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ggplot
单细胞密度散点图的绘制
单细胞绘图系列:Seurat绘图函数总结使用
ggplot
2优化Seurat绘图scRNAseq灵活的点图绘制:FlexDotPlot富集分析结果雷达图DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:17
桑基图:不同分辨率下的细胞分群可视化
单细胞绘图系列:Seurat绘图函数总结使用
ggplot
2优化Seurat绘图scRNAseq灵活的点图绘制:FlexDotPlot富集分析结果雷达图DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:09
DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图
单细胞绘图系列:Seurat绘图函数总结使用
ggplot
2优化Seurat绘图scRNAseq灵活的点图绘制:FlexDotPlot富集分析结果雷达图1.使用DoHeatmap绘制Seurat自带热图library
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:05
scRNAseq灵活的点图绘制:FlexDotPlot
单细胞绘图系列:Seurat绘图函数总结使用
ggplot
2优化Seurat绘图在读NatMed一篇文献Asingle-cellatlasoftheperipheralimmuneresponseinpatientswithsevereCOVID
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:01
Seurat绘图函数总结(更新版)
更多重要函数见:Seurat重要命令汇总Seurat绘图函数总结在使用R语言进行单细胞数据的分析和处理时,除了优秀的绘图包
ggplot
2以外,Seurat也自带一些优秀的可视化工具,可以用于各种图形绘制
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:52
ggplot
2主题配置神器:ggthemr
每一个模板都拥有完善的标度和主题设定(包括离散标度和连续标度、填充颜色和线条颜色),有助于快速简便的完全更改
ggplot
2图形的外观。
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:59
添加p-value和显著性标记:ggsignif和ggpubr
在数据分析过程中,常常需要把组间的显著性添加到图形中,但是在
ggplot
2中实现起来略显麻烦,幸运的是,有很多R包可以帮助我们实现这一操作,比如ggsignif和ggpubr。
Hayley笔记
·
2022-06-30 09:05
ggplot
2 箱线图 分面顺序修改
分面顺序问题的解决有张图library('
ggplot
2')
ggplot
(data=Salaries,aes(x=rank,y=salary,fill=sex))+geom_boxplot()+facet_wrap
努力学习的消炎药
·
2022-06-29 11:56
R语言绘制带误差线的条形图
继续使用我们的汽车销售数据(公众号回复:汽车销售,可以获得该数据)来演示,先导入数据library(foreign)library(
ggplot
2)library(tidyverse)bc<-read.spss
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2022-06-27 11:45
R包ggtreeExtra绘制进化树
目录引言绘图示例1、下载安装ggtreeExtra包2、加载依赖包3、设置工作目录4、数据来源5、获取数据6、绘制树状图7、获取数据集绘制图a、绘制点图层b、绘制热图层c、绘制热图层d、绘制柱状图层引言
ggplot
2
·
2022-06-24 12:13
R语言
ggplot
2拼图包patchwork安装使用
目录引言安装例子高级特性引言patchwork是基于
ggplot
2的拼图包,因为
ggplot
2本身没有强大的拼图语法,而一般使用的gridExtra与cowplot的拼
ggplot
2图形都存在不少问题。
·
2022-06-24 12:09
R语言绘制维恩图ggvenn示例详解
现在有很多在线的网站都可以绘制,但是R来画也方便,其中ggvenn是基于
ggplot
2的专门绘制韦恩图的R包。
·
2022-06-24 10:23
ggplot
画误差线 条形图
geneexpression此表格为某个基因在两个样本即CM和HP三个生物重复的表达Mean和SE(SE为标准误差,可用来评估准确性或精确性,用来估计抽样误差),此表格在excel中保存为csv格式将数据导入R,用
ggplot
27生信学习
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2022-06-18 21:58
R语言
ggplot
2优雅的绘制环状云雨图
❝本节来介绍如何使用「
ggplot
2」绘制环状云雨图,下面通过一个小栗子来进行介绍❞安装R包并加载package.list=c("tidyverse","ggridges","extrafont","geomtextpath
Mrrunsen
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2022-06-15 18:03
R语言
r语言
开发语言
R语言利用
ggplot
2绘制QQ图和箱线图详解
目录绘制qq图函数介绍例子绘制boxplot函数介绍例子利用分位点绘制箱线图将QQ图和箱线图进行融合函数介绍参数介绍注意事项例子绘制qq图在
ggplot
2中绘制qq图需要两步,geom_qq()将绘制样本分位点
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2022-06-10 01:11
R
ggplot
2
文章目录1.
