ggplot

R可视化：'patchwork:合并多个R图的包'

'patchwork:合并多个R图的包'patchwork是基于gglot2的拼图包，它使得基于ggplot2的图形更容易拼接在同一个图层。更多知识分享请到https://zouhua.top/。
华仔少年·2021-04-18 11:30

用ggtree画进化树

setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\tree")library("ggtree")library("ggplot2")tree<-read.tree("species.tree
周运来就是我·2021-04-18 10:08

R语言：合并散点图、箱图、密度图

参考：aplot包：让你画出更复杂的图依赖包library(ggplot2)library(aplot)一、输入数据sample=paste("sample",seq(1,10,1),sep=".")x
小白菜学生信·2021-04-18 10:23

R绘图_ggpubr: Publication Ready Plots

PublicationReadyPlotsggplot2-EasyWaytoMixMultipleGraphsonTheSamePage作者：kassambara日期：01/09/2017翻译：谢俊飞在同一页面上排列多个ggplot2
谢俊飞·2021-04-18 07:00

TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）

rawreads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从rawreads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】其他文章系列：ggplot2
ZZZZZZ_XX·2021-04-18 06:57

ggplot2 修改图例的一些操作

首先做一幅简单的散点图，使用的数据集是R语言里自带的irislibrary(ggplot2)ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+geom_point
小明的数据分析笔记本·2021-04-18 06:32

『R画图脚本进阶』TBtools两个富集分析结果合并一键可视化

为啥搞这个之前写过一个用ggplot2画TBtools富集分析结果的代码，用ggplot2做富集分析气泡图,发现大家确实喜欢花里胡哨的东西....其实我感觉柱状图就已经挺能说明问题的，当然一张花里胡哨的图小概率可以成为论文的加分项
ShawnMagic·2021-04-18 06:27

2018-07-23 R for data science之使用ggplot2进行可视化

library(tidyverse)library(ggplot2)查看mpg数据结构##采用ggplot2自带的数据mpg来探索引擎与燃油效率之间的关系##变量displ：引擎的大小hwy：燃油的效率
热衷组培的二货潜·2021-04-18 05:38

跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2以原点为中心画坐标轴

前天的推文里模仿论文中的散点图以原点为中心花了一个坐标轴，R语言的ggplot2画图通常坐标轴是在左下角，如果想把坐标轴改成以原点（0,0）为中心应该如何实现呢？
小明的数据分析笔记本·2021-04-18 05:16

R语言ggplot2画带有空白格的热图

image.png之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱形图，最后将四个图组合到一起。那就按照这个思路试一下看能不能实现。首先画热图这个热图和常规的还稍微有点不太一样，可以简单的理解为带有缺失值的热图，缺失值是空白格，其他值分别填充颜色。那我们就按照这个思路来构造
小明的数据分析笔记本·2021-04-18 04:17

跟着张旭东老师学ggplot2绘制火山图

基因课FTP地址：ftp://http://gsx.genek.tv/2020-3-10%E7%9B%B4%E6%92%AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%8C%E6%95%B4%E7%9A%84%E8%BD%AC%E5%BD%95%E7%BB%84%E9%A1%B9%E7%9B%AE/听张旭东老师的课RMarkdown可生成html文件完成后点击Knit,可生成Markdown
嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2021-04-18 04:49

ggplot2 001 图形语法

ggplot2是R语言最流行的第三方扩展包，包名中“gg”是图形语法（grammarofgraphics）的简称，WickhamHadley将这套语法诠释如下：一张统计图形就是从数据到几何对象（geometricobject
caoqiansheng·2021-04-18 02:41

使用ggtree对进化树进行分组美化

ggtree可以像ggplot2一样，用图层化的语法绘制进化树，通过不同的图层组合即可绘制出更为复杂
生信小王子·2021-04-18 02:30

R数据科学 R for data sciences

一使用ggplot2进行数据可视化坐标系ggplot()，在此函数种添加的映射会作为全局变量应用到图中的每个几何对象种。
Dawn_WangTP·2021-04-18 00:18

R语言学习指南(2) ggplot2中的一些关键概念

本节主要向初学者简要介绍ggplot2中的一些关键概念先看下面的代码：ggplot(celebs,aes(x=age,y=oscars))+geom_point(size=7,aes(color=gender
益民厂老厂长·2021-04-18 00:59

TidyTuesday 可视化学习之 ggplot2 一笔一画绘制表格

更好阅读移步至：https://www.yuque.com/docs/share/01fe5958-5f6b-4364-aa39-cb7d3fd602ed?#参考链接：twitter：https://twitter.com/geokaramanis/status/1247586395876741120代码github链接：https://github.com/gkaramanis/tidytues
热衷组培的二货潜·2021-04-18 00:55

R语言ggplot2包绘制散点图详解

R语言的ggplot包可以实现各种复杂的制图功能，本文以散点图为例，介绍ggplot2代码的使用方法。首先，使用R内置数据attitude绘制complaints和learning的散点图。
GlobalWarming·2021-04-17 22:07

