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r语言ggplot2
时间序列分析的基本流程(
R语言
版——实验篇)
数据处理1.导入数据(.csv)能导入绝大所数形式的格式文件ex52f1f1Call:arima(x=delatex_52series,order=c(3,0,0))Coefficients:ar1ar2ar3intercept-0.7603-0.7078-0.57050.0186s.e.0.08180.08500.08160.1815sigma^2estimatedas29.34:loglike
今日说"法"
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2023-04-18 23:31
笔记
数学建模
算法
r语言
开发语言
R语言
贝叶斯方法在生态环境领域中的高阶技术应用
贝叶斯统计已经被广泛应用到物理学、生态学、心理学、计算机、哲学等各个学术领域,其火爆程度已经跨越了学术圈,如促使其自成统计江湖一派的贝叶斯定理在热播美剧《TheBigBangTheory》中都要秀一把。贝叶斯统计学即贝叶斯学派是一门基本思想与传统基于频率思想的统计学即频率学派完全不同的统计学方法,它在统计建模中具有灵活性和先进性特点,使其可以轻松应对复杂数据和模型结构。然而,很多初学者在面对思想、
WangYan2022
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2023-04-18 23:31
生态
R语言
r语言
贝叶斯方法
R语言
地理加权回归数据分析
本次培训从局部加权回归开始,详细讲述了基于
R语言
的空间异质性数据分析方法。专题一:地理加权回
天青色等烟雨..
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2023-04-18 23:30
遥感
地质
地学
r语言
R语言
地理加权回归、主成份分析、判别分析等空间异质性数据分析
本次培训从局部加权回归开始,详细讲述了基于
R语言
的空间异质性数据分析方法。专题一:地理加权回
思考的小猴子
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2023-04-18 23:00
r语言
回归
数据分析
R语言
指数平滑预测法分析南京出租车打车软件空载率时间序列补贴政策可行性
报告链接:http://tecdat.cn/?p=32161原文出处:拓端数据部落公众号本文通过建立空载率的数学模型,帮助客户来分析出租车的空载率,从而对出租车补贴政策能否提高高峰期的实载率,缓解打车难问题进行了说明。分析思路1.利用这么多天的数据,按照算法先算出每天的日平今年空载率,绘制成曲线2利用一次平滑预测模型算出这么多天的预测日平均空载率,其中的平滑常数分别带入我假设的那三种数值,求出预测
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2023-04-18 22:04
数据挖掘深度学习人工智能算法
数据分享|
R语言
决策树和随机森林分类电信公司用户流失churn数据和参数调优、ROC曲线可视化|附代码数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=26868最近我们被客户要求撰写关于电信公司用户流失的研究报告,包括一些图形和统计输出。在本教程中,我们将学习覆盖决策树和随机森林。这些是可用于分类或回归的监督学习算法下面的代码将加载本教程所需的包和数据集。library(tidyverse)# 电信客户流失率数据churn % trang()chuest % tesg()#在训练数据集上创建交叉
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2023-04-18 22:40
数据挖掘深度学习机器学习算法
R 语言怎么保存工作目录到当前路径_
R语言
--创建(编写)R包
一、在电脑的那个位置创建自己的R包?编写R包的第一步就是要知到在哪里可以写包,电脑的任何位置,只要能够创建文件夹的地方都可以写R包,但是文件的路径要是英文。简单的方法就是在DEF等盘下直接创建一个文件夹,命名为所要创建包的名字,如:E:ProgramDataMyRPackageFirstp二、编写R包的架构以及整个流程。一个R包就是由很多文件构成的集合,这里面既有函数,又有能够帮助读者理解的帮助文
weixin_39792049
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2023-04-18 20:15
R
语言怎么保存工作目录到当前路径
R语言
包
R语言
命令行写linux,如何在Linux上编写和使用R脚本
——by不是杀杀虽然大多数时候在Windows下和在Jupyter中能够非常方便快捷地进行
R语言
编程,但对于处理数据量较大的工作时,还是避免不了需要在服务器上运行我们写的代码,那么我们要如何方便快捷地将代码编写成脚本移植到服务器上运行呢
大章鱼啊没秘密
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2023-04-18 20:45
R语言命令行写linux
R包开发的标准姿势
R包开发对
R语言
编程能力提升有极大帮助,更能方便理解他人编写的包,而不仅仅调参。
R语言
已经存在上万的开源包,总会有一个包满足需求。当一个真香的调参侠才可节省时间。以windows系统为平台,
「已注销」
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2023-04-18 20:44
R语言
R语言
R包开发
devtools
dummy
哑变量
R语言