ggplot
2特点2.
ggplot
2基本概念3.
ggplot
2语法框架3.1共性映射与个性映射3.2几何对象与统计变换3.3aes与data参数4geom_xxx()几何对象4.1aestheticsspecifications
一株草的世界
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2022-06-08 19:58
R
R语言
ggplot
2条形图/柱状图geom_bar()
我们希望绘制一个横坐标为name,纵坐标为value的条形图library(
ggplot
2)
ggplot
(data=dat,aes(x=nam
Miao 2
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2022-06-08 19:57
R语言
统计学
R-ggplot
ggplot2
数据可视化
r语言
统计学
数据分析
UCLA-(R Graphics: Intro to
ggplot
2)笔记
目录原文请见RGraphics:Introductiontoggplot2(12)(ucla.edu)https://stats.oarc.ucla.edu/stat/data/intro_
ggplot
2
晨打水水水
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2022-06-08 19:57
r语言
r语言
开发语言
第五章,数据可视化-
ggplot
2
其中最具盛名的包就是HadlyWickham开发的
ggplot
2包。
维刚
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2022-06-08 19:26
【R语言】
修改
ggplot
2图形外观
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>>坐标轴控制坐标轴和刻度线外观的函数函数选项scale_x_continuous()和scale_y_continuous()breaks=指定刻度标记,labels=指定刻度标记标签,limits=控制要展示的值的范围scale_x_discrete()和scale_y_discrete()breaks=对因子的水平进行放置和排序,labels
weixin_34100227
·
2022-06-08 19:26
r语言
python
R数据可视化-
ggplot
2包
ggplot
2作图qplot函数:install.packages(“
ggplot
2”)library(
ggplot
2)#
ggplot
2自带的数据集diamondsdiamondsgetOption(“
华仔宝宝
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2022-06-08 19:24
R与数据分析
r语言
R语言
ggplot
2可视化:使用element_text函数设置轴标题文本为粗体字体(Bold Font,只设置X轴的标题文本使用粗体字体)
R语言
ggplot
2可视化:使用element_text函数设置轴标题文本为粗体字体(BoldFont,只设置X轴的标题文本使用粗体字体)目录
Data+Science+Insight
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2022-06-08 19:53
R语言从入门到机器学习
r语言
人工智能
机器学习
数据挖掘
自然语言处理
R语言实现漂亮的ROC图效果
目录1.读取数据2.AUC和CI的计算3.利用
ggplot
2绘图4.合并多个ROC曲线结果pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包,目前已被CRAN收录,因此安装也非常简单,同时该包也兼容
ggplot
2
·
2022-06-07 16:21
因子分析之
ggplot
2
R语言因子分析与
ggplot
2一、mvstats包与本文所用的数据1.mvstats包2.本文所用的数据二、检验是否适合做因子分析1.KMO检验巴特利特球形度检验2.相关系数检验3.相关系数热力图三、因子提取
阿强真
·
2022-06-04 07:29
r语言
开发语言
R语言
ggplot
2绘图
R语言绘图之
ggplot
2一.绘图的基本要素1.图形映射2.分面:3.添加平滑曲线二.绘制条形图设置坐标抽格式一.绘图的基本要素首先载入tidyverse包install.packages("tidyverse
阿强真
·
2022-06-04 07:59
r语言
数据分析
开发语言
41.Matplotlib风格
matplotlibinline#查看所有风格plt.style.available['bmh','classic','dark_background','fast','fivethirtyeight','
ggplot
鸿腾阳阳
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2022-05-29 10:35
Python常用数据科学库
matplotlib 可视化 —— 定制画布风格 Customizing plots with style sheets(plt.style)
Customizingplotswithstylesheets—Matplotlib1.5.1documentation1.使用和显示其他画布风格>>importmatplotlib.pyplotasplt>>plt.style.use('
ggplot
weixin_30412577
·
2022-05-29 09:17
matplotlib常用绘图风格
bmh','dark_background','fivethirtyeight','
ggplot
','grayscale','defa
于科技人文间徘徊
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2022-05-29 09:05
笔记
python
可视化
数据分析