【生信工具】快速绘制发表级图片ggplot2智能版ggpubr包学习总结

软件简介HadleyWickham编写的ggplot2是出色且灵活的作图软件包，可用于R中的优雅数据可视化。ggplot2默认生成的绘图需要进行一些格式化，才能作出发表级别的图片质量。
基因侦探·2021-04-17 22:06

用R语言绘制ROC曲线的实例讲解

如图：2代码部分install.packages(“pROC”)install.packages(“ggplot2”)library(pROC)library(ggplot2)#建立曲线data(aSAH
·2021-04-17 20:28

R语言绘图大小设定的操作

5,3))#pin()函数控制图形的尺寸plot(x=x,y=y)x=c(1:10)y=c(11:20)par(pin=c(2,3))#pin()函数控制图形的尺寸plot(x=x,y=y)补充：R语言ggplot2
·2021-04-17 20:28

第一章使用ggplot2进行数据可视化

第一章使用ggplot2进行数据可视化library(tidyverse)查看运行环境devtools::session_info(c("tidyverse"))-Sessioninfo--------
Seurat_·2021-04-17 20:08

相关性分析 | R语言 -- 两个变量的相关性分析

安装并加载所需的R软件包我们将使用ggpubrR软件包进行基于ggplot2的简
你有康娜可爱吗·2021-04-17 19:35

R语言 ggplot2改变柱状图的顺序操作

如下所示：library(ggplot2)library(ggthemes)dt=data.frame(obj=c('A','D','B','E','C'),val=c(2,15,6,9,7))dt$obj
·2021-04-17 17:51

R语言 使用ggplot2绘制好看的分组散点图

1.首先载入ggplot2包，library(ggplot2)2.然后进行ggplot(data=NULL,mapping=aes(),...,environment=parent.frame())绘制
·2021-04-17 17:51

R语言 解决安装ggplot2报错的问题

如下所示：install.packages(‘xxx',repos=‘http://cran.us.r-project.org')xxx改为ggplot2补充：R包安装时，出现的错误解决合集如下所示：1
·2021-04-17 17:51

R语言ggplot2x轴顺序设置自定义颜色的操作

先声明一下所用的数据集第一个图如下这个图主要在于x轴的顺序设置上，如果按不做任何处理的话>3那个就会在2之前，解决方法是b[,1]3"))，这句代码可以重新设置因子的级别完整代码如下：a[,1]3"))ggplot
·2021-04-17 17:51

R语言ggplot2包之注释方式

library(ggplot2)library(gcookbook)p<-ggplot(faithful,aes(x=eruptions
·2021-04-17 17:20

R语言ggplot2包之坐标轴详解

library(ggplot2)library(gcookbook)ggplot(PlantGrowth,aes(x=group,y=weight))+geom_boxplot()ggplot(Plan
·2021-04-17 17:49

ggplot2绘制条形图

转载自作者：悦光阴出处：http://www.cnblogs.com/ljhdo/使用geom_bar()函数绘制条形图，条形图的高度通常表示两种情况之一：每组中的数据的个数，或数据框中列的值，高度表示的含义是由geom_bar()函数的参数stat决定的，stat在geom_bar()函数中有两个有效值：count和identity。默认情况下，stat="count"，这意味着每个条的高度等于
onlyme_862a·2021-04-17 16:54

R语言中qplot()函数的用法说明

ggplot2()函数ggplot2是一个强大的作图工具，它可以让你不受现有图形类型的限制，创造出任何有助于解决你所遇到问题的图形。
·2021-04-17 15:43

R的ggplot2画图,去除灰色阴影和网格的方式

使用代码+theme_bw()+theme(panel.grid.major=element_line(colour=NA),panel.background=element_rect(fill="transparent",colour=NA),plot.background=element_rect(fill="transparent",colour=NA),panel.grid.minor=e
·2021-04-17 15:42

R语言 设置ylab每个汉字竖向排列的操作

下面给出代码：library(ggplot2)#数据df<-data.frame(gp=factor(rep(letters[1:3],each=10)),y=
·2021-04-17 15:42

R ggplot2 修改默认颜色的操作

我们都知道ggplot2包是R的神器，很多生物学文章都选择用这个包来画图。用ggplot2就像玩俄罗斯方块一样，一层一层地往上叠加元素，这使得它用起来很方便。
·2021-04-17 15:42

R语言ggplot2画带有置信区间的折线图

今天遇到一个分组求均值的问题，愣是看不出问题出在哪了，大家帮我看看文末的代码是哪里出问题了，或者留言说一下自己分组求均值在R语言里是如何实现的。折线图通常用来表现数据的变化趋势，比如做果树研究的通常会研究果实在整个发育过程中一些生理生化指标的变化趋势，这个时候就可以选择折线图的方式来展现数据。首先是构造一份数据集library(tidyverse)huron%group_by(first)%>%s
小明的数据分析笔记本·2021-04-17 15:30

