ggplot 第12页

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画箱线图(boxplot)展示D statistic

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png这篇论文的数据是公开的，代码也公开了一部分，那我们就可以按照他的提供的数据来试着复原一些论文中的图了。本来已经重复到了论文中Fig1的2c，但是试着做局部放大的时候遇

小明的数据分析笔记本·2023-07-30 15:54

ggplot2回顾(9): 分面

1.若干问题1.1分面和拼图的适用范围分面：数据在一张表格上，存在若干个分类变量可以给数据分组，这时可以使用分面；拼图：已经产生了多个图（对象），需要拼在一起1.2facet_grid()和facet_wrap()的差异facet_grid()本质是二维;facet_wrap()本质是一维1.3分面标签如何调整角度1.4并列与分面的比较分面的一个优势是通过scales,space可以控制构图，见图

TOP生物信息·2023-07-29 15:10

队列数据分析积累-1

library(bkmr)library(ggplot2)#给数据赋值，如果要自己进行研究，数据的地址以及数据的变量需要对应的自行选择替换，data1是导入数据，covar是定义协变量，expose是定义暴露

橙子榴莲巧克力·2023-07-29 12:33

R数据科学第五章——蜂

R数据科学第五章library(tidyverse)变量的分布进行可视化ggplot(data=diamonds)+geom_bar(mapping=aes(x=cut))图片.png观测值可以使用dplyr

寂静之巅·2023-07-29 07:44

R语言ggalluvia包优雅的绘制桑基图

先导入数据和R包library(foreign)library(ggplot2)library(ggalluvial)librar

天桥下的卖艺者·2023-07-29 03:13

R语言ggplot2画棒棒糖图展示中国十大姓氏的数量

发现了一个很有意思的R语言包ChineseNames，对应的github主页是https://github.com/psychbruce/ChineseNamesimage.png自己的理解是这个包里统计了12亿汉族人的姓名信息，其中姓是1806个，名字是2614个，今天推文的内容来简单探索一下姓的信息，主要包括最多的人的姓是啥最少的姓是啥复姓都有啥首先是安装这个包install.packages

小明的数据分析笔记本·2023-07-29 03:25

ggplot杂记

Ref:ggplot2-book使用theme_classic()使ggplot的图变成r-base的样子使用plotmth在图片中显示数学公式，seethissites.

单嘉伟xx·2023-07-28 12:59

2022-04-16:一天就搞了一个这

library(readr)library(ggtree)library(treeio)library(DESeq2)library(ggplot2)library(stringr)library(tidyverse

小明的数据分析笔记本·2023-07-28 06:50

R语言绘制饼图及三维饼图

之前需要绘制饼图，但是R语言自带函数绘制饼图不好，终于找到通过ggplot来绘制饼图了。链接https://mp.weixin.qq.com/s/zsVO8cAHGRy2dh3s9nkfgQ

R语言与医学生·2023-07-27 22:47

（转帖）R语言-ggplot2-星巴克门店分布图

原文地址：https://mp.weixin.qq.com/s/ifVrdv_yF6dQ4kQ3qha0Hwlibrary("rvest")library("dplyr")library("ggplot2

苏慕晨枫·2023-07-27 19:06

0923 chapter 5

确定异常值的原因)p70练习题1.首先把x，y，z换个名字mutate(id=row_number())%>%+select(x,y,z,id)%>%+gather(variable,value,-id)%>%+ggplot

森尼啊·2023-07-27 17:02

geom_bar()之报错

但当绘制双变量时，直接添加变量则会出现如下报错：rm(list=ls())data("iris")library(ggplot2)base<-ggplot(iris,aes(iris$Species,iris

啊吧啊吧鸭·2023-07-27 14:53

复现《nature communications》图表（三）：画样本时间轴图（堆叠柱状图）

画图还是用ggplot2。由于文章中没有提供具体数据，所以我自己虚

KS科研分享与服务·2023-07-27 08:03

ggplot2绘制散点图进阶（一）

简单散点图上篇文章R语言与散点图介绍了如何用ggplot2包中的geom_point()函数绘制简单的散点图。

生信分析实验室·2023-07-27 04:22

BGI-College生信入门——9、R语言基础（二）

ggplot2ElegantGraphicsforDataAnalysis，用于数据分析的精美图形ggplot2是一个用于数据统计和绘图的R包与其它绘图包不同，ggplot2有自己的基础语法ggplot2

华大基因学院·2023-07-26 23:25

1. R语言运行效率分析_小结（6）

library(tidyverse)library(scales)ggplot(data[which(data$fun!

