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ggplot
使用R语言绘制棒棒糖图火柴杆图教程
目录使用原生
ggplot
方法1)生成数据使用ggpubr包中的ggdotchart()参考使用原生
ggplot
方法最容易也是最简单想到的方法是直接使用
ggplot
2包进行更新,这里需要使用
ggplot
本身的特性
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2021-11-05 17:19
R语言数据可视化
ggplot
绘制置信区间与分组绘图技巧
目录1.单组情况1)构造数据集2)绘制置信区间2.多组情况方法11)构造数据集2)绘制置信区间方法21)构造数据集2)绘制置信区间3)美化1.单组情况1)构造数据集x<-1:10y<-x^2ci_l<-x^2-0.5*xci_r<-x^2+0.5*xdat_plot<-data.frame(x,y,ci_l,ci_r)数据集长下面这样:xyci_lci_r1110.51.52243.05.0339
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2021-11-05 17:14
使用R语言绘制散点图结合边际分布图教程
目录1.使用ggExtra结合
ggplot
21)传统散点图2)密度函数3)直方图4)箱线图(宽窄的显示会有些问题)5)小提琴图(会有重叠,不建议使用)6)密度函数与直方图同时展现2.使用cowplot与
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2021-11-05 14:08
R语言read.table()函数读取文件如果有换行符\n,一个\为什么会变成两个\\呢?
使用R语言的
ggplot
2作图,使用geom_text()函数添加文本,因为文本比较长,所以想在文本中间添加一个换行符,这样添加文本后就可以换行显示image.png这个是数据但是使用R语言读取进来的时候为什么会多一个斜杠呢
小明的数据分析笔记本
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2021-11-03 16:23
ggplot
2 金字塔图形(双向柱状图)
这篇文章主要是分享一下金字塔图形的绘制方法,其来源是文章中的图E,如下:文章图片.jpg看了一下,可以通过
ggplot
2来实现,数据来自于自己试验的数据(该数据也是两个样本整合的数据,计算了每个样本的各个
Zee_李海海
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2021-10-29 17:22
ggplot
2绘制有显著性标注的箱线图
2.基础绘图
ggplot
()+geo
Wei_Sun
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2021-10-28 13:23
R语言编程重读微积分泰勒级数示例详解
library(
ggplot
2)library(gganimate)library(av)library(tibble)x=seq(-pi,pi,0.1)n=length(x)xs=rep(x,11)ys
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2021-10-21 10:52
ggplot
2绘制散点图进阶二
上篇文章记录了散点图如何用
ggplot
2包中的pch参数调整点的类型和参数col调整点的颜色以及如何按照分组绘制不同颜色的散点图,而且特别提醒大家分组属性需要转化为因子型数据,用函数factor()实现
生信分析实验室
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2021-10-20 20:07
R语言编程学习绘制动态图实现示例
绘图需要用到
ggplot
2,为多张图加上时间轴则需要用到gganimate,为了让这些动态图片被渲染,需要用到av。此外,
ggplot
2绘图需要输入的数据格式为tibble。install.packa
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2021-10-19 17:18
一款 Python 神器搞定自动化图表配色
//mp.weixin.qq.com/s/lw...作者:朱小五我们在利用Python进行数据可视化时,有着大量的高质量库可以用,比如:Matplotlib、seaborn、Plotly、Bokeh、
ggplot
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2021-10-14 22:41
python
一款 Python 神器搞定自动化图表配色
mp.weixin.qq.com/s/lwvZ1SyhiOiWx2lP-Iou6Q作者:朱小五我们在利用Python进行数据可视化时,有着大量的高质量库可以用,比如:Matplotlib、seaborn、Plotly、Bokeh、
ggplot
写代码的明哥
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2021-10-14 22:25
Python
Data visualisation
Rfordatascience的一些笔记原书地址:3Datavisualisation|RforDataScience(had.co.nz)对数据集进行简单的可视化,可用以下通式,其中GEO_FUNCTION部分输入
ggplot
2
章植梨柝
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2021-10-12 00:38
R语言绘图|散点图详解(geom_point)
此文内容来自微信公众号:R语言搬运工,关注公众号浏览更多精彩内容如何在
ggplot
2中绘制柱形图,实际中根据数据形式需要添加误差棒,这也是在科研绘图中经常遇到的,比如根据数据平均值绘制的柱形图往往要求添加误差棒
R语言搬运工
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2021-10-11 14:27
