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r语言ggplot2
吨吨吨的生信技能树
r语言
学习笔记(1)
前面课程的代码见【生信技能树】
R语言
学习代码笔记-(jianshu.com)6.选取差异明显的基因的表达量矩阵绘制热图感觉这一节课听的有点懵了rm(list=ls())options(stringAsFactors
吨吨吨_e0c9
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2023-08-22 19:55
R语言
机器学习与临床预测模型38--深度学习
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01深度学习深度学习(DeepLearning
科研私家菜
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2023-08-22 16:32
Python环境指南2023版
因为Anaconda不仅仅支持Python语言,还支持其它的数据科学工具,比如Matlab,
R语言
,Fortran语言。Anaconda同
SpringJavaMyBatis
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2023-08-22 12:17
python
python
开发语言
Python环境
爬虫
Python教程
使用
R语言
绘制折线图
那么,我们也使用
R语言
复现此图形。此外,在前期的教程中,我们基本没有分享过折线图的教程。因此,我们在这里也制作一期关于折线图的教程。在后续的教程,会陆续进行更新。
小杜的生信筆記
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2023-08-22 10:02
r语言
信息可视化
开发语言
学习
数据挖掘
R语言
机器学习方法在生态经济学领域
R语言
是用于统计建模的主流计算机语言,用于机器学习十分方便,且学习曲线
xiao5kou4chang6kai4
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2023-08-22 10:31
生态
经济
环境
r语言
机器学习
开发语言
swirl包学习
R语言
--Looking at Data
使用数据集plantsclass()dim()查看几行几列nrow()查看行数ncol()查看列数object.size()查看占用的储存空间names()查看列的名字head()默认6行head(data,10)tail(data,15)查看后15行summary()每个变量如何分布,有多少缺失值table(),如果某一列是因子变零str()比summary()更简洁的查看结构
Lemon_93d5
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2023-08-22 07:14
RStudio和RStudio Server
RStudio是一个强大的、免费的、开源的
R语言
集成开发环境的应用软件,可以安装在Windows、Linux和Mac不同操作系统上。
饮食有度的元气少女
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2023-08-22 06:27
R编程练习
笔记
R包开发一:R与Git版本控制
本文来源:《
R语言
编程》(2023年2月出版,人民邮电出版社)仅供
饮食有度的元气少女
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2023-08-22 06:53
R编程练习
git
笔记
生信小组DAY6-JANE
R包
R语言
的包,常常听到各种名字,扩展包、程序包、软件包、函数包、算法包……不如单名一个“包(Package)”字来的简单粗暴。
Jane_30e5
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2023-08-22 01:48
R语言
PCA主成分、lasso、岭回归降维分析全球气候变化对各国土地面积影响|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=31445最近我们被客户要求撰写关于各国土地面积的研究报告,包括一些图形和统计输出。机器学习在环境监测领域的应用,着眼于探索全球范围内的环境演化规律,人类与自然生态之间的关系以及环境变化对人类生存的影响。课题着眼于环境科学中的近年来土地面积变化影响的课题,应用机器学习的方法,进行数据处理与分析预测。数据的处理方法以及机器学习本身算法理论的学习和代码
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2023-08-21 22:52
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
PCA主成分、lasso、岭回归降维分析全球气候变化对各国土地面积影响|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=31445最近我们被客户要求撰写关于各国土地面积的研究报告,包括一些图形和统计输出。机器学习在环境监测领域的应用,着眼于探索全球范围内的环境演化规律,人类与自然生态之间的关系以及环境变化对人类生存的影响。课题着眼于环境科学中的近年来土地面积变化影响的课题,应用机器学习的方法,进行数据处理与分析预测。数据的处理方法以及机器学习本身算法理论的学习和代码
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2023-08-21 22:47
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
BUGS/JAGS贝叶斯分析: 马尔科夫链蒙特卡洛方法(MCMC)采样|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=17884最近我们被客户要求撰写关于BUGS/JAGS贝叶斯分析的研究报告,包括一些图形和统计输出。在许多情况下,我们没有足够的计算能力评估空间中所有n维像素的后验概率。在这些情况下,我们倾向于利用称为Markov-ChainMonteCarlo算法的程序。此方法使用参数空间中的随机跳跃来(最终)确定后验分布相关视频:马尔可夫链原理可视化解释与R语
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2023-08-21 22:46
R语言
神经网络模型预测多元时间序列数据可视化|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=32198最近我们被客户要求撰写关于神经网络的研究报告,包括一些图形和统计输出。多元时间序列建模一直是吸引了来自经济,金融和交通等各个领域的研究人员的主题(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。多元时间序列预测的一个基本假设是,其变量相互依赖。在本文中,我们专门针对客户的多元时间序列数据设计了神经网络框架,拟合单隐层神经网络,可能存在跳跃层连接。
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2023-08-21 22:46
数据挖掘深度学习
R语言
lasso惩罚稀疏加法(相加)模型SPAM拟合非线性数据和可视化
p=33462原文出处:拓端数据部落公众号本文将关注
R语言
中的LASSO(LeastAbsoluteShrinkageandSelectionOperator)惩罚稀疏加法模型(SparseAdditiveModel
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2023-08-21 22:45
数据挖掘深度学习人工智能算法
R语言
简要入门
R语言
简介
R语言
笔记:数据分析与绘图的编程环境版本1.7RDevelopmentCoreTeamJune10,2006Contents1绪论与基础11.1
R语言
环境...................
