16S测序分析（四）用MaAsLin寻找组间差异细菌

导读

MaAsLin（Multivariate Analysis by Linear Models，多变量线性回归模型）
功能：相关性分析
特点：多表型同时分析，矫正协变量
数据输入：表型，微生物群丰度或功能
数据类型：连续型，布尔型（二分类型），离散型
数据要求：矫正到1

MaAsLin在线工具地址：https://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/

一、输入数据

格式应如下：

图片.png

二、数据上传

上传方法同上一篇LEfSe，如下：

图片.png

图片.png

三、MaAsLin分析

点点点，一键执行。

图片.png

四、分析结果

在右侧的数据栏中双击分析结果，保存，结果文件如下：

一个变量产生一个结果文件（仅介绍内容，数据与前面有不同）

其中output-biplot.pdf是结果汇总图，由NMDS结合回归拟合分析得到

打开其中一个文件，内容格式如下：

图片.png

第一列：变量名
第二列：菌名称
第三列：回归系数
分类变量（+：组内>对照；-：对照>组内）
连续变量（+：正相关；-：负相关）
第四列：样本数
第五列：非0样本数
第六列：P值
第七列：多重矫正后P值

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