关于python中
ggplot
包出现 ‘DataFrame‘ object has no attribute ‘sort‘问题的解决方法
关于python中
ggplot
包出现‘DataFrame’objecthasnoattribute'sort’问题的解决方法最近发现python中也有
ggplot
包与R语言上的
ggplot
2库中的函数大体上一样
孤数不证
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2022-05-25 02:31
绘图的基本元素(
ggplot
2实现)
一、为什么要进行数据可视化?1.相比于文字,将文字进行可视化可以让大脑能够同时处理更多的数据。例如,如果读到下面一段文字3rdStreetistothenorthof4thStreet.PeachAvenuerunsperpendicularto3rdand4thstreets.Onthesoutheastcornerof4thandPeachisacoffeeshop.Onthenorthwes
华大基因学院
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2022-05-23 18:59
R
GDP与人预期寿命的关系图----R
单位GDP与寿命的关系统计绘图library(
ggplot
2)library(gganimate)theme_set(theme_bw())library(gapminder)head(gapminder
a10534126
·
2022-05-23 18:25
面试
学习路线
阿里巴巴
java
java进阶
后端
利用
ggplot
2画发文章级别的TSNE图
直接上代码:1.安装程序包,读取数据package.list=c("
ggplot
2","pals","dplyr")for(packageinpackage.list){if(!
沉迷工作的我
·
2022-05-21 21:37
R语言绘制双坐标轴(5种方法全网最全)
本文分别使用base、plotly、
ggplot
2、lattice4个系统,5种方法绘制双坐标轴。
yuanzhoulvpi
·
2022-05-20 12:09
ggplot2
R
R
ggplot2
数据可视化
R语言使用gganimate创建可视化动图
目录使用
ggplot
2绘制1.transition_time()核心函数,添加动态2按需设置参考资料介绍一个主要用于绘制动画的
ggplot
2的扩展包---gganimate包。
·
2022-05-15 07:46
R语言可视化
ggplot
2绘制24小时动态血糖图
目录数据格式创建等距时间序列的方法(分钟)画图代码数据格式sample=read.csv("sample.csv",header=T,stringsAsFactors=F)head(sample)创建等距时间序列的方法(分钟)time=strptime("00:00:00","%H:%M:%S")+300*0:287#没有填日期的时候,默认日期为今天画图代码#time首先要转换成POSIXct格式
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2022-05-12 12:54
R语言绘制条形图及分布密度图代码总结
目录条形图普通条形图分组簇状条形图分布密度图条形图普通条形图
ggplot
(df,],aes(x=group,y=value))+geom_bar(stat="identity",width=0.57)#
·
2022-05-12 12:17
技巧 |
ggplot
2绘图如何添加多块矩形框标注
本篇就来介绍在
ggplot
2绘图系统中,如何方便地添加多块矩形框。「矩形函数」在
ggplot
2工具包中,一共有三个矩形函数:geom_rect()、geom_tile()、geom_raster()。
R语言学堂
·
2022-05-12 07:20
python
机器学习
javascript
matlab
数据可视化
R语言|ggtreeExtra包绘制进化树
R包-ggtreeExtra绘制进化树
ggplot
2提供的geom_tile图层可以画热图了,
ggplot
2的geom_point或者ggstar的geom_star可以绘制点图层。
作图帮
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2022-05-12 07:37
r语言
开发语言
【转】Python 可视化神器-Plotly Express
受Seaborn和
ggplot
2的启发,它专门设计为具有简洁,一致且易于学习的API:只需一次导入,你就可以在一个函数调用中
weixin_34269583
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2022-05-07 12:58
python
GDP与人预期寿命的关系图----R
单位GDP与寿命的关系统计绘图library(
ggplot
2)library(gganimate)theme_set(theme_bw())library(gapminder)head(gapminder
小宇2022
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2022-05-07 12:23
数据可视化
可视化
r语言可视化
r语言
开发语言
python matplotlib绘制折线图
前言众所周知,matplotlib是一款功能强大开源的数据可视化模块,凭借着强大的扩展性构建出更高级别的绘图工具接口如seaborn、
ggplot
。
编程简单学
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2022-05-06 11:56
程序员
python
python
开发语言
后端
数据分析
ggplot
绘制小提琴图+箱线图+统计检验
文章参考:
ggplot
绘制小提琴图+箱线图+统计检验R语言50绘图|第七期boxplot()展示多个基因在两组间的差异同一数据多变量分组的boxplot?