中的绘图技巧1:plot()函数参数汇总
文章目录plot()函数函数形式及参数**type**参数pch参数lty参数bty参数adj参数可以控制文字的对齐方式实例par函数参数介绍控制文字或字符大小颜色字体坐标轴实例坐标轴延长坐标轴不显示points函数实例lines函数实例ablines函数实例axis函数函数形式及参数介绍实例实例1实例2title函数实例text函数实例mtext函数实例segments函数实例symbols函数
zoujiahui_2018
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2023-04-18 20:14
R
r语言
开发语言
经纬度坐标和笛卡尔坐标的相互转换--
r语言
写论文想找GPS坐标转笛卡尔坐标的方法,搜了一圈,大多是通过编程、arcgis等方式,转换方式很复杂,小叶子现将发现的一种简单的方法分享给大家。第一步,将你的经纬度坐标按图1所示整理,lon代表经度,lat代表纬度。ps:我一般是将excel表格保存成csv格式,习惯啦。后面需要用到“SoDA"包,先提前下载好噢。图1第二步当然是直接上手啦。```library("SoDA")#导入经纬度坐标数据
发hong的小叶子
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2023-04-18 18:37
R语言
GEO数据挖掘:步骤四:富集分析KEGG,GO
1.读取第三部存储数据(基因差异表达情况)rm(list=ls())##魔幻操作,一键清空~load(file='deg.Rdata')head(deg)deg2.设定阈值计算基因上调下调数量##不同的阈值,筛选到的差异基因数量就不一样,后面的超几何分布检验结果就大相径庭。logFC_t=1.5deg$g=ifelse(deg$P.Value>0.05,'stable',ifelse(deg$lo
mayoneday
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2023-04-18 18:18
Fig2-c 纵轴log化的带标签散点图Scatter Plot的绘制 2020-12-14
image.png重点:1)散点图上带标签2)纵轴log化(即:
ggplot2
::scale_y_log10()的应用)具体实现如下:3.7.1数据格式image.png读取数据:l1<-read.csv
RashidinAbdu
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2023-04-18 16:00
【
R语言
入门】
R语言
环境搭建
说明
R语言
是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。
R语言
作为一个功能十分强大的工具,几乎绝大多数的数据分析工作都可以在R中完成。
沧海拾贝
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2023-04-18 11:12
利用
R语言
作PPI(免String网页和安装cytoscape法)
原创来自https://mp.weixin.qq.com/s/xw-x_r9yq6Iiw-4LwyKvWw,本人稍作修改,原文是针对小鼠,现改为人类当得到差异基因后,很多时候需要作PPI蛋白互作网络,一般需要登陆STRING网站,然后用cytoscape软件作图,本文将通过R包STRINGdb(记住是大写,这个包是bioconductor里的,默认的CRAN里有个stringdb,名字一模一样,但
欧阳松
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2023-04-18 08:27
R语言
批量去掉“双引号”
在GEO读取矩阵文件,或者其他文件的时候常常会碰到下面这样的情况表格中的字符串带上了双引号表格中的字符串带上了双引号,我们可以提取第一列第一行出来变成字符串后带两个双引号这样对后面的ID转化非常不方便,所以我们要去掉双引号代码如下b=gsub('["]','',a)但是要注意的是,我们是一整个矩阵,有几千行,不可能一行行来操作,所以必须要使用循环语句##nrow(AA)-----这个矩阵的行数fo
每天都在进步的FFOO
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2023-04-18 06:10
ggplot2
:在一幅图中插入另外一幅图
需求我用
ggplot2
做了两幅图:柱形图library(
ggplot2
)df<-data.frame(x=LETTERS[1:10],y=10:1)dfggplot()+geom_bar(data=df
小明的数据分析笔记本
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2023-04-18 06:23
左手Python 右手R —— 最大公约数和最小公倍数
Python右手R——最大公约数和最小公倍数前言1、最大公约数1.1约数1.2最大公约数1.3求解方法2、最小公倍数2.1倍数2.2最小公倍数2.3求解方法3、程序实现3.1python代码实现3.2
R语言
代码实现小结创作不易
铭记yu心
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2023-04-18 06:37
左手python—右手R
python
r语言
机器学习
数据挖掘
人工智能
R package:
ggplot2
画中国地图
1.安装包install.packages("rgdal")install.packages("
ggplot2
")2.读取地图2.1读取省界地图m1<-rgdal::readOGR("..
