r语言ggplot2

《物种起源》第一章：家养状况下的变异读后感

人们为了将数据可视化而发明的多种语言工具如R语言、python语言、C语言等；为了阐明恒定各种物理定律，科学家对各种抽象的事物进行命名如“速度、质量、引力、磁场、电场、神以及物种等”，其中物种一词至今都没有一个明确的界定
澡堂陈奕迅·2023-12-22 06:36

3.多元统计分析

学习多元统计分析与R语言截屏。但是我不会R,只会Python。所以只是用来学习一些方法。第一章概述1.1目录目录第二章多元数据的数学表达2.1R:用矩阵表示数据。行代表样本，列代表特征值。
Plenari·2023-12-22 05:50

R语言快速更新

打开R而不是Rstudio，输入：installr::updateR()没有installr包的需要安装一下，这种比上官网下载并且自己转移包要方便的多。
该叫个什么名字好呢·2023-12-22 02:02

R语言的ggplot2+ggforce包绘制散点图并添加分组边界

之前的推文介绍过ggplot2绘图添加椭圆分组边界和圆形分组边界，借助的函数分别是stat_ellipse()ggforce包里的geom_circle()函数今天查找桑基图的资料的时候发现了一份介绍ggforce
小明的数据分析笔记本·2023-12-22 00:52

R语言【base】——match.arg通过部分匹配校正参数输入，参数的输入值从首字母开始，保持连续，宁缺勿错

Packagebaseversion4.3.2match.arg通过部分匹配校正参数输入match.arg(arg,choices,several.ok=FALSE)match.arg的功能是：将参数【arg】的传入值与参数【choices】的传入值进行匹配，参数choices的传入值可以视为一个候选值列表。match.arg的参数参数【arg】：当参数【serveral.ok】为FALSE时，既
ALittleHigh·2023-12-21 19:47

R语言【invisible】——将控制台的输出模式调整为隐藏，只允许赋值后输出，返回对象的（临时）不可见副本

Packagebaseversion4.3.2invisible(x=NULL)参数【x】：一个任意的R对象，默认为NULL。如果希望函数返回的值可以赋值，但在未赋值时不打印，则可以使用该函数。f<-function(x){if(x){return(x)}else{return(invisible(x))}}f(1)f(0)只有f(1)显示结果：[1]1
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【cli】——cli_warn可以更便捷的在控制台输出警告信息

Packagecliversion3.6.2cli_warn(message,...,.envir=parent.frame())参数【message】：它是通过调用cli_bullets()进行格式化的。进一步地，还需要调用inline-makeup（内联标记）。参数【...】：传递给rlang::abort()，rlang::warn()或rlang::warn()的参数。参数【.envir】
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【assignOps】——通过超赋值符（＜＜-）向上层环境中的变量写入值，或者在上层环境中创建新变量并写入值

Packagebaseversion4.3.2在R语言中，处在某一个环境层的代码都拥有读入上一环境层的变量的权限，但相反地，若只通过标准的赋值运算符test_suprassign()[1]3>a错误
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【cli】——通过cli_abort用 cli 格式的内容显示错误、警告或信息，内部调用cli_bullets和inline-makeup

cli_abort(message,...,call=.envir,.envir=parent.frame(),.frame=.envir)先从那些不需要下大力气理解的参数入手：参数【.envir】：进行万能表达式编译的环境。参数【.frame】：抛出上下文。默认用于参数【.trace_bottom】，当参数【.internal】为TRUE时，用于确定在内部错误中提及的内部软件包。参数【call】
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

【R绘图】当图例映射color/shape等多个属性时，如何修改图例标题？

一般而言，我们修改ggplot2图例标题，常用以下三种方法：+guides(fill=guide_legend(title="NewLegendTitle"))+labs(fill="NewLegendTitle
生物信息与育种·2023-12-21 16:53

R语言机器学习与临床预测模型74--模型建立和验证的统计基础

R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01统计模型统计模型是一类数学模型，通常由一个或多个变量与近似现实相关的数学方程指定。
科研私家菜·2023-12-21 16:47

用Python画一个中国地图

为什么是Python先来聊聊为什么做数据分析一定要用Python或R语言。编程语言这么多种，Java,PHP都很成熟，但是为什么在最近热火的数据分析领域，很多人选择用Python语言？
小凶许打小脑斧·2023-12-21 15:12

