2021.11.20【读书笔记】|差异可变剪接事件及DTU分析

  • 一、可变剪接(Alternative Splicing)
    • 定义:
      • 同一前体mRNA分子,可以在不同的剪接位点发生剪接反应,生成不同的mRNA分子,最终产生不同的蛋白质分子的一种RNA剪切方式。
    • 意义:
      • 1. AS是形成生物多样性的重要原因之一
      • 2. AS是基因表达调控的重要组成部分,与基因表达的时空性息息相关
      • 3. 由于可变剪接直接造成表达产物的差异,因此可变剪接在一些性状、疾病中发挥重要作用。
    • 识别:
      • 分成了7个类型
      • 2021.11.20【读书笔记】|差异可变剪接事件及DTU分析_第1张图片

    • 识别工具:
      • SUPPA,#目前已升级为SUPPA2
      • 1.计算时间短。小数据,数分钟可以完成计算。
        • 2021.11.20【读书笔记】|差异可变剪接事件及DTU分析_第2张图片

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