分子动力学模拟学习——VMD安装

下载VMD

参考的是昌南何许人的教程

sudo apt-get instal csh libstdc++5

wget http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/vmd-1.9.3/files/final/vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz

gunzip vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz 

tar -xvf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar

cd vmd-1.9.3
sudo  ./configure LINUXAMD64
sudo ./configure
cd src
sudo make install

前面的步骤都没有遇见问题，之后直到最后的sudo make install，无法运行。后来尝试make install，界面出现提示，按照提示操作后重复sudo make install就安装好了。
同时我采用同样的方法下载了NAMD，并解压

wget https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/cvs/download/741376/NAMD_Git-2019-12-03_Linux-x86_64-multicore.tar.gz
gunzip NAMD_Git-2019-12-03_Linux-x86_64-multicore.tar.gz
tar -xvf NAMD_Git-2019-12-03_Linux-x86_64-multicore.tar