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ggplot2
scRNAseq灵活的点图绘制:FlexDotPlot
单细胞绘图系列:Seurat绘图函数总结使用
ggplot2
优化Seurat绘图在读NatMed一篇文献Asingle-cellatlasoftheperipheralimmuneresponseinpatientswithsevereCOVID
Hayley笔记
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2022-07-01 10:01
Seurat绘图函数总结(更新版)
更多重要函数见:Seurat重要命令汇总Seurat绘图函数总结在使用R语言进行单细胞数据的分析和处理时,除了优秀的绘图包
ggplot2
以外,Seurat也自带一些优秀的可视化工具,可以用于各种图形绘制
Hayley笔记
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2022-07-01 10:52
ggplot2
主题配置神器:ggthemr
每一个模板都拥有完善的标度和主题设定(包括离散标度和连续标度、填充颜色和线条颜色),有助于快速简便的完全更改
ggplot2
图形的外观。
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:59
添加p-value和显著性标记:ggsignif和ggpubr
在数据分析过程中,常常需要把组间的显著性添加到图形中,但是在
ggplot2
中实现起来略显麻烦,幸运的是,有很多R包可以帮助我们实现这一操作,比如ggsignif和ggpubr。
Hayley笔记
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2022-06-30 09:05
ggplot2
箱线图 分面顺序修改
分面顺序问题的解决有张图library('
ggplot2
')ggplot(data=Salaries,aes(x=rank,y=salary,fill=sex))+geom_boxplot()+facet_wrap
努力学习的消炎药
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2022-06-29 11:56
R语言绘制带误差线的条形图
继续使用我们的汽车销售数据(公众号回复:汽车销售,可以获得该数据)来演示,先导入数据library(foreign)library(
ggplot2
)library(tidyverse)bc<-read.spss
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2022-06-27 11:45
R包ggtreeExtra绘制进化树
目录引言绘图示例1、下载安装ggtreeExtra包2、加载依赖包3、设置工作目录4、数据来源5、获取数据6、绘制树状图7、获取数据集绘制图a、绘制点图层b、绘制热图层c、绘制热图层d、绘制柱状图层引言
ggplot2
·
2022-06-24 12:13
R语言
ggplot2
拼图包patchwork安装使用
目录引言安装例子高级特性引言patchwork是基于
ggplot2
的拼图包,因为
ggplot2
本身没有强大的拼图语法,而一般使用的gridExtra与cowplot的拼
ggplot2
图形都存在不少问题。
·
2022-06-24 12:09
R语言绘制维恩图ggvenn示例详解
现在有很多在线的网站都可以绘制,但是R来画也方便,其中ggvenn是基于
ggplot2
的专门绘制韦恩图的R包。
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2022-06-24 10:23
R语言
ggplot2
优雅的绘制环状云雨图
❝本节来介绍如何使用「
ggplot2
」绘制环状云雨图,下面通过一个小栗子来进行介绍❞安装R包并加载package.list=c("tidyverse","ggridges","extrafont","geomtextpath
Mrrunsen
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2022-06-15 18:03
R语言
r语言
开发语言
R语言利用
ggplot2
绘制QQ图和箱线图详解
目录绘制qq图函数介绍例子绘制boxplot函数介绍例子利用分位点绘制箱线图将QQ图和箱线图进行融合函数介绍参数介绍注意事项例子绘制qq图在
ggplot2
中绘制qq图需要两步,geom_qq()将绘制样本分位点
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2022-06-10 01:11
R
ggplot2
文章目录1.
ggplot2
特点2.
ggplot2
基本概念3.
