ggplot2 第16页

第五部分第19章使用ggplot2进行高级绘图

19.1R中四种图形系统图形系统的载入系统基础安装中是否包含是否需要显示加载baseYNgridYYlatticeYYggplot2NY19.2ggplot2包介绍ggplot的图采用加号+函数串联起来创建

Hannahhao·2023-01-31 10:43

R语言ggstatsplot画回归拟合图

suppressMessages(library(ggstatsplot))#不显示加载包附带的信息library(ggplot2)#将mtcars数据集的行名转换成mtcars数据集的一个列，将数据集存储为

Whuer_deng·2023-01-31 09:55

python--seaborn直方图

seaborn是专门用于统计数据可视化的包，可媲美R语言中的ggplot2包。本文介绍用seaborn绘制直方图。

FTDdata·2023-01-31 05:49

ggplot2一页多图Rmisc-multiplot功能新手排雷

背景：在用DESeq2做转录组差异基因，有几个关注的marker基因想要画图展示；这种情况可以用DESeq2包自带的plotcounts功能，这里我利用这个功能输出数据，后面接ggplot2作图；想要把关注的

NICE_AGIS·2023-01-31 04:57

R脚本-生成密度分布表格

在组学分析中，我们常常会看到曼哈顿图，密度分布图，bin图等，之前我以为ggplot2画densityplot的数据处理格式和SNP密度一样，后来发现不是那么麻烦。

ShawnMagic·2023-01-31 00:29

KM生存分析如何取最佳的cutoff

###survivalpackagelibrary(survival)library(survminer)##Loadingrequiredpackage:ggplot2##Loadingrequiredpackage

医科研·2023-01-30 14:14

R-ggplot2-箱图系列（2）注释P值与组间比较

R-ggplot2-箱图系列（1）basic-(jianshu.com)R-ggplot2-箱图系列（2）注释P值与组间比较-(jianshu.com)组间比较分析时可能会涉及到以下的分析情况：1、两组间比较

小贝学生信·2023-01-30 10:45

再见 Matplotlib 和 Seaborn ，Python 画图建议用这个

R语言提供了一些很棒的数据可视化（ggplot2、leafl

Python数据挖掘·2023-01-30 04:15

ggplot2 annotate文本设置意大利斜体

有时ggplot作图时希望某些字变成斜体，可以导入Unicode包实现：library(Unicode)p.val<-'<1e-4'italic_p<-u_char_inspect(u_char_from_name("MATHEMATICALITALICSMALLP"))["Char"]cairo_pdf('~/Downloads/tmp/test.pdf',height=5,width=8)gg

生信编程日常·2023-01-30 02:52

【R>>ggplot2】去掉legend

在ggplot2画图过程中，有时候需要去掉legend，这个时候怎么办呢？这个情况需要在theme()中找legend.position函数来帮忙。

高大石头·2023-01-30 00:40

一行代码展示回归模型结果森林图

;公众号为：R语言和统计加载R包#install.packages("forestmodel")library(forestmodel)#森林图library(ggplot2)#使用到里面的数据集“msleep

北欧森林·2023-01-29 14:03

跟着Nature Genetics学作图：使用ggarrange包对ggplot2的多个图进行组合

论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.p

小明的数据分析笔记本·2023-01-29 02:22

ggplot2学习（一）

ggplot2基础（1）ggplot2基础（1）ggplot2基础（2）——坐标轴ggplot2基础（3）——注释ggplot2基础（4）——主题ggplot2基础（5）——配色与图例最近在学习用R语言来绘图

韧心222·2023-01-28 18:49

R语言学习笔记 -- ggplot2 绘图指定字体大小与线宽

期刊投稿时一般对figure的字体大小(fontsize)和线宽(linewidth)有特定的要求，e.g.,"Sizeanytextinyourfiguretoatleast6–8points","graphlinesatleast0.25pointswide"。这里的point（pt）翻译为点，也音译磅因、磅，是印刷所使用的长度单位。1点的标准并不统一，当代最通行的是广泛应用于桌面排版软件的D

逍遥尐生·2023-01-28 04:57

R语言作业（初级·上）

www.bio-info-trainee.com/3727.html>library(GSEABase)>library(GSVA)>library(clusterProfiler)>library(genefu)>library(ggplot2

xyn_271100·2023-01-27 22:04

MetaWRAP

#bowtieaptinstallbowtie##bwaaptinstallbwa##fastqcaptinstallfastqc##自动安装了一堆东西##perlaptinstallperl##R&ggplot2aptinstallr-base

nitrostarch·2023-01-27 21:26

教你将ggplot2的2D图像变为3D

该包的主要功能就是将ggplot2画出来的2D图像变为3D图像。废话就不多说了，直接做出来看看效果吧！

R语言与SPSS学习笔记·2023-01-27 19:14

用Ｒ画出价格走势图

代码：library(ggplot2)library(openxlsx)＃＃＃导入数据mydat<-read.xlsx("吡唑醚菌酯.xlsx",sheet=1)＃＃＃变更数据格式mydat$日期<-as.Date

goodwish·2023-01-27 17:44

phyloseq包的使用

不但利用了R中许多经典的工具进行生态学和系统发育分析（例如：vegan，ade4，ape，picante），同时还结合ggplot2以轻松生成发表

纸飞机_b371·2023-01-27 15:17

SNP PCA 3d图绘制代码_R

library(calibrate)library(genefilter)library(gplots)library(rio)library(ggsci)library(eoffice)library(ggplot2

