经有R和Rstudio了，服务器上也有Rstudioserver，所以安装步骤跳过。

三点水的番薯·2023-04-04 14:50

R语言学习.5-数据读写

数据读写练习是生信技能树生信爆款入门课程R语言部分Day5的讲到的一个重要知识点。为加深理解，现在做下练习巩固。

Seurat_·2023-04-04 11:55

spatialreg | 基于特征向量的空间滤波方法（2）

专注系列化、高质量的R语言教程推文索引|联系小编|付费合集阅读本篇推文前，请先阅读如下推文：spatialreg|基于特征向量的空间滤波方法上面这篇推文介绍了空间滤波方法的原理以及应用于线性模型的案例。

R语言学堂·2023-04-04 10:22

R语言学堂推文索引 - 2023年3月

专注系列化、高质量的R语言教程推文索引|联系小编|付费合集更新时间:2023.3.310前言1数据处理通识专辑1.1base-R1.2dplyr和tidyr工具包1.3文本/日期/分类数据处理1.4向量化运算

R语言学堂·2023-04-04 10:22

R语言介绍与散点图绘制

R语言简介什么是R语言R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。R语言的诞生R语言是从S语言演变而来的。

生信分析记录本·2023-04-04 09:16

showtext | R语言绘图字体设置——针对Windows系统

R语言绘图的字体设置是个老大难的问题，它默认情况下只提供三种字体。

R语言学堂·2023-04-04 09:17

【案例分析】全流程基于最新导则下的生态环境影响评价技术方法及图件制作与案例

吹翻书页的风·2023-04-04 08:39

Multi-omics Hammer软件介绍

《生信小院》公众号也开通了一段时间，期间分享了自己使用R语言的一些脚本与数据分析的一些心得。但是总觉得这样零零总总的介绍无法能够系统的帮助别人学习数据分析以及数据可视化工作。

WJ的生信小院·2023-04-04 05:57

R语言入门--第一节（基础知识）

1、熟悉语句R的赋值符号为<-,也可以用=（但是后者不是标准语法，专业人员不推荐使用，但我觉得=更方便，只要打一个字符毕竟-.-）回顾：目前已经改过来了哈，使用<-为主。快捷键Alt加短横键可一次输出，也很方便。注释由#开头，在它之后的文本都会被忽略（方便打草稿，做记录等等）x<-rnorm(5)#即创建了一个名为x的向量对象，包含5个来自标准正态分布的随机偏差2、一些帮助命令install.pa

小贝学生信·2023-04-04 00:39

跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并在坐标轴添加分组标记

论文EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和数据下载链接https://github.com/plemey/SARSCoV2origins今天的推文我们来重复一下论文中的Figure2中的簇状柱

小明的数据分析笔记本·2023-04-03 23:10

R语言学习.2/3-数据类型

本文是生信技能树生信爆款入门课程R语言部分的讲到的一个重要知识点。为加深理解，现在做下练习总结。R语言数据类型主要包括向量，数据框，矩阵，列表。

Seurat_·2023-04-03 23:18

万能转换，R图和统计表转成发表级的Word，PPT，Excel，HTML，LaTeX，矢量图等

你和PPT高手之间，就只差一个I幻灯片式Excel改变了你的基因名，30％相关自然文章受影响，NCBI也受波及特点可以用命令将交互式R图或ggplot2，Lattice或baseR保存到MicrosoftWord

生信宝典·2023-04-03 18:40

2019-05-11 如何编写自己的R package

今天学习R语言tidyquant包，需要把两张图放在一起比较。

鱼多多同学·2023-04-03 17:17

ggpur-ggplot2还是太难

如果觉得ggplot2对你来说还是太难，可以尝试用ggpur...ggplot2,byHadleyWickham,isanexcellentandflexiblepackageforelegantdatavisualizationinR.Howeverthedefaultgeneratedplotsrequiressomeformattingbeforewecansendthemforpublic

xmu_zhang_lab·2023-04-03 17:14

跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2画世界地图展示采样地点

论文StructureandfunctionofthesoilmicrobiomeunderlyingN2Oemissionsfromglobalwetlandshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29161-3#Sec21没有找到论文的代码，但是论文的数据是公开的，可以用论文中的数据复现一下论文中的结果，今天的推文试着复现一下论文中的figure