泥人吴
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2022-04-28 07:35
R Venn.diagram设置背景透明
我们都知道,在一般的
ggplot
2绘图中我们可以设置bg=“transparent”来使图片背景透明,但是venndiagram中却不能实现。对,没法设置背景透明。
11的雾
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2022-04-27 08:24
R语言输出可编辑的图片
在
ggplot
2程序包的加持下,R语言可以做出非常漂亮的统计图出来。然而大家是否会有这样的体会,为了做出理想的图片,需要不停的调整作图的参数,包括颜色,字体大小,字体格式,注释的位置,非常麻烦。
小蜜蜂Stats
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2022-04-26 20:51
相关性分析 addmodulescore得到的每个细胞评分与page_enrichments得到的每个细胞评分的相关性
addmodule_ns7d_dataframe与PAGE_enrichments相关性addmodulescore得到的每个细胞评分与page_enrichments得到的每个细胞评分的相关性library(patchwork)library(
ggplot
2
qq_52813185
·
2022-04-25 07:32
笔记
r语言
seurat
python图标编程_六种Python的数据可视化包和工具比较 - 全文
本文概述并比较Python数据可视化包和工具,包括Pandas,Seaborn,
ggplot
,Bokeh,pygal,和Plotly。
weixin_39557419
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2022-04-22 07:23
python图标编程
python数据可视化是什么_六种Python的数据可视化包和工具比较
本文概述并比较Python数据可视化包和工具,包括Pandas,Seaborn,
ggplot
,Bokeh,pygal,和Plotly。
weixin_39522423
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2022-04-22 07:23
python数据可视化是什么
玩转数据可视化之R语言
ggplot
2:(八)
ggplot
2绘制空间地理数据图
玩转数据可视化之R语言
ggplot
2个人主页:JoJo的数据分析历险记个人介绍:小编大四统计在读,目前保研到统计学top3高校继续攻读统计研究生如果文章对你有帮助,欢迎关注、点赞、收藏、订阅专栏本系列主要介绍
JoJo的数据分析历险记
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2022-04-20 07:24
R语言:ggplot画图
R语言
数据可视化
ggplot2
空间地理数据
地图绘制
跟着 Cell 学作图 | 火山图进阶版
DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.02.027之前复现过火山图:跟着CELL学作图|1.火山图答疑|
ggplot
绘制火山图并添加文字标签跟着Cell学作图|
木舟笔记
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2022-04-17 10:23
ggplot2
可视化
数据可视化
webgl
go
time ROC代码
一、绘制符合
ggplot
2风格的图片,可以加theme1、先定义一个函数,生成timeROC对象,注意数据集和相应列名需要修改library(survivalROC)##DefineahelperfunctiontoevaluateatvarioustsurvivalROC_helper
郭师傅
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2022-04-16 21:36
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