R语言——文件读写（三）

目录一、获取数据二、读取文件三、写入文件四、读写Excel文件五、读写R格式的文件参考一、获取数据获取数据的三种途径：1.利用键盘来输入数据2.通过读取存储在外部文件上的数据3.通过访问数据库系统来获取数据edit()：定义一个数据编辑器，可直接输入修改数据，关闭编辑器，数据自动保存到变量中，注意这里需要将修改后的数据重新指向一个变量名，才可以成功保存fix()：可以直接修改并保存，不需要重新定义
Billie使劲学·2023-12-21 09:13

R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习技术应用

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。本教程针对
梦想的初衷~·2023-12-21 09:42

R语言——基本操作（二）

目录一、矩阵与数组二、列表三、数据框四、因子五、缺失数据六、字符串七、日期和时间参考一、矩阵与数组matrix：创建矩阵，nrow和ncol可以省略，但其值必须满足分配条件，否则会报错只写一个值则自动分配，默认按列分配byrow属性可以控制矩阵按行排列dimnames(m)：定义矩阵行和列的名字dim(x)：输出x的维度dim(x)<-c(2,5)：为x添加维度（创建数组），三个数字则为三维数组a
Billie使劲学·2023-12-21 09:41

R语言机器学习一揽子解决方案-tidymodels（Build a model）

本文为笔者从官网学习的代码实录，不对的地方请多指教！官网地址：https://www.tidymodels.org/官网介绍：Thetidymodelsframeworkisacollectionofpackagesformodelingandmachinelearningusingtidyverseprinciples.本次内容为getstarted部分的pipeline内容目录如下图内容目录载
灵活胖子的进步之路·2023-12-21 08:28

【R语言】logistic回归（一）批量单因素logistic回归

后续会继续分享一些R语言分析代码，欢迎大家一起讨论学习。
Moon_5237·2023-12-21 08:59

[原创][R语言]股票分析实战[3]:周级别涨幅趋势的相关性

[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父·2023-12-21 07:52

R 语言 | 堆积图绘制教程|收藏

绘图##date:2022.0121##author:小杜的生信筆記#堆积图rm(list=ls())library("ggplot2")导入数据decoration-color:initial;">setwd
小杜的生信筆記·2023-12-21 05:16

R语言：独立性检验函数

在R语言中，我们可以使用独立性检验函数来评估两个变量之间是否存在独立性关系。独立性检验是统计学中一种常用的方法，用于确定两个变量是否在统计上相互独立。
代码创造·2023-12-21 04:29

R语言中逻辑回归的R方求解

在R语言中，我们可以使用不同的函数和库来进行逻辑回归分析，并计算模型的R方（R-squared）值，以评估模型的拟合程度。R方是一种常见的统计指标，用于衡量回归模型对观测数据的拟合程度。
代码创造·2023-12-21 04:29

跟着PNAS学画图：R语言ggplot2分面的堆积柱形图

论文https://www.pnas.org/content/118/20/e2010588118Deathratesatspecificlifestagesmoldthesexgapinlifeexpectancyimage.png论文本地存储e2010588118.full.pdf很有意思的一篇论文，研究的内容是为什么女生比男生活的时间长（Whydowomenlivelongerthanmen
小明的数据分析笔记本·2023-12-21 03:40

R语言ggplot2绘制中国区域地图并添加河流信息的小栗子

下面是正文前几天看了几篇闫大佬绘制的中国沿海地区的地图（公众号：R语言数据分析指南），然后试着自己画了一下。大佬的代码里面只有中国主要河流的信息，没有区域河流信息。
小明的数据分析笔记本·2023-12-21 02:43

R语言|绘制组间差异柱状图

柱状图也是差异可视化图形的一种，今天小编来分享一下组间差异柱状图在R语言中的绘制方法，主要用的是ggplot2包，这个包功能的确很强大。
维凡生物·2023-12-21 01:45

变量类型转换：将变量转换为因子变量（R语言）

变量类型转换：将变量转换为因子变量（R语言）在R语言中，变量类型的转换是非常常见和重要的操作之一。其中，将变量转换为因子变量是一个常见的需求，特别是在数据分析和建模过程中。
独行侠影·2023-12-21 00:40

R语言入门系列：rep函数的用法

R语言入门系列：rep函数的用法在R语言中，rep函数是一个常用的函数，它用于创建重复的向量。这篇文章将详细介绍rep函数的用法，并提供相应的源代码示例。
独行侠影·2023-12-21 00:10