R语言绘图基础篇-添加拟合曲线(geom_smooth)
**此文内容来自微信公众号:R语言搬运工,关注公众号浏览更多精彩内容**原文连接上一篇介绍了使用
ggplot
2绘制散点图,通过散点图可以大致看出数据的分布规律,然而,现实中如果数据点较多,数据展示的分布趋势并不是十分的明显
R语言搬运工
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2021-10-11 14:58
R绘制漂亮的中国地图的实现示例
ggmapmaps+mapdataggplot2+mapdataggrepelggmap说起用R绘制中国地图,很多有经验的老司机肯定会推荐ggmap,无论是里面自带的各种地区绘图、经纬度查询以及可以与
ggplot
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2021-09-23 18:41
R与散点图进阶(一)
简单散点图上篇文章R语言与散点图介绍了如何用
ggplot
2包中的geom_point()函数绘制简单的散点图。
生信分析记录本
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2021-09-22 11:40
跟着Science学画图:R语言
ggplot
2实现图中嵌图
论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本
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2021-09-19 20:01
ggplot
2绘制聚类热图
加载需要的R包:library(reshape2)library(
ggplot
2)library(ggtree)#需要在bioconductor下载读入数据:gene%data.frame(x=c(1:
钿璎纍纍佩珊珊
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2021-09-18 23:51
Python与R共舞:在python中用
ggplot
2、plotnine画散点相关(回归)分析图(附最新高清plotnine、
ggplot
2速查表(
ggplot
2-cheatsheet))
但是笔者还是被
ggplot
2包绘图所吸引,图层直接简单叠加型设计,用它们可以美观、灵活、简洁的构建几乎任何类型的图表。
意疏
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2021-09-18 14:59
数据分析与数据挖掘
rpy2
ggplot2
plotnine
python与R共舞
回归(相关)分析图
ggplot
2绘制散点图(拟合曲线,添加R方和回归方程)
在进行回归分析之前,通常要画散点图看两组的相关趋势,并添加拟合曲线,本文就描述一下,如何使用
ggplot
2来绘制散点图,并添加拟合曲线及其95%CI,最后加上R方值和回归方程。
钿璎纍纍佩珊珊
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2021-09-18 00:01
超全的Matplotlib速查表,打包下载
Matplotlib还是众多可视化库的底层依赖,比如Seaborn、Cartopy、animatplot、
ggplot
、Geoplot等,为它们提供图表套件和基础功能,所以Matplotlib几乎已经成为
python大数据分析
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2021-09-13 15:57
如何将多个生存分析曲线图片进行合并拼图
函数可以画好看的生存分析曲线,也可以用分面的方法分面绘制多组图片(教程可以见我以前给生信助手上的一个小建议「凌云34」MultipleOverallSurvivalPlots(2),虽然说ggsurvplot()的语法基于
ggplot
2
欧阳松
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2021-09-13 01:07
跟着Nature Genetics 学画图:R语言
ggplot
2画基因结构示意图
今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8c,基因结构图,论文中文字部分对图的描述是GenestructureofLsat_6X11620.Closedb
小明的数据分析笔记本
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2021-09-08 19:45
ggplot
2绘制柱形图(1)
这是流式的部分结果:UR代表右上象限,LR代表右下象限先加载要用的R包:>library(reshape2)>library(
ggplot
2)>library(ggsignif)读入数据并整理数据:>mito48colnames
钿璎纍纍佩珊珊
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2021-09-03 13:06
r语言
ggplot
2误差棒图快速指南
library(
ggplot
2) df <- ToothGrowth df$dose <- as.factor(df$dose) head(df) ## len supp dose ## 1 4.2 VC
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2021-09-01 19:11
ggplot
2绘制火山图
>fpkmhead(fpkm)>fpkm$typedata2head(data2)>data2$pvaldata2$typeggplot(data2)+geom_point(mapping=aes(x=log2FC,y=pval,color=type),size=3,alpha=0.8)+scale_color_manual(values=c("skyblue","grey","pink"))+#
钿璎纍纍佩珊珊
