ggplot2 第10页

R语言ggplot2 | R语言绘制物种组成面积图（三）

文章目录面积图简介准备数据集加载数据集数据处理数据可视化利用R语言绘制物种组成图。本文以堆叠面积图的方式与大家分享。面积图简介面积图又叫区域图。它是在折线图的基础之上形成的,它将折线图中折线与自变量坐标轴之间的区域使用颜色或者纹理填充，这样一个填充区域我们叫面积。颜色的填充可以更好地突出趋势信息（比如时间上的差异，分类上的差异），需要注意的是颜色要带有一定的透明度，透明度可以很好地帮助使用者观

酷在前行·2023-08-11 22:26

R语言之探索性数据分析1

首先得把dplyr和ggplot2知识综合起来如果没有安装tidyverse这个包的话，会出现错误提示library(tidyverse)Errorinlibrary(tidyverse):不存在叫‘tidyverse

分享之家·2023-08-11 03:46

ggplot2气泡图的又一个小例子

今天公众号的一位读者留言说要做气泡图。他的数据如下image.pngID是X，log2FC用作y，class是分类变量用来填充颜色范围是A到I。P值用来映射点的大小。还有一个要求是能否突出p值=0.05")ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC,size=pvalue,color=Class,shape=group))+geom_point(alpha=0.5)+scale_siz

小明的数据分析笔记本·2023-08-10 18:39

跟着Nature Microbiology学作图：R语言ggplot2用单列数据做柱形图

ProtectiveroleoftheArabidopsisleafmicrobiotaagainstabacterialpathogenimage.png这篇论文中的数据是公开的，争取把论文中的图都复现一下，今天的推文复现Figure3a和b,这两个类型一样，都是柱形图image.png这里涉及到一个小知识点是：ggplot2

小明的数据分析笔记本·2023-08-09 23:27

第19章使用ggplot2进行高级绘图

注：R语言的再复习之路1.ggplot2包介绍##拟合平滑曲线ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg))+geom_point(pch=17,color='blue',size

Drakens_Africa·2023-08-09 09:03

【R语言南丁格尔玫瑰图绘制】

library(ggplot2)library(RColor

寻小宁·2023-08-09 05:01

ggplot2包可视化——绘制条形图

参考文献：张杰.R语言数据可视化之美：专业图表绘制指南：增强版—北京：电子工业出版社，2019Winstonchang.R数据可视化手册—北京：人民邮电出版社，2014在R语言中，ggplot2包的绘图以精美

zarzzzz1·2023-08-09 05:59

ggplot2如何画error bar charts

参考：1.http://www.cookbook-r.com/Graphs/Plotting_means_and_error_bars_(ggplot2)/2.https://www.zhihu.com

RachaelRiggs·2023-08-08 19:05

跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2散点组合误差线展示响应比（Response ratio）

论文Meta-analysisoftheimpactsofglobalchangefactorsonsoilmicrobialdiversityandfunctionalityhttps://www.nature.com/articles/s41467-020-16881-7#Sec15论文里提供了数据和代码，很好的学习素材这篇论文是公众号的一位读者留言，说这篇论文提供了数据和代码，但是代码比较长

小明的数据分析笔记本·2023-08-07 14:31

ggpolt2绘制7种不同的柱形图简单又实用

ggplot2是R语言中常用的包，它具有强大的绘图功能，在生物学数据可视化过程中，有很多图都是用ggplot2绘制出来的。

蜗牛数据分析·2023-08-07 02:31

利用ggplot2绘制SCI样式的UMAP图

这次借助ggplot2进行可视化，对于Seurat出来的umap/tsne后期的微调。

Zee_李海海·2023-08-07 01:18

通过BiocManager下载安装ggplot2和DESeq2

R语言之书：“每年大约有四个新版本的R，用于解决函数、兼容性问题和错误修复。最好保持最新版本。”首先将R与RStudio更新至最新版本（2020.6.4我R用的4.0.0，RStudio1.3.959）。输入旧命令：source("https://bioconductor.org/biocLite.R")，结果显示：bioconductor现在已经更新成BiocManager按照提示去网站搜索ht

