FSL的安装

集群Linux环境下安装FSL

1.下载安装包
从FSL官网中[link]https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation/Linux下载合适的Linux版本的fsl安装包，名称为fslinstaller.py

2.安装
在该文件所在路径下打开命令窗口，使用命令：

su root

进入root权限（需要输入集群root权限的密码，可询问管理人员）

保证在python2版本环境下，命令窗口内输入 ：

python installer.py

等待下载安装至100%（此处不用管，等安装完成即可）
3.环境配置
此时在终端输入fsl命令会出现：

fsl:command not found

在终端输入命令：

gedit ~/.bash_profile

在出现的窗口末尾输入下列字段：

FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH

此时环境配置已完成。若输入fsl后人出现命令不可用的提示，请重启该终端后输入：

source ~/.bash_profile

此时输入fsl即可弹出如下窗口：