CHIP

ChIP-Seq数据挖掘系列-4: liftOver - 基因组坐标在不同基因组注释版本间转换

UCSCGenomeBrowserliftover是UCSC提供的一个用于不同基因组注释版本间基因组坐标转换的工具。UCSC提供了一个web版本；数据过多时用起来很不方便，也可以下载程序到本地进行批量操作。应用：已经发表的chipseqpeak结果可能基于不同基因组版本，这样就不好直接比较某些peak之间的关系了，重新分析一次数据需要时间成本；因此，使用liftover将peak位置信息转换到同一
_eason_·2020-06-24 00:28

内存相关知识

chip：一个内存颗粒就是一个chiprank：rank是跟内存位宽有位的。一个soc的内存位宽是32bit，一个chip是8bit的，那么需要4片内存颗粒才能凑
ivychend·2020-06-23 20:26

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月31日

用心陪伴每一天1音频0b轮播，汉语第一册上轮播2动画0bturtleandsnail,jonnyjohnny,seesaw3儿歌与游戏儿歌大联唱M:Baby,let'ssingasongonebyone.Letmesingfirst.Kangeroo,kangeroo,hop,hop,hop.It'syourturnnow.C:OK.Dinosaur,dinosuar,waveyourtail,d
水中的珊瑚雨·2020-06-23 18:36

图像插值算法及其实现

sensor、codec、displaydevice都是基于pixel的，高分辨率图像能呈现更多的detail，由于sensor制造和chip的限制，我们需要用到图像插值（scaler/resize）技术
lemonHe_·2020-06-23 13:22

【张勇】ChIP-seq 讲习班

pan.baidu.com/s/1skJAaAx，密码：ga2l视频链接：https://mp.weixin.qq.com/s/JLPQbgQKUpa4ONNhzURQxwimage.png第一部分：ChIP-seq
caokai001·2020-06-23 11:01

今日芯声 | 芯片界 “摇滚明星”Jim Keller 离职英特尔，Chip God 到底在想啥？

“今日芯声”是读芯术推出的一档简读栏目，汇聚每日国内外最新最热的AI应用资讯，敬请关注。1、芯片界“摇滚明星”JimKeller离职英特尔，ChipGod到底在想啥？近日英特尔宣布，顶级芯片设计师JimKeller因为个人原因辞职，辞呈立即生效。但在接下里的六个月里，Keller将继续担任公司顾问，协助交接工作。正如MoorInsights&Strategy的分析师PatrickMoorhead在
读芯术·2020-06-23 05:58

ChIP-seq数据分析实战1

最近开始上手ChIP-seq数据分析，按照“刘小泽”的流程，目前已拿到比对后的bam文件并进行了比对信息的统计，豆豆的流程非常赞，运行下来木有问题！
chenxiaoxi·2020-06-22 19:30

第10篇：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析

从RNA-Seq层面，我们可以探究哪些基因具有显著差异，上调或下调；从ChIP-Seq层面，我们可以研究某个特定转录因子的调控作用；从ATAC-Seq我们可以了解到染色质可及性的动态变化，由于染色质的可及性与调控元件或转录因子的结合密切相关
六六_ryx·2020-06-22 05:17

APxxx系列wifi驱动芯片移植笔记

/**Dave/2017-07-26撰写*/Ap系列芯片设备树的移植：compatible=“wlan-platdata”表示Wifi_chip_type=“ap6212”表示使用wifi芯片的类型
Linux匿名者·2020-06-22 02:18

设计Soc并使用FPGA实现的流程及软件简介

IntroductionSoc即“System-on-a-Chip”，将系统做成一块芯片上。
JasonKangXX·2020-06-21 22:11

EFM32片内外设Timer之基本操作

#include#include#include"efm32.h"#include"efm32_chip.h"#include"efm32_cmu.h"#include"efm32_timer.h"#include"efm32
杀猪的大侠·2020-06-21 19:28

