ggplot 第11页

【ggplot2】不同方法画half -小提琴图

参考：split-violin-plot-with-ggplot2gghalves效果图：每一个分组画出一半小提琴图,放一起。

caokai001·2023-08-21 00:23

复现《nature communications》散点小提琴图+蜜蜂图

今天我们学做一下NC文章的小提琴图，有小提琴图，也有散点，其实看过之前系列文章的人如果能够联想，可以想到这个图是（ggplot分组散点图-坐标轴截断-添加四分位图-显著性检验）和（ggplot批量绘制小提琴图并添加趋势连线

KS科研分享与服务·2023-08-20 16:25

如何快速学会用R语言做出漂亮的ROC图

pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包，目前已被CRAN收录，因此安装也非常简单，同时该包也兼容ggplot2函数绘图，本次就教大家怎么用pROC来快速画出ROC图。

沉迷工作的我·2023-08-19 12:54

Python有哪些优质的可视化工具

目录1.Matplotlib2.Seaborn3.Plotly4.Bokeh5.PlotlyExpress6.ggplot7.Altair8.Wordcloud9.D3.js(Data-DrivenDocuments

傻啦嘿哟·2023-08-18 16:09

六一双倍的快乐：ggplot2绘制双y轴图

双y轴图的目的，是想要在同一坐标系中画两组数据，但是他们值范围差很多，比如一组数据是1-10，另一组是10-100，那么可以对第一组数据做数据变化，比如第一组数据乘以10，然后在对应的y轴上写上1-10，虽然第一组的数据已经变成了10-100。这种数据变换叫做归一化(Normalization，又称Min-MaxScaling)把数值型某一特征缩放到最大值和最小值在某个范围，在sklearn中使用

·2023-08-18 00:52

R绘图—Ternary的绘制(三元图)

1.直观展示基因表达在三组的表达偏向性首先清除环境，安装并加载所需要的R包rm(list=ls())#清除环境内存install.packages("ggplot2")install.packages(

Clariom·2023-08-17 23:08

用ggplot2绘制多维折线图

故又重新搬出了ggplot2，将用到的一些方法与走的弯路做一下总结。我们将用R自带iris数据集进行图形的绘制。自定义颜色一般公司中，对于ppt的制作都有固定的模版，且对图表的颜色也做了相应的约定。

dogyii·2023-08-16 18:31

ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247486262&idx=1&sn=d38221a4063d866b1f10f4c9ebab5f88&chksm=ec0dcebcdb7a47aa03ff27872048304d33be27d1ab8bd3af0aefc320366a4bd3aceb943cb384&mpshare=1&s

土豆学生信·2023-08-16 16:16

R语言实现免疫浸润分析（2）

原始数据承接免疫浸润分析（1），下面展示免疫浸润结果：#直接使用IOBR包内的cell_bar_plotpic%ggplot(aes(ID,fraction))+theme_void()+geom_bar

weixin_49320263·2023-08-16 06:23

拼图神器-customLayout，一个R包解决

customLayout特点它可以用来完成自由拼图，可以使用矩阵自定义图形位置和顺序，用数字来定义每一个模块的长宽比这个包不仅支持数字拼图，还支持R内置的base绘图对象、grid绘图对象等（也就是支持ggplot2

Dayueban·2023-08-15 23:22

MJades·2023-08-15 15:17

ggplot2优雅的绘制饼状热图

欢迎关注R语言数据分析指南最近看到一张非常有意思的图，暂且称之为饼状热图,与corrplot所绘制的有所不同此图使用的为离散型变量，例图如下所展示；由于作者未提供原始数据，小编自己构建了一份数据来进行初步的展示论文内容Systematicprofilingofthechickengutmicrobiomerevealsdietarysupplementationwithantibioticsalt

R语言数据分析指南·2023-08-15 09:17

使用ggplot2绘制热图（1）

#使用ggplot2绘制热图library(ggplot2)#清空rm(list=ls())gc()#创建数据集data%as.data.frame()%>%mutate(group=c(rep("S1

weixin_49320263·2023-08-15 08:46

R_DATACAMP10 Cluster Analysis in R分类分析

Calculatingdistancebetweenobservations计算两点间距离lims(x=c(-30,30),y=c(-20,20))应用于ggplot中，可以设置图标坐标轴的范围dist