彭喆倫Arlen·2023-08-05 06:21

ggplot2高级:使用ggproto构建自己的图层(四)

创建你自己的主题如果你需要创建自己的完整主题，有以下几个件事情你需要知道重写已有的元素，而不是修改他们有四个全局性元素影响几乎所有其他主题元素完整和不完整元素的比较重写元素默认情况下，当你新增一个主题元素，它会从一个已有主题中继承参数值。例如，如下的代码设置key颜色是红色，但它继承了已有的fill颜色。theme_grey()$legend.key#>Listof5#>$fill:chr"gre

xuzhougeng·2023-08-05 06:20

GO分类条形图

R绘图脚本rm(list=ls())library(ggplot2)windowsFonts(myFont=windowsFont("TimesNewRoman"))setwd("D:\\data\\kegg_go_class

清水咸鱼·2023-08-05 02:29

R 语言 | 用ggplot2画2个分类变量的计数柱状图

1.基本柱状图对于计数数据+2个分类变量，画柱状图。难点：怎么控制组内的柱子间宽？模拟数据:x轴是汽化器的个数，颜色分类是自动挡/手动挡，y轴是该分类的汽车型号计数。#准备数据:df1=table(mtcars$carb,mtcars$am);df1df2=as.data.frame(df1);df2colnames(df2)=c("carb","am","count")df2#library(g

biomooc·2023-08-04 02:23

ggplot2：气泡图及散点图小结

geom_point(shape=17,size=4)p+geom_point(aes(shape=factor(cyl)),size=4)2.改变点的大小：气泡图加载包、数据的读入及数据格式library(ggplot2

村狗儿·2023-08-04 00:08

计算ChIP-seq的CPM值

得到然后R开始#loadpackages------library(ChIPseeker)library(org.Mm.eg.db)library(gggenes)library(ggplot2)library

pudding815·2023-08-03 22:36

小有所成题目一答案：nature高水平组组合图形绘制

高手题目二小有所成题目二点击此处查看题目详细内容小有所成一答案这位朋友使用的策略是拼图library(reshape)library(ggplot2)library(cowplot)构造数据#数据x1]

wentaomicro·2023-08-03 01:27

KEGG Pathway通路结果绘制气泡图

参考CSDN博客ntuYision：使用R语言ggplot2包绘制pathway富集分析气泡图（Bubble图）:数据结构及代码getwd()setwd("D:/Desktop/")#查看和修改工作目录

小灰灰want_to_fly·2023-08-02 23:42

R-ggplot2-如何将点图与密度统计图通过双坐标轴的方式结合在一起？本篇给出解决方案~

目录0.问题导入1.示例数据2.导入示例数据3.离散类型连续化4.绘图数据框构建5.将密度图与点图叠加（图2）6.总结7.本文所使用的R-packages（没有的小伙伴需要使用install.packages()进行安装）8.致谢0.问题导入科研过程中，我们可能会遇到想把样本点放到总体的概率统计图上，同时体现样本点的类型，类似于下面两图的叠加（图1）。但这样会面临如下两个问题：1.如何绘制双坐标轴

TroyShen·2023-08-02 09:08

R语言 Mutate家族

包中含有各种数据整理以及画图的包，如下加载tidyverse包：>library(tidyverse)--Attachingpackages------------------------tidyverse1.3.0--√ggplot23.3.3

日月其除·2023-08-02 07:48

【有一才有二】scRNA-Seq数据分析第一步：数据载入方式的汇总

MyOneDriveCloud/OneDrive/GSE156329_RAW")rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)library(Seurat)library(ggplot2

研平方·2023-08-01 14:47

绘制双坐标图

library(ggplot2)library(scales)library(magrittr)library(tidyr)fst_s_d=read.table("LRP1B_fst_s_d_extend1000kb.txt