2019-12-05 Day4 学习R语言基础

安装R和Rstudio第一步：查看你的电脑用户名是中文还是英文如果是中文-百度[当Rstudio杠上中文用户名]（我这个电脑是英文）搜狗微信搜索：“果子学生信给自己一个全新的R语言环境”教程下载R语言https
卅衣·2023-12-20 23:47

解决R语言中文乱码问题

解决R语言中文乱码问题在R语言中，处理中文字符时可能会遇到乱码问题。这种问题通常出现在数据读取、数据处理和图形输出等环节。本文将介绍一些常见的乱码问题及其解决方法，并提供相应的源代码示例。
coding远方·2023-12-20 18:48

R语言--19

函数：定义函数mean,var,stderrmymeansqtest1(,4)#缺省值x=3[1]5>sqtest1(6,8)[1]10
白猫警长ic·2023-12-20 18:43

生物信息学R分析工具包ggkegg的详细使用方法

ggkegg是从KEGG获取信息并使用ggplot2和ggraph进行解析、分析和可视化的工具包，结合其他使用KEGG进行生物功能研究的软件包。该工具旨在利用图形语法来可视化KEGG的复杂组件。
小果运维·2023-12-20 14:22

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图实践技术

R语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。
weixin_贾·2023-12-20 13:09

ggplot2绘制棒棒糖图——Lollipop chart

棒棒糖图，就是长得像棒棒糖一样的图（一句废话），和柱形图，散点图想要表达的意思是一致的，不过展示会更加好看一点，是点图geom_point()和堆叠图geom_segment()的组合，今天这篇文章主要介绍几种常见的棒棒图表现形式，以及一些美化。0.准备工作#读取数据>datahead(data)IDNUM1A_1642A_2593A_3534A_4585A_558#调用R包>library(ti
Wei_Sun·2023-12-20 13:27

R：数据结构

中常见的数据结构向量矩阵数据框：经常使用的一种数据结构列表因子R中常见的数据结构数值型：数值可以用于直接结算，加减乘除字符串型：可以进行连接，转换，提取等逻辑型：真或者假日期型1.2向量向量概述向量是R语言中最基本的数据结构
尔玉RGX·2023-12-20 12:59

R语言--20/21/22

cor相关性：cor():cor(x,y,method=c("pearson","kendall","spearman"))计算x,y的相关性，x,y需要为向量，若为矩阵则计算x列，y列的相关性。method指定相关性计算的方法,默认情况下是Pearson相关性系数。Pearson，spearman计算方法见笔记本cor.test():cor.test()使用方法.pngcor()只给出相关性值，
白猫警长ic·2023-12-20 11:28

R语言专题班（训练营：2023.10.23~10.30）

茗创科技专注于脑科学，涵盖（EEG/ERP，fMRI，结构像，DTI，ASL，FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑科学课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技·2023-12-20 09:17

【R语言】estimate包计算免疫相关分值

前面小编给大家介绍了☞肿瘤免疫分值数据库—ESTIMATE☞肿瘤微环境生信高分套路☞如何合并ESTIMATEScore和生存时间☞合并TCGA表达谱数据，生存状态和生存时间在介绍ESTIMATE数据库的时候，小编就提到，目前该数据库中只提供25种肿瘤的Stromalscore,Immunescore和ESTIMATEscore这三种分值。（https://bioinformatics.mdande
生信交流平台·2023-12-20 08:44

文献计量学方法与应用、主题确定、检索与数据采集、VOSviewer可视化绘图、Citespace可视化绘图、R语言文献计量学绘图分析

目录一、文献计量学方法与应用简介二、主题确定、检索与数据采集三、VOSviewer可视化绘图四、Citespace可视化绘图五、R语言文献计量学绘图分析六、论文写作七、论文投稿更多应用文献计量学是指用数学和统计学的方法
小艳加油·2023-12-20 06:10

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图丨R语言基础、tidyverse数据清洗、多元统计分析、随机森林模型、回归及混合效应模型、结构方程模型、统计结果作图

