[机器智能与生物]研究生物智能的问题

RNA-seq数据分析_未完成子诚之组学数据分析数据分析
目录基础分析1.质控（reads）2.比对3.质控（alignment）4.定量5.样本合并差异表达1.质控（cohort）2.差异分析3.可视化（差异）富集分析肿瘤免疫1.免疫组库2.免疫浸润3.免疫响应4.新抗原预测微生物组参考本文主要覆盖了肿瘤样本bulkRNA-seq数据常见的分析步骤，并从实践角度出发，较为具体地介绍了每一步骤依赖的工具和数据集。另外，尽管本文适用于肿瘤样本，但其中的一些
梦璃夜丶
人至暮年矣，独留白发老翁守空宅，一声叹息谁人懂，心中的孤意又与谁说。人们常说梦是不真实的，不过事实确实如此，梦，也有梦想的意思。古人相信，做梦总要有原因的，王符就曾说"夫奇异之梦，多有收而少无为者矣"认为做梦总有原因可寻。做梦的原因主要三:即物理因素，生理因素和心理因素。梦属于灵魂医学范畴，是由内外信使的剌激，引起大脑的一小部分神经细胞活动，表现为高层次灵魂的最低水平的意识状态，当然，它也遵循生物
【创作纪念日】1024回忆录风巽·剑染春水创作纪念日 1024
不知不觉中，从创作第一篇文章到现在，已经1024天了，两年多的时间里，已经从硕士到博士了，1024，对于程序员来说，是个特别的数字吧，在此回忆与记录一下这些美好的经历吧。缘起很早以前，我从来也没想过我会了解计算机，了解代码的世界，那时候少年心中的梦想是当一名医生，想要悬壶济世，想要治病救人。后来因为种种原因，我没能成为一名临床医学生，学习了生物医学工程专业。这个专业说实话很杂，什么都学
狼道：能成大事的人，除了自身能力，还要具备狼的这种特质葑筝
很多人都面临着是否想成为动物的问题，我想很多人都想成为狼，这不仅是因为狼以其支配性的特点使人非常向往。而且它有很高的智力水平，使它能够主宰一切。在自然界中，就战斗力而言，狼当然不是最强的动物，但在生存智慧方面，很少有人能与它相比。嘲笑弱者、惧怕强者是每一种生物与生俱来的本性，弱肉强食是大自然的法则。但狼自己的说法是这样的:“我不怕懦弱，因为我战斗力强；我不怕赤身裸体，因为我伪装得好；我生活在逆境中
记录的重要性王超亲子绘本朗读者
写的文章，已经有好几个月了，动力自然是来源于007的倒逼输出。回过头来，看看自己的文章，感慨之余也不免有些唏嘘，庞杂而不成体系。今天，听了一本格拉宁写的一本叫做《奇特的一生》的书，书中的主人公柳比歇夫是前苏联一位伟大的生物学家。他用时间取得了学术上的丰硕成就，但并不限于生物学，他一生发表了70多本著作。最让我印象深刻的是，柳比歇夫对于自己一生的记录，每一天，见了几个人，参加了哪些活动，用了多长时间
2021.0208论语一句安羽心
子曰：“为政以德，譬如北辰，居其所而众星共之。”孔子说，用德行管理国家，要从大方向是否正确，从这个方向考虑问题。如同北极星，待在那里安然不动，其他的众星就会来围绕着，跟着你转。老子说治大国若烹小鲜。小鱼小虾放在锅里煎的时候不能老是翻滚，一翻滚你就给翻糊了。孔子和老子在对待这件事情上的想法是一致的，面对复杂的体系时别折腾。我们面对复杂体系（生物体）和简单体系（机械体）的时候是不一样的，简单体系你可以
全量知识系统“全基因序列”程序构想及百度AI的回复一水鉴天人工智能
Q0.今天我们开始编写全量知识系统中的一个重要部分的程序--用“全基因序列”来描述全量知识系统的设计（需求设计、程序概要和数据库）A0.全基因序列描述程序.首先，让我们从全基因序列的概念开始。全基因序列是指一个生物体全部基因的DNA序列信息。在全量知识系统的上下文中，我们可以将这个概念扩展到包含所有相关知识和信息的序列。现在，让我们开始编写程序的第一部分。由于您还没有提供具体的代码或功能需求，我将
最新ChatGPT支持下的PyTorch机器学习与深度学习 zkzhzy ChatGPT 机器学习 python 机器学习深度学习 pytorch chatgpt 数据分析人工智能