第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化

ChIPseekerChIPseeker虽然最初是为了ChIP-seq
六六_ryx·2020-06-21 17:46

emmc、Nand flash、Nor flash之间的区别

一、定义及区别emmc：全称为embededMultiMediaCard，是一种嵌入式非易失性存储器系统，由Nandflash和Nandflash控制器组成，以BGA方式封装在一款chip上。
疯子°没有欲望·2020-06-21 14:49

送书 | 哈佛大学单细胞课程：笔记汇总前篇

经典赏析NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2020-06-21 04:20

复现原文（二）：Single-cell RNA sequencing of human

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2020-06-21 04:49

复现原文（一）：Single-cell RNA sequencing of human kidney（step by step）

https://www.nature.com/articles/s41597-019-0351-8NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq
生信宝典·2020-06-21 04:49

代码分析 | 单细胞转录组数据整合详解

两种整合方法详解NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2020-06-21 04:49

哇！单细胞测序-配体受体互作分析原来可以这么简单又高大上！

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2020-06-21 04:49

单细胞分析Seurat使用相关的10个问题答疑精选！

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2020-06-21 04:48

ChIP-seq之检峰

ChIP-seq的核心是检峰（PeakCalling），当然现成的工具有很多，其中MACS比较常用，本文以MACSv2为例进行检峰的原理和使用。
浩渺予怀·2020-06-21 02:31

ChIP-Seq分析之ChIPQC结果含义

刘小泽写于2020.6.20首先是ChIP-Seq分析的前言介绍部分：1：了解ChIP-seq的实验流程2：继续了解ChIP-Seq3：关于ChIP-Seq的实验对照与偏差来源4：ChIP-Seq的实验设计补充
刘小泽·2020-06-20 20:01

认识各种内存地址

每一个内存颗粒叫做一个chip。每个chip中又叠了若干bank在每个bank内部，就是电容的行列矩阵结构了，每一个元素有8个小电容，存储8个
Gean·2020-06-04 14:00

ionic移动开发常用的HTML组件总结

ionic常用的11个组件header组件list组件卡片组件复选框组件单选框组件下拉选择组件按钮组件chip组件图形组件输入组件栅格化组件1、header组件演示代码ionic组件header部分浏览运行效果
微笑涛声·2020-05-27 23:14

苹果的芯酸往事

紧接着，他身后的屏幕上出现一行傲娇白字：“AppleA4Chip”。这款首次被冠以苹果之名的芯片，半年后被搭载到了一代神机iPhone4之上。
虎嗅网·2020-05-26 00:00

[每日干货]:分享一个ctf及平时都可用到的一个在线php审计的工具

每日干货:https://phpchip.com/CHIP挖掘所有PHP动态特性个人感觉和seay审计差不多不过PHPchip也算是另一种方法叭当我上传一个PHP一句话马文件(免杀)的时候：先附上代码:
shadowwolf·2020-05-23 17:00

“vivo chip”“vivo SoC”商标曝光 手机专属芯片要来了？

如今已有不少手机厂商通过自研芯片的方式，提升自家产品的竞争力。近日有消息指出，vivo或许也将加入自研发芯片的队伍中来。近日有数码博主曝光了vivo申请的芯片商标，似乎坐实了vivo即将在芯片领域发力。vivochip商标vivoSoC商标根据曝光的截图来看，vivo申请的两个商标分别为“vivochip”以及“vivoSoC”，申请日期在2019年9月。两个商标将用于中央处理器、调制解调器、智能
手机中国·2020-05-11 00:00

Flutter 标签类控件大全Chip

老孟导读：Flutter内置了多个标签类控件，但本质上它们都是同一个控件，只不过是属性参数不同而已，在学习的过程中可以将其放在放在一起学习，方便记忆。RawChipMaterial风格标签控件，此控件是其他标签控件的基类，通常情况下，不会直接创建此控件，而是使用如下控件：ChipInputChipChoiceChipFilterChipActionChip如果你想自定义标签类控件时通常使用此控件。
老孟Flutter·2020-05-10 09:00