煮梦斋_bioinfo·2023-01-27 11:14

nature microbiology图表复现之聚类条形图

本节来复现naturemicrobiology上的一张带聚类的条形图，图均基于ggplot2,ggtree，通过jjAnno很轻松的添加了阴影，下面来进行具体介绍，数据代码已经上传VIP交流群FusariumfruitingbodymicrobiomememberPantoeaagglomeransinhibitsfungalpathogenesisbytargetinglipidrafts

R语言数据分析指南·2023-01-27 06:04

画一个有标签的火山图—标出显著变化的基因

参考：ggplot2绘制火山图实例rm(list=ls())setwd('')library(ggplot2)DEG=read.csv('marker.csv',header=T)rownames(DEG

五谷吃不完了·2023-01-27 01:13

2021生信技能树R语言终极练习题

使用循环，对iris的1到4列分别画点图（plot）方案1：我的答案参考https://www.jianshu.com/p/4b7f3b9e4cf2>library(patchwork)>library(ggplot2

超级可爱的懂事长鸭·2023-01-27 01:18

R_柱状图（加误差线，显著性差异）

先放最终效果图结果图#bar_plot2021/01/19#导入所需的包library(ggplot2)library(ggthemr)library(ggsignif)library(tidyverse

奔跑的Forrest·2023-01-26 22:51

[29]《R数据科学》ggplot2图形标签与注释

标签要想将探索性图形转换为解释性图形，最容易的办法就是加上一些标签。可以使用labs()函数来添加标签，以下示例为图形添加了一个标题：ggplot(mpg,aes(displ,hwy))+geom_point(aes(color=class))+geom_smooth(se=FALSE)+labs(title=paste('Fuelefficiencygenerallydecreaseswith'

灰常不错·2023-01-26 16:57

ggplot2绘图细节总结

修改x轴绘图顺序通过设置x轴factor顺序实现：用forcats包：fct_inorder按照第一次出现的次序排列；fct_infreq按照出现的频率排列。data$Factor<-fct_inorder(data$Factor)ggplot(data,aes(x=Factor,y=PSM,fill=Charge))+scale_fill_manual("Charge",values=mycol

MJades·2023-01-25 22:40

R语言数据可视化包ggplot2画图之散点图

ggplot2的功能很强大，并因为其出色的画图能力而闻名，下面来介绍一下它的基本画图功能，本期介绍散点图的基本画法。

星途*·2023-01-25 10:46

使用ggplot2画图

Whyuseggplot2ggplot2是我见过最humanfriendly的画图软件，这得益于LelandWilkinson在他的著作《TheGrammarofGraphics》中提出了一套图形语法，

macyang·2023-01-25 10:13

ggplot2学习之1——ggplot函数

这里写自定义目录标题说明函数名及参数1、双参数使用2、单参数使用3、缺省使用说明R语言的版本为4.0.2，IDE为Rstudio，版本为1.3.959。学习的主要内容是R官方文档当中给出的算法，对其中的英文注释做了自己理解基础上的翻译。函数名及参数#画布函数，创建画布图层并设置全局参数，主要有两个参数#data：数据，定义整个画图使用的默认数据集#mapping：映射，将数据中的各个属性映射到坐标

行僧行僧·2023-01-25 10:13

R语言学习—— ggplot2函数

其中有些图表来源于网络，如有侵权联系可删~目录一、R语言介绍二、快捷键二、R语言包的学习（一）ggplot21、数据2、函数三、知识点合集（一）回归的种类一、R

今天学会Python了吗·2023-01-25 10:12

ggplot绘图

如何生成可参考右边的帮助文档文章目录ggolot绘图一、横坐标为日期二、分类多图例ggolot绘图这里介绍下ggplot绘图过程中遇到的一些问题：横坐标为日期分类多图例一、横坐标为日期#1、引用R包：library(ggplot2

gummy_bear·2023-01-25 10:42

如何在 ggplot2 中删除网格线（附示例）

在ggplot2中删除网格线的最简单方法是使用theme_classic()：ggplot(df,aes(x=x,y=y))+geom_point()+theme_classic()

