【samtools】运行报错: error while loading shared libraries：libcrypto.so.1.0.0或libncurses.so.5或libtinfow...

samtools用conda安装后，总是出现共享库缺失的报错。即便你刚安装samtools时可以用，但后面在同一环境中安装其他相关软件，有可能产生了冲突，导致库替换，因而报错。

避免这种情况，可能最好是给samtools单独一个环境。但我不喜欢这样，我的习惯是一般做一件事才建一个环境，不然环境太多了，我自己都忘了。

网上很多回答分析原因说：samtools的版本已经在1.9以上了，但是conda安装的samtools版本依然是1.7。所以建议强制安装1.9版本：conda install -c bioconda samtools=1.9 --force-reinstall

这回答有可能对某些人管用。但其实conda已经早到1.9以上了：conda search samtools

image.png

我装的版本默认已经是1.10，仍然缺这库那库的。总之，仍然是依赖库的版本不匹配。

这一问题在github有很多issue，如libtinfow.so.5

开发者建议从别处软链接过来（降级）。

比如，我的samtools缺libcrypto.so.1.0.0，libncurses.so.5，libtinfow.so.5。
先找到其他软件的相同依赖库，软链接为以上名称即可。

find ./ -name "libtinfow*"
ln -s ../../predict/lib/libtinfow.so.6 libtinfow.so.5

image.png

其他缺失库类似，如失败，可多尝试几个。相邻版本之间并无太大差异。

ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0
ln -s /lib64/libbz2.so.1 /usr/lib64/libbz2.so.1.0

https://www.cnblogs.com/emanlee/p/7325171.html
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https://www.jianshu.com/p/093522c89aef