seurat v5更新及样本整合方法

目录

seurat v5的去批次方式

①pbmc单细胞数据

②Seurat V5多种去批次

进行合并分组数据

进行去批次

CCA降维

harmony降维


Analysis, visualization, and integration of Visium HD spatial datasets with Seurat • Seurat (satijalab.org)

 Tools for Single Cell Genomics • Seurat (satijalab.org)

重点是:seurat v5对象转换成v4 ;seurat v4和v5互相转换-CSDN博客

1 Seurat 对象和 Assay 类发生了变化:

支持更多种类的检测和数据

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