灭绝老衲·2023-07-25 09:10

跟着Nature Microbiology学作图：R语言ggplot2做散点图添加拟合曲线和p值

本地文件s41564-021-00997-7.pdf论文ProtectiveroleoftheArabidopsisleafmicrobiotaagainstabacterialpathogenimage.png今天的推文来重复一下论文中的figure3c散点图添加拟合曲线image.png读取数据集library(readxl)df<-read_excel("41564_2021_997_MOE

小明的数据分析笔记本·2023-07-25 03:38

3 Data visualisation (II)

3.6Geometricobjectsggplot(data=mpg)+geom_point(mapping=aes(x=displ,y=hwy))ggplot(data=mpg)+geom_smooth

德先森的书·2023-07-24 16:32

【生信技能树】R语言高级练习题

安装一些R包数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包：ggplot2了解ExpressionSet

函数IsLazy·2023-07-24 16:18

学习小组Day4笔记--尤书书

Day4-R语言基础.pngR数据科学--详解ggplot2RforDataScience1.安装R和RstudioRstudio相当于R语言的一个人性化/图形的界面果子学生信给自己一个全新的R语言环境之前有装过

SHore_1913·2023-07-24 02:23

R 数据处理（三）

tidyverse中所有的包具有同样的设计理念、语法以及数据结构主要包含如下R包：包名描述ggplot2鼎鼎大名的画图包，不用过多介绍dplyr提供了一组便利的数据操作语法tidyr数据的整洁之道readr

名本无名·2023-07-23 08:34

RNA-seq学习：No.12 EnhancedVolcano绘制美观火山图

EnhancedVolcano包可根据差异分析结果，基于ggplot2绘图结构，方便地绘制美观的火山图，下面根据自己的理解小结下基本用法。

小贝学生信·2023-07-23 03:33

ggplot2笔记

ggplot之六层参数基本格式：ggplot(Data数据集,Aesthetics坐标+Geometries图形+Facets分组+Statistics+ggplot之六层参数Aesthetics基本格式

姚宝淇·2023-07-22 15:47

Python使用Matplotlib库绘制双y轴图形（柱状图+折线图）

Matplotlib介绍Matplotlib是Python数据分析中常用的可视化工具，也是其他高级绘图接口（如seaborn,HoloViews,ggplot等

XIAOWANGaxs·2023-07-22 10:04

python双y轴的折线图_Matplotlib双Y轴折线图小实例

简单注释fig,ax1=plt.subplots(figsize=(12,9))创建画布，有点类似于ggplot2的ggplot()函数的作用；figsize参数用来控制图片长和宽，但是单位是啥还没搞明白

weixin_39670857·2023-07-22 10:04

【R语言基础六：有关R的其他知识】

下升级R#查看当前R版本version#升级Rinstall.packages("installr")library(installr)updateR()升级R要在R内核中而不是RStudio中进行2.ggplot2

lkj666·2023-07-22 08:04

2019-04-22

rm(list=ls())require("ggplot2")require("reshape")library(wesanderson)require("plyr")setwd("~/Documents

Larrylu007·2023-07-22 05:51

ggplot2 画图 X 轴排序问题

实际使用ggplot2画柱状体时，遇到x轴排序问题。本文描述问题及其解决过程。

梦想画家·2023-07-21 22:27

PlotEnrichDotPlot ggplot2画图拆解

#returnheatcolorsofgivenlengthGetMyHeatCols50){ht.col25){results<-results[1:25,]my.cols<-my.cols[1:25]}df<-data.frame(Name=factor(row.names(results),levels=rev(row.names(results))),rawp=results[,4],lo

Young.Dr·2023-07-21 22:54

4.数据可视化（一）

—JohnTukey通过本节你将学会如何使用ggplot2可视化数据。R有多种用于生成图的系统，但ggplot2是最高效和最通用的系统之一。

denghb001·2023-07-21 09:02

R 数据可视化 —— gtable 介绍

当我们需要展示的数据，包含相同的X轴，但是具有两个不同的Y轴变量时，我们会选择在右侧添加一条轴，在ggplot2中，可以使用sec_axis来设置。那如果Y轴变量有多个呢？我们该如何绘制？

名本无名·2023-07-21 04:15

个性化调整GSEAplot

这两个函数中可以调整的参数较少，因此我们希望把图导出为ggplot对象，然后用ggplot2包重新对其进行调整。

一只烟酒僧·2023-07-21 01:37

跟着Nature学作图：R语言ggplot2箱线图、小提琴图、抖动散点图

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的

小明的数据分析笔记本·2023-07-20 13:05

探索 ggplot2 的其它图层

ggplot2包自带了很多图层，基本可以满足我们的各种绘图需要，但是有时候我们需要绘制一些“古怪”的图，就需要使用一些ggplot2的拓展包了，本文将介绍一些好用的ggplot2拓展包。

