tidyverse 第3页

R数据科学--第一步安装

1.Rhttps://cloud.r-project.org2.Rstudiohttp://www.rstudio.com/download最好默认安装，否则容易出错3.tidyverse--一个R包合集

Seurat_·2023-10-06 07:54

基因家族分析(4)ggtree绘制高端进化树

进阶一点的便会使用iTOL，evolview等2款在线绘图平台，然而这并不是本文所要介绍的重点，本节来介绍如何使用ggtree来绘制系统发育树，自从有了ggtree进化树绘制从未如此简单加载R包library(tidyverse

R语言数据分析指南·2023-10-06 02:25

R语言中的数据重塑

文章目录介绍reshape2::melt()的用法实例reshape2::dcast()的用法实例tidyr::gather()的用法tidyr::spread()的用法介绍tidyverse系列包中的函数操作都是针对简洁数据框进行的

zoujiahui_2018·2023-09-29 00:17

ggplot2再话箱线图之几何填充

；在原有的基础上做了一些小的改动也许恰好您正好有此特殊需求，需要着重体会八个字变实为虚，变虚为实，希望对各位观众老爷有所帮助；下面来看具体案例；需要获取数据的欢迎关注我的号留言加载R包library(tidyverse

R语言数据分析指南·2023-09-26 06:32

R语言检查系统生成环境Session info

>devtools::session_info(c("tidyverse"))-Sessioninfo--------------------------------------------------

Seurat_·2023-09-24 17:03

R语言绘制环状柱状堆积图+分组+显著性

code-main/条形图")#加载R包library(ggplot2)#CreateElegantDataVisualisationsUsingtheGrammarofGraphicslibrary(tidyverse

清纯世纪·2023-09-24 16:35

R语言编程-Tidyverse 书籍 - R Markdown

RMarkdown是Markdown在R中的延伸。除了具备一般Markdown语法功能之外，最关键的是可以在Rmarkdown中插入代码块，并能运行代码，将代码运行结果显示出来。其作用：image.pngimage.png编译过程.Rmd文件提交给knitr后，将执行代码块创建一个新的包含代码和运行结果的Markdown文件（.md），再被Pandoc处理生成最终的输出文件。image.png1常

Hello育种·2023-09-24 13:23

箱线图进行方差分析并添加显著性标记

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何在计算多样性指数的基础上来进行显著性标记，可在文末找到获取数据的方式加载R包library(tidyverse)library(vegan)library(magrittr

R语言数据分析指南·2023-09-21 20:37

ggraph优雅的绘制环状网络图

ggraph绘制圆形网络图，这里使用了一个R包ccgraph，各位观众老爷细细体会，下面通过一个小例子来进行展示加载R包library(tidygraph)library(ggraph)library(tidyverse

R语言数据分析指南·2023-09-20 07:40

r语言相关性作图_R语言学习指南(6) 初探相关性热图

PP鲁·2023-09-20 03:35

R数据科学chapter 1

install.packages("tidyverse")library(tidyverse)mpg?

枸杞子岛年·2023-09-20 01:07

R数据科学第五章DEA-day1

准备工作：library(tidyverse)2.问题(1)变量本身会发生何种变动？(2)不同变量之间会发生何种相关变动？3.变动变动是每次测量时数据值的变化趋势。3.1对分

梦幻天堂_ccd5·2023-09-18 15:12

R数据科学chapter6

library(tidyverse)#多数其他R包使用的是标准数据框#使用as_tibble()函数来完成将数据框转换为tibble:as_tibble(iris)#可以通过tibble()函数使用一个向量来创建新

枸杞子岛年·2023-09-16 15:02

R字符串操作

实例library(tidyverse)//生成一个tribble表df%mutate(x2=str_split(x1,","))%>%unnest()//将

冬之心·2023-09-14 11:59

前言+第一章：使用ggplot2 进行数据可视化

清洁数据：每列都是一个变量每行都是一个观测tidyverse：ggplot2tibblereadrpurrrdplyr更新：tidyverse_update（）（别老瞎更新）第一章：使用ggplot2进行数据可视化

致知_5974·2023-09-09 11:14

tidyverse|数据分析常规操作-分组汇总（sumamrise+group_by)

|本文首发于“生信补给站”https://mp.weixin.qq.com/s/tQt0ezYJj3H7x3aWZmKVEQ一summarise汇总汇总函数summarize()，可以将数据框折叠成一行,多与group_by()结合使用1.1summarize完成指定变量的汇总统计均值，标准差，最小值，个数和逻辑值library(dplyr)iris%>%summarise(mean(Petal.