近年来，随着AlphaGo、无人驾驶汽车、医学影像智慧辅助诊疗、ImageNet竞赛等热点事件的发生，人工智能迎来了新一轮的发展浪潮。尤其是深度学习技术，在许多行业都取得了颠覆性的成果。另外，近年来，Pytorch深度学习框架受到越来越多科研人员的关注和喜爱。郁磊（副教授）主要从事AI人工智能、大语言模型及软件开发、生理系统建模与仿真、生物医学信号处理，具有丰富的科研经验，主编《MATLAB智能算
平静地接受好的，也接受坏的烽火长歌
文|烽火长歌一个人得意的时候，会如何表现？一个人失意的时候，会如何表现？得意的时候应该开心，失意的时候应该伤心。这应该是很多人心中的答案，可是我想来想去，这个还不算是最终答案，这个只是表象。就如同水往低处流一样，是我们的心境对客观刺激产生的最直接反馈。可是为什么如此呢？水往低处流是因为重力的作用。人为什么开心或者伤心的根本原因我不知道，这里面一定有一些生物学原理，否则为什么不是反过来的那样呢？估计
R语言microeco:一个用于微生物群落生态学数据挖掘的R包（构建microeco对象。还是要前进啊 R语言 r语言数据挖掘
我以前写过临床微生物组的文章，其中数据分析用过microeco包，在这里，将我学到的资源分享给大家。R语言microeco:一个用于微生物群落生态学数据挖掘的R包。主要功能R6类;分类群丰度图，维恩图，Alpha多样性，Beta多样性，差异丰度分析，环境数据分析，零模型分析，网络分析，功能分析。install.packages("microeco")library(microeco)library
如何处理NGS数据中的污染？ lakeseafly
本次文章和大家讨论一个大家可能胡遇到很常见的一个问题，在测序中我们很难避免引入一些微生物污染或者人类的污染，例如，我想测序拟南芥，其中由于实验员的操作不够干净，很容易引入一些人类的DNA，又或者该拟南芥的叶子上也混杂着细菌真菌等其他的DNA。当你进行组装或者做一些后续分析，这些污染会造成一些可想不到的不良影响。这篇文章会和大家讨论一下，处理NGS数据中的微生物污染？清理原始数据显而易见的，在一开始
你知道恐怖片和惊悚片的区别吗？同样是带来刺激却有何不同之处？白夜幽灯
HELLO,大家好，我是白哥，恐怖片和惊悚片它们到底有什么区别？关于这个问题，我其实有着自己的看法，当然网上也有很多的解释，仁者见仁智者见智吧，我在这里跟大家说下我的看法！很多人会说，恐怖片就是有真鬼，惊悚片就是心里有鬼！似乎有些道理，但是用在一些怪物题材的电影似乎就不好区分了。恐怖片和惊悚片的共性恐怖片和惊悚片有一个的共性那就是可怕，恐怖片（如极度深寒）以恐怖的生物来制造可怕的气氛，惊悚片（如狂
诗意地生活清风解语
如果你有两块面包，你当用其中一块去换一朵水仙花。——穆罕默德什么是生活？我时常这样扣问自己。“生活”一词，《现代汉语词典》对它的解释有以下五个：（一）人或生物为了生存和发展而进行的各种活动；（二）进行各种活动；（三）生存；（四）衣、食、住、行等方面的情况；（五）活儿（主要是指工业、农业、手工业方面的）。从这些释义中不难看出，我们普遍意义上的生活与生存没有太大差别；但是于我而言，生活的意义却远远高于
有些人看起来很一般，一旦“开窍”后就像开挂一样，究其原因在哪儿呢？惠心成长笔记
今天是我早起的第89/365天，日更的第110/365篇！早安打卡大自然的神奇之处在于，那些看似蠢笨而缓慢的生物，往往有着巨大的力量，而那些看似聪明的生物，却往往会经历更多的淘汰。作为人，“笨鸟先飞”的道理我们听过太多，但我们却忽略了“笨鸟”身上更为重要的品质。上天总是公平的，当把你的一扇门关上的时候，却会为你开另外一扇窗，当你在某一方面不开窍，不如人的时候，上天却赋予了你其他的优势。当你通过努力
U411934 统计分数plus+ 127wangruopu 算法数据结构开发语言 c++前端图论
本题为本人原创，请勿抄袭。难度：普及/提高-题目背景在你的帮助下，老师成功地完成了成绩的统计。但是，教委又说要添加口语听说成绩，并且还要写出每科的排名和平均分。老师们有彻夜难眠。题目描述这是一题将结构体和排序结合在一起的题。输入格式第一行，学生的数量。第二行，学生的名字。第三行，学生的语文、数学、英语听说、英语笔试、历史、生物、地理、政治、信息学奥林匹克竞赛成绩。输出格式第一行，name:学生的名