R语言的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。
小艳加油·2023-12-20 06:01

ggplot2绘制堆积柱形图

前面给大家简单介绍了如何用☞R绘制堆积柱形图，今天我们来看看如何用ggplot2这个包来绘制堆积柱形图。
生信交流平台·2023-12-20 03:33

GO.db:存储Gene Ontology信息的R包

在生信分析领域，R语言由于其简单易用的特点和良好的生态环境，占用重要的一席之地。其中，Bioconductor作为生信分析专用的R语言社区，提供了许多的R包。
生信修炼手册·2023-12-20 02:58

R语言采集获取58商铺出租转让信息

在R语言中，你可以使用rvest等包从58等网站抓取商铺出租和转让信息。以下是一个使用伪代码的步骤计划：1、加载必要的R库（如rvest，htt
q56731523·2023-12-19 22:48

R语言绘制频率直方图

频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式，同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型；R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便，但是当遇到多组数据的时候就不如ggplot2绘制来的方便
种地的pele·2023-12-19 22:31

R语言之简单图表制作1

比如简单画一个图foo=5],y[y>=5],pch=4,col="darkmagenta",cex=2)points(x[y=5&x-5&y=5&x-5&y15)&(y>-5&y15)&(y>-5&y<5)])lines(x,y,lty=4)arrows(x0=8,y0=14,x1=11,y1=2.5)legend("bottomleft",legend=c("overallprocess","
知识分享小能手·2023-12-19 22:25

R绘图_几种多重比较方法

本文参考:基于R语言的七种多重比较方法若研究目的是方差分析有统计学差异后，想知道哪些组间的均数有差异，便是事后比较。事后比较的常用方法有SNK、Turkey、Scheffe和Bonferroni法。
谢俊飞·2023-12-19 21:14

学习小组Day4笔记--Jeremy

R语言基本操作Rstudio界面图片来源于生信星球查看目录及文件查看目录及文件基本算术基本算术赋值与删除赋值与删除作图图1图2
Jeremy_bin·2023-12-19 20:53

R语言基础（1）——数字、字符与向量

向量1、向量的赋值第一种赋值方法：c()xx#进一步有y3)#结果显示为FALSEany(c(1,2,3,4,5,6)>3)#结果显示为TRUE6、缺失数据用NA表示某处的数据缺省或缺失x<-c(1,2,3,NA)y<-is.na(x)#结果为is.na()函数是检测缺失数据的函数，如果返回值为值（TRUE），则说明此数据是缺失数据，如果返回值为假（FALSE），则此数据不是缺失数据
令平子·2023-12-19 17:29

R语言：转换—宽数据↔长数据

博客来源于我的语雀专栏：R语言·语雀更多内容同步更新请关注我的语雀：令平子·语雀参考资料：部分已引用到各段落宽转长二维数据转长r-Reshapingdata.framefromwidetolongformat-StackOverflow
令平子·2023-12-19 17:29

【R语言】--- 回归分析最优拟合模型及作图

因变量和自变量间的拟合关系对于生态学而言极其重要，很多因变量和自变量间关系是一元线性回归，然而很多数据并不一定是直线关系，而是需要探索其曲线拟合关系。这种曲线关系并非直观看出，而是需要进行统计检验，通过比较拟合度及其显著性，来选择最优拟合模型。赤池信息准则（Akaikeinformationcriterion,AIC）和贝叶斯信息准则（Bayesianinformationcriterion,BI
生态数据·2023-12-19 15:05

跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言做方差分解的一个简单小例子

之前好多人在公众号留言问这个方差分解的内容，但是之前自己也没有听说过。最近看到有人分享了公众号推文一种简单易行的方差分解方法。看了这个推文我目前理解的是方差分解的主要作用是量化回归模型Y=b0+b1x1+b2x2+…中x1,x2,x3…对Y贡献的相对大小，以及不同X所属的因素类别（如生物因素，非生物因素）对Y的贡献大小。这篇推文以已经发表的论文中的数据为例子进行了介绍，论文是image.png这篇
小明的数据分析笔记本·2023-12-19 15:22

R语言——基本操作（一）

目录一、基本操作二、R包的安装及使用三、获取帮助四、内置数据集五、数据结构六、向量索引七、向量运算参考Rstudio控制台常用快捷键Ctrl+↑：查看所有历史记录，比直接使用↑查找更方便Esc：中断操作，可中断未完成的操作（未完成回车后是+），也可以清空命令。Ctrl+L：清空屏幕Alt+Shift+K：显示Rstudio中所有的快捷操作一、基本操作getwd()：显示当前工作目录setwd('E
Billie使劲学·2023-12-19 13:00
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