r语言热图对列不进行聚类_生信技术:R语言制作热图的一个小实例(第6期)

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r语言热图对列不进行聚类_生信技术:R语言制作热图的一个小实例(第6期)_第1张图片

        热图(heatmap)用不同的颜色和颜色的深浅来展示数据之间的差异,直观、美丽、大方,深受科研工作者的喜爱,尤其是转录组类的文章里,几乎必有一幅热图用来展示差异表达基因。很多工具都可以完成热图的制作,比如我们最常使用的excel;还有一款比较好用的制作热图的工具是CJ大神开发的工具TBtools,在公众号生信札记有比较详细的教程,感兴趣的可以自行搜索相关教程;今天这篇文章主要介绍利用R语言的 pheatmap 包和ggplot2 包制作热图的简单小例子。pheatmap是R语言中专门用来制作热图的工具包;ggplot2是R语言中最常用的可视化工具包。R语言中还有一个专门用来绘制热图的工具包ComplexHeatmap,功能比pheatmap强大,帮助文档非常详细,感兴趣的可以自行查阅帮助文档,在这篇文章中就不做过多介绍。

利用pheatmap制作热图

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