R语言柱状图排序和x轴上的标签倾斜操作

R语言做柱状图大致有两种方法，一种是基础库里面的barplot函数，另一个就是ggplot2包里面的geom_bar此处用的是字符变量统计其各频数，然后做出其柱状图。
·2021-04-17 14:08

R语言绘制频率直方图的案例

频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式，同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型；R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便，但是当遇到多组数据的时候就不如ggplot2绘制来的方便
·2021-04-17 14:16

ggplot可视化

ggplot库的使用ggplot绘图几何图形层统计变化美化层绘制一个空白图绘制散点图绘制散点图并标记形状绘制折线图绘制直方图面积图条形图箱体图线性回归ggplot绘图ggplot_pypi0.11.5简单的图层累加
laufing·2021-04-15 19:12

R语言 ggplot2 一页多图方法 ggpubr::ggarrange()

R语言ggplot2一页多图方法ggpubr::ggarrange()#载入packageslibrary(ggplot2)library(ggpubr)#生成数据x<-seq(1,10,0.01)*pie
红泥小火炉儿·2021-04-15 15:16

R 数据可视化 —— ggplot 线图

前言ggplot2包含很多绘制线条的函数：大致可分为如下几类：连接线：折线(geom_line)、路径线(geom_path)、阶梯线(geom_step)参考线：水平线(geom_hline)、竖直线
名本无名·2021-04-15 13:08

R语言可视化之ggplot2——GO富集分析

自学生信两个月了，都是自己在网上东找找西找找，总觉得连门都没入。总说最高效的学习方法就是输出，而最好的输出就是教别人。当然给别人讲课我还远远达不到，但自己学完，写下来，也算是一种输出了吧。1.数据准备DAVID是一个可以做ID转换、富集分析等多种生信分析的综合数据库。以DAVID上的GO分析结果为例，主要需要Category，Term，Count，FDR，FoldEnrichment这几列。随便用
zrh_h·2021-04-15 10:27

R语言：一文搞定ggplot柱形图

导读以模拟数据为案例，总结ggplot柱形图绘图参数。内容如下方目录所示，一共包含1-9个部分。
小白菜学生信·2021-04-15 09:03

R语言学习指南(4) 初识ggplot2绘图

经过前面ggplot2绘图原理的学习，我们了解到ggplot图形的本质都是散点图，因此让我们从一个散点图的案例开始学习，先看下图：point.pngA图为ggplot2默认输出的图形样式，而B图则是在geom_point
益民厂老厂长·2021-04-15 08:49

跟着Nature Communications学画图~Figure1~ggplot2箱线图

学习R语言ggplot2包画箱线图。
小明的数据分析笔记本·2021-04-15 07:44

- 02. ggplot2基本概念和语法框架

一．ggplot2的特点及其基本概念1.ggplot2特点在介绍ggplot2之前，首先来介绍一下作者HadleyWickham。
诺禾致源·2021-04-15 06:16

跟着Nature Communications 学画图~ggplot2拼图

学习R语言ggplot2包画图。然后多个图拼接到一起。对应的是论文中的补充材料图一。
小明的数据分析笔记本·2021-04-15 05:39

R小姐：利用ggplot2绘制散点图

比如说：ggplot2。利用ggplot2绘制出来的图表非常好看。首先安装**ggplot2**和
环境健康学·2021-04-15 05:34

R语言ggplot2两个离散变量画热图的简单小例子

今天推文的内容来自http://userweb.eng.gla.ac.uk/umer.ijaz/bioinformatics/ecological.html。这个链接的数据和代码主要来自论文Assessmentoftheinfluenceofintrinsicenvironmentalandgeographicalfactorsonthebacterialecologyofpitlatrinesi
小明的数据分析笔记本·2021-04-15 04:32

R绘图_ggplot2图形参数之图例[2]

EasystepstochangethepositionandtheappearanceofagraphlegendinRsoftwareggplot2图例：轻松更改图例的位置和外观本教程的目的是描述如何更改使用ggplot2
谢俊飞·2021-04-15 04:13

跟着Nature Genetics学画图~ggplot2画折线图并在指定区域添加灰色背景

image.png最近在看论文Phaseddiploidgenomeassembliesandpan-genomesprovideinsightsintothegenetichistoryofappledomestication（高水平论文看起来还真是吃力！）看懂一点记一点吧。今天的笔记记录的是论文中Figure2图a的画法，图a展示的是啥内容我暂时还没有看懂，如果从画图的角度来说就是一个简单的折
小明的数据分析笔记本·2021-04-15 03:19

跟着Nature Methods学画图：R语言ggplot2画气泡图（dotplot）展示基因表达量

今天的推文继续重复论文中的原图在土豆学生信分享的内容看到这篇论文的链接是https://www.jianshu.com/p/bbf9cb13b41a论文是image.png论文对应的代码是公开的https://github.com/ajwilk/2020_Wilk_COVIDimage.png今天重复的内容是论文中的figure2fimage.png今天的推文主要介绍其中的气泡图，明天的推文介绍如
小明的数据分析笔记本·2021-04-15 02:11
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