小飞侠-2
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2023-08-21 16:38
R语言
临床数据分析与临床预测模型建立(SEER数据库)
该体系分析流程学习优势:1最完整的
R语言
临床数据分析与模型代码流程;2涵盖2700多篇已发表SEER相关
医学程序研究
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2023-08-21 06:17
MCD4290代写、代做skill game、代写web/css编程语言、代做web/HTML调试Matlab程序|代写
R语言
程序
Assignment1-MemoryTrainingGameMCD4290,Trimester1,2020Due:Week5,23:55Worth:12%offinalmarkAimForthisassignmentyourteamwilldevelopamemoryskillgamebasedontheelectronicgameSimon,producedbyHasbro.Youwillcre
xiatuobian
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2023-08-21 04:46
ggplot2
不同主题展示
1.theme_bw()2.theme_classic()3.theme_dark()4.theme_gray()5.theme_grey()6.theme_light()7.theme_linedraw()8.theme_minimal()
onlyme_862a
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2023-08-21 04:00
【
R语言
】百分比表格删除两行重新计算百分比
好不容易算好的每个样本中检测到的微生物的百分比含量发现前面两行一个是没有分类的类型,另外一个是无法比对到微生物物种上的。这两行需要删掉,这样每个样本中微生物的占比就需要重新计算了。删除之前,每个样本中微生物的占比为下面我们用两种方法来实现一、使用apply函数#读入数据a<-read.table(file="sample_bacteria_percentage.txt",sep="\t",head
生信交流平台
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2023-08-21 03:37
R语言
介绍及安装教程
R语言
是一种免费的开源编程语言和环境,主要用于数据分析、统计建模和可视化。它可以运行在不同的操作系统上,如Windows、MacOS和Linux。
chuxuezhe_987
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2023-08-21 03:26
R
r语言
R语言
mgcv包中的`gam`函数:构建广义加性模型
R语言
mgcv包中的gam函数:构建广义加性模型概述广义加性模型(GeneralizedAdditiveModels,GAMs)是一种灵活的机器学习方法,可以对非线性、非参数和高维数据建模。
ByteGlide
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2023-08-21 01:46
R语言
r语言
python
开发语言
R语言
R语言
中mgcv包的gam函数与线性回归的性能比较
R语言
中mgcv包的gam函数与线性回归的性能比较在
R语言
中,我们通常使用线性回归来建立预测模型,但是在某些情况下,线性回归并不能很好地拟合数据。
TechBurst
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2023-08-21 01:46
R语言
r语言
线性回归
python
R语言
R语言
中实现非参数单指标模型估计的函数mgcv::gam
gam(formula,family=gaussian(),data=list(),weights=NULL,subset=NULL,na.action,offset=NULL,method="GCV.Cp",optimizer=c("outer","newton"),control=list(),scale=0,select=FALSE,knots=NULL,sp=NULL,min.sp=NUL
zoujiahui_2018
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2023-08-21 01:16
R
r语言
使用
R语言
进行广义加性模型拟合的高级方法——mgcv包中的gam函数
使用
R语言
进行广义加性模型拟合的高级方法——mgcv包中的gam函数引言:在统计建模中,广义加性模型(GeneralizedAdditiveModels,简称GAM)是一种常用的非线性回归方法。
2301_79326930
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2023-08-21 01:16
R语言
r语言
开发语言
R语言
【
ggplot2
】不同方法画half -小提琴图
参考:split-violin-plot-with-
ggplot2
gghalves效果图:每一个分组画出一半小提琴图,放一起。
caokai001
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2023-08-21 00:23
社交网络分析的 R 基础:(一)初探 R 语言
回想当时学习
R语言
时也是非常戏剧性的,开始科研生活时到处发邮件要源代码,发完最后一封本以为又是无功而返,很意外的收到了秒回的邮件,邮件中附上了由
R语言
编写的实验代码。
电脑玩家张高兴
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2023-08-20 23:57
R语言
处理缺失数据(1)-mice
#清空rm(list=ls())gc()###生成模拟数据####生成100个随机数library(magrittr)set.seed(1)asd%round#平均60,标准差10#将10个数随机替换为NANA_positions%data.framecolnames(asd)%roundasd$BMI%as.factorasd$death%as.factor#查看数据分布str(asd)libr
weixin_49320263
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2023-08-20 13:13
常用方法
r语言
拓端tecdat|Python用时变马尔可夫区制转换(Markov regime switching)自回归模型分析经济时间序列