生信补给站·2023-09-09 05:54

简单的违约特征探索

pan.baidu.com/s/1mjg8OGSNote:本文同时用了dplyr包（处理速度很快）和sqldf包（sql语句写起来比较方便，但是速度没有dplyr快）的方法进行数据整理导入数据library(tidyverse

鸣人吃土豆·2023-09-08 19:46

学习小组Day6笔记——TheCatcher

安装和加载tidyr包因为之前安装过tidyverse包，已经将tidyr包含在内，所以就直接library啦，不过以防将来需要，还是学习一下更换镜像的方法tools->globaloptions->packages

The_Catcher·2023-09-08 08:11

R数据科学chapter8

library(tidyverse)#使用readr进行数据导入#•read_csv()读取逗号分隔文件、#read_csv2()读取分号分隔文件(这在用,表示小数位的国家非常普遍)、#read_tsv

枸杞子岛年·2023-09-05 08:33

R语言---使用runway进行机器学习模型性能的比较

R语言—使用runway进行机器学习模型性能的比较#dataloadrm(list=ls())#librarylibrary(dcurves)library(gtsummary)library(tidyverse

MRI_lab·2023-09-04 15:19

Gviz绘制基因isoform结构

TheGvizUserGuideisoform结构绘图----R包Gviz(IGV菀菀类卿)需要从GTF文件中提取并准备数据rm(list=ls())suppressMessages(library(tidyverse

落寞的橙子·2023-09-02 19:43

如何解决 R CMD CHECK 出现 NOTE:： No visible binding for global variable

虽然初始目的是为了交互运行的时候减少代码输入方便计算，随着tidyverse兴起，大大增加了数据分析效率，NSE用途也越来越广，许多新开发的包都依赖一些采用了NSE的函数。

饮食有度的元气少女·2023-08-31 02:17

利用R作圆环条形图

需要以下步骤：数据处理，将EXCEL中的数据做成3*N的表格导入系统，代码如下：library(tidyverse)library(stringr)library(ggplot2)library(viridis

criket·2023-08-30 07:33

R包tidyr，数据预处理

Introducingtidyr：tidyrisnewpackagethatmakesiteasyto“tidy”yourdata.安装失败，尝试安装“tidyverse”包，加载失败报错，报错如下：─

赵会成·2023-08-29 14:43

R 第七章tibble

>#使用tibble>library(tidyverse)>atibble(+x=1:5,+y=1,+z=x^2+y+)#Atibble:5x3xyz11122215331104411755126>>x

liyin_d64b·2023-08-23 14:27

Slingshot | 细胞分化轨迹的这样做比较简单哦！~（一）

2用到的包rm(list=ls())library(slingshot)library(tidyverse)library(uwot)library(mclust)library(RColorBrewer

生信漫卷·2023-08-21 02:23

R - 一行代码从向量中生成两两组合并且生成tibble

个子网络，生成两个子网络之间的连接强度.mod.label=c('SUB','VN','SMN','DAN','VAN','LM','FPN','DMN')网络组合有C(8,2)=4*7=28种预期结果在tidyverse

Lairai·2023-08-20 23:10

R数据科学chapter10

#使用stringr处理字符串#正则表达式(regularexpression，regexp)library(tidyverse)library(stringr)#字符串基础#可以使用单引号或双引号来创建字符串

枸杞子岛年·2023-08-19 14:02

Chord diagram | 啧啧啧！~人人必会的Chord diagram你不来学一学吗！？

2用到的包rm(list=ls())library(tidyverse

生信漫卷·2023-08-17 16:25

Dendrogram | 今天是人见人爱、花见花开的环形Dendrogram！~（附完整代码）

~2用到的包rm(list=ls())library(ggraph)library(igraph)library(tidyverse)library(RColorBrewer

生信漫卷·2023-08-17 16:55

ggrisk | 高分文章必备的三图联动就这样轻松搞定哦！~（附完整教程）

2用到的包rm(list=ls())library(tidyverse)library(g

生信漫卷·2023-08-17 16:55

Wordcloud | 风中有朵雨做的‘词云‘哦！~

2用到的包rm(list=ls())library(tidyverse)library(tm)library(wordcloud)3示例数据这里我准

生信漫卷·2023-08-17 16:25

自制函数【rep_words】

rm(list=ls())library(tidyverse)AA<-read.table("测试文档.txt")class(AA)length(row.names(AA))#x=AAc=6a=3for

