影像组学

1、影像组学的常规步骤是怎么样的？

传统影像组学的步骤包括：
1、影像获取及预处理；
2、感兴趣区(ROI)标定；
3、影像组学特征提取；
4、特征降维；
5、模型建立、优化。

医学影像有哪些

主要有CT（电子计算机断层扫描）、MRI（磁共振成像）、PET（正电子发射断层扫描）

2、有哪些好用的医学影像配准软件？

首推Ants, 其次FSL，此外3D Slicer组间也可进行配准。另外，SimpleITK包可支持多种编程语言进行图像配准。

3、常用的医学影像文件格式转换软件有哪些

AFNI是我用过最好用的dicom转nifti软件。其次MRIcroGL也很常用，轻量级，且支持Windows，linux，MacOS三平台。

4、做影像组学研究需要多少病例？

据说PASS软件可以评估需要的病例数，但在实践中，受各种现实条件的限制，未必总能满足要求。
一般来说，如果研究对象有足够的价值，那么分类问题中每类至少需要30例以上，回归问题至少需要50例。

5、如何阅读医学科研论文？

1、按照小李的习惯，会先看一看文章的摘要。看过摘要基本上就知道要不要读下去这篇文章。
2、第二步是看图、表（包括图表的标题、注释），如果你对一个研究领域很熟悉，那一篇好文章的图表基本能够让你了解文章的大部分内容。
3、Introduction的前半部分通常是背景介绍，刚接触某研究领域时要重点关注。
4、Introduction的后半部分，作者通常会提出问题和假说。
5、Method部分应重点关注与其他文章的不同之处，或是你不了解的内容。
6、Discussion部分关注文章的结论以及从结果到结论的逻辑。思考自己能从这篇文献收获什么，是内容上的收获，还是研究思路方法的收获。

6、影像组学研究基本流程：

• 获取图像
• 图像分割
• 特征提取
• 特征筛选
• 分类/预测
• 作图

引用了两篇文献，对于理解影像组学的基本概念和流程有很好的帮助：
　
张利文，等，影像组学的基本概念与临床应用；中华放射学杂志
　
Pancreatic ductal adenocarcinoma: a radiomics nomogram outperforms clinical model and TNM staging for survival estimation after curative resection

7、肿瘤分割算法总结列举

分割形式有自动分割，半自动分割，和人工分割。其中，人工分割通常被用来作为为标准，衡量分割算法的优劣。实际操作中，各种分割算法，都有其自适应的场景、范围、条件，特别受制于客观条件。现在也没有哪种算法敢站出来，说自己适应力强，准确性高（我又一次看见诺奖向我微笑），所以，最可靠的，还是临床医生们自己手动勾画ROI（Region of Interest），实际科研中，临床用得最多的，还是纯手工（我们行业内称顶级智慧型生物智能勾画法）。