Python/Java/C++/C#等主流编程语言的多线程对比

具有这种能力的系统包括对称多处理机、多核心处理器以及芯片级多处理（Chip-levelmultith
江南蜡笔小新·2020-04-30 12:33

Chip-Seq分析过程 Multiqc 安装使用过程的问题

Anaconda下载multiqc软件后运行命令报错：multiqc*zip-o./multiqc/image.png报错原因：python版本问题Debug:condacreate--namepython3python=3.6#下载python3.6版本sourceactivatepython3#激活Anaconda的python3环境sourceactivatechipseqcondainst
Htt_1996·2020-04-25 20:50

如何实现在jupyter notebook中播放视频(不停地展示图片)

代码如下#-*-coding:utf-8*-importcv2capture=cv2.VideoCapture("D:\\dataset\\chip_gesture.ts")#图像处理函数defprocessImg
MC-Zhang·2020-04-23 08:51

生物信息系列：根据成对bed文件以及多个BigWig文件画出信号图

Materials：两个bed文件，多个ENCODE数据库下载的组蛋白CHip-seq数据的bigwig文件。
Minka__·2020-04-16 22:03

PH每日快报 | 众筹世界上第一台9刀芯片主机，约？

点击产品名称即可进入，试用后有什么感想记得告诉我们哦~~CHIP『硬件』CHIP是世界上第一台9美元芯片主机（众筹中）。CHIP目前在kickstarter
Product_X·2020-04-14 01:21

成长足迹

图片发自App跟读牛津树chip'slettersounds因为里面生词比较多，今天只要求跟着音频朗读。每读到涛哥会的词，自己就会在右边的图片里找答案喜欢Ispy的游戏。
涛妈妈·2020-04-12 07:37

Chip-seq分析流程

以Targetingsuper-enhancer-associatedoncogenesinoesophagealsquamouscellcarcinoma为例，实现其Chip-seq分析。
yangmqglobe·2020-04-10 18:44

Exome-seq、ChIP-seq、RNA-seq之间的差异

本文转自沈梦圆的博客全外显子测序是啥？转录组测序是啥？转录组测序又是啥？他们之间有什么差别么？傻傻分不清，不用怕，多学习下就会了，下面让我们一起来看看！1温基础测序深度：指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M，测序深度为10X，那么获得的总数据量为20M。覆盖度：指测序获得的序列占整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在，测序最终拼接组装获得的序
井底蛙蛙呱呱呱·2020-04-10 06:52

「工具」使用BETA整合分析ATAC-seq/ChIP-seq和RNA-seq数据

BETA网址:http://cistrome.dfci.harvard.edu/BETA/tutorial.html功能介绍数据准备：peakbedfile#chrstrend$headmep_ebDfpeak_deseq2_sig.bedchr81205080812052743chr96649299966494729chr4125632449125634758chr410182030101835
六六_ryx·2020-04-06 16:06

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月12日

用心陪伴每一天1音频0a0b轮播2动画0aunit1-63儿歌与游戏a、lollipop宝宝，姜老师给我们布置了一个作业，去超市看各种各样的棒棒糖、买棒棒糖、一起吃棒棒糖!好呀好呀，妈妈，为什么姜老师要布置买棒棒糖的作业呀？嗯，可能是因为姜老师也特别喜欢吃棒棒糖吧！Baby,let'sgotothesupermarkettobuysomelollipops.Ok?Ok!Hereweare!Look
水中的珊瑚雨·2020-04-06 14:34

Flutter之Chip组件

/***碎片，一般是用作标签constChip({Keykey,this.avatar,//标签左侧Widget，一般为小图标@requiredthis.label,//标签this.labelStyle,this.labelPadding,this.deleteIcon,//删除图标this.onDeleted,//删除回调，为空时不显示删除图标this.deleteIconColor,//删除
习惯了_就好·2020-04-06 07:16

博士妈妈读英文绘本57：Floopy Did This Floopy做了这件事

今天继续给大家分享牛津阅读树，ReadWithBiff,Chip&Kipper系列故事。今天的故事，讲罗宾逊一家人之间互相画画像的趣事。在此之前，我们需要先了解下这一家人。二来认识罗宾逊一家吧！
快乐流利说英语·2020-04-06 05:21