一条很闲的咸鱼·2023-08-14 14:54

R数据科学--使用ggplot2进行数据可视化1

library(tidyverse)基础作图ggplot(data=mpg)+geom_point(mapping=aes(x=displ,y=hwy))分别设好xy轴及数据集即可image.png加颜色

Seurat_·2023-08-14 08:25

跟着Nature Biotechnology学作图:R语言pca分析并使用ggplot2可视化结果

论文Removingunwantedvariationfromlarge-scaleRNAsequencingdatawithPRPShttps://www.nature.com/articles/s41587-022-01440-w#data-availability数据链接https://zenodo.org/record/6459560#.Y2D2NHZBzidhttps://zenodo.

小明的数据分析笔记本·2023-08-14 05:05

ggplot2优雅的自定义轴文本颜色

今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象的前提下在图形的原有的基础上自定义修改轴文本颜色，也许恰好您正好有此特殊需求，希望对各位观众老爷有所帮助；下面来看具体案例；加载R包library(tidyverse)数据清洗data1%head(6)%>%mutate_if(is.numeric,function(x)x+10)%>%log10()%>%as.data.frame()%>%rownames_

R语言数据分析指南·2023-08-13 17:10

ggplot学习笔记（五）

我们编程找出寿命增长不稳定的国家。这部分内容与作图关系不大，可以跳过。对每个国家做线性回归，以期望寿命为因变量，以年份为自变量，找出残差方差很大的，以及直线斜率为负的国家。library(tidyverse)extract_lmr%select(country,year,lifeExp)%>%group_by(country)%>%nest(data=c(year,lifeExp))%>%muta

财富经略·2023-08-13 14:06

正则表达式（stringr包）

HadleyWickham通过开发ggplot2包让人们意识到原来R语言绘图可以这么简单美观，这可是为R语言争取了不少用户，因为觉得在数据处理不够便捷，大神

范垂钦_92be·2023-08-13 12:54

R 数据可视化 —— ggforce（注释和分面）

例如，我们想展示不同种类的鸢尾花在花瓣长度和宽度上的区别，使用ggplot2，我们常用的绘制方式是ppn_pages(p)[1]54.2内容缩放ggplot2的缩放包括：坐标系统的缩放和位置的缩放，而ggforce

名本无名·2023-08-13 02:44

R绘制玫瑰图，我有玫瑰，你要代码么？

更新什么的，都是浮云先直接上图其实就是x轴极化的柱状图，bar长和颜色也是连续变量，labelcolor表示基因类型是离散变量上数据：上代码：ggplot(genes_55_auc)+geom_bar(

生信杂谈·2023-08-12 18:24

基于R做宏基因组结果的PCoA分析

决定从中重新挑选部分样本进行再分析步骤表格结果预处理在属水平genus参考原本结果已有的PCA图，尽可能挑选距离较远且聚团的样本选取不同样本属水平的丰度数据，整理成逗号分隔的csv文件代码演示library(vegan)#计算bray距离library(ggplot2

twocanis·2023-08-12 15:06

R语言ggplot2 | R语言绘制物种组成面积图（三）

文章目录面积图简介准备数据集加载数据集数据处理数据可视化利用R语言绘制物种组成图。本文以堆叠面积图的方式与大家分享。面积图简介面积图又叫区域图。它是在折线图的基础之上形成的,它将折线图中折线与自变量坐标轴之间的区域使用颜色或者纹理填充，这样一个填充区域我们叫面积。颜色的填充可以更好地突出趋势信息（比如时间上的差异，分类上的差异），需要注意的是颜色要带有一定的透明度，透明度可以很好地帮助使用者观

酷在前行·2023-08-11 22:26

EDA-3

2、library(modelr)mod%add_residuals(mod)%>%mutate(resid=exp(resid))ggplot(data=diamonds3)+geom_point(mapping

Lemon_93d5·2023-08-11 17:17

R语言之探索性数据分析1

首先得把dplyr和ggplot2知识综合起来如果没有安装tidyverse这个包的话，会出现错误提示library(tidyverse)Errorinlibrary(tidyverse):不存在叫‘tidyverse

分享之家·2023-08-11 03:46

ggplot2气泡图的又一个小例子

还有一个要求是能否突出p值=0.05")ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC,size=pvalue,color=Class,shape=group))+geom_point(alpha