我们是否生活在一个超大型生物的大脑之中？——对多元宇宙观与生命存在形式的哲学探讨神气仙人科技未来科学
随着科技和哲学思辨的深入，关于人类所处宇宙的本质及我们自身存在的真实性的讨论越发引人入胜。其中一种颇具科幻色彩的观点认为，我们可能生活在某个巨大生物的大脑之中，所有的物理规律、自然现象以及我们的感知体验，都可能是这个生物意识活动的表现。本文将围绕这一观点展开深入的讨论。首先，这种观点受到多重理论的启发。在量子力学中，观察者效应揭示了观测行为对微观世界状态的影响，使得一些学者提出“全息宇宙”或“模拟
最美的丑石心说社群空间站坚持，毅力最美的丑石
早上（18），我又在习惯的生物钟的时间起来了，先是放一放水管里存的水，开始接新的水烧开水喝，再将早上的粥做上，大约4：40-4：55就再到沙发上躺一会儿，到了5：30我问女儿去不去锻炼了，本想再懒一下不去了，后来还是女儿坚持了一下，起来了，骑上自行车锻炼开始了……最美的丑石心说－社群空间站大约7：30左右我们就结束了，返回家里大约8：00左右，今天回来的早，所以在家做点炝菜加上早起做的粥，还是给女
《复仇者联盟4》观后感竹墨学堂
以前老是听到绿巨人，被当作大屌哥，而出名的。复仇者联盟，可以说是个汇聚天下各路大侠的地方，名震五湖的美国队长，响彻云霄的钢铁侠，力大无群有黑暗力量的灭霸。一群人，一件事，一辈子，一条心，一起赢。我看到了无论是男人还是女人，都要为社会创造价值，最后你就是成为了完成使命而生的生物。你的吃穿住行，日常起居，行为举止到最后都会工作化。时间是一条条静静流淌的河，无论你认同不认同，它都在那里。如果真的拥有一台
破解孩子成绩提升的密码（5）之情绪问题的困扰（中）爱的力量_心灯
上一期我们分享到我们要想学习好，我们必须摆脱消极情绪的困扰，把消极情绪转化为积极情绪，就是让你每天都保持一种快乐的状态，保持心情的宁静愉悦。这样我们才能把大脑激活，注意力集中，有了学习动力，进而高效地学习。那我们具体怎么做呢？怎么把消极情绪转化积极情绪呢？这两期我们就分享一些对同学们有操作意义的方法。（1）积极心态法我们人是个很奇妙的生物，我们身上有太多的不可思议。比如我们的观念认知，情感情绪和行
清晨，难得的清净时光--谈谈文学创作的基本要素以及如何成为一个文人洋娃娃的甜品屋
不知是今年的冬天这样，还是往年的冬天都是这样，只是我自己没有细心观察的原因，今年冬天的每一个早晨都特别的阴暗，一般早晨7点之前，天空都是阴暗的，如果你没有很好的生物钟，或者你定了闹钟，一般你就要睡过头了。因为阴暗的天会误导你认为现在是早晨四五点钟的样子，现在你终于明白了，这样的天是如何的阴暗了吧。周六的早晨多么难得的宝贵时光，不用上班上学，一切是非常安静的开始，我觉得这样的开始是让人舒服的。我竟然
向上管理：老板这种生物的正确打开方式 tuionf
向上管理新知帮助上司的重要性：他的成败与你最相关；他成功的概率最大；他会犯错，而你能补位上司的三个功能：信用卡功能、客户功能、加分功能我们和上司的三种关系：怕，远远望见就想溜怨，看不起，背地里抱怨相处融洽，互相成就把老板定义为权威的人，先把自己降了一级，然后她做得好就怕，做得不好就抱怨，把自己定义为“员工”。他的进步也就停止了，他的无非无非是做好手头事或者做不好把老板定义为资源的人，内心有平等心，
佩奇与达里奥的智慧董洪杉
全世界只有一种生物可以不死，就是一种海蜇。这种海蜇在正常情况下和其他生物没有什么不同，都会生老病死，但是如果刻意用针去刺激它，它会长出新的细胞，然后当母体死亡时，新的细胞会发育成完整的海蜇。佩奇曾经在公司一次内部会议上讲，企业和生物一样，从小到大，慢慢老化再到衰亡，难以避免。不介意公司的死亡，不会刻意去拯救一个衰老的公司，而是把目光往前看，努力寻找下一次机会，因此佩奇希望Google能不断创造新的
9月14日188天每日一省：你的一言一行孩子看在眼里 1078392508cd