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2021-08-28 21:34
拓端tecdat|R语言可视化:
ggplot
2冲积/桑基图sankey分析大学录取情况、泰坦尼克幸存者数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=23490本文介绍了冲积/桑基图,以及定义了命名方案和冲积/桑基图的基本组成部分(轴、冲积层、流)。描述了所识别的冲积/桑基图数据结构。展示了一些流行的主题。冲积/桑基图这里有一个典型的冲积/桑基图。现在,我们以该图像为参考点,定义典型冲积图的以下元素。轴是一个维度(变量),数据沿着这个维度在一个固定的水平位置被垂直分组。上面的图使用了三个分类轴。
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2021-08-19 16:25
约会数据动态可视化分析:R语言使用
ggplot
和ganimate制作的动画图
p=23440你知道吗,你可以把普通的静态
ggplot
图转换成动画图?在R软件包ganimate的帮助下,你可以做到这一点,而且效果非常好。
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2021-08-16 20:09
预测模型 | 决策曲线分析(DCA):基于ggDCA包
ggDCA是目前能同时绘制Cox回归模型、logistic回归模型及广义线性模型的DCA曲线且其图形能用
ggplot
2美化。同时,该包还能计算DCA的曲
小毛竹_mxd
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2021-08-10 11:12
ggplot
2绘制带箭头图的条形图
本节介绍一下用
ggplot
2绘制带箭头的条形图,很简单的绘图案例,但是用到了很多的画图函数,希望对大家学习
ggplot
2绘图有所帮助加载R包library(tidyverse)library(ggsci
R语言数据分析指南
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2021-08-03 00:12
拓端tecdat|R语言在地图上绘制散点饼图可视化
p=22537我们在
ggplot
2中制作的饼实际上是一个条形图转换为极坐标。如果我们想制作一个像上面截图那样的地图,这就很困难了。但在地图上绘制饼图时,它也有自己的缺点。
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2021-07-29 18:04
拓端tecdat|
ggplot
2如何在R语言中绘制表格
该函数tableGrob创建像一个数据帧的曲线图表,显示在
ggplot
2图形对象的网页上。
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2021-07-27 20:18
R语言
ggplot
2实现将多个照片拼接到一起
将多个照片拼接到一起,然而电脑上没有安装ps和ai(拼图我暂时只想到这两个软件了)直接使用R语言吧思路是读取图片使用
ggplot
2显示最后使用patchwork拼接代码library(
ggplot
2)library
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2021-07-27 18:13
R
ggplot
2画图 注释和坐标系调整
如何修改坐标轴的显示范围scale_x_continuous()scale_y_continuous()xlim(min,max)ylim(min,max)p+scale_x_continuous(limits=c(-5,15))#将x轴刻度显示范围设置为-5到15p+scale_y_continuous(breaks=seq(1,7,1),limits=c(0,7))#breaks()可以设置显
毛线东东a
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2021-07-26 19:34
R语言
ggplot
2绘制平滑曲线的折线图
R语言
ggplot
2常规的折线图library(
ggplot
2)df<-data.frame(x=1:10,y=sample(1:10,10))
ggplot
(df)+geom_line(aes(x,y)
小明的数据分析笔记本
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2021-07-26 16:11
VlnPlot(小提琴图)
(烦人)library(Seurat)library(
ggplot
2)pbmc<-readRDS(rds)p<-VlnPlot(pbmc,features="NT5E",group.by="stim",
Zee_李海海
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2021-07-21 09:51
ggplot
2优雅的绘制热图
之前写过了不少绘制热图的文档,但是总感觉有不少细节没有交代清楚,今天统一再详细描述一次,希望各位观众老爷以后绘制热图再也没有困惑加载R包library(tidyverse)library(ggtree)library(aplot)构建数据集set.seed(56489)df%pivot_wider(names_from=x,values_from=value)%>%column_to_rownam
R语言数据分析指南
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2021-07-18 12:35
《高效R语言编程》7--高效优化
需要用到的包:microbenchmark,
ggplot
2movies,profvis,Rcpp代码分析首先是确定哪个是瓶颈,Rprof()是可以分析的一个内置工具,但是这个结果不确定,取决于外部环境,
zd200572
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2021-07-16 16:55
文章中的哑铃图复现(基础知识)
效果如下两图所示:图片.png图片.png1.