相关视频:马尔可夫链原理可视化解释与
R语言
区制转换Markovregimeswitching实例马尔可夫链原理可视化解释与
R语言
区制转换Markovregimeswitching实例,时长07:25相关视频马尔可夫链蒙特卡罗方法
拓端研究室
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2023-08-19 23:24
时间序列
python
Python
时变
Markovregime
时间序列
马尔可夫区制转换
R语言
修改 libPath包的储存路径
思路:改变R中.libPaths()?>R>.libPaths()[1]"/usr/lib64/R/library""/usr/share/R/library"方法:新建~/.Rprofile指定libPathsvi.Rprofile.libPaths(c("/GPFS/*/lib/R_LIBS","/usr/lib64/R/library","/usr/share/R/library"))wq>
SnorkelingFan凡潜
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2023-08-19 20:26
[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--显著性箱线图
本期内容为[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--显著性箱线图花费一点时间整理出来的,还是比较粗糙,主要的问题还是主题颜色,因此如有你好看的主题颜色,可以留言分享哦!!
小杜的生信筆記
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2023-08-19 20:57
图数据库_Neo4j学习cyphe
r语言
_常用函数_关系函数_字符串函数_聚合函数_数据库备份_数据库恢复---Neo4j图数据库工作笔记0008
然后再来看一些常用函数,和字符串函数,这里举个例子,然后其他的类似可以看到substring字符串截取函数可以看到截取成功聚合函数这里用了一个count(n)统计函数,可以看到效果关系函数,我们用过就是id(r)可以取出对应的r的id来这样..
脑瓜凉
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2023-08-19 19:30
图数据库
neo4j
neo4j关系函数
neo4j常用函数
neo4j备份恢复
neo4j聚合函数
2020-04-17
http://www.360doc.com/content/17/0324/19/19913717_639839658.shtml
R语言
答疑:txt文件无法被R正确读入
PureZhang
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2023-08-19 14:05
Day5-
R语言
数据结构-佛系study
数据类型向量(vector):定义:多个元素构成的变量区别:标量(单个元素构成的变量)向量基础操作:.赋值:x<--1:10.从向量中提取元素:(1)根据元素位置:x[1:4](2)根据值:x[x<5].向量算数:可以将相同长度的两个向量相加,减去,相乘或相除,给出结果作为向量输出Createtwovectorsx1<-c(1,3,7,8,2,9)x2<-c(3,1,5,4,9,6)Vectora
佛系study
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2023-08-19 12:10
如何快速学会用
R语言
做出漂亮的ROC图
pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包,目前已被CRAN收录,因此安装也非常简单,同时该包也兼容
ggplot2
函数绘图,本次就教大家怎么用pROC来快速画出ROC图。
沉迷工作的我
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2023-08-19 12:54
自动执行探索性数据分析 (EDA),更快、更轻松地理解数据
本文将在
R语言
和python语言的探索性处理。摄影:CharlotteKarlsenonUnsplash二、什么是EDA?EDA是exploratorydataanalysis(探索性数据分
无水先生
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2023-08-19 12:06
数据挖掘和量化分析
人工智能
深度学习
三本书与三场发布会,和鲸社区重新定义编程类书籍从阅读到实践新体验
答案是:过去半年,和鲸社区凭借在气象、医学、社科等垂直领域的长期积累以及多方伙伴的支持,联合举办了三场新书发布会——从Python到
R语言
、从气象到医学,新近出版的优质教科书通过社区更早更快地被需要它的受众朋友们了解到
ModelWhale
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2023-08-19 11:30
数据分析
python
r语言
R语言
有限混合模型聚类FMM、广义线性回归模型GLM混合应用分析威士忌市场和研究专利申请、支出数据|附代码数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=24742原文出处:拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于有限混合模型聚类FMM的研究报告,包括一些图形和统计输出。摘要有限混合模型是对未观察到的异质性建模或近似一般分布函数的流行方法。它们应用于许多不同的领域,例如天文学、生物学、医学或营销。本文给出了这些模型的概述以及许多应用示例。介绍有限混合模型是对未观察到的异质性建模或近似一般分布函数
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2023-08-19 00:26
数据挖掘深度学习人工智能
R 语言入门与介绍
文章和代码已经归档至【Github仓库:https://github.com/timerring/dive-into-AI】或者公众号【AIShareLab】回复
R语言
也可获取。
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2023-08-18 23:24
r
R语言
的数据结构与转换
文章和代码已经归档至【Github仓库:https://github.com/timerring/dive-into-AI】或者公众号【AIShareLab】回复
R语言
也可获取。
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2023-08-18 23:24