小明的数据分析笔记本·2023-08-10 18:39

跟着Nature Microbiology学作图：R语言ggplot2用单列数据做柱形图

ProtectiveroleoftheArabidopsisleafmicrobiotaagainstabacterialpathogenimage.png这篇论文中的数据是公开的，争取把论文中的图都复现一下，今天的推文复现Figure3a和b,这两个类型一样，都是柱形图image.png这里涉及到一个小知识点是：ggplot2

小明的数据分析笔记本·2023-08-09 23:27

第19章使用ggplot2进行高级绘图

注：R语言的再复习之路1.ggplot2包介绍##拟合平滑曲线ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg))+geom_point(pch=17,color='blue',size

Drakens_Africa·2023-08-09 09:03

【R语言南丁格尔玫瑰图绘制】

library(ggplot2)library(RColor

寻小宁·2023-08-09 05:01

数据可视化_科学统计图表5——ggplot绘制南丁格尔玫瑰图

19世纪50年代，英国、法国、土耳其和俄国进行了克里米亚战争，英国的战地战士死亡率高达42%。弗罗伦斯·南丁格尔主动申请，自愿担任战地护士。她率领38名护士抵达前线，在战地医院服务。当时的野战医院卫生条件极差，各种资源极度匮乏，她竭尽全力排除各种困难，为伤员解决必须的生活用品和食品，对他们进行认真的护理。仅仅半年左右的时间伤病员的死亡率就下降到2.2%。每个夜晚，她都手执风灯巡视，伤病员们亲切地称

LKKKKKKKKKKT·2023-08-09 05:00

ggplot2包可视化——绘制条形图

参考文献：张杰.R语言数据可视化之美：专业图表绘制指南：增强版—北京：电子工业出版社，2019Winstonchang.R数据可视化手册—北京：人民邮电出版社，2014在R语言中，ggplot2包的绘图以精美

zarzzzz1·2023-08-09 05:59

ggplot2如何画error bar charts

参考：1.http://www.cookbook-r.com/Graphs/Plotting_means_and_error_bars_(ggplot2)/2.https://www.zhihu.com

RachaelRiggs·2023-08-08 19:05

复现Cell图表：双侧柱状图展示上下调GO富集结果

Cell》图表：柱状图|添加分组注释|legend设置2、复现《Cell》图表：双侧柱状图及坐标轴设置|ComplexHeatmap图例设置3、复现《Cell》图表：多形状气泡图4、复现《Cell》图表：ggplot

KS科研分享与服务·2023-08-08 09:54

跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2散点组合误差线展示响应比（Response ratio）

论文Meta-analysisoftheimpactsofglobalchangefactorsonsoilmicrobialdiversityandfunctionalityhttps://www.nature.com/articles/s41467-020-16881-7#Sec15论文里提供了数据和代码，很好的学习素材这篇论文是公众号的一位读者留言，说这篇论文提供了数据和代码，但是代码比较长

小明的数据分析笔记本·2023-08-07 14:31

ggpolt2绘制7种不同的柱形图简单又实用

ggplot2是R语言中常用的包，它具有强大的绘图功能，在生物学数据可视化过程中，有很多图都是用ggplot2绘制出来的。

蜗牛数据分析·2023-08-07 02:31

利用ggplot2绘制SCI样式的UMAP图

这次借助ggplot2进行可视化，对于Seurat出来的umap/tsne后期的微调。

Zee_李海海·2023-08-07 01:18

chatgpt赋能python：Python如何在一张图上画多条折线

在数据可视化方面，Python有一些很好的库，如matplotlib、Seaborn和ggplot等。

turensu·2023-08-06 19:45

通过BiocManager下载安装ggplot2和DESeq2

R语言之书：“每年大约有四个新版本的R，用于解决函数、兼容性问题和错误修复。最好保持最新版本。”首先将R与RStudio更新至最新版本（2020.6.4我R用的4.0.0，RStudio1.3.959）。输入旧命令：source("https://bioconductor.org/biocLite.R")，结果显示：bioconductor现在已经更新成BiocManager按照提示去网站搜索ht

彭喆倫Arlen·2023-08-05 06:21

ggplot2高级:使用ggproto构建自己的图层(四)