ggplot
2实现以mtcars数据集为例:library(
ggplot
2)data(mtcars)mt
单细胞空间交响乐
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2021-07-13 09:25
数据可视化——图表
install.packages("installr")library("installr")updateR()②导入所需R包:library("dplyr")library("
ggplot
2")library
小新122
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2021-06-29 22:15
R语言包
ggplot
2绘制多组箱线图
本文记录于2021年6月28日,2021年8月20日更新最近在做cibersort浸润分析,在对结果做可视化的时候遇到一点问题(问题解答蓝字部分)需要的代码和数据参考这个资源:https://download.csdn.net/download/weixin_52730798/21402082?spm=1001.2014.3001.5501根据默认的绘图只能进行一组数据的绘制,而我想要的结果是不同
彩虹色的朝阳
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2021-06-28 23:21
[R语言]
ggplot
2包 可视化《R for data science》 1
RforDataScience》第二、三章Datavisualisation啃书知识点积累参考书籍《Rfordatascience》《R数据科学》TheLayeredGrammarofGraphics.
ggplot
2
半为花间酒
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2021-06-27 09:20
可视化学习笔记(十一):
ggplot
2:存储图片
1、存储为pdf格式使用pdf存储格式pdf('file_name.pdf')dev.off()使用ggsave()函数ggsave()函数不能保存多页图形2、存储为PNG格式输出多幅图形时,可以在文件名中加入%d,在后续图形中这个位置将被1、2、3取代png("myplot-%d.png",width=400,height=400)plot(mtcars$wt,mtcars$mpg)print(
100gle
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2021-06-27 04:06
Python入门
python真的是太难了,现在还没找到适合的像Rstudio那样的IDE,pycharm我是真的用不来先下载个anaconda试试,用自带的Jupiternotebook百度了半天安装了python的
ggplot
liyin_d64b
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2021-06-26 09:58
教你用科学杂志喜欢的配色作图——R包ggsci
ggsci是
ggplot
的主题包,它提供一系列高质量的调色板,其灵感来自于科学期刊、数据可视化库、科幻电影和电视节目中使用的颜色。ggsci中的调色板可以作为
ggplot
2scales使用。
stanford_strive
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2021-06-24 21:16
R语言边学边记-
ggplot
作图
library(
ggplot
2)#数据集mtcars#基本格式:
ggplot
(data,aes(x,y))+geom_xx()+annotate()+labs()#aes是美化的意思,geom几何,annotate
Jerry_5543
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2021-06-24 19:28
R语言与医学统计图形-【19】
ggplot
2坐标轴调节
ggplot
2绘图系统——坐标轴调节scale函数:图形遥控器。
bioin
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2021-06-24 10:25
ggplot
2:堆积柱形图
输入文件格式如下:library(
ggplot
2)setwd("C:/Users/lenovo/Desktop")data<-read.csv(file="111.csv",header=T)
ggplot
Mr_我爱读文献
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2021-06-23 08:47
你到底想要什么样的umap/tsne图?
我们都知道
ggplot
2是一款很好的绘图R包,甚至可以说在语法上扩展了R语言本身。那么,当我们需要绘图的时候,自然我们会想到它及其周边。今天我们就主要地看一下ggforce这个包带给我们的可能性。
周运来就是我
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2021-06-23 04:02
ggplot
2修改坐标轴
library(
ggplot
2)data(ToothGrowth)ToothGrowth$dose<-factor(ToothGrowth$dose)p<-
ggplot
(ToothGrowth,aes(
生信编程日常
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2021-06-22 21:49
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