医只蜗牛·2023-08-17 14:34

[数据分析与可视化] 数据绘图要点3-意大利面条图

#Librarieslibrary(tidyverse)library(hrbrthemes)library(kable

落痕的寒假·2023-08-16 10:57

R数据科学--使用ggplot2进行数据可视化1

library(tidyverse)基础作图ggplot(data=mpg)+geom_point(mapping=aes(x=displ,y=hwy))分别设好xy轴及数据集即可image.png加颜色

Seurat_·2023-08-14 08:25

Entrez ID 和 gene symbol 和 Ensembl ID转换

手动迁入编程版library(AnnotationDbi)library(org.Hs.eg.db)library(tidyverse)如果你有基因gene%unlist()g%unlist()mget

茅逗逗·2023-08-14 06:02

R语言列表中嵌套列名一致的多个数据框如何整合为一个数据框

载入R包library(broom)library(tidyverse)模拟数据models%group_by(city)%>%do(mod=lm(log2(sales)~factor(month),data

茅逗逗·2023-08-14 06:30

数据框筛选和GO富集的小操作

比如下面这个数据框#gene是我随机抽取的基因library(tidyverse)library(clusterProfiler)library(org.At.tair.db)data.frame(gene

城管大队哈队长·2023-08-14 04:40

ggplot2优雅的自定义轴文本颜色

今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象的前提下在图形的原有的基础上自定义修改轴文本颜色，也许恰好您正好有此特殊需求，希望对各位观众老爷有所帮助；下面来看具体案例；加载R包library(tidyverse

R语言数据分析指南·2023-08-13 17:10

ggplot学习笔记（五）

library(tidyverse)extract_lmr%select(country,year,lifeExp)%>%group_by(country)%>%nest(data=c(year,lifeExp

财富经略·2023-08-13 14:06

基于R做宏基因组结果的PCoA分析

参考原本结果已有的PCA图，尽可能挑选距离较远且聚团的样本选取不同样本属水平的丰度数据，整理成逗号分隔的csv文件代码演示library(vegan)#计算bray距离library(ggplot2)library(tidyverse

twocanis·2023-08-12 15:06

R语言之探索性数据分析1

首先得把dplyr和ggplot2知识综合起来如果没有安装tidyverse这个包的话，会出现错误提示library(tidyverse)Errorinlibrary(tidyverse):不存在叫‘tidyverse

分享之家·2023-08-11 03:46

首次安装RStudio后，一定要做如下操作

如果不修改，你可以试一下，在安装tidyverse包时候，

饮食有度的元气少女·2023-08-09 02:56

2020-05-10 dplyr包中的distinct()函数

而distinct()函数则是专门为数据框设计的，这也与tidyverse系列包的宗旨一致。

cppcwang·2023-08-07 15:48

R语言 tidyverse系列学习笔记（系列6）数据分析之写入导出多个文件

mypath="/User/sample_files"list.files(path=my_pah,full.names=TRUE)#筛选出_+数字+dot+csv结尾的文件list.files(path=my_pah,pattern="_\\d.csv$")my_file_dir=list.files(path=my_pah,pattern="_\\d.csv$",full.names=TRUE

来份芒果布丁·2023-08-07 05:12

R中可以处理因子的一切-forcats包（二）

library(tidyverse)rm(list=ls())options(stringsAsFactors=T)#构建测试数据集df%select(c("rincome","denom"))head

灵活胖子的进步之路·2023-08-06 14:46

TCGA差异分析——limma, DEseq2, edgeR

一、数据整理这里我们需要count矩阵，以及对应的分组信息rm(list=ls())library(tidyverse)library(limma)lib

芋圆学徒·2023-08-06 11:41

R语言【Tidyverse、Tidymodel】的机器学习方法

在各种语言中，R语言以编程简单，方法先进脱颖而出,本次机器学习基于现代Ｒ语言，Tidyverse,Tidymodel语法。点击查看原文h

Mr.靳靳477302280·2023-08-02 14:52

R语言 Mutate家族

日月其除·2023-08-02 07:48

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