晚饭过后整理完毕，躺在床上翻弄手机，女儿的老师在群里面加了一项背生物题的作业，女儿今天的作业已经完成了，正要准备自由活动呢。此时女儿走过来女儿：妈妈，你和我一起背生物卷子呗我：怎么一起背啊？我也记不住啊女儿：你就随便背吧，记不住也行。（其实边说我就边起来了，坐在了自己的书桌旁）我：我同意和你一起背题，（接过她手里的卷子，边说我就边拿起了我自己的书）女儿：你这是打算人在朝廷心在汉呗，算了吧，我自己回
八年级上册生物思维导图-全册脑图整理分享思维导图模板大全
八年级上册的内容延续了七年级曾学过的相关要点，都是为生物圈的重要组成部分。同样的，知识量大，记忆起来也比较困难。因此，在学习的过程中，用思维导图构建知识网络越发重要。知犀为大家整理了八年级上册生物思维导图的全部内容，同学们在学习的时候，可以借助八年级上册生物思维导图串联这部分的知识点，以便减轻记忆上的压力。八年级上册生物思维导图（1）动物的主要类群本章主要介绍了11种动物的形态结构特征、生活方式和
多轨迹建模方法的介绍与实操-基于R语言做自己的探路者统计机器学习人工智能
本文介绍了多轨迹建模方法（Group-BasedMultivariateTrajectoryModeling），这是一种扩展了单指标组基轨迹建模的技术，用于分析多个疾病生物标志物或临床重要因素的联合轨迹，以更好地理解和追踪疾病进程、行为或健康状态的变化。多轨迹建模利用有限混合模型，识别出遵循相似多指标轨迹的个体群体。这种方法克服了传统统计分析在处理多变量纵向数据时的局限性，允许同时分析多个相关指标
2021-03-06 如鱼饮水2020
中原焦点团队网络初23期坚持分享第254天，约练第94场，本周10咨28（20210306）生物钟被自然调整，一觉醒来才7点，赶紧上约练群，有适合的时间就接龙。简单自我介绍后没有要聊的话题，就来个box练习。分别扮演ABC开始练习：假设来访者有负面情绪的抱怨，咨询师通过你不想。。。你想要的是什么？的问句引导正向。我心里还挺不舒服的，假假的，怀疑是不是有效，我先当观察员C吧。来访者拿出一个负面情绪的
普通生物学陈阅增第9章气体交换与呼吸墨羽濛雪
9.1人的呼吸系统的结构与功能9.1.1人为什么必须不停地呼吸呼吸过程可以分为两部分:内呼吸和外呼吸。内呼吸是指能源物质在细胞内氧化的过程,又称细胞呼吸;外呼吸是指细胞与外环境之间交换气体的过程,在本章讨论。9.1.2人的呼吸系统包括口、鼻、喉、气管、肺吸气时,空气经鼻或口进入咽,再经喉、气管才进入肺。气管由马蹄铁形软骨支撑。气管进入胸腔,分为2个支气管。入肺后,支气管再一分为二,分为细支气管。这
2023-10-31 南粤清风HD
第5章：数学20分竟然上大学对于这次能否考上大学，江健峰也是心中无底，毕竟他不知道全国考生考得怎么样。在忐忑不安中度过几周后，高考成绩出来了，江健峰的总分上了本科线，其中语文、物理、化学、政治、英语、生物科的分数较高，但数学只考得20分。能否被高等学校录取，还是未知数。多年后从报纸等公开的资料才得知：那一年理工农医类卷的数学达到奥数级别，全国以被高校录取的考生来统计，数学平均分只有26分，其中京津
【计算机二级】综合题目 guan12319 python linux 数据挖掘
计算机二级python真题文章目录计算机二级python真题一、简单应用题二、综合应用题《人工智能分词两问》一、简单应用题描述模板中给出的代码是本题目的提示框架,其中代码可以任意修改。请在该文件中删除横线,编写代码,以实现一下功能:键盘输入小明学习的课程名称及考分等信息,信息间采用空格分隔,每个课程一行，空行回车结束录入，示例格式如下：数学90语文95英语86物理84生物87屏幕输出得分最高的课程
044故友振芳王健康老师
相识振芳同学，不觉过去了半个多世纪了，但她的身影却常留在我心中。一九五六年九月，我有幸入学浙江师范学院化学系，由一名小学教师变成了一名大学生，当然是十分高兴，那一年师院化学系，共招收了一百二十名学生，并分四个班，记得当时班上共有十三位女生和十七位男生，除浙江外，还有来自山东、江苏、上海和福建的同学，那时化学系和物理系、数学系、生物系都在钱塘江畔，六和塔旁的原之江大学的校园内。振芳是来自上海的女同学
