生信学习者1
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【科研绘图系列】R语言绘制论文组图（multiple plots）

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文章目录

    • 介绍
    • 加载R包
    • 数据下载
    • 导入数据
    • 数据预处理
    • 画图1
    • 画图2
    • 画图3
    • 画图4
    • 输出图片
    • 总结
    • 系统信息

介绍

一个用于分析和可视化博茨瓦纳婴儿微生物组研究（Botswana Infant Microbiome Study）中呼吸道病毒和细菌数据的R脚本。代码的主要目的是生成论文中的Figure 1，包括三个子图（a、b、c），并保存相关的数据和图表。

代码结构和功能

  1. 初始化和数据加载

    • 清除环境变量并设置随机种子，确保结果的可重复性。
    • 加载必要的R包，包括phyloseq、tidyverse、ggplot2等，用于数据处理和可视化。
    • 定义颜色主题，使用wesanderson和RColorBrewer包生成颜色调色板，用于图表的美观。

  2. 数据预处理

    • 从CSV和RDS文件中加载元数据和

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