创建你自己的主题如果你需要创建自己的完整主题，有以下几个件事情你需要知道重写已有的元素，而不是修改他们有四个全局性元素影响几乎所有其他主题元素完整和不完整元素的比较重写元素默认情况下，当你新增一个主题元素，它会从一个已有主题中继承参数值。例如，如下的代码设置key颜色是红色，但它继承了已有的fill颜色。theme_grey()$legend.key#>Listof5#>$fill:chr"gre

xuzhougeng·2023-08-05 06:20

GO分类条形图

R绘图脚本rm(list=ls())library(ggplot2)windowsFonts(myFont=windowsFont("TimesNewRoman"))setwd("D:\\data\\kegg_go_class

清水咸鱼·2023-08-05 02:29

R 语言 | 用ggplot2画2个分类变量的计数柱状图

1.基本柱状图对于计数数据+2个分类变量，画柱状图。难点：怎么控制组内的柱子间宽？模拟数据:x轴是汽化器的个数，颜色分类是自动挡/手动挡，y轴是该分类的汽车型号计数。#准备数据:df1=table(mtcars$carb,mtcars$am);df1df2=as.data.frame(df1);df2colnames(df2)=c("carb","am","count")df2#library(g

biomooc·2023-08-04 02:23

ggplot2：气泡图及散点图小结

气泡图也属于散点图的一种，在散点图的基础上改变点的形状，大小和颜色1.如何改变点的形状用自带的mtcars演示p=ggplot(mtcars,aes(wt,mpg))p+geom_point(shape

村狗儿·2023-08-04 00:08

计算ChIP-seq的CPM值

得到然后R开始#loadpackages------library(ChIPseeker)library(org.Mm.eg.db)library(gggenes)library(ggplot2)library

pudding815·2023-08-03 22:36

ggplot学习笔记（六）

前面所有国家的图包含了过多的曲线，使得图形表现得很拥挤。可以将一个作图区域拆分成若干个小块，称为小图（facet），按照某一个或两个分类变量的不同值将数据分为若干个子集，每个数据子集分别在小图上作图。对于上面的例子，可以将每个大洲的图形分别放置在一个小图上。小图不是一种变量映射，而是一种图形摆放方法，所以不设置在aes()函数内，而是用facet_wrap()函数规定。这种功能与group映射的功

财富经略·2023-08-03 19:31

小有所成题目一答案：nature高水平组组合图形绘制

高手题目二小有所成题目二点击此处查看题目详细内容小有所成一答案这位朋友使用的策略是拼图library(reshape)library(ggplot2)library(cowplot)构造数据#数据x1]

wentaomicro·2023-08-03 01:27

KEGG Pathway通路结果绘制气泡图

参考CSDN博客ntuYision：使用R语言ggplot2包绘制pathway富集分析气泡图（Bubble图）:数据结构及代码getwd()setwd("D:/Desktop/")#查看和修改工作目录

小灰灰want_to_fly·2023-08-02 23:42

R-ggplot2-如何将点图与密度统计图通过双坐标轴的方式结合在一起？本篇给出解决方案~

目录0.问题导入1.示例数据2.导入示例数据3.离散类型连续化4.绘图数据框构建5.将密度图与点图叠加（图2）6.总结7.本文所使用的R-packages（没有的小伙伴需要使用install.packages()进行安装）8.致谢0.问题导入科研过程中，我们可能会遇到想把样本点放到总体的概率统计图上，同时体现样本点的类型，类似于下面两图的叠加（图1）。但这样会面临如下两个问题：1.如何绘制双坐标轴

TroyShen·2023-08-02 09:08

R语言 Mutate家族

包中含有各种数据整理以及画图的包，如下加载tidyverse包：>library(tidyverse)--Attachingpackages------------------------tidyverse1.3.0--√ggplot23.3.3

日月其除·2023-08-02 07:48

【有一才有二】scRNA-Seq数据分析第一步：数据载入方式的汇总

MyOneDriveCloud/OneDrive/GSE156329_RAW")rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)library(Seurat)library(ggplot2

研平方·2023-08-01 14:47

绘制双坐标图

library(ggplot2)library(scales)library(magrittr)library(tidyr)fst_s_d=read.table("LRP1B_fst_s_d_extend1000kb.txt

宗肃書·2023-08-01 08:44

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