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ggplot2
ggplot2
版聚类物种丰度堆叠图
文章目录写在前面加载依赖关系导入数据ggtree绘制聚类树物种组成数据整理成facet需要的格式保证颜色填充独立性分面组合树和柱图修改配色ggtree调整布局添加样本其他信息树+柱+堆叠图组合猜你喜欢写在后面写在前面随着研究的逐渐深入,我们对绘图的要求越来越高,各种之前使用的较少的图形如今追求热度和新颖程度,都开始逐渐在大文章中显现。如下图。这是最近刚发表于NatureEcology&Evolut
刘永鑫Adam
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2020-08-08 01:43
R
matplotlib绘制条形图
本文主要讲解如何通过Python主流绘图库matplotlib绘制条形图使用matplotlib绘制图形有时会让人感到麻烦,我自己曾经就学过R语言的
ggplot2
绘图包,说实在的,确实好用。
zhangxiaojiakele
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2020-08-07 22:44
Python
数据可视化
可视化:中国地图R/
ggplot2
这里介绍一下如何在R中用
ggplot2
画出好看的中国地图,是很多年前写的代码了,运行了一下发现还没有过时。下一篇介绍在python中如何画。如果不想写代码,可以搜索“地图慧“,在线制作相关地图。
公众号YueTan
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2020-08-07 18:29
核密度函数的推导实现代码
library(
ggplot2
)set.seed(100101)x=sort(rnorm(1000))k<-function(z){if(abs(z)<=1){k=0.75*(1-z^2)}else{k
你怎么秃了
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2020-08-07 17:14
qplot\
ggplot2
绘制箱型图、散点图
1.箱型图我们利用qplot来画图,使用iris中的数据。qplot(Species,Sepal.Length,data=iris,geom=c("boxplot"),fill=Species,main="1依据种类分组的花萼长度箱线图")#geom表示画的是什么图形。fill表示轮廓以内的填充颜色(不包括轮廓的颜色),控制轮廓的颜色使用color函数。2.小提琴图qplot(Species,Se
lishangyin88
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2020-08-07 15:58
[R语言]调整坐标、设置坐标轴、标题居中
154431233682528695169316001115347708702054631586163256363672510092282080766191832182310170087251116532083121667943613173248371418363977......library(
ggplot2
scxyz_
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2020-08-05 02:16
R语言
ggplot2
画中国地图
闲着无聊,画着玩~还是实际工作中能够用到,才会更加熟悉。还是要专注更重要的部分,这些当做消遣和游戏吧主要参考资料:刘万祥老师的新浪博客R语言中文社区的知乎专栏发现一个坑:bou2_4p.dbf、bou2_4p.shx、bou2_4p.shp三个文件要放在一个文件下,虽然读取的是bou2_4p.shpcode#画省热力图----------------------------------------
维格堂406小队
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2020-08-04 21:44
★★★R软件
#
★★R可视化
2020-06-05
25220599CodinglanguagePerlhttp://www.perl.org/Pythonhttps://www.python.org/Rhttp://www.r-project.org/Plot
ggplot2
http
study_qsy
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2020-08-04 08:09
ggplot2
设置箱线图boxplot异常值outlier的填充色outlier.fill
ggplot2
绘制线形图的时候,异常值的点颜色默认和箱子的线条颜色一致,没有额外的填充色了,设置outlier.fill并不能奏效。
datanewlook
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2020-08-04 01:36
R
r语言
ggplot2
数据可视化
R语言学习一 常用函数命令
安装程序包:install.packages("xxx")加载程序包:>library(
ggplot2
)查看包内函数:data(package='xxx')帮助:>?read.delim>??
秋天的原野
·
2020-08-04 00:40
R语言
基于R语言构建的电影评分预测模型
一,前提准备1.R语言包:
ggplot2
包(绘图),recommenderlab包,reshape包(数据处理)2.获取数据:大家可以在明尼苏达州大学的社会化计算研究中心官网上面下载这些免费数据集,网站链接为
王亨
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2020-08-03 08:55
R语言
推荐系统
数据挖掘
R语言
annotate(
ggplot2
)
ggplot2
中的annotate可以在已有图形基础上,添加任意几何对象(如rect,pointrange,text等)ggplot(ct1,aes(x=pos,group=Feature,weight
weixin_30906425
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2020-08-02 19:46
r语言
Coding and Paper Letter(七十七)
firecracker2.R语言包ggthemeassist,一个RStudio的Add-in插件用于调整
ggplot2
主题里的一些绘图细节(文字,边框,颜色)。
胖胖雕
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2020-08-02 17:04
科研学术
Coding and Paper Letter(七十五)
geospatial3.