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月1日

用心陪伴每一天1音频0b轮播2动画汉语第一册第一单元-虫虫飞3儿歌与游戏turtleandsnail边唱儿歌边四处躲藏，桌子底下，椅子底下，浴巾底下，都是我们可以找到的shell.妈妈拿着一块绿色的垫子当成shellI'maturtle.Ihaveashell.Ihaveagreenshell.Icanbe-bop,be-bop,hidemyheadwell.宝宝拿着粉色和黄色两块垫子当成shel
水中的珊瑚雨·2020-04-05 18:42

[SSC] U6L5&6 Homework

本次学习内容：目标词汇:Phonics：Understand/ch/phonicswords:cheese,chip,torch,punch,chin,chainDrinks:milk,water,tea
TimmySHENX·2020-04-04 21:12

ChIP-seq 分析------原理

一：背景介绍  之前一直在死磕ChIP-seq的实验，接下来要逐步过渡到ChIP-seq的上手分析了。在进行ChIP-seq在分析之前，明确一下几个问题：1.1：whatisChIP-seq?
liu_ll·2020-04-04 05:41

每日文献：2018-01-06

ChIP-seq文章8年前的ChIP-seq如何找peak老板前几天丢了2010年的文章给我，让我去看下这篇文章的ChIP-seq分析结果中，他要的基因是不是也被调控了。
徐洲更hoptop·2020-04-02 11:43

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月9日

用心陪伴每一天1音频1a轮播2动画1aunit1-33儿歌与游戏卡片游戏bigbadbug贴了鳄鱼、小蝌蚪、蚊子、害虫等几张卡片在墙上，找出乒乓球轮流投掷，边投边唱儿歌Chasethatbigbadbug,makeitgoaway,shoo,shoo.Chasethatbigbadcrocodile,makeitgoaway,shoo,shoo.Chasethatbigbadmosquito,ma
水中的珊瑚雨·2020-04-02 10:53

ChIP随记

ChIP-seq文献1.【2018NB】phantompeakqualtools1.MACS-g表示实际可比对的基因组大小。比如说人类是2.7e9，也就是2.7G，而实际人类基因组大概是3.2G左右。
caokai001·2020-04-02 09:01

GEM peak caller

GEM(GenomewideEventfindingandMotifdiscovery)2.GPS和GEM两种算法GPS:input：ChIP-Seqreaddataoutput：bindingeventcallingGEM
horsefish·2020-04-02 09:19

let短语

“chip”在这个短语中指的是“（木头的）碎屑”。这个用法出现在19世纪末。木匠在砍木头的时候并不会在意木头碎屑落在了什么地方。如今，这个短语用来表示“无论结果如何都能够安然接受”。
仓鼠Betsy·2020-04-01 15:33

chipBase:转录调控数据库

转录调控是生命活动中重要的调控机制，通过chip_seq数据，我们可以得到转录因子或者组蛋白修饰和基因之间的调控关系。
生信修炼手册·2020-04-01 03:30

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-170-Chip-2017年8月15日

用心陪伴每一天1音频0a轮播今天从爷爷奶奶老家返程，路上五个小时，自然不能错过这完美的音频时间，爸爸妈妈和宝宝，唱着儿歌，学着音频里的对话，漫长的旅途也没那么无聊了；回到家，找出0b的资料，开始第一次听其中的音频2儿歌与游戏bigbadbugchasethatbigbadbug，makeitgoaway.shoo,shoo!（手指游戏）3爸爸时间和爸爸一起研究了新玩具-方块之谜，玩了捞对子，晚餐后
水中的珊瑚雨·2020-03-28 19:55

enChIP 介绍和如何设计gRNA

版权所有：http://epigenie.com/products/enchip-kit/CatalogNo.53125.什么是enChIP：ChromatinImmunoprecipitation(ChIP
Runuply·2020-03-26 17:00
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