宗肃書·2023-08-01 08:44

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画箱线图(boxplot)展示D statistic

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png这篇论文的数据是公开的，代码也公开了一部分，那我们就可以按照他的提供的数据来试着复原一些论文中的图了。本来已经重复到了论文中Fig1的2c，但是试着做局部放大的时候遇

小明的数据分析笔记本·2023-07-30 15:54

ggplot2回顾(9): 分面

1.若干问题1.1分面和拼图的适用范围分面：数据在一张表格上，存在若干个分类变量可以给数据分组，这时可以使用分面；拼图：已经产生了多个图（对象），需要拼在一起1.2facet_grid()和facet_wrap()的差异facet_grid()本质是二维;facet_wrap()本质是一维1.3分面标签如何调整角度1.4并列与分面的比较分面的一个优势是通过scales,space可以控制构图，见图

TOP生物信息·2023-07-29 15:10

队列数据分析积累-1

library(bkmr)library(ggplot2)#给数据赋值，如果要自己进行研究，数据的地址以及数据的变量需要对应的自行选择替换，data1是导入数据，covar是定义协变量，expose是定义暴露

橙子榴莲巧克力·2023-07-29 12:33

R语言ggalluvia包优雅的绘制桑基图

先导入数据和R包library(foreign)library(ggplot2)library(ggalluvial)librar

天桥下的卖艺者·2023-07-29 03:13

R语言ggplot2画棒棒糖图展示中国十大姓氏的数量

发现了一个很有意思的R语言包ChineseNames，对应的github主页是https://github.com/psychbruce/ChineseNamesimage.png自己的理解是这个包里统计了12亿汉族人的姓名信息，其中姓是1806个，名字是2614个，今天推文的内容来简单探索一下姓的信息，主要包括最多的人的姓是啥最少的姓是啥复姓都有啥首先是安装这个包install.packages

小明的数据分析笔记本·2023-07-29 03:25

ggplot杂记

Ref:ggplot2-book使用theme_classic()使ggplot的图变成r-base的样子使用plotmth在图片中显示数学公式，seethissites.

单嘉伟xx·2023-07-28 12:59

2022-04-16:一天就搞了一个这

library(readr)library(ggtree)library(treeio)library(DESeq2)library(ggplot2)library(stringr)library(tidyverse

小明的数据分析笔记本·2023-07-28 06:50

（转帖）R语言-ggplot2-星巴克门店分布图

原文地址：https://mp.weixin.qq.com/s/ifVrdv_yF6dQ4kQ3qha0Hwlibrary("rvest")library("dplyr")library("ggplot2

苏慕晨枫·2023-07-27 19:06

geom_bar()之报错

但当绘制双变量时，直接添加变量则会出现如下报错：rm(list=ls())data("iris")library(ggplot2)base<-ggplot(iris,aes(iris$Species,iris

啊吧啊吧鸭·2023-07-27 14:53

复现《nature communications》图表（三）：画样本时间轴图（堆叠柱状图）

画图还是用ggplot2。由于文章中没有提供具体数据，所以我自己虚

KS科研分享与服务·2023-07-27 08:03

ggplot2绘制散点图进阶（一）

简单散点图上篇文章R语言与散点图介绍了如何用ggplot2包中的geom_point()函数绘制简单的散点图。

生信分析实验室·2023-07-27 04:22

BGI-College生信入门——9、R语言基础（二）

ggplot2ElegantGraphicsforDataAnalysis，用于数据分析的精美图形ggplot2是一个用于数据统计和绘图的R包与其它绘图包不同，ggplot2有自己的基础语法ggplot2

华大基因学院·2023-07-26 23:25

跟着Nature Microbiology学作图：R语言ggplot2做散点图添加拟合曲线和p值

本地文件s41564-021-00997-7.pdf论文ProtectiveroleoftheArabidopsisleafmicrobiotaagainstabacterialpathogenimage.png今天的推文来重复一下论文中的figure3c散点图添加拟合曲线image.png读取数据集library(readxl)df<-read_excel("41564_2021_997_MOE