Mrrunsen·2023-01-25 10:12

ggplot2学习笔记3：ggplot()基本用法

GettingStartedwithggplot2首先明确一下ggplot()画出的图所具备的要素数据：必须以数据框的形式作为参数映射：呈现数据与视觉变量之间的关系（aestheticmappings）

灯bupa冷·2023-01-25 10:11

用R语言做逻辑回归

我这里简单讲一个例子，来自于加州大学洛杉矶分校的课程首先加载需要用的包library(ggplot2)##Warn

皮肤科大白·2023-01-21 12:40

R语言caret包的安装问题

包的安装问题Rstudio报错：installloadedpakeages我不知道应该更新哪些包，直接将所有下载的包都更新了，更新之后顺利安装了caret包备注：已经下载的包除了Rstudio自带的包还有ggplot2

姜姜是社会好青年·2023-01-21 01:22

plotnine数据可视化手册

介绍R语言数据可视化的强大之处在于ggplot2，而plotnine相当于是python版的ggplot2，语法与R语言的ggplot2基本一致，无论是从语法简洁性、作图灵活性、美观度等方面，相对于传统可视化模块

蟹老板2020·2023-01-19 15:35

R 画 violin图

library(ggplot2)#注释：package在使用之前需要调用Fontsize_defined=20;#字体大小results_png_path=file.path(save_path,paste

可爱的小垃圾·2023-01-19 15:01

识别差异表达蛋白编码基因

识别差异表达蛋白编码基因题目回顾1.识别差异表达蛋白编码基因1.1文件读入1.2预处理1.3t检验1.4foldchange1.5合并2.绘制火山图2.1最简单的火山图绘制：2.2关于ggplot2的其他细节用法

冬猫∩ω∩·2023-01-19 08:18

python交互式数据可视化_基于Python实现交互式数据可视化的工具(用于Web)

通过各种课程的学习，他们已经能够熟练使用ggplot2和matplotlib，为学习大型多变量数据可视化打下了基础。作为一个数据可视化的研究者，我

weixin_39900023·2023-01-17 22:58

生信人的20个R语言习题的答案

这是生信技能树关于生信人的20个R语言习题的答案：1安装R包数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包：ggplot2

生信小白白·2023-01-17 09:14

R语言绘图-1-火山图

https://gist.github.com/stephenturner/806e31fce55a8b7175af前10行数据如下：2.绘图代码2.1数据处理library(ggrepel)library(ggplot2

蓄起大胡子·2023-01-13 13:24

R语言实战-第十一章 R in action-chapter11

#第11章中级绘图(与ggplot2包进行对比)#散点图#图1plot()函数attach(mtcars)plot(wt,mpg,main="基本散点图",xlab="车重",ylab="每加仑英里数"

Anny Yeung·2023-01-11 16:59

pandas中数据框的reshape操作

使用ggplot2画图时，最常用的数据处理就是长宽转换了。

生信修炼手册·2023-01-11 09:49

R语言绘制双坐标图的案例详解

之前推送了一系列关于使用ggplot2包绘制统计图形的文章，有网友询问是否可以绘制双轴的统计图形。很抱歉，Hradly在设计ggplot2包时就没有将双轴图形功能考虑进来。

·2023-01-10 07:34

R语言利用ggplot画图时调整坐标轴字体大小

R的具体代码如下所示：library(ggplot2)acs=read.csv("newJScs.csv",header=T)pdf(file="fig13

阿智智·2023-01-08 10:08

ggspatial | ggplot2的地图制作拓展包（1）：如何添加指北针和比例尺

ggplot2工具包作为现在最受欢迎的绘图包，其本身绘制地图的功能并不算强大。

R语言学堂·2023-01-07 08:38

近7年上海天气数据抓取和分析（含代码）--分析部分

今天，我们接着抓取的天气数据，使用R语言中的ggplot2包对其进行探索性分析。开始探索一、数据处理探索之前，我们再来看一下抓取下来的数据结构。

Sim1480·2023-01-07 08:55

R语言—简介、安装、包（package）的安装与加载

R语言有一系列的数据可视化包，包括ggplot21及ggplot2拓展包2、lattice、leaflet、playwith、ggvis、ggmaps。R语言安装R可以在CRAN

大作家佚名·2023-01-05 23:40

R语言学习001

howtoremovepackagesremove.packages("mypackage")2.checktheversionofRR.version或者getRversion()3.checktheversionofpackagepackageVersion("ggplot2

weixin_44231554·2023-01-05 23:39

Python动态可视化Plotly

受Seaborn和ggplot2的启发，它专门设计为具有简洁、一致且易于学习的API：只需一次导入，您就可以在一次函数调用中制作丰富的交互式绘图，包括分面、地图、动画、和趋势线。

生活明朗，万物可爱，人间值得，未来可期·2023-01-04 08:02

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