面向对象面向过程 3213213333332132 java
面向对象：把要完成的一件事，通过对象间的协作实现。面向过程：把要完成的一件事，通过循序依次调用各个模块实现。我把大象装进冰箱这件事为例，用面向对象和面向过程实现，都是用java代码完成。 1、面向对象 package bigDemo.ObjectOriented; /** * 大象类 * * @Description * @author FuJian
Java Hotspot: Remove the Permanent Generation bookjovi HotSpot
openjdk上关于hotspot将移除永久带的描述非常详细，http://openjdk.java.net/jeps/122 JEP 122: Remove the Permanent Generation Author Jon Masamitsu Organization Oracle Created 2010/8/15 Updated 2011/
正则表达式向前查找向后查找,环绕或零宽断言 dcj3sjt126com 正则表达式
向前查找和向后查找 1. 向前查找：根据要匹配的字符序列后面存在一个特定的字符序列(肯定式向前查找)或不存在一个特定的序列(否定式向前查找)来决定是否匹配。.NET将向前查找称之为零宽度向前查找断言。对于向前查找，出现在指定项之后的字符序列不会被正则表达式引擎返回。 2. 向后查找：一个要匹配的字符序列前面有或者没有指定的
BaseDao 171815164 seda
import java.sql.Connection; import java.sql.DriverManager; import java.sql.SQLException; import java.sql.PreparedStatement; import java.sql.ResultSet; public class BaseDao { public Conn
Ant标签详解--Java命令 g21121 Java命令
这一篇主要介绍与java相关标签的使用终于开始重头戏了，Java部分是我们关注的重点也是项目中用处最多的部分。 1
[简单]代码片段_电梯数字排列 53873039oycg 代码
今天看电梯数字排列是9 18 26这样呈倒N排列的,写了个类似的打印例子，如下: import java.util.Arrays; public class 电梯数字排列_S3_Test { public static void main(S
Hessian原理云端月影 hessian原理
Hessian 原理分析一．远程通讯协议的基本原理网络通信需要做的就是将流从一台计算机传输到另外一台计算机，基于传输协议和网络 IO 来实现，其中传输协议比较出名的有 http 、 tcp 、 udp 等等， http 、 tcp 、 udp 都是在基于 Socket 概念上为某类应用场景而扩展出的传输协
区分Activity的四种加载模式----以及Intent的setFlags aijuans android
在多Activity开发中，有可能是自己应用之间的Activity跳转，或者夹带其他应用的可复用Activity。可能会希望跳转到原来某个Activity实例，而不是产生大量重复的Activity。这需要为Activity配置特定的加载模式，而不是使用默认的加载模式。加载模式分类及在哪里配置 Activity有四种加载模式： standard singleTop
hibernate几个核心API及其查询分析 antonyup_2006 html .net Hibernate xml 配置管理
(一) org.hibernate.cfg.Configuration类读取配置文件并创建唯一的SessionFactory对象.(一般,程序初始化hibernate时创建.) Configuration co
PL/SQL的流程控制百合不是茶 oracle PL/SQL编程循环控制