c7a1c4db132c·2023-07-20 03:27

基于R的ggplot2使用指南整理（一）——柱状图画法（含代码）

可视化第一期：在R平台使用ggplot2欢迎查询ggplot2使用指南什么是ggplot2？

pi-pickles·2023-07-19 14:38

基于R的ggplot2使用指南整理（二）——分组求和折线图画法（含代码）

可视化第二期：在R平台使用ggplot2欢迎来到ggplot2第二期使用指南折线图简单介绍数据集实例总结欢迎来到ggplot2第二期使用指南不好意思让大家久等了！

pi-pickles·2023-07-19 14:38

R语言ggplot2移除图例_读书笔记:R语言绘图—ggplot2

这次给大家带来的是R语言绘图神器—ggplot2绘图包，根据Hadley的说法，这个包的核心思想，是来源于LelandWilkinson《TheGrammarofGraphics》。

weixin_39548776·2023-07-19 14:07

如何用R语言中ggplot包在同一张图上画两组折线图，或者散点图

原始数据：以position为横坐标，对一组和二组分别做折线代码如下library('ggplot2')getwd()workdir="C:/Users/lyqro/Desktop"file="C:/Users

Sarah945·2023-07-19 14:07

R语言使用ggplot2包绘图

使用ggplot2包绘图设置绘图显示中文showtext_auto()查看并设置字体windowsFonts()设置标题添加公式expression()绘图添加文本geom_text();annotate

小琳子要开心呀·2023-07-19 14:37

R语言ggplot2——散点图

BMI=read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/33lesson33ggplot2散点图（一）/33_ggplot2/BMI.txt',sep='\t',header

帅锅不识字·2023-07-19 14:07

R语言ggplot2——柱形图

BMI=read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/33lesson33ggplot2散点图（一）/33_ggplot2/BMI.txt',header=T,row.names

帅锅不识字·2023-07-19 14:07

使用R语言绘制折线图

R语言绘制折线图一、绘制折线图1.载入bruceR（ggplot2）2.设置当前工作目录3.载入数据集4.查看数据结构5.绘制基础图形6.图形优化二、绘制多重折线图1.载入数据2.绘制图形一、绘制折线图

安念、·2023-07-19 14:36

R关于ggplot2简单修改坐标轴——修改标签及范围

修饰坐标轴关于如何对坐标轴进行简单修改，如修改坐标轴便签及其范围。坐标轴标签xlab()和ylab()可以分别用以设置x轴和y轴标签，直接在加号后面添加即可。如果要省略坐标轴标签的话，可以使用xlab(NULL)和ylab(NULL)来实现。坐标轴范围xlim()和ylim()可以设置坐标轴的显示区间，主要注意里面范围的设置使用的是逗号。此处运用扰乱点图时还添加了宽度来限制噪音点的分布。ggplo

别动我啊，我要膨胀了啊·2023-07-19 14:06

R语言基础图形绘制——折线图

折线图简介1.基础函数2.ggplot()函数3.实践参考书籍简介折线图通常用来对两个连续变量之间的相互依存关系进行可视化。x轴可以是连续型变量，也可以是离散型变量。

生信小菜鸟啊·2023-07-19 14:05

R语言ggplot-Slope chart(坡度图)绘制考试排名变化

R语言ggplot-Slopechart(坡度图)绘制考试排名变化注意：一些图像细节需要导出矢量图在其他软件中进一步调整，小编这里使用的是RStudio+福昕PDF编辑器。

RedJACK~·2023-07-19 14:35

R语言绘制ggplot2双色XY-面积图组合交叉折线图可视化

让我们尝试用ggplot2绘制这个图.首先，加载ggplot2并生成要在示例中使用的数据框（我使用的是稍微修改过的数据集，因此最终结果会与原始图有所不同）。

拓端研究室·2023-07-19 14:05

ggplot2——双坐标轴？

来源|R友舍对于研究过ggplot2的人而言，一个很奇怪的问题就是，为什么ggplot2做双坐标轴那么难？（解决方案可以参见StackOverflow的这个问题。）

R语言中文社区·2023-07-19 14:34

ggplot2包可视化——折线图

而在ggplot2中，我们可

zarzzzz1·2023-07-19 14:34

R语言ggplot2——折线图

BMI<-read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/33lesson33ggplot2散点图（一）/33_ggplot2/BMI.txt',header=T,

帅锅不识字·2023-07-19 14:02

跟着Molecular Systems Biology学作图：R语言ggplot2多图拼接工具patchwork

论文Agenome-scaleTF-DNAinteractionnetworkoftranscriptionalregulationofArabidopsisprimaryandspecializedmetabolismhttps://www.embopress.org/doi/full/10.15252/msb.202110625image.png论文中提供了figure1中4个柱形图的数据和代

小明的数据分析笔记本·2023-07-19 01:15

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