ggplot2
的相关资源整理。awesome
ggplot2
4.Earthaxiv的一篇论文相关代码。题目为“Thecontributionofsubmesoscaleov
胖胖雕
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2020-08-02 16:15
科研学术
比较我国金融机构:银行部门、证券部门、信托部门和保险部门的破产风险(根据中信行业分类)
library("readxl")library("dplyr")library(stringr)library(PerformanceAnalytics)library(gcookbook)library(
ggplot2
Jarry1
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2020-08-02 16:18
可视化-鸢尾花
R语言:需要使用包:绘图包
ggplot2
、gridExtra(图形分布)、GGally(ggplot扩展,适合做成对出现图形)library(
ggplot2
)library(gridExtra)#加载数据
potherb
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2020-08-01 09:41
如何成为一个数据分析师--必备技能清单(中文版)
总目录编程统计学数学机器学习数据整理数据可视化数据直觉编程Pythonnumpypandasmatplotlibscipyscikit-learnR语言
ggplot2
dplyrggallyreshape2
飘荡的鱼头头头头头大
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2020-08-01 04:55
Coding and Paper Letter(十四)
1Coding:1.R语言包ungeviz,
ggplot2
的拓展包,专门用来作不确定性的可视化。ungeviz2.计算机图形学相关开源项目。计算机图形学光线追踪开源项目C++源码。
weixin_33754913
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2020-07-30 17:37
R中的包
在访谈中他提到了自己在R中常用的几个扩展包,其中包括用
ggplot2
包来绘图,用glmnet包做回归,用tm包进行文本挖掘,用plyr、reshape、lubridate和stringr包进行数据预处理
feng_lilan
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2020-07-30 15:53
R
R语言iris数据集的层次聚类
)#分3类result=cutree(model1,k=3)mds=cmdscale(dist.e,k=2,eig=T)x=mds$points[,1]y=mds$points[,2]library(
ggplot2
ddem35827
·
2020-07-30 12:14
[R|
ggplot2
]
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第五章
这个主要是对《
ggplot2
数据分析与图形艺术》第五章相关练习题的总结library(tidyverse)
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第二章
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第三章
ggplot2
xhog
·
2020-07-30 10:47
R作图系列-----
ggplot2
语法
ggplot2
理论基础:图形图层语法(六种语法组件)1.data\mapping\2.aestheticattributes3.geometricobject\4.facet\5.statistics\
weixin_30840253
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2020-07-30 02:39
用R语言绘制ROC曲线
如图:2代码部分install.packages(“pROC”)install.packages(“
ggplot2
”)library(pROC)library(
ggplot2
)#建立曲线data(aSAH
coding-day
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2020-07-29 22:52
[R|
ggplot2
]
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第六章
这个主要是对《
ggplot2
数据分析与图形艺术》第六章相关练习题的总结library(tidyverse)
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第二章
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第三章
ggplot2
xhog
·
2020-07-29 12:15
R包介绍系列-适用于回归模型可视化的visreg包
library(visreg)#模型可视化library(
ggplot2
)library(e1071)#支持向量机li
画长空_yin
·
2020-07-29 11:02
[R|
ggplot2
]
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第八章
这个主要是对《
ggplot2
数据分析与图形艺术》第八章相关练习题的总结library(tidyverse)
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第二章
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第三章
ggplot2
xhog
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2020-07-29 09:16
每日一图Marginal Histogram/Boxplot
原文链接Top50
ggplot2
Visualizations-TheMasterList(WithFullRCode)Ifyouwanttoshowtherelationshipaswellasthedistributioninthesamechart
牧羊的男孩儿
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2020-07-29 04:05
R语言的练习题-高级(原生信人的20个R语言习题)
安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:reshape2绘图包:
ggplot2
不同领域的R包使用频率不一样
mayoneday
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2020-07-29 00:53
有哪些值得推荐的数据可视化工具?
1.plotly2.R
ggplot2
3.无需编程语言的工具(7个)4.基于JavaScript实现的工具(8个)5.基于其他语言的工具(5个)6.地图数据可视化工具(7个)7.金融(股票)数据可
怀璧其罪
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2020-07-29 00:45
图表
如何处理地图投影转换
之前在学习
ggplot2
中的
weixin_34067980
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2020-07-28 18:33
python
数据库
r语言
【r<-方案】解决R从源安装缺乏cairo导致的错误
使用
ggplot2
画图发现报错:Erroringrid.Call(C_stringMetric,as.graphicsAnnot(x$label)):X11font-adobe-helvetica-%s
王诗翔
·
2020-07-28 12:58
[R|
ggplot2
]
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第七章
这个主要是对《
ggplot2
数据分析与图形艺术》第七章相关练习题的总结library(tidyverse)
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第二章
ggplot2
数据分析与图形艺术课后题:第三章
ggplot2
xhog
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2020-07-27 17:45
[R语言]数据可视化的最佳解决方案:
ggplot2
教程及实例
本篇从R的角度介绍如何使用
ggplot2
包,首先给几个我觉得最值得推荐的理由:采用“图层”叠加的设计方式,一方面可以增加不同的图之间的联系,另一方面也有利于学习和理解该package,photoshop
番茄猫
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2020-07-27 16:45
r
机器学习
数据分析
可视化
ggplot2
作图相关
www.cnblogs.com/JoAnnal/p/9921737.htmlR语言中相关图的绘制方法简介:http://blog.sciencenet.cn/blog-3406804-1173194.html
ggplot2
inR
闹钟又响了
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2020-07-26 05:21
Jupyter Notebook使用简析
LaTex,JavaScript交互式小部件可以用来实时操作和可视化数据大数据整合支持大数据工具,如ApacheSpark,fromPython,RandScala方便pandas,scikit-learn,
ggplot2
qq_39438455
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2020-07-16 07:13
Python数据分析
被迫从
ggplot2
转向matplotlib的第一天之matplotlib初体验!
作为一个
ggplot2
的死忠粉,迫于生计,开始学习matplotlib,这里是一些随想随记,Giao!
自其变者而观之
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2020-07-16 06:46
Python
Graphpad,经典绘图工具初学初探
漂亮的文章配图能给自己的工作加不少分,生信宝典推出R的系列教程
ggplot2
高效实用指南(可视化脚本、工具、套路、配色)讲解通过R语言绘制高颜值图。
生信宝典
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2020-07-16 04:53
资源
Bioinfo
转录组
生物信息
算法
图形解读系列 | 散点图也不简单
来源:https://www.r-graph-gallery.com/272-basic-scatterplot-with-
ggplot2
.html
生信宝典
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2020-07-16 04:53
在 R 中的
ggplot2
文本中添加颜色
ggplot2
软件包功能强大,几乎可以无限制地进行自定义,但是有时进行一些细微调整可能是一个挑战。ggtext软件包旨在简化可视化文件中的样式文本。
cxq8989
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2020-07-15 22:41
ggplot2
学习笔记系列之利用
ggplot2
绘制误差棒及显著性标记
YanTao绘制带有误差棒的条形图library(
ggplot2
)#创建数据集df%上次说过是管道操作,用于连接各个代码,十分有用)df.world_ports%>%filter(year==2014)
taoyan
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2020-07-15 21:47
ggplot2
颜色设置
1.手动指定颜色及顺序
ggplot2
涉及到的颜色主要由两种
常玉俊bioinfo
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2020-07-15 21:38
python可视化分析(matplotlib、seaborn、
ggplot2
)
python可视化分析总结(matplotlib、seaborn、ggplot)一、matplotlib库1、基本绘图命令3、图形参数设置4、特殊统计图的绘制4.1数学函数图4.2气泡图4.1三维曲面图二、seaborn库1、常用统计图1.1箱线图1.2小提琴图1.3点图1.4条图与计数图1.5分组图1.6概率分布图2、联合图3、配对图三、ggplot库1、图层画法+常用图形2、快速绘图一、mat
feifei2233
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2020-07-15 14:49
python与数据分析
python
数据可视化
ggplot2
Jupyter 常见可视化框架的选择
可能对于R社区而言,鼎鼎大名的
ggplot2
是常见的可视化框架,而大家对于Python,以及Jupyter为核心的交互式报告的可个视化方案就并没有那么熟悉。
数据与算法之美
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2020-07-15 13:34
tidyverse数据处理
tidyverse出自于R大神HadleyWickham之手,他是Rstudio首席科学家,也是
ggplot2
的作者。
zhenglit
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2020-07-15 12:44
数据分析
R语言对于Machine learning的代码以及研究
####packagesinstall.packages("
ggplot2
")install.packages("ROCR")install.packages("glmnet")install.packages
yumengzhang17
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2020-07-15 11:30
R语言-使用
ggplot2
绘制测序深度图
本文展示如何使用
ggplot2
包绘制测序reads深度分布图,即用条形图来展示每个位点的测序深度,以及用饼图来展示检出病原的分布。
husy_
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2020-07-15 10:16
在R中使用plot,qplot,ggplot三个函数做简单的常用图形
R自带的作图工具有plot,但是在使用R作图时,不得不提到的一个强大的包
ggplot2
。
ggplot2
中qplot和ggplot函数也可以用来作图。
三分之一给你
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2020-07-15 10:28
可视化
R语言可视化作图笔记(1)R语言
ggplot2
与plotly的基本介绍
R语言
ggplot2
与plotly的基本介绍
ggplot2
以R包自带的数据mpg为例library(
ggplot2
)data0<-mpgggplot(data=data0,mapping=aes(x=displ
wildwind0907
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2020-07-15 09:56
R的数据可视化笔记
R编程
R语言可视化作图笔记(2)感知与可视化预处理
感知与可视化预处理不同的散点图(
ggplot2
)还是以
ggplot2
里的mpg为例,第一幅只设置x,y,color三个参数。
wildwind0907
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2020-07-15 09:56
R的数据可视化笔记
R编程
R语言-ggplot自定义点的形状、线条的类型
library(
ggplot2
)library(ggpubr)show_point_shapes()#显示点的形状(ggpubr包内的函数)p1<-ggplot(mpg,aes(x=displ,y=hwy
Whuer-deng
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2020-07-15 07:39
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