佳名
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2023-04-18 04:11
R语言
可视化之
ggplot2
——KEGG通路富集分析
之前分享了如何用
ggplot2
可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。1.数据准备同样的,我们从DAVID获取KEGGpathway的结果。
zrh_h
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2023-04-18 03:06
《Advanced R》学习笔记 | Chapter3 Vectors
专注系列化、高质量的
R语言
教程推文索引|联系小编|付费合集本篇推文是学堂君学习第3章“Vectors”的笔记,原文链接是https://adv-r.hadley.nz/vectors-chap.html
R语言学堂
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2023-04-18 03:36
r语言
学习
笔记
开发语言
R语言
系列1:数据结构、数据导入和常用函数
R语言
系列1:数据结构、数据导入和常用函数此文内容为《
R语言
实战》的笔记,人民邮电出版社出版。
爱吃汉堡薯条
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2023-04-18 01:27
学生党
R语言
入门手册!终于截稿
1什么是
R语言
R语言
是一个开源的数据分析环境,起初是由数位统计学家建立起来,以更好的进行统计计算和绘图,这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。
童欣
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2023-04-18 00:16
R语言
stringr包处理字符串
stringr包是R数据处理神器Tidyverse包中的工具之一,是处理字符串很好用的工具,结合正则表达式,可以发挥巨大作用。字符串长度stringr包的操作对象是向量,str_length()函数用于确定字符串长度。>xstr_length(x)#>[1]355549但是如果是下面这种写法,便会出现语法错误,因为输入对象是非向量。>str_length("why","video","cross"
亘心37
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2023-04-17 17:17
2-14 |“特殊”的日子,多学一种表达爱的方式
首发于“生信补给站”https://mp.weixin.qq.com/s/U8yzX-BYQ6wdZObkBz8ecw全世界所有的语言都有表达爱意的方式,
R语言
当然也有!
生信补给站
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2023-04-17 16:56
学习小组Day5笔记-- 乳酸君
Day5向量与数据框向量向量的概念在
R语言
当中,元素指代的是字符串、数字等数据类型,可分为标量和向量。向量提示我们它是有方向的,我们可以简单地将它定义为一排有序排列的元素。
soda0301
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2023-04-17 15:41
facebook社交网络分析
1.2数据预处理本社交网络分析案例是基于
R语言
程序实现的。原始数据为.txt文件,读入
R语言
中,展示如下:建立社交网络关系图:
小小孩儿的碎碎念
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2023-04-17 13:55
R语言
学习笔记 -- R markdown 输出期刊投稿用 word 格式
转发一则技术贴AbetterwaytogotoWordfromRmd。旧链接失效,可访问其github。RMarkdown是R版的Markdown,其中可以嵌入R代码和latex语句,使人们使用易读易写的纯文本格式编写文档。相比word有不少优势,重复性特别好、没有格式排版的烦恼、支持pdf矢量格式图片、参考文献管理简单等等。RMarkdown对PDF的支持性最佳,但pdf无法投稿用,RMarkd
逍遥尐生
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2023-04-17 12:30
『R画图脚本进阶』单个基因结构绘制
就用
ggplot2
撸出来了。国际惯例,上图Gh_A08G039000.jpg方法和原理其实就是把gff文件可视化一下,看GFF文件的介绍:陈连福大佬的博客-GFF3格式介
ShawnMagic
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2023-04-17 12:31
62-
R语言
防止过拟合训练神经网络模型
《深度学习精要(基于
R语言
)》学习笔记1、过拟合问题概述机器学习的一个陷阱是,越复杂的数据越有可能过拟合训练数据,因此,对相同数据训练模型的性能评价会导致有偏的、过度乐观的模型性能的估计,甚至会影响到对模型的选择
wonphen
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2023-04-17 12:04
R语言
数据的查询筛选-subset()
subset(x,subset,select,drop=FALSE,...)&多条件查询select显示指定列selectresult=subset(df1,name=="aa"&sex=="f",select=c(age,sex))负号排除指定列selectresult=subset(df1,name=="aa"&sex=="f",select=c(-age,-sex))例1:从快递帐单表中抽取
付德刚Q
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2023-04-17 11:32
矩阵转为
ggplot2
画图的数据格式
作者:ahworld链接:转换矩阵为
ggplot2
的输入格式来源:微信公众号-seqyuan著作权归作者所有,任何形式的转载都请联系作者。
seqyuan
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2023-04-17 11:23
PCA原理解读和绘制方法
⚠️该教程的PCA绘图基于
ggplot2
,可以根据
ggplot2
语法对图片进行额外的修改和保存。1.基础PCA:全称PrincipalComponentMethods,也就是主成分分析。
Hayley笔记
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2023-04-17 09:28
gganimate:
ggplot2
拓展之让你的数据high起来
gganimate:让
ggplot2
图随时而动。
码农郭
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2023-04-17 08:15
新手如何理解管道符号
R语言
的管道符号%>%出自R包tidyverse,表示前一句代码的输出作为后一句代码的输入。举个栗子补充:iris是一个
R语言
内置数据框,filter
小洁忘了怎么分身
