ggplot2 第14页

使用ggstatsplot简化数据探索：一步完成数据可视化和统计建模 | 简说基因 Recommend...

简佐义的博客·2023-03-31 16:43

20180409-D · NFL Positional Salaries · ggplot2 ggbeeswarm 绘制抖动散点图 · R 语言数据可视化案例源码

所有作品合集传送门：TidyTuesday2018年合集传送门：2018NFLPositionalSalariesNFLPositionalSalariesTidyTuesday在GitHub上的传送地址：ThomasMock(2022).TidyTuesday:AweeklydataprojectaimedattheRecosystem.https://github.com/rfordatasc

数绘小站·2023-03-31 15:02

R for data science chap21——使用ggplot2进行图形化沟通

library(tidyverse)21.2标签1、labs()ggplot(mpg,aes(displ,hwy))+geom_point(aes(color=class))+geom_smooth(se=F)+labs(title=paste("Fuelefficiencygenerallydecreaseswith","enginesize"))image.png使用图形标题的目的是概括主要成

陆慕熙·2023-03-30 10:48

2021-04-28corrmorrant包快速绘制相关图

iColors·2023-03-30 03:43

matlab调用R给散点图画95%置信椭圆（95% confidence ellipse in a scatterplot）

95%置信椭圆一开始画的不是置信椭圆，就是简单的椭圆，把一个类别的数据点都框起来的那种，就用了ggforce这个包，里面有一个geome_mark_ellipse的函数官方文档介绍参考示例1后面用的是ggplot2

Daily365·2023-03-30 01:29

【R画图学习10.2】复杂箱图和显著性检验

library(ggplot2)library(ggp

jjjscuedu·2023-03-29 23:31

R包ggplot2画散点图+循环批量画+一些基本设置

library（ggplot2）#这个应该都知道，载入R包1）图例设置theme(legend.background=element_rect(fill="white",colour="black"))

五四四123456789·2023-03-29 21:43

Fig4-a ggplot2绘制箱线图叠加散点图2020-12-14

ggplot2包支持图形叠加，可以很好的实现我们想要的效果。由于使用ggpolt2包绘制的箱线图的末端没有短横线，可以采用误差条图来绘制箱线图胡须末端没有短横线。

RashidinAbdu·2023-03-29 18:43

R语言数据处理学习记录--使用linkET包完成mental test

语言数据处理学习记录–使用linkET包完成mentaltest注：本文仅作为自己的学习记录以备复习查阅一简单介绍一下这个包依旧是来自于GitHub上，作者给出的介绍：linkET的目标是简单而直接地可视化基于’ggplot2

炮炮炮~~·2023-03-29 18:55

求助关于GO富集分析可视化代码问题

dplyr)#数据清洗library(stringr)library(org.Hs.eg.db)#物种注释(Homosapiens)library(clusterProfiler)#富集分析library(ggplot2

weixin_55021421·2023-03-29 05:53

ggpubr：快速绘制用于发表的图形

更好的阅读体验-->>ggplot2(HadleyWickham开发)是目前R语言数据可视化的主流。

Boer223·2023-03-28 19:15

R中利用ggplot2做双轴图

以下代码实现利用ggplot2做双轴图的功能#构建数据Date<-seq(from=as.Date("2015-01-01"),to=as.Date("2015-12-01"),by="month")Consumers

LeoinUSA·2023-03-28 16:53

R语言主成分分析(PCA)加“置信椭圆”

使用R语言为PCA散点图加置信区间的方法，我知道的有三种，分别是使用ggplot2,ggord,ggfortify三个包去绘制。后面两个R包是基于ggplot2的快捷返方法。

Z_bioinfo·2023-03-28 11:46

R绘图|ggplot2火山图的绘制

上一期R绘图|ggplot2散点图的绘制简单介绍了散点图在高通量数据展示上的作用，以及如何绘制？散点图在数据展示上存在局限，只能体现基因的差异幅度，并不能体现统计学意义。

Clariom·2023-03-27 15:24

ggplot2优雅的绘制华夫图

R包安装与加载package.list=c("tidyverse","wesanderson","lubridate","ggstream",ggwaffle"waffle","extrafont")for(packageinpackage.list){if(!require(package,character.only=T,quietly=T)){install.packages(package

R语言数据分析指南·2023-03-27 00:42

Fig2-d 泡泡图的绘制2020-12-14

）首先需要的数据与格式：image.png读取数据bubble<-read.csv(file.choose())#选择对应的CSV文件bubble#展示读取的数据开始绘制：#导入画图包library(ggplot2

RashidinAbdu·2023-03-27 00:24

R-ggplot2-瀑布图包安装使用太复杂，本文给出ggplot2版解决方案

目录0.问题导入1.ggplot2精仿版瀑布图预览2.示例数据生成3.绘制主图14.绘制主图25.主图1-2图例提取6.绘制瀑布图7.本文总结8.本篇所用软件包（没有的，还需要install.packages