小明的数据分析笔记本·2023-04-03 16:07

R语言颜色代码大全

经常会看到FFCC00表示颜色的方法，例如在火山图里：http://www.mamicode.com/info-detail-1448036.html选择16进制代码。

佳名·2023-04-03 15:25

R语言七天入门教程七：项目实战

R语言七天入门教程七：项目实战在完成之前R语言基础知识的学习后，今天的内容是项目实战，通过完成一些小项目来巩固知识。

liyiersan123·2023-04-03 15:13

R语言-矩阵

1.矩阵的建立矩阵一般通过函数matrix()来建立。matrix()的调用格式为matrix(data=NA,nrow=1,ncol=1,byrow=FALSE,dimnames=NULL)其中data为向量数据；nrow为矩阵的行数；ncol为矩阵的列数；byrow=TRUE表示按照向量的行排列，默认byrow=FALSE表示按列排列；dimnames为矩阵维数的名称。>mdatmdatC.1

叮咚小溪水·2023-04-03 14:18

时间序列模型R语言实现-批量建模，预测（ARIMA, 随机森林）

时间序列预测首先要确定预测的内容。本文预测共享单车的日租借量使用的是每日数据预测的时间范围是需要提前一个月、半年还是一年？根据预测范围，会使用到不同的模型。首先安装加载本文所需要的包install.packages("modeltime")library(tidymodels)library(modeltime)library(timetk)library(lubridate)library(ti

RookieTrevor·2023-04-03 13:25

Day4——李棉袄

前言：今天开始接触R语言的学习。由于在学校上课时已安装R3.6.4和Rstudio，这里就不再写安装步骤。

李棉袄Jadra·2023-04-03 05:29

R语言--绘图部分

点图和折线图涉及到的绘图函数总结：plot（）lines（）根据数据集中的内容添加点或者直线;根据起始点/终点的位置去添加直线（详见箱形图应用）legend()添加图注text()添加文字abline()根据斜率和截距添加直线pdf(),dev.off()plot函数详解>aheightweightgenderBMItom18075male23.14815cindy16558female21.30

白猫警长ic·2023-04-03 05:55

利用R制作词云图

制作词云图本不是难事，利用R或者tableau可以轻松制作出花式词云图，但是词源的获取就不是那么容易了，今天我们就利用R语言中的jiebaR包来对北大校长林建华在北大120周年校庆的致辞做分词，并制作词云图

小T数据站·2023-04-03 05:48

学习小组Day6-邱邱

学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。

邱qiu爱学习·2023-04-03 04:25

机器学习（R语言） part1.preprocessing

本文是JohnsHopkinsUniverisity的课堂笔记文章是Rmarkdown中编写的（需要安装Rstudio和knitr）首先安装caret包install.packages("rmarkdown")install.packages("knitr")install.packages("caret"){rsetup,include=FALSE}knitr::opts_chunk$set(e

任海亮·2023-04-03 02:35

python学习之Monotonic约束绘制和【R语言】基础知识|apply函数家族中的兄弟姐妹

fromsklearn.ensembleimportHistGradientBoostingRegressorfromsklearn.inspectionimportPartialDependenceDisplayimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltrng=np.random.RandomState(0)n_samples=5000f_0=rng.

临风暖阳·2023-04-03 02:02

infercnv运行测试10--1300细胞2h

1300细胞运行2h>rm(list=ls())>options(stringsAsFactors=F)>library(Seurat)>library(ggplot2)>library(infercnv

Seurat_Satija·2023-04-03 00:33

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