科研绘图系列：R语言富集散点图（enrichment scatter plot）

介绍

富集通路散点图（Enrichment Pathway Scatter Plot）是一种数据可视化工具，用于展示基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA）的结果。

横坐标是对应基因名称，纵坐标是通路名称，图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue，可以简单理解为不同环境下的贡献大小。

加载R包

导入所需要的R包，在导入前需要用户自己安装。

library(readxl)
library(tidyverse)
library(reshape2)

# rm(list = ls())
options(stringsAsFactors = F)
options(future.globals.maxSize = 1000 * 1024^2)

导入数据

数据可从以下链接下载（画图所需要的所有数据）：

• 百度云盘链接: https://pan.baidu.com/