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2023-04-17 08:58
使用
ggplot2
画 点图、箱线图、小提琴图、蜂窝图、云雨图
使用
ggplot2
画点图、箱线图、小提琴图、蜂窝图、云雨图加载包library(tidyverse)library(cowplot)library(ggrepel)library(ggsci)library
μμ豆奶
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2023-04-17 07:27
r语言
r语言
R语言
做单因素方差分析
R语言
做单因素方差分析检验三组与三组以上数据(需满足正态,方差,独立)整理数据保存CSV格式打开Rstudiogetwd()#查看工作目录read.csv("filename")df<-read.csv
μμ豆奶
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2023-04-17 07:26
r语言
CCLE:求任意基因的相关性
进行肿瘤的研究,求两个或多个基因的相关性,可以用GEPIA2或者直接下载数据用
R语言
处理,如果能再加上细胞系的相关性就能完美了。下面就分享下,手动下载CCLE测序数据,求任意两个基因的相关性。
高大石头
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2023-04-17 02:18
在jupyter notebook中使用
R语言
在jupyternotebook中使用
R语言
2018年09月17日15:52:14一窗星乱银河静阅读数:2677标签:
R语言
jupyternotebook更多个人分类:
R语言
学习笔记R的安装R的安装网上教程很多
榴莲气象
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2023-04-17 01:33
nomogram by R language_04Jul2020
目的:使用
R语言
结合某些包实现nomogram(列线图)绘制。缘起:由于偶然的机会,学到了这种图的画法,及其解读,在此作为笔记记录。
liang_rujiang
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2023-04-16 20:00
R语言
机器学习与临床预测模型21--预测模型的评价指标
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】00混淆矩阵混淆矩阵包含四部分的信息:
科研私家菜
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2023-04-16 19:20
R语言
网页版笔记
给大家分享一些写的比较好的
R语言
笔记(或者称教程也可以),由于是我自己在网上看到的别人的笔记,所以这个是不定期更新的,那天看到有好的笔记,就会将链接分享到这里。
淡水鱼Ada
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2023-04-16 14:21
R-
ggplot2
-今天来说说坐标轴在绘图过程中出现乱序的问题
目录0.问题导入1.随机生成示例数据2.默认数据可视化(图1)3.字母加数字内置顺序排列错误排除4.字母+数字内置顺序排列错误排除后结果可视化(图2)5.字符串排列问题示例数据生成6.R中字符串顺序排列示例(图3)7.自定义横轴顺序8.自定义横轴顺序后结果可视化(图4)9.本篇总结10.本文所用到package(若没有需要通过install.packages进行安装)11.致谢0.问题导入有时候,
TroyShen
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2023-04-16 13:21
为Jupyter Notebook安装R Kernel
我们都知道在生物信息学领域,
R语言
发挥着极其重要的价值,相信大家平时进行个性化数据分析或者利用R进行工具开发时,主要用到的还是⬇⬇⬇。也就是最经典的
R语言
集成开发环境,RStudio⬇⬇⬇。
林枫bioinfo
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2023-04-16 11:25
学习小组Day4笔记-- Joanna
rnorm(50))image.png输入boxplot(irisSpecies,col=c("lightblue","lightyellow","lightpink"))image.pngiris是一个
R语言
十步芳艸
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2023-04-16 06:59
R语言
实战—2
图形初阶pdf("mygraph.pdf")attach(mtcars)#绑定了数据框mtcarsplot(wt,mpg)#绘制散点图abline(lm(mpg~wt))#向图形添加了一条最优拟合曲线title("RegressionofMPGonWeight")#添加了标题detach(mtcars)#为数据框解除了绑定dev.off()通过执行如plot()、hist()(绘制直方图)或box
七白七白七七白
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2023-04-16 05:34
【
R语言
】---列表
列表是
R语言
的对象集合,可以用来保存不同类型的数据,可以是数字、字符串、向量、另一个列表等,当然还可以包含矩阵和函数。
奶茶可可
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2023-04-15 23:40
r语言
开发语言
R语言
机器学习方法
在各种语言中,
R语言
以编程简单,方法先进脱颖而出。基于
R语言
机器学习方法与案例分析技术应用第一章:基础知识1.机器学习的基本概念2.机器
zkzhzy
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2023-04-15 20:55
机器学习
数据可视化
R语言
r语言
机器学习
开发语言
R语言
BIOMOD2模型的物种分布模拟
根据国家林草局最新工作指示,我国将积极整合、优化自然保护地,加快推进国家公园体制试点,构建以国家公园为主体的自然保护地体系。针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题,科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特定物种与其环境之间的关系,试图利用环境变量来模拟特定物种的生态位,基于R语
zkzhzy
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2023-04-15 20:54
生物多样性
生态系统
R语言
数据分析
r语言
个人博客文章合集
不定期更新链接:博客文章合集:data.table学习笔记
ggplot2
分面填充色与字体大小
ggplot2
画箭头
ggplot2
坡度图iTOL修饰进化树NMDS分析OPLS-DA在
R语言
中的实现PCA和PERMANOVA
研究僧小蓝哥
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