TroyShen·2023-03-26 10:22

2022-09-19一张图画多个KEGG富集结果

输入文件示例；Species用于指定不同的分组脚本library(ggplot2)pathway=read.csv("kegg1.csv",header=TRUE,check.names=FALSE)head

AsuraPrince·2023-03-26 02:25

R: stair ggplot

library(plotly)library(ggplot2)d=data.frame(x=c(1,2,4,5,7,8,9),y=c(1,2,3,5,6,7,9))ggplot(data=d,mapping

小白菜学生信·2023-03-25 21:40

R-ggplot2

mianfunction：ggplot():初始化图形并指定数据来源aes():指定每个变量的角色geom_XXX():使用几何函数向图中添加几何对象（视觉输出）使用串联符号(+)创建函数图形保存：ggsave(plot=p1,file="mygraph.pdf",width=3,height=4)以pdf格式保存了图片p1，命名为mygraph，3英寸宽4英寸高e.g.ggplot(data=m

JY_Liu·2023-03-25 19:28

bioconvert计算测序覆盖度并使用R语言ggplot2画折线图进行可视化展示

参考基因组下载自NCBIhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/FN433596下载原始测序数据最近发现了两个新方法一个是bioconvert可以直接下载还有一个工具是kingfisher这个好强大git主页链接https://github.com/wwood/kingfisher-download我试了一下这个kingfisher这个工具kingfisherge

小明的数据分析笔记本·2023-03-24 15:14

【ggplot2绘图二：散点图】

参考：《R数据可视化手册》、学术数据分析及可视化1.理解数据与图层library(ggplot2)set.seed(999)diamonds<-diamonds[sample(1:53940,5000,

lkj666·2023-03-24 12:31

R语言三种方法绘制饼图

ggplot2及其拓展包做出来的图美观。下面提供三种以ggplot2及其拓展包绘制饼图的方法。以mtcars数据集为例子，要查看32辆车中Cylinders数的分布情况。

Whuer_deng·2023-03-23 19:59

10x数据热图绘制之指定图例上下限

看起来不统一”我改~也就是一个修改刻度~然后~然后我就后悔了~漫漫Debug路第一次尝试Seurat包里面热图，用的是ggplot2绘制的，一般处理这种问题，只要获取对象后

dasdadf·2023-03-22 12:24

R语言与医学统计图形-【27】ggplot2图形组合、字体、保存

ggplot2绘图系统——图形组合、字体选择、保存输出1.图形组合一页多图在基础包中利用par和layout函数来切分画布。

Bioinfarmer·2023-03-22 06:30

用R画boxplot+dotplot+violinplot+jitter及代码

首先violin的代码如下：library(ggplot2)theme_set(theme_bw())g<-ggplot(mpg,aes(class,cty

gtt儿_生物信息学习·2023-03-22 05:10

2021年你应该学会的20个R包

包功能tidyverse家族dplyr变量操控tidyr数据（结构）整理ggplot2画图purrr定义、应用函数，操作lists等stringr字符操作lubridate日期

多多爸·2023-03-21 03:21

R语言ggplot2作图小技巧：柱形图如何让y轴的起始点不是0

答案是在coord_cartesian(ylim=c(5,10))函数里设置y坐标的范围library(ggplot2)dat<-data.frame(x=LETTERS[1:10],y=10)ggplot

小明的数据分析笔记本·2023-03-21 02:18

R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记之ggplot2

4.3ggplot2简介4.3.1ggplot2和图形语法ggplot2可以用来创建优雅的图形，由于它的灵活，简洁和一致的接口，可以提供美丽、可直接用来发表的图形，吸引了许多用户，特别是科研领域的用户。

zd200572·2023-03-20 18:22

第四章第一节 R、RStudio和ggplot2简介

4.1RandRStudio简介①安装R、RStudio和R包：R可以从http://www.r-project.org下载。Rstudio可以从https://www.rstudio.com/products/rstudio/download3/下载，所有的统计分析和图形都可以通过RStudio来实现。下载并安装R和RStudio软件后，可以启动R或RStudio终端来安装所需的软件包。在使用其

ZMQ要加油呀·2023-03-20 17:36

EMD（经验模态分解）算法一

第一次尝试首先安装依赖包#install.packages("reshape2")#install.packages("plm")#install.packages("ggplot2")加载包library

cumtzzy·2023-03-19 19:42

DoHeatmap 调整热图颜色

[参考链接](https://github.com/satijalab/seurat/issues/1048)library(Seurat)library(ggplot2)pbmc<-readRDS

Zee_李海海·2023-03-19 09:38

R绘图基础指南 | 3. 散点图(一)

3.1绘制基本散点图library(gcookbook)library(ggplot2)#列出我们用到的列head(heightweight[,c("ageYear","heightIn")])>head

