如何解决在R中安装`RTCGA.clinical`出现的问题

本方法适用于Windows系统出现的一小部分问题

下载Rtools

为什么要下载Rtools？因为在楼主多次尝试安装后，发现了一个错误lazy loading failed for package 'RTCGA.clinical'

经过上网检索后发现是因为没有安装Rtools所导致的，安装网址

如果是3.6版本以前的R，请点击这里噢

安装的过程可以参考这一篇文章

Putting Rtools on the PATH

这一步我个人理解是把Rtools放到使用路径上（或者是环境中）

1.打开R

运行下面这句是为了把Rtools放置到环境中（个人理解）

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")

2.查看结果

完成第一步后要重启R，然后使用下面的语令

如果结果和这个一样就说明放置在环境中的步骤成功了

 Sys.which("make")
 >"C:\\rtools40\\usr\\bin\\make.exe"

3.检验

本地安装R包

 install.packages("KEGG.db_1.0.tar.gz", type="source")
 library("KEGG.db")

完成了上述步骤后就可以安装RTCGA.clinical了，其他更多的关于TCGA的安装可以看这篇推文

注意上面这篇推文可能因为书写时间太久远，其中source("https://bioconductor.org/biocLite.R") # downloads bioClite function和

biocLite()都只是使用于3.5版本以下的，应该改为BiocManager::install()

如果有其他好技巧也可以在评论区留言告诉我噢，大家一起学习进步