小明的数据分析笔记本·2023-07-25 03:38

【生信技能树】R语言高级练习题

安装一些R包数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包：ggplot2了解ExpressionSet

函数IsLazy·2023-07-24 16:18

学习小组Day4笔记--尤书书

Day4-R语言基础.pngR数据科学--详解ggplot2RforDataScience1.安装R和RstudioRstudio相当于R语言的一个人性化/图形的界面果子学生信给自己一个全新的R语言环境之前有装过

SHore_1913·2023-07-24 02:23

R 数据处理（三）

tidyverse中所有的包具有同样的设计理念、语法以及数据结构主要包含如下R包：包名描述ggplot2鼎鼎大名的画图包，不用过多介绍dplyr提供了一组便利的数据操作语法tidyr数据的整洁之道readr

名本无名·2023-07-23 08:34

RNA-seq学习：No.12 EnhancedVolcano绘制美观火山图

EnhancedVolcano包可根据差异分析结果，基于ggplot2绘图结构，方便地绘制美观的火山图，下面根据自己的理解小结下基本用法。

小贝学生信·2023-07-23 03:33

ggplot2笔记

ggplot之六层参数基本格式：ggplot(Data数据集,Aesthetics坐标+Geometries图形+Facets分组+Statistics+ggplot之六层参数Aesthetics基本格式：ggpplot(dataset,aes(x=字段1,y=字段2,color=字段3,shape=字段4,size=字段5,……))+典型的aes参数❗️label和shape只能用于分类变量❗️

姚宝淇·2023-07-22 15:47

python双y轴的折线图_Matplotlib双Y轴折线图小实例

简单注释fig,ax1=plt.subplots(figsize=(12,9))创建画布，有点类似于ggplot2的ggplot()函数的作用；figsize参数用来控制图片长和宽，但是单位是啥还没搞明白

weixin_39670857·2023-07-22 10:04

【R语言基础六：有关R的其他知识】

下升级R#查看当前R版本version#升级Rinstall.packages("installr")library(installr)updateR()升级R要在R内核中而不是RStudio中进行2.ggplot2

lkj666·2023-07-22 08:04

2019-04-22

rm(list=ls())require("ggplot2")require("reshape")library(wesanderson)require("plyr")setwd("~/Documents

Larrylu007·2023-07-22 05:51

ggplot2 画图 X 轴排序问题

实际使用ggplot2画柱状体时，遇到x轴排序问题。本文描述问题及其解决过程。

梦想画家·2023-07-21 22:27

PlotEnrichDotPlot ggplot2画图拆解

#returnheatcolorsofgivenlengthGetMyHeatCols50){ht.col25){results<-results[1:25,]my.cols<-my.cols[1:25]}df<-data.frame(Name=factor(row.names(results),levels=rev(row.names(results))),rawp=results[,4],lo

Young.Dr·2023-07-21 22:54

4.数据可视化（一）

—JohnTukey通过本节你将学会如何使用ggplot2可视化数据。R有多种用于生成图的系统，但ggplot2是最高效和最通用的系统之一。

denghb001·2023-07-21 09:02

R 数据可视化 —— gtable 介绍

当我们需要展示的数据，包含相同的X轴，但是具有两个不同的Y轴变量时，我们会选择在右侧添加一条轴，在ggplot2中，可以使用sec_axis来设置。那如果Y轴变量有多个呢？我们该如何绘制？

名本无名·2023-07-21 04:15

个性化调整GSEAplot

这两个函数中可以调整的参数较少，因此我们希望把图导出为ggplot对象，然后用ggplot2包重新对其进行调整。

一只烟酒僧·2023-07-21 01:37

跟着Nature学作图：R语言ggplot2箱线图、小提琴图、抖动散点图

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的

小明的数据分析笔记本·2023-07-20 13:05

推荐频道

ggplot2