木舟笔记·2023-03-19 07:49

[ggplot2]小提琴图经验总结

一、前期准备1.所用软件与版本：R4.0.52.所需R包：ggplot2,cowplot,ggpub,magrittr3.示例数据：iris数据集二、绘

YERA·2023-03-19 07:50

使用R中ggplot2和Hmisc绘制带误差线的柱状图

>BiocManager::install("Biobase",version="3.8")>library("Hiiragi2013")>data("x")>dim(Biobase::exprs(x))>selectedProbes=c(Fgf4="1420085_at",Gata4="1418863_at",+Gata6="1425463_at",Sox2="1416967_at")>libr

热衷组培的二货潜·2023-03-19 05:45

R语言ggplot2作图小技巧：如何给坐标轴添加minor breaks

需要用到ggh4x这个R包library(ggplot2)library(ggh4x)dat<-data.frame(x=1:10,y=1:10)ggplot(data=dat,aes(x=x,y=y)

小明的数据分析笔记本·2023-03-18 16:00

ggplot2 配色

ggplot2的提供了海量的默认配色方案和DIY配色选项，根据色彩显示类型一般分为连续型（渐变色）和离散型（差异色）两种。

吴十三和小可爱的札记·2023-03-17 20:36

R 数据可视化 —— ggforce（形状）

前言ggforce是ggplot2的一个扩展包，提供了许多自定义的工具函数，可以更方便地为图形添加不同的形状、线条等注释，更灵活的分面图形绘制使用安装使用#从CRAN安装install.packages

名本无名·2023-03-17 03:46

ggplot---展示带下标的log2FC和-log10(pvalue)

*"FC"))+ylab(expression("-log"["10"]*"PValue"))+注意expression里面要用*把文本隔开，另外，上标用^，下标用[]简单画一个火山图library(ggplot2

一只烟酒僧·2023-03-17 00:26

ggplot2绘制环状条形图(进阶)

本节继续介绍通过ggplot2来绘制环状条形图，重点使用annotate函数对数据进行注释library(tidyverse)自定义颜色colors%head(6)%>%mutate_if(is.numeric

R语言数据分析指南·2023-03-16 14:54

如何轻松绘制基因表达聚类趋势图

image.png#清除当前环境中的变量rm(list=ls())#设置工作路径setwd("C:/Users/Dell/Desktop/")#加载所需的R包library(ggplot2)library

Davey1220·2023-03-16 00:02

ggplot2 画个基因结构示意图

library(Homo.sapiens)library(ggplot2)xxC","T>A","C>G"))p1<-ggplot()+geom_point(data=xxx,aes(x=x,y=ymax

上校的猫·2023-03-16 00:56

[22] 《R数据科学》工作流：脚本

vebeenusingtheconsoletoruncode.That’sagreatplacetostart,butyou’llfinditgetscrampedprettyquicklyasyoucreatemorecomplexggplot2graphicsanddplyrpipes.Togiveyoursel

灰常不错·2023-03-15 21:33

24-使用ggplot2进行数据可视化

参考资料：根据《R数据科学(中文完整版）》第一章内容总结。1、散点图library(pacman)p_load(tidyverse)df%tbl_df();str(df)##Classes'tbl_df','tbl'and'data.frame':19obs.of5variables:##$name:Factorw/19levels"Alfred","Alice",..:2351011121516

wonphen·2023-03-15 19:01

Coding and Paper Letter（七十五）

geospatial3.ggplot2的相关资源整理。awesomeggplot24.Earthaxiv的一篇论文相关代码。

G小调的Qing歌·2023-03-15 14:21

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画热图展示基因表达量

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一

小明的数据分析笔记本·2023-03-15 02:04

热图7：ggplot2/ComplexHeatmap做离散型热图

此外，这篇文章的内容是补充之前的不足，因为没有涉及到离散型热图的做法，这里我们以一篇Cell文章为引子，展示下ggplot2/ComplexHeatmap做离散型热图，这样热图系列就完善了。

KS科研分享与服务·2023-03-14 22:17

R语言ggplot2画个月饼送给你，祝你中秋节快乐！

今天的推文就简单画一个月饼吧，没有想到太好的办法，基本的逻辑就是用ggplot2添加已经做好的图片实现代码library(ggimage)library(ggplot2)library(patchwork

小明的数据分析笔记本·2023-03-14 04:55

R 数据可视化 —— ggplot 主题

ggplot2采用数据与非数据分离的方式，在绘图时，首先确定数据的展示，然后在通过主题系统对细节进行调整。

名本无名·2023-03-13 23:20

[跟着NC学作图]-绘制频率分布图（图中图）

一、数据输入options(stringsAsFactors=FALSE)library(ggplot2)library(plyr)library(dplyr)library(cowplot)##导入数据

小杜的生信筆記·2023-03-13 07:17

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