ggplot2
语法框架3.1共性映射与个性映射3.2几何对象与统计变换3.3aes与data参数4geom_xxx()几何对象4.1aestheticsspecifications
一株草的世界
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2022-06-08 19:58
R
R语言
ggplot2
条形图/柱状图geom_bar()
我们希望绘制一个横坐标为name,纵坐标为value的条形图library(
ggplot2
)ggplot(data=dat,aes(x=nam
Miao 2
·
2022-06-08 19:57
R语言
统计学
R-ggplot
ggplot2
数据可视化
r语言
统计学
数据分析
UCLA-(R Graphics: Intro to
ggplot2
)笔记
目录原文请见RGraphics:Introductionto
ggplot2
(12)(ucla.edu)https://stats.oarc.ucla.edu/stat/data/intro_
ggplot2
晨打水水水
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2022-06-08 19:57
r语言
r语言
开发语言
第五章,数据可视化-
ggplot2
其中最具盛名的包就是HadlyWickham开发的
ggplot2
包。
维刚
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2022-06-08 19:26
【R语言】
修改
ggplot2
图形外观
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>>坐标轴控制坐标轴和刻度线外观的函数函数选项scale_x_continuous()和scale_y_continuous()breaks=指定刻度标记,labels=指定刻度标记标签,limits=控制要展示的值的范围scale_x_discrete()和scale_y_discrete()breaks=对因子的水平进行放置和排序,labels
weixin_34100227
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2022-06-08 19:26
r语言
python
R数据可视化-
ggplot2
包
ggplot2
作图qplot函数:install.packages(“
ggplot2
”)library(
ggplot2
)#
ggplot2
自带的数据集diamondsdiamondsgetOption(“
华仔宝宝
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2022-06-08 19:24
R与数据分析
r语言
R语言
ggplot2
可视化:使用element_text函数设置轴标题文本为粗体字体(Bold Font,只设置X轴的标题文本使用粗体字体)
R语言
ggplot2
可视化:使用element_text函数设置轴标题文本为粗体字体(BoldFont,只设置X轴的标题文本使用粗体字体)目录
Data+Science+Insight
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2022-06-08 19:53
R语言从入门到机器学习
r语言
人工智能
机器学习
数据挖掘
自然语言处理
R语言实现漂亮的ROC图效果
目录1.读取数据2.AUC和CI的计算3.利用
ggplot2
绘图4.合并多个ROC曲线结果pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包,目前已被CRAN收录,因此安装也非常简单,同时该包也兼容
ggplot2
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2022-06-07 16:21
因子分析之
ggplot2
R语言因子分析与
ggplot2
一、mvstats包与本文所用的数据1.mvstats包2.本文所用的数据二、检验是否适合做因子分析1.KMO检验巴特利特球形度检验2.相关系数检验3.相关系数热力图三、因子提取
阿强真
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2022-06-04 07:29
r语言
开发语言
R语言
ggplot2
绘图
R语言绘图之
ggplot2
一.绘图的基本要素1.图形映射2.分面:3.添加平滑曲线二.绘制条形图设置坐标抽格式一.绘图的基本要素首先载入tidyverse包install.packages("tidyverse
阿强真
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2022-06-04 07:59
r语言
数据分析
开发语言
关于python中ggplot包出现 ‘DataFrame‘ object has no attribute ‘sort‘问题的解决方法
关于python中ggplot包出现‘DataFrame’objecthasnoattribute'sort’问题的解决方法最近发现python中也有ggplot包与R语言上的
ggplot2
库中的函数大体上一样
孤数不证
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2022-05-25 02:31
绘图的基本元素(
ggplot2
实现)
一、为什么要进行数据可视化?1.相比于文字,将文字进行可视化可以让大脑能够同时处理更多的数据。例如,如果读到下面一段文字3rdStreetistothenorthof4thStreet.PeachAvenuerunsperpendicularto3rdand4thstreets.Onthesoutheastcornerof4thandPeachisacoffeeshop.Onthenorthwes
华大基因学院
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2022-05-23 18:59
R
GDP与人预期寿命的关系图----R
单位GDP与寿命的关系统计绘图library(
ggplot2
)library(gganimate)theme_set(theme_bw())library(gapminder)head(gapminder
a10534126
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2022-05-23 18:25
面试
学习路线
阿里巴巴
java
java进阶
后端
利用
ggplot2
画发文章级别的TSNE图
直接上代码:1.安装程序包,读取数据package.list=c("
ggplot2
","pals","dplyr")for(packageinpackage.list){if(!
