构建生物医学知识图谱from zero to hero (4):通过Neo4j构建知识图谱

图数据库是一种专门用于存储图形数据的 NoSQL 数据库。与传统的关系型数据库和其他 NoSQL 数据库不同,图数据库利用图形数据模型来存储和管理数据。图形数据模型由节点和边组成,节点代表实体,边代表实体之间的关系。例如,在社交网络中,用户可以表示为节点,朋友关系可以表示为边。

图数据库具有以下特点:

  1. 灵活的数据模型:图数据库采用图形数据模型,可以灵活地存储和表示各种类型的数据,例如社交网络、地图、知识图谱等。
  2. 快速的图形遍历:图数据库可以快速地遍历图形数据,通过节点和边之间的关系来发现数据之间的联系和模式,可以用于实现推荐系统、路径分析等功能。
  3. 高性能的查询和事务处理:图数据库支持高效的查询和事务处理,可以处理大规模的图形数据和高并发请求,具有较高的性能和可扩展性。
  4. 可视化和交互性:图数据库可以通过图形界面来可视化和交互数据,使用户可以更加直观地理解和操作数据。

Neo4j使用图相关的概念来描述数据模型,把数据保存为图中的节点以及节点之间的关系。数据主要由三部分构成:

  • 节点。节点表示对象实例,每个节点有唯一的ID区别其它节点,节点带有属性;
  • 关系。就是图里面的边,连接两个节点,另外这里的关系是有向的并带有属性;
  • 属性。key-value对,存在于节点和关系中,如图1所示。
    构建生物医学知识图谱from zero to hero (4):通过Neo4j构建知识图谱_第1张图片
    图 1 节点、关系和属性三者的关系

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