r
图数据库_Neo4j学习cyphe
r语言
_使用CQL_构建明星关系图谱_导入明星数据_导入明星关系数据_创建明星关系---Neo4j图数据库工作笔记0009
首先找到明星数据可以看到有一个sheet1,是,记录了所有的关系的数据然后比如我们搜索一个撒贝宁,可以看到撒贝宁的数据然后这个是构建的CQL语句首先我们先去启动服务neo4jconsole然后我们再来看一下以前导入的,可以看到导入很简单,就是上面有CQL看一下节点的属性
脑瓜凉
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2023-08-18 20:38
neo4j
CQL构建明星关系图谱
neo4j构建明星关系图谱
CQL
图数据库
泰迪大数据挖掘建模平台功能特色介绍
大数据挖掘建模平台介绍平台底层算法基于
R语言
、Python、Spark等引擎,使用JAVA语言开发,采用B/S结构,用户无需下载客户端,可直接通过浏览器进行访问;且在没有编程基础的情况下,运用拖拽的方式进行操作
泰迪智能科技
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2023-08-18 10:02
数据挖掘平台
数据挖掘
人工智能
R-Meta分析与【文献计量分析、贝叶斯、机器学习等】多技术融合
R语言
拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制,可以对数据直接进行分析和显示,命令格式简单、结果可读性强,包含众多针对Meta分析软件包,是进行Meta整合分析及评价的有效平台针对Meta
xiao5kou4chang6kai4
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2023-08-18 08:22
生态
环境
农业
r语言
开发语言
R语言
APSIM模型进阶应用与参数优化、批量模拟实践技术
随着数字农业和智慧农业的发展,基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM(AgriculturalProductionSystemssIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和NextGeneration两个系列模型,能模拟几十种农作物、牧
思考的小猴子
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2023-08-18 08:22
土壤
环境
农业
r语言
环境
农业
基于
R语言
APSIM模型进阶应用与参数优化、批量模拟
随着数字农业和智慧农业的发展,基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM(AgriculturalProductionSystemssIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和NextGeneration两个系列模型,能模拟几十种农作物、牧
xiao5kou4chang6kai4
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2023-08-18 08:48
农业
生态
遥感
r语言
开发语言
python画pr曲线_Python scikit-learn计算PR ROC曲线AUC值
由于云海平台仅支持Python语言,原算法使用
R语言
实现,因此实现一份Python版,用于竞赛算法的结果核算。源数据样本csv格式说明:航班动态起降数据集。
weixin_39816141
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2023-08-18 07:56
python画pr曲线
相关性热图
相关性分析其实较为简单,用
R语言
自带的cor()函数非常容易计算得到两两变量间的相关系数。下面我们就来看下如何用
R语言
实现相关性计算并绘制带有显著性星标的相关性热图。
wanghaihua888
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2023-08-18 04:17
生信技能树作业和习题&
R语言
初级练习题
1、打开Rstudio告诉我它的工作目录。getwd()新建6个向量,基于不同的原子类型。(重点是字符串,数值,逻辑值)QQ截图20190419100812.png告诉我在你打开的rstudio里面getwd()代码运行后返回的是什么?新建一些数据结构,比如矩阵,数组,数据框,列表等重点是数据框,矩阵)在你新建的数据框进行切片操作,比如首先取第1,3行,然后取第4,6列使用data函数来加载R内置
永恒_7d35
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2023-08-18 03:24
R语言
实现神经网络(1)
#
R语言
实现神经网络library(neuralnet)library(caret)library(MASS)library(vcd)data(shuttle)str(shuttle)#因变量use;table1
weixin_49320263
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2023-08-18 03:56
神经网络
r语言
神经网络
R语言
实现非等比例风险生存资料分析(1)
#非等比例风险的生存资料分析###1生成模拟数据###library(flexsurv)set.seed(123)#生成样本数量n%summarypz=775,]pzg2%summarypz2<-pzg2[["coefficients"]][1,5]hr2<-pzg2[["coefficients"]][1,1]duan_1<-survfit(Surv(time,status)~group,dat
weixin_49320263
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2023-08-18 03:25
建模
r语言
R语言
dplyr包select函数删除dataframe数据中包含指定字符串内容的数据列(drop columns in dataframe)
问题描述参考链接我有一个数据框,想删除列名包含“Pval”的列实现方法a_new<-select(data,-contains('Pval'))大功告成。
小八四爱吃甜食
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2023-08-18 00:19
r语言
开发语言
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