sybyl基础操作

1. 打开软件设置路径:Option-Set-Default Directory

    每次关闭软件都要进行一次

路径保存

2 .建立数据库:File-Database-New-命名数据库(出现在下方)

3. 画结构 进行(结构)能量优化:sketch(苯环图形)-画完结构都要加氢(有快捷键)-

 Compute-Minimize-Molecule-弹出选项框(里面有个最大迭代数(理论上值越大越好设定2000)

Modify-charge -小分子选Huckel,大分子选MMFF94 用这些算法优化

综上,已处理好一个分子,然后将分子放进刚建立的数据库 File-Database-Get Molecule




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