小技巧2-melt()函数转换

我们常见的数据一般长这样：

image.png

作图时常用的形式是这样：（这个就是melt型数据）

image.png

图片来源：[pandas]处理pcr数据的时候，melt真是好东西呀 - 路人乙小明的文章 - 知乎
https://zhuanlan.zhihu.com/p/58474925

ggplot2常用melt型数据，excel里手动进行转换很麻烦

使用reshape2包里的melt()函数就很方便了

melt()函数

melt(data,id.vars,measure.vars,variable.name=“variable”,…,na.rm=FALSE,value.name=“value”,factorsAsStrings=TRUE)

id.vars:标识变量（依旧在列上，保持不变的变量）
measure.vars：度量变量（我们想要放进同一列的变量）
variable.name：为新列取名，如果不取名，默认新增列的列名就是“variable”
value.name：新列对应值所在的变量名

变换需指定哪些数据是id variables，哪些是measured variables

举例1：

plot.png

library(reshape2)
# ggplot2常用melt型数据
#使用σf作为数值一列所在列名
plot_melt = melt(plot, value.name = "σf")

注意！这里没有指定“id.vars”和“measure.vars”，所以默认了第一列为的“id.vars（不做变动的列）”，其余所有列都作为“measure.vars（需要melt转换的列）”

plot_melt.png

如果是复杂一些的表格，则必须明确指出“id.vars”或“measure.vars”：
举例2：
这里"Time[s]"和"Temperature[C]"两列是想要固定不变的列，后三列为3次重复实验的数据，需要转换为melt格式

plot2.png

plot2_melt= melt(plot2,
                  id.vars = c("Time [s]","Temperature [°C]"),
                  value.name = "First Derivative")
##same as:
plot2_melt= melt(plot2,
                  id.vars = c("Time [s]","Temperature [°C]"),
                  measure.vars = c("First Derivative_1","First Derivative_2","First Derivative_3"),
                  value.name = "First Derivative")
##只指定id.vars，其余所有列都会视为measure.vars，反之同样。

melt后得到的数据如下：

plot2_melt.png

“小技巧”系列是我在实际使用中遇到的，又容易忘记的小知识点。记录下来，分享的同时，以备自己查询