PL/SQL也是一门高级语言,所以流程控制是必须要有的,oracle数据库的pl/sql比sqlserver数据库要难,很多pl/sql中有的sqlserver里面没有流程控制; 分支语句 if 条件 then 结果 else 结果 end if ; 条件语句 case when 条件 then 结果; 循环语句 loop
强大的Mockito测试框架 bijian1013 mockito 单元测试
一.自动生成Mock类在需要Mock的属性上标记@Mock注解，然后@RunWith中配置Mockito的TestRunner或者在setUp()方法中显示调用MockitoAnnotations.initMocks(this);生成Mock类即可。二.自动注入Mock类到被测试类 &nbs
精通Oracle10编程SQL(11)开发子程序 bijian1013 oracle 数据库 plsql
/* *开发子程序 */ --子程序目是指被命名的PL/SQL块，这种块可以带有参数，可以在不同应用程序中多次调用 --PL/SQL有两种类型的子程序：过程和函数 --开发过程 --建立过程：不带任何参数 CREATE OR REPLACE PROCEDURE out_time IS BEGIN DBMS_OUTPUT.put_line(systimestamp); E
【EhCache一】EhCache版Hello World bit1129 Hello world
本篇是EhCache系列的第一篇，总体介绍使用EhCache缓存进行CRUD的API的基本使用，更细节的内容包括EhCache源代码和设计、实现原理在接下来的文章中进行介绍环境准备 1.新建Maven项目 2.添加EhCache的Maven依赖 <dependency> <groupId>ne
学习EJB3基础知识笔记白糖_ bean Hibernate jboss webservice ejb
最近项目进入系统测试阶段，全赖袁大虾领导有力，保持一周零bug记录，这也让自己腾出不少时间补充知识。花了两天时间把“传智播客EJB3.0”看完了，EJB基本的知识也有些了解，在这记录下EJB的部分知识，以供自己以后复习使用。 EJB是sun的服务器端组件模型，最大的用处是部署分布式应用程序。EJB (Enterprise JavaBean)是J2EE的一部分，定义了一个用于开发基
angular.bootstrap boyitech AngularJS AngularJS API angular中文api
angular.bootstrap 描述：手动初始化angular。这个函数会自动检测创建的module有没有被加载多次，如果有则会在浏览器的控制台打出警告日志，并且不会再次加载。这样可以避免在程序运行过程中许多奇怪的问题发生。使用方法： angular .
java-谷歌面试题-给定一个固定长度的数组，将递增整数序列写入这个数组。当写到数组尾部时，返回数组开始重新写，并覆盖先前写过的数 bylijinnan java
public class SearchInShiftedArray { /** * 题目：给定一个固定长度的数组，将递增整数序列写入这个数组。当写到数组尾部时，返回数组开始重新写，并覆盖先前写过的数。 * 请在这个特殊数组中找出给定的整数。 * 解答： * 其实就是“旋转数组”。旋转数组的最小元素见http://bylijinnan.iteye.com/bl
天使还是魔鬼？都是我们制造 ducklsl 生活教育情感
----------------------------剧透请原谅，有兴趣的朋友可以自己看看电影，互相讨论哦！！！从厦门回来的动车上，无意中瞟到了书中推荐的几部关于儿童的电影。当然，这几部电影可能会另大家失望，并不是类似小鬼当家的电影，而是关于“坏小孩”的电影！自己挑了两部先看了看，但是发现看完之后，心里久久不能平

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