沉迷工作的我
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2022-05-21 21:37
R语言绘制双坐标轴(5种方法全网最全)
本文分别使用base、plotly、
ggplot2
、lattice4个系统,5种方法绘制双坐标轴。
yuanzhoulvpi
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2022-05-20 12:09
ggplot2
R
R
ggplot2
数据可视化
R语言使用gganimate创建可视化动图
目录使用
ggplot2
绘制1.transition_time()核心函数,添加动态2按需设置参考资料介绍一个主要用于绘制动画的
ggplot2
的扩展包---gganimate包。
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2022-05-15 07:46
R语言可视化
ggplot2
绘制24小时动态血糖图
目录数据格式创建等距时间序列的方法(分钟)画图代码数据格式sample=read.csv("sample.csv",header=T,stringsAsFactors=F)head(sample)创建等距时间序列的方法(分钟)time=strptime("00:00:00","%H:%M:%S")+300*0:287#没有填日期的时候,默认日期为今天画图代码#time首先要转换成POSIXct格式
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2022-05-12 12:54
技巧 |
ggplot2
绘图如何添加多块矩形框标注
本篇就来介绍在
ggplot2
绘图系统中,如何方便地添加多块矩形框。「矩形函数」在
ggplot2
工具包中,一共有三个矩形函数:geom_rect()、geom_tile()、geom_raster()。
R语言学堂
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2022-05-12 07:20
python
机器学习
javascript
matlab
数据可视化
R语言|ggtreeExtra包绘制进化树
R包-ggtreeExtra绘制进化树
ggplot2
提供的geom_tile图层可以画热图了,
ggplot2
的geom_point或者ggstar的geom_star可以绘制点图层。
作图帮
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2022-05-12 07:37
r语言
开发语言
【转】Python 可视化神器-Plotly Express
受Seaborn和
ggplot2
的启发,它专门设计为具有简洁,一致且易于学习的API:只需一次导入,你就可以在一个函数调用中
weixin_34269583
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2022-05-07 12:58
python
GDP与人预期寿命的关系图----R
单位GDP与寿命的关系统计绘图library(
ggplot2
)library(gganimate)theme_set(theme_bw())library(gapminder)head(gapminder
小宇2022
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2022-05-07 12:23
数据可视化
可视化
r语言可视化
r语言
开发语言
CNS里高大上的图咋绘制的?
希望对大家有帮助,以后持续更新,发现了好工具再往里添加:https://www.zhihu.com/question/334997852/answer/1765120307写完了,起来吃早饭了.本文目录:1、R
ggplot2
qq_21478261
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2022-05-06 07:39
#
生物信息
#
生物信息
可视化
科研
R Venn.diagram设置背景透明
我们都知道,在一般的
ggplot2
绘图中我们可以设置bg=“transparent”来使图片背景透明,但是venndiagram中却不能实现。对,没法设置背景透明。
11的雾
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2022-04-27 08:24
R语言输出可编辑的图片
在
ggplot2
程序包的加持下,R语言可以做出非常漂亮的统计图出来。然而大家是否会有这样的体会,为了做出理想的图片,需要不停的调整作图的参数,包括颜色,字体大小,字体格式,注释的位置,非常麻烦。
小蜜蜂Stats
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2022-04-26 20:51
相关性分析 addmodulescore得到的每个细胞评分与page_enrichments得到的每个细胞评分的相关性
addmodule_ns7d_dataframe与PAGE_enrichments相关性addmodulescore得到的每个细胞评分与page_enrichments得到的每个细胞评分的相关性library(patchwork)library(
ggplot2
qq_52813185
·
2022-04-25 07:32
笔记
r语言
seurat
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
:(八)
ggplot2
绘制空间地理数据图
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
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JoJo的数据分析历险记
·
2022-04-20 07:24
R语言:ggplot画图
R语言
数据可视化
ggplot2
空间地理数据
地图绘制
time ROC代码
一、绘制符合
ggplot2
风格的图片,可以加theme1、先定义一个函数,生成timeROC对象,注意数据集和相应列名需要修改library(survivalROC)##DefineahelperfunctiontoevaluateatvarioustsurvivalROC_helper
郭师傅
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2022-04-16 21:36
火山图学习
尝试复现文章的过程中,运用生信技能树jimmy大大的搜索神技,顺利整理出了一幅看着还不错的火山图,用的包是
ggplot2
,分享一下,共同学习进步!
monkey_study
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2022-04-16 14:44
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
:(七)对图形添加注释和标签(包含标题、坐标轴、参考线和高亮等注释方法)
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
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JoJo的数据分析历险记
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2022-04-15 07:21
R语言:ggplot画图
数据可视化
R语言
ggplot2
图形注释
R语言
ggplot2
可视化:可视化人口金字塔图、直方图(堆叠直方图、连续变量堆叠直方图、离散变量堆叠直方图)、密度图、箱图(添加抖动数据点、tufte箱图、多分类变量分组箱图)、小提琴图
R语言
ggplot2
可视化:可视化人口金字塔图、直方图(堆叠直方图、连续变量堆叠直方图、离散变量堆叠直方图)、密度图、箱图(添加抖动数据点、tufte箱图、多分类变量分组箱图)、小提琴图目录
Data+Science+Insight
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2022-04-15 07:50
R语言从入门到机器学习
r语言
机器学习
数据挖掘
人工智能
数据分析
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
:(六)统计变换绘图:包括加权绘图、数据分布图、曲面图、图形重叠处理等
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
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JoJo的数据分析历险记
·
2022-04-14 07:02
R语言:ggplot画图
数据可视化
R语言
ggplot2
统计变换
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
:(五)分组画图
玩转数据可视化之R语言
ggplot2
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JoJo的数据分析历险记
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2022-04-14 07:31
R语言:ggplot画图
R语言
数据可视化
ggplot2
分组绘图
直接读取表达矩阵和metadata信息创建seurat单细胞对象
library(CellChat)library(Seurat)library(dplyr)library(patchwork)library(
ggplot2
)library(ggalluvial)library
qq_52813185
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2022-04-14 07:21
笔记
r语言
seurat
addmodule
r
ggplot2
几种常见的散点图
1,散点图结果示例:image.png输入文件示例:image.png代码:library(
ggplot2
)datadata$plasma_ratio,]sub2<-data[data$tissue_ratio
bioyangyang
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2022-04-12 15:45
用R语言画日历
在本文中,以年为单位的日历图我们使用基于
ggplot2
衍生的ggTimeSeries包两种函数作图,以月为单位的日历图我们使用ggplot和openair包两种方法作图数据说明年日历图数据
chongminglun
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2022-04-07 07:21
数据可视化
可视化
ggplot2
r语言
python画离散图_Python-matplotlib 学术型散点图绘制
首先我们看一下下面这幅图:(图片来源于网络,如有侵权,望告知,删除,谢谢)从该图可以看出,这是用
ggplot2
绘制的相关性散点图(别问我为啥,第一感觉就是),需要的数据量极大且颜色代表了散点密度大小。
weixin_39926540
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2022-04-02 07:54
python画离散图
plot函数_「R」快速探索数据的几个基础函数
ggplot2
并不是R绘制图形的唯一方法。要快速探索数据,有时使用R基础包中的绘图函数会很有用。这些函数随R软件默认安装,无需另行安装附加包。它们简短易输入,处理简单问题时使用方便,且运行速度极快。
weixin_39581571
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2022-04-02 07:52
plot函数
r语言ggplot2
多线图绘制图例
r语言plot函数x轴y轴名字
r语言折线图把横坐标改为字符
没有ggplot这个函数
5 类图形为你展示—变量间相互关系—提供示例与完整代码-
ggplot2
-geom_point-ComplexHeatmap-pheatmap-ggpairs
gzh原文点我,欢迎同时关注在数据分析过程中,我们经常碰到想要直观获取两个或多个变量间相互关系的情况。本期就介绍5种常用于展示变量间相互关系的图形,并给出常用示例图形及对应的完整可复现代码1、散点图散点图用于表示2个数字变量之间的关系。散点图中每个数据点,其第一个变量的值在X轴上表示,第二个在Y轴上表示常见问题&处理方法数据重叠(过度绘制)缩小散点大小调整散点透明度对数据取样(lessismore
生信小书生
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2022-03-24 15:40
ggplot2
|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗?
本文首发于“生信补给站”,
ggplot2
|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗?更多关于R语言,
ggplot2
绘图,生信分析的内容,敬请关注小号。
生信补给站
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2022-03-21 05:29
ggplot2
可视化
生物信息学
R